RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533059.5

CHID1-222, Transcript of chitinase domain containing 1, human

TSL 3

Gene CHID1, Length 578 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CHID1-222	ENST00000533059	PDIK1L	Q8N165	341 aa		13.54	□□□□□ -0.24
CHID1-222	ENST00000533059	BBOF1	Q8ND07	529 aa		13.54	□□□□□ -0.24
CHID1-222	ENST00000533059	OR4D9	Q8NGE8	314 aa		13.54	□□□□□ -0.24
CHID1-222	ENST00000533059	TMEM159	Q96B96	161 aa		13.54	□□□□□ -0.24
CHID1-222	ENST00000533059	LIN37	Q96GY3	246 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
CHID1-222	ENST00000533059	CCDC74B	Q96LY2	380 aa		13.54	□□□□□ -0.24
CHID1-222	ENST00000533059	PANX3	Q96QZ0	392 aa		13.54	□□□□□ -0.24
CHID1-222	ENST00000533059	UCK1	Q9HA47	277 aa		13.54	□□□□□ -0.24
CHID1-222	ENST00000533059	KLHL3	Q9UH77	587 aa		13.54	□□□□□ -0.24
CHID1-222	ENST00000533059	VPS9D1	Q9Y2B5	631 aa		13.54	□□□□□ -0.24
CHID1-222	ENST00000533059	LOXL2	Q9Y4K0	774 aa		13.54	□□□□□ -0.24
CHID1-222	ENST00000533059	PRSS21	Q9Y6M0	314 aa		13.54	□□□□□ -0.24
CHID1-222	ENST00000533059	PLXNB3	Q9ULL4	1909 aa		13.54	□□□□□ -0.24
CHID1-222	ENST00000533059	FAM187A	A6NFU0	413 aa		13.53	□□□□□ -0.24
CHID1-222	ENST00000533059	PRR19	A6NJB7	356 aa		13.53	□□□□□ -0.24
CHID1-222	ENST00000533059	KIF2A	O00139	706 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
CHID1-222	ENST00000533059	PGAM1	P18669	254 aa		13.53	□□□□□ -0.24
CHID1-222	ENST00000533059	MPST	P25325	297 aa		13.53	□□□□□ -0.24
CHID1-222	ENST00000533059	CSF2RB	P32927	897 aa		13.53	□□□□□ -0.24
CHID1-222	ENST00000533059	PREP	P48147	710 aa		13.53	□□□□□ -0.24
CHID1-222	ENST00000533059	ITGA8	P53708	1063 aa		13.53	□□□□□ -0.24
CHID1-222	ENST00000533059	CSE1L	P55060	971 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
CHID1-222	ENST00000533059	ARL4C	P56559	192 aa		13.53	□□□□□ -0.24
CHID1-222	ENST00000533059	PLOD1	Q02809	727 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
CHID1-222	ENST00000533059	DHX9	Q08211	1270 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
CHID1-222	ENST00000533059	RPA4	Q13156	261 aa		13.53	□□□□□ -0.24
CHID1-222	ENST00000533059	GPR18	Q14330	331 aa		13.53	□□□□□ -0.24
CHID1-222	ENST00000533059	LONRF1	Q17RB8	773 aa		13.53	□□□□□ -0.24
CHID1-222	ENST00000533059	ANKRD20A4	Q4UJ75	823 aa		13.53	□□□□□ -0.24
CHID1-222	ENST00000533059	TMEM71	Q6P5X7	295 aa		13.53	□□□□□ -0.24
CHID1-222	ENST00000533059	LRRC6	Q86X45	466 aa		13.53	□□□□□ -0.24
CHID1-222	ENST00000533059	PLXDC1	Q8IUK5	500 aa		13.53	□□□□□ -0.24
CHID1-222	ENST00000533059	LILRA3	Q8N6C8	439 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
CHID1-222	ENST00000533059	SERBP1	Q8NC51	408 aa	Known RBP eCLIP	13.53	□□□□□ -0.24
CHID1-222	ENST00000533059	GPR150	Q8NGU9	434 aa		13.53	□□□□□ -0.24
CHID1-222	ENST00000533059	CALML6	Q8TD86	181 aa		13.53	□□□□□ -0.24
CHID1-222	ENST00000533059	FERD3L	Q96RJ6	166 aa		13.53	□□□□□ -0.24
CHID1-222	ENST00000533059	CCDC68	Q9H2F9	335 aa		13.53	□□□□□ -0.24
CHID1-222	ENST00000533059	SEMA6C	Q9H3T2	930 aa		13.53	□□□□□ -0.24
CHID1-222	ENST00000533059	SLC40A1	Q9NP59	571 aa		13.53	□□□□□ -0.24
CHID1-222	ENST00000533059	THSD1	Q9NS62	852 aa		13.53	□□□□□ -0.24
CHID1-222	ENST00000533059	C20orf96	Q9NUD7	363 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
CHID1-222	ENST00000533059	MARCH4	Q9P2E8	410 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
CHID1-222	ENST00000533059	PISD	Q9UG56	409 aa		13.53	□□□□□ -0.24
CHID1-222	ENST00000533059	UTP11	Q9Y3A2	253 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
CHID1-222	ENST00000533059	ARID1B	Q8NFD5	2236 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
CHID1-222	ENST00000533059		A8MU76	341 aa		13.52	□□□□□ -0.25
CHID1-222	ENST00000533059		E5RI56	91 aa		13.52	□□□□□ -0.25
CHID1-222	ENST00000533059	PLD2	O14939	933 aa		13.52	□□□□□ -0.25
CHID1-222	ENST00000533059	RASSF9	O75901	435 aa		13.52	□□□□□ -0.25
CHID1-222	ENST00000533059	TTC4	O95801	387 aa		13.52	□□□□□ -0.25
CHID1-222	ENST00000533059	TUBB4A	P04350	444 aa		13.52	□□□□□ -0.25
CHID1-222	ENST00000533059	APOA4	P06727	396 aa		13.52	□□□□□ -0.25
CHID1-222	ENST00000533059	OGN	P20774	298 aa	Known RBP	13.52	□□□□□ -0.25
CHID1-222	ENST00000533059	CSTF2	P33240	577 aa	Known RBP eCLIP	13.52	□□□□□ -0.25
CHID1-222	ENST00000533059	LSS	P48449	732 aa		13.52	□□□□□ -0.25
CHID1-222	ENST00000533059	LIMK2	P53671	638 aa		13.52	□□□□□ -0.25
CHID1-222	ENST00000533059	ZFP36L1	Q07352	338 aa	Known RBP	13.52	□□□□□ -0.25
CHID1-222	ENST00000533059	TRA2A	Q13595	282 aa	Known RBP eCLIP	13.52	□□□□□ -0.25
CHID1-222	ENST00000533059	HIF1A	Q16665	826 aa		13.52	□□□□□ -0.25
CHID1-222	ENST00000533059	ZNF470	Q6ECI4	717 aa		13.52	□□□□□ -0.25
CHID1-222	ENST00000533059	NEPRO	Q6NW34	567 aa		13.52	□□□□□ -0.25
CHID1-222	ENST00000533059	ARMC6	Q6NXE6	501 aa		13.52	□□□□□ -0.25
CHID1-222	ENST00000533059	OOSP2	Q86WS3	158 aa		13.52	□□□□□ -0.25
CHID1-222	ENST00000533059	FAM129C	Q86XR2	697 aa		13.52	□□□□□ -0.25
CHID1-222	ENST00000533059	SLITRK4	Q8IW52	837 aa		13.52	□□□□□ -0.25
CHID1-222	ENST00000533059	RCBTB1	Q8NDN9	531 aa		13.52	□□□□□ -0.25
CHID1-222	ENST00000533059	SPDYE1	Q8NFV5	336 aa	Predicted RBP	13.52	□□□□□ -0.25
CHID1-222	ENST00000533059	RMDN2	Q96LZ7	410 aa		13.52	□□□□□ -0.25
CHID1-222	ENST00000533059	TGM7	Q96PF1	710 aa		13.52	□□□□□ -0.25
CHID1-222	ENST00000533059	INSM2	Q96T92	566 aa	Predicted RBP	13.52	□□□□□ -0.25
CHID1-222	ENST00000533059	TRIM56	Q9BRZ2	755 aa	Known RBP	13.52	□□□□□ -0.25
CHID1-222	ENST00000533059	FAM167B	Q9BTA0	163 aa		13.52	□□□□□ -0.25
CHID1-222	ENST00000533059	NAT9	Q9BTE0	207 aa		13.52	□□□□□ -0.25
CHID1-222	ENST00000533059	RAB17	Q9H0T7	212 aa		13.52	□□□□□ -0.25
CHID1-222	ENST00000533059	DPH5	Q9H2P9	285 aa		13.52	□□□□□ -0.25
CHID1-222	ENST00000533059	WDR70	Q9NW82	654 aa		13.52	□□□□□ -0.25
CHID1-222	ENST00000533059	IL1RAPL1	Q9NZN1	696 aa		13.52	□□□□□ -0.25
CHID1-222	ENST00000533059	ZMIZ1	Q9ULJ6	1067 aa		13.52	□□□□□ -0.25
CHID1-222	ENST00000533059	SNX24	Q9Y343	169 aa		13.52	□□□□□ -0.25
CHID1-222	ENST00000533059	PCDHGA8	Q9Y5G5	932 aa		13.52	□□□□□ -0.25
CHID1-222	ENST00000533059	PRAMEF33	A0A0G2JMD5	474 aa		13.51	□□□□□ -0.25
CHID1-222	ENST00000533059	IGHV5-10-1	A0A0J9YXX1	117 aa		13.51	□□□□□ -0.25
CHID1-222	ENST00000533059		H3BMM5	538 aa		13.51	□□□□□ -0.25
CHID1-222	ENST00000533059	HGS	O14964	777 aa	Predicted RBP	13.51	□□□□□ -0.25
CHID1-222	ENST00000533059	RAD51C	O43502	376 aa		13.51	□□□□□ -0.25
CHID1-222	ENST00000533059	KDM1A	O60341	852 aa		13.51	□□□□□ -0.25
CHID1-222	ENST00000533059	SEC31A	O94979	1220 aa	Known RBP	13.51	□□□□□ -0.25
CHID1-222	ENST00000533059	TNFSF15	O95150	251 aa		13.51	□□□□□ -0.25
CHID1-222	ENST00000533059	THRA	P10827	490 aa		13.51	□□□□□ -0.25
CHID1-222	ENST00000533059	HOXB3	P14651	431 aa	Predicted RBP	13.51	□□□□□ -0.25
CHID1-222	ENST00000533059	FMO4	P31512	558 aa		13.51	□□□□□ -0.25
CHID1-222	ENST00000533059	MAGEA3	P43357	314 aa		13.51	□□□□□ -0.25
CHID1-222	ENST00000533059	CAPZB	P47756	277 aa		13.51	□□□□□ -0.25
CHID1-222	ENST00000533059	CD151	P48509	253 aa		13.51	□□□□□ -0.25
CHID1-222	ENST00000533059	MAPK10	P53779	464 aa		13.51	□□□□□ -0.25
CHID1-222	ENST00000533059	MRPS25	P82663	173 aa	Known RBP	13.51	□□□□□ -0.25
CHID1-222	ENST00000533059	HSPA14	Q0VDF9	509 aa		13.51	□□□□□ -0.25
CHID1-222	ENST00000533059	PRKAA1	Q13131	559 aa		13.51	□□□□□ -0.25
CHID1-222	ENST00000533059	WHAMMP3	Q1A5X7	153 aa		13.51	□□□□□ -0.25

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