RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560957.1

AKAP13-223, Transcript of A-kinase anchoring protein 13, human

TSL 3

Gene AKAP13, Length 751 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
AKAP13-223	ENST00000560957	RBPJ	Q06330	500 aa		2.78	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	SCGB2A2	Q13296	93 aa		2.78	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	RIPK1	Q13546	671 aa		2.78	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	FGFBP1	Q14512	234 aa		2.78	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	IL13RA2	Q14627	380 aa		2.78	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	LPIN1	Q14693	890 aa		2.78	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	NAB2	Q15742	525 aa		2.78	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	RPE65	Q16518	533 aa		2.78	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	ODF3L2	Q3SX64	289 aa		2.78	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	LRRC23	Q53EV4	343 aa	Predicted RBP	2.78	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	CXorf66	Q5JRM2	361 aa	Predicted RBP	2.78	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	ZCCHC12	Q6PEW1	402 aa		2.78	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	C16orf87	Q6PH81	154 aa		2.78	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	FIP1L1	Q6UN15	594 aa	Known RBP	2.78	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	FAM198B	Q6UWH4	519 aa		2.78	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	IL20RB	Q6UXL0	311 aa		2.78	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	PPP1R21	Q6ZMI0	780 aa		2.78	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	SEPT14	Q6ZU15	432 aa		2.78	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	FAM57B	Q71RH2	274 aa		2.78	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	TAF8	Q7Z7C8	310 aa		2.78	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	ARID3B	Q8IVW6	561 aa	Predicted RBP	2.78	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	LAS2	Q8IYD9	372 aa		2.78	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	AGBL3	Q8NEM8	1001 aa		2.78	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	DBF4B	Q8NFT6	615 aa		2.78	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	OR56B2P	Q8NGI1	322 aa		2.78	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	URGCP	Q8TCY9	931 aa		2.78	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	LRRC8C	Q8TDW0	803 aa		2.78	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	TRPC4AP	Q8TEL6	797 aa		2.78	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	TMEM170A	Q8WVE7	144 aa		2.78	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	TEKT4	Q8WW24	435 aa		2.78	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	ATL1	Q8WXF7	558 aa		2.78	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	PIGK	Q92643	395 aa		2.78	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	KCNJ9	Q92806	393 aa		2.78	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	EXT2	Q93063	718 aa		2.78	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	DTNBP1	Q96EV8	351 aa		2.78	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	GIMAP5	Q96F15	307 aa		2.78	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	ELMOD3	Q96FG2	381 aa		2.78	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	HES6	Q96HZ4	224 aa		2.78	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	CLMN	Q96JQ2	1002 aa		2.78	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	NAP1L3	Q99457	506 aa	Predicted RBP	2.78	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	POLR3C	Q9BUI4	534 aa	Predicted RBP	2.78	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	TRIM2	Q9C040	744 aa		2.78	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	CHMP4B	Q9H444	224 aa	Known RBP	2.78	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	SFXN1	Q9H9B4	322 aa		2.78	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	MOV10	Q9HCE1	1003 aa	Known RBP	2.78	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	TRPV5	Q9NQA5	729 aa		2.78	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	SLC6A13	Q9NSD5	602 aa		2.78	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	PNPLA3	Q9NST1	481 aa		2.78	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	NMRK1	Q9NWW6	199 aa		2.78	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	SPG21	Q9NZD8	308 aa		2.78	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	MSRB1	Q9NZV6	116 aa		2.78	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	TRMT6	Q9UJA5	497 aa	Known RBP	2.78	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	FBXW2	Q9UKT8	454 aa		2.78	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	VPS4A	Q9UN37	437 aa		2.78	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	PCDHA12	Q9UN75	941 aa		2.78	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	TRAF3IP3	Q9Y228	551 aa		2.78	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	C2CD2	Q9Y426	696 aa		2.78	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957		U3KQV3	271 aa		2.78	□□□□□ -1.96
AKAP13-223	ENST00000560957	ZNF335	Q9H4Z2	1342 aa	Predicted RBP	2.77	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	TRBV5-3	A0A0A0MS03	114 aa		2.77	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957		A0A1W2PPC1	479 aa		2.77	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	ELOVL7	A1L3X0	281 aa		2.77	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	OR6C68	A6NDL8	312 aa		2.77	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	YDJC	A8MPS7	323 aa		2.77	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957		H0YC42	278 aa		2.77	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957		H0YCG3	227 aa		2.77	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957		L7N2F9	121 aa		2.77	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	PES1	O00541	588 aa	Known RBP	2.77	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	SMAD9	O15198	467 aa	Known RBP	2.77	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	SSX5	O60225	188 aa		2.77	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	NEMF	O60524	1076 aa		2.77	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	ATG13	O75143	517 aa		2.77	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	NDUFB8	O95169	186 aa		2.77	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	CELF2	O95319	508 aa	Known RBP	2.77	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	SLC16A8	O95907	504 aa		2.77	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	SERPINC1	P01008	464 aa		2.77	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	HLA-DQA2	P01906	255 aa		2.77	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	TF	P02787	698 aa		2.77	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	HIST1H2AB	P04908	130 aa		2.77	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	ABHD2	P08910	425 aa		2.77	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	TOP1	P11387	765 aa	Known RBP	2.77	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	LYL1	P12980	280 aa		2.77	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	PRG2	P13727	222 aa		2.77	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	ETS1	P14921	441 aa		2.77	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	ZNF182	P17025	639 aa	Predicted RBP	2.77	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	EPOR	P19235	508 aa		2.77	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	HIST1H2AD	P20671	130 aa		2.77	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	EEF1B2	P24534	225 aa	Known RBP	2.77	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	ACP1	P24666	158 aa		2.77	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	CDC25A	P30304	524 aa		2.77	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	CORO1A	P31146	461 aa	Known RBP	2.77	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	CTNNB1	P35222	781 aa		2.77	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	PCGF2	P35227	344 aa		2.77	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	PRKCI	P41743	596 aa		2.77	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	SKIV2L2	P42285	1042 aa	Known RBP	2.77	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	FASLG	P48023	281 aa		2.77	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	VPS41	P49754	854 aa		2.77	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	MXI1	P50539	228 aa		2.77	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	ZNF84	P51523	738 aa		2.77	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	SUOX	P51687	545 aa		2.77	□□□□□ -1.97

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