RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000529667.1

SOX9-AS1-208, SOX9 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene SOX9-AS1, Length 340 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Cytoplasm .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX9-AS1-208ENST00000529667 RIMS3Q9UJD0 308 aa6.66□□□□□ -1.34
SOX9-AS1-208ENST00000529667 ADAMTS6Q9UKP5 1117 aa6.66□□□□□ -1.34
SOX9-AS1-208ENST00000529667 PPT2Q9UMR5 302 aa6.66□□□□□ -1.34
SOX9-AS1-208ENST00000529667 FAM50BQ9Y247 325 aa6.66□□□□□ -1.34
SOX9-AS1-208ENST00000529667 SLC27A6Q9Y2P4 619 aa6.66□□□□□ -1.34
SOX9-AS1-208ENST00000529667 MED16Q9Y2X0 877 aa6.66□□□□□ -1.34
SOX9-AS1-208ENST00000529667 TSC22D4Q9Y3Q8 395 aa6.66□□□□□ -1.34
SOX9-AS1-208ENST00000529667 PCDHA9Q9Y5H5 950 aa6.66□□□□□ -1.34
SOX9-AS1-208ENST00000529667 SPO11Q9Y5K1 396 aa6.66□□□□□ -1.34
SOX9-AS1-208ENST00000529667 DNMT3AQ9Y6K1 912 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
SOX9-AS1-208ENST00000529667 CCDC78A2IDD5 438 aa6.65□□□□□ -1.34
SOX9-AS1-208ENST00000529667 C2orf78A6NCI8 922 aa6.65□□□□□ -1.34
SOX9-AS1-208ENST00000529667 NEMP2A6NFY4 417 aa6.65□□□□□ -1.34
SOX9-AS1-208ENST00000529667 ZNF839A8K0R7 811 aa6.65□□□□□ -1.34
SOX9-AS1-208ENST00000529667 NT5C1B-RDH14C9J2C7 533 aa6.65□□□□□ -1.34
SOX9-AS1-208ENST00000529667 GFYI3L273 518 aa6.65□□□□□ -1.34
SOX9-AS1-208ENST00000529667 FBP2O00757 339 aa6.65□□□□□ -1.34
SOX9-AS1-208ENST00000529667 MRPS14O60783 128 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
SOX9-AS1-208ENST00000529667 KCNJ13O60928 360 aa6.65□□□□□ -1.34
SOX9-AS1-208ENST00000529667 SKAP2O75563 359 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
SOX9-AS1-208ENST00000529667 PDE5AO76074 875 aa6.65□□□□□ -1.34
SOX9-AS1-208ENST00000529667 FGF18O76093 207 aa6.65□□□□□ -1.34
SOX9-AS1-208ENST00000529667 RECQL5O94762 991 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
SOX9-AS1-208ENST00000529667 MYO1DO94832 1006 aa6.65□□□□□ -1.34
SOX9-AS1-208ENST00000529667 CXCL14O95715 111 aa6.65□□□□□ -1.34
SOX9-AS1-208ENST00000529667 CLPTM1O96005 669 aa6.65□□□□□ -1.34
SOX9-AS1-208ENST00000529667 PRNPP04156 253 aa6.65□□□□□ -1.34
SOX9-AS1-208ENST00000529667 RETP07949 1114 aa6.65□□□□□ -1.34
SOX9-AS1-208ENST00000529667 PDHA1P08559 390 aa6.65□□□□□ -1.34
SOX9-AS1-208ENST00000529667 RAP2AP10114 183 aa6.65□□□□□ -1.34
SOX9-AS1-208ENST00000529667 ATP1B2P14415 290 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
SOX9-AS1-208ENST00000529667 XRCC1P18887 633 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
SOX9-AS1-208ENST00000529667 POLR2EP19388 210 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
SOX9-AS1-208ENST00000529667 PRPS1L1P21108 318 aa6.65□□□□□ -1.34
SOX9-AS1-208ENST00000529667 SLC6A2P23975 617 aa6.65□□□□□ -1.34
SOX9-AS1-208ENST00000529667 MAP4P27816 1152 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
SOX9-AS1-208ENST00000529667 SERPINB1P30740 379 aa6.65□□□□□ -1.34
SOX9-AS1-208ENST00000529667 VIPR1P32241 457 aa6.65□□□□□ -1.34
SOX9-AS1-208ENST00000529667 CSKP41240 450 aa6.65□□□□□ -1.34
SOX9-AS1-208ENST00000529667 CASP2P42575 452 aa6.65□□□□□ -1.34
SOX9-AS1-208ENST00000529667 ABCG1P45844 678 aa6.65□□□□□ -1.34
SOX9-AS1-208ENST00000529667 GJA8P48165 433 aa6.65□□□□□ -1.34
SOX9-AS1-208ENST00000529667 RPIAP49247 311 aa6.65□□□□□ -1.34
SOX9-AS1-208ENST00000529667 RAB15P59190 212 aa6.65□□□□□ -1.34
SOX9-AS1-208ENST00000529667 ST8SIA6P61647 398 aa6.65□□□□□ -1.34
SOX9-AS1-208ENST00000529667 WDR5P61964 334 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
SOX9-AS1-208ENST00000529667 ESRRGP62508 458 aa6.65□□□□□ -1.34
SOX9-AS1-208ENST00000529667 ELP6Q0PNE2 266 aa6.65□□□□□ -1.34
SOX9-AS1-208ENST00000529667 CSTF3Q12996 717 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
SOX9-AS1-208ENST00000529667 LAPTM5Q13571 262 aa6.65□□□□□ -1.34
SOX9-AS1-208ENST00000529667 NFYCQ13952 458 aa6.65□□□□□ -1.34
SOX9-AS1-208ENST00000529667 GBX1Q14549 363 aa6.65□□□□□ -1.34
SOX9-AS1-208ENST00000529667 PPP1R3AQ16821 1122 aa6.65□□□□□ -1.34
SOX9-AS1-208ENST00000529667 ZNF284Q2VY69 593 aa6.65□□□□□ -1.34
SOX9-AS1-208ENST00000529667 KCTD21Q4G0X4 260 aa6.65□□□□□ -1.34
SOX9-AS1-208ENST00000529667 TMEM259Q4ZIN3 620 aa6.65□□□□□ -1.34
SOX9-AS1-208ENST00000529667 LIN52Q52LA3 116 aa6.65□□□□□ -1.34
SOX9-AS1-208ENST00000529667 PITRM1Q5JRX3 1037 aa6.65□□□□□ -1.34
SOX9-AS1-208ENST00000529667 CTSL3PQ5NE16 218 aa6.65□□□□□ -1.34
SOX9-AS1-208ENST00000529667 TTC23Q5W5X9 447 aa6.65□□□□□ -1.34
SOX9-AS1-208ENST00000529667 PSAPL1Q6NUJ1 521 aa6.65□□□□□ -1.34
SOX9-AS1-208ENST00000529667 ERAP2Q6P179 960 aa6.65□□□□□ -1.34
SOX9-AS1-208ENST00000529667 PSRC1Q6PGN9 363 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
SOX9-AS1-208ENST00000529667 PAOXQ6QHF9 649 aa6.65□□□□□ -1.34
SOX9-AS1-208ENST00000529667 SBSNQ6UWP8 590 aa6.65□□□□□ -1.34
SOX9-AS1-208ENST00000529667 NECAB2Q7Z6G3 386 aa6.65□□□□□ -1.34
SOX9-AS1-208ENST00000529667 DSG4Q86SJ6 1040 aa6.65□□□□□ -1.34
SOX9-AS1-208ENST00000529667 TMEM150AQ86TG1 271 aa6.65□□□□□ -1.34
SOX9-AS1-208ENST00000529667 CIR1Q86X95 450 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
SOX9-AS1-208ENST00000529667 FUNDC1Q8IVP5 155 aa6.65□□□□□ -1.34
SOX9-AS1-208ENST00000529667 SLC15A3Q8IY34 581 aa6.65□□□□□ -1.34
SOX9-AS1-208ENST00000529667 CMTM8Q8IZV2 173 aa6.65□□□□□ -1.34
SOX9-AS1-208ENST00000529667 TRAM1L1Q8N609 369 aa6.65□□□□□ -1.34
SOX9-AS1-208ENST00000529667 ARL14EPQ8N8R7 260 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
SOX9-AS1-208ENST00000529667 MRPL43Q8N983 215 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
SOX9-AS1-208ENST00000529667 TMEM102Q8N9M5 508 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
SOX9-AS1-208ENST00000529667 FNDC5Q8NAU1 212 aa6.65□□□□□ -1.34
SOX9-AS1-208ENST00000529667 TMIEQ8NEW7 156 aa6.65□□□□□ -1.34
SOX9-AS1-208ENST00000529667 SP7Q8TDD2 431 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
SOX9-AS1-208ENST00000529667 BCL7CQ8WUZ0 217 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
SOX9-AS1-208ENST00000529667 NCSTNQ92542 709 aa6.65□□□□□ -1.34
SOX9-AS1-208ENST00000529667 IRF7Q92985 503 aa6.65□□□□□ -1.34
SOX9-AS1-208ENST00000529667 USP7Q93009 1102 aa6.65□□□□□ -1.34
SOX9-AS1-208ENST00000529667 UBE2E3Q969T4 207 aa6.65□□□□□ -1.34
SOX9-AS1-208ENST00000529667 RAB7BQ96AH8 199 aa6.65□□□□□ -1.34
SOX9-AS1-208ENST00000529667 PPWD1Q96BP3 646 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
SOX9-AS1-208ENST00000529667 TESCQ96BS2 214 aa6.65□□□□□ -1.34
SOX9-AS1-208ENST00000529667 ARMC5Q96C12 935 aa6.65□□□□□ -1.34
SOX9-AS1-208ENST00000529667 SDCCAG3Q96C92 435 aa6.65□□□□□ -1.34
SOX9-AS1-208ENST00000529667 RHBDF1Q96CC6 855 aa6.65□□□□□ -1.34
SOX9-AS1-208ENST00000529667 AURKBQ96GD4 344 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
SOX9-AS1-208ENST00000529667 PPP1R16AQ96I34 528 aa6.65□□□□□ -1.34
SOX9-AS1-208ENST00000529667 CCDC138Q96M89 665 aa6.65□□□□□ -1.34
SOX9-AS1-208ENST00000529667 RNF145Q96MT1 663 aa6.65□□□□□ -1.34
SOX9-AS1-208ENST00000529667 RAD9AQ99638 391 aa6.65□□□□□ -1.34
SOX9-AS1-208ENST00000529667 KCTD14Q9BQ13 255 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
SOX9-AS1-208ENST00000529667 TUBA1CQ9BQE3 449 aa6.65□□□□□ -1.34
SOX9-AS1-208ENST00000529667 VN1R3Q9BXE9 311 aa6.65□□□□□ -1.34
SOX9-AS1-208ENST00000529667 ANKRD60Q9BZ19 345 aa6.65□□□□□ -1.34
SOX9-AS1-208ENST00000529667 ALG2Q9H553 416 aa6.65□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26 ms