RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000546048.5

MDM2-234, Transcript of MDM2 proto-oncogene, human

TSL 5

Gene MDM2, Length 363 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MDM2-234	ENST00000546048	BLK	P51451	505 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MDM2-234	ENST00000546048	TERF1	P54274	439 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MDM2-234	ENST00000546048	DRG2	P55039	364 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
MDM2-234	ENST00000546048	GEM	P55040	296 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MDM2-234	ENST00000546048	DCDC1	P59894	354 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MDM2-234	ENST00000546048	E2F1	Q01094	437 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MDM2-234	ENST00000546048	ZFP36L1	Q07352	338 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
MDM2-234	ENST00000546048	COL9A2	Q14055	689 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
MDM2-234	ENST00000546048	SEMA3A	Q14563	771 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MDM2-234	ENST00000546048	POU6F1	Q14863	301 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MDM2-234	ENST00000546048	RTP5	Q14D33	572 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MDM2-234	ENST00000546048	TRIP13	Q15645	432 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
MDM2-234	ENST00000546048	MSMP	Q1L6U9	139 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MDM2-234	ENST00000546048	PARP6	Q2NL67	630 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MDM2-234	ENST00000546048	AMZ1	Q400G9	498 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MDM2-234	ENST00000546048	ZNF658B	Q4V348	819 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
MDM2-234	ENST00000546048	HP1BP3	Q5SSJ5	553 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
MDM2-234	ENST00000546048	CHCHD2P9	Q5T1J5	151 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
MDM2-234	ENST00000546048	GPRC6A	Q5T6X5	926 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MDM2-234	ENST00000546048	ANKRD22	Q5VYY1	191 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MDM2-234	ENST00000546048	IYD	Q6PHW0	289 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MDM2-234	ENST00000546048	NAPRT	Q6XQN6	538 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MDM2-234	ENST00000546048	ZNF534	Q76KX8	674 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MDM2-234	ENST00000546048	BZW1	Q7L1Q6	419 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
MDM2-234	ENST00000546048	DET1	Q7L5Y6	550 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MDM2-234	ENST00000546048	GLT6D1	Q7Z4J2	308 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MDM2-234	ENST00000546048	ZAR1	Q86SH2	424 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MDM2-234	ENST00000546048	SLITRK4	Q8IW52	837 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MDM2-234	ENST00000546048	SYCE1	Q8N0S2	351 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MDM2-234	ENST00000546048	GALNT15	Q8N3T1	639 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MDM2-234	ENST00000546048	SFRP1	Q8N474	314 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MDM2-234	ENST00000546048	UBL4B	Q8N7F7	174 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MDM2-234	ENST00000546048	RCBTB1	Q8NDN9	531 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MDM2-234	ENST00000546048	OR52K1	Q8NGK4	314 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MDM2-234	ENST00000546048	CCHCR1	Q8TD31	782 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MDM2-234	ENST00000546048	SLC37A2	Q8TED4	501 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MDM2-234	ENST00000546048	HNRNPLL	Q8WVV9	542 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
MDM2-234	ENST00000546048	SGF29	Q96ES7	293 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MDM2-234	ENST00000546048	WDR89	Q96FK6	387 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
MDM2-234	ENST00000546048	NAF1	Q96HR8	494 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
MDM2-234	ENST00000546048	PDLIM2	Q96JY6	352 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MDM2-234	ENST00000546048	PLEKHG4B	Q96PX9	1271 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MDM2-234	ENST00000546048	VAT1	Q99536	393 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MDM2-234	ENST00000546048	YIPF2	Q9BWQ6	316 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MDM2-234	ENST00000546048	TBC1D10A	Q9BXI6	508 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MDM2-234	ENST00000546048	AP1M1	Q9BXS5	423 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MDM2-234	ENST00000546048	LRRN3	Q9H3W5	708 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MDM2-234	ENST00000546048	CCDC86	Q9H6F5	360 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
MDM2-234	ENST00000546048	ARNT2	Q9HBZ2	717 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MDM2-234	ENST00000546048	TRIM39	Q9HCM9	518 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MDM2-234	ENST00000546048	LUC7L	Q9NQ29	371 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
MDM2-234	ENST00000546048	ASCL3	Q9NQ33	180 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MDM2-234	ENST00000546048	RAD18	Q9NS91	495 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MDM2-234	ENST00000546048	KLC4	Q9NSK0	619 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MDM2-234	ENST00000546048	TRNAU1AP	Q9NX07	287 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
MDM2-234	ENST00000546048	OGFR	Q9NZT2	677 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MDM2-234	ENST00000546048	NFKBIL1	Q9UBC1	381 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
MDM2-234	ENST00000546048	DCTN4	Q9UJW0	460 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MDM2-234	ENST00000546048	APPL1	Q9UKG1	709 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MDM2-234	ENST00000546048	SATB2	Q9UPW6	733 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MDM2-234	ENST00000546048	DNAJC16	Q9Y2G8	782 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MDM2-234	ENST00000546048	NEU2	Q9Y3R4	380 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MDM2-234	ENST00000546048	PRSS21	Q9Y6M0	314 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MDM2-234	ENST00000546048	ANKRD11	Q6UB99	2663 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
MDM2-234	ENST00000546048	ANKRD36	A6QL64	1941 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MDM2-234	ENST00000546048	LRP4	O75096	1905 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MDM2-234	ENST00000546048	AHCTF1	Q8WYP5	2266 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MDM2-234	ENST00000546048	TP53BP1	Q12888	1972 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
MDM2-234	ENST00000546048	IGHV1OR21-1	A0A087WYE8	117 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MDM2-234	ENST00000546048	IGHV5-10-1	A0A0J9YXX1	117 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MDM2-234	ENST00000546048	GLYATL1P3	A0A0U1RQE8	302 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MDM2-234	ENST00000546048	GOLGA6L3	A6NEY3	463 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MDM2-234	ENST00000546048	MROH6	A6NGR9	719 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MDM2-234	ENST00000546048	OR2AG2	A6NM03	316 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MDM2-234	ENST00000546048	AGAP14	A8MT82	685 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MDM2-234	ENST00000546048		D6RAR5	112 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MDM2-234	ENST00000546048	STX7	O15400	261 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
MDM2-234	ENST00000546048	KRT86	O43790	486 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MDM2-234	ENST00000546048	CEP104	O60308	925 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MDM2-234	ENST00000546048	OR1I1	O60431	355 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MDM2-234	ENST00000546048	AVIL	O75366	819 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MDM2-234	ENST00000546048	POP7	O75817	140 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
MDM2-234	ENST00000546048	ANXA9	O76027	345 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MDM2-234	ENST00000546048	SUN1	O94901	812 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MDM2-234	ENST00000546048	CDK14	O94921	469 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MDM2-234	ENST00000546048	AP2A1	O95782	977 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MDM2-234	ENST00000546048	IFNB1	P01574	187 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MDM2-234	ENST00000546048	FOSL1	P15407	271 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MDM2-234	ENST00000546048	ZNF7	P17097	686 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
MDM2-234	ENST00000546048	WT1	P19544	449 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
MDM2-234	ENST00000546048	HLA-DPA1	P20036	260 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MDM2-234	ENST00000546048	CA4	P22748	312 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MDM2-234	ENST00000546048	KEL	P23276	732 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MDM2-234	ENST00000546048	PSMA3	P25788	255 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MDM2-234	ENST00000546048	ARNT	P27540	789 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MDM2-234	ENST00000546048	MAPK1	P28482	360 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MDM2-234	ENST00000546048	ALDH4A1	P30038	563 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MDM2-234	ENST00000546048	SPAM1	P38567	509 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MDM2-234	ENST00000546048	PPP1CA	P62136	330 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MDM2-234	ENST00000546048	UBE2I	P63279	158 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61

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