RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514384.1

SMIM20-202, Transcript of small integral membrane protein 20, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene SMIM20, Length 774 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM20-202ENST00000514384 KLHL35Q6PF15 583 aa7.13□□□□□ -1.27
SMIM20-202ENST00000514384 FAM43BQ6ZT52 329 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
SMIM20-202ENST00000514384 GPR141Q7Z602 305 aa7.13□□□□□ -1.27
SMIM20-202ENST00000514384 PIGZQ86VD9 579 aa7.13□□□□□ -1.27
SMIM20-202ENST00000514384 RALGPS2Q86X27 583 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
SMIM20-202ENST00000514384 FAM131BQ86XD5 332 aa7.13□□□□□ -1.27
SMIM20-202ENST00000514384 DHFR2Q86XF0 187 aa7.13□□□□□ -1.27
SMIM20-202ENST00000514384 YAF2Q8IY57 180 aa7.13□□□□□ -1.27
SMIM20-202ENST00000514384 PYROXD2Q8N2H3 581 aa7.13□□□□□ -1.27
SMIM20-202ENST00000514384 GALNT4Q8N4A0 578 aa7.13□□□□□ -1.27
SMIM20-202ENST00000514384 DNAAF3Q8N9W5 541 aa7.13□□□□□ -1.27
SMIM20-202ENST00000514384 SMYD1Q8NB12 490 aa7.13□□□□□ -1.27
SMIM20-202ENST00000514384 PCYOX1LQ8NBM8 494 aa7.13□□□□□ -1.27
SMIM20-202ENST00000514384 CCNYQ8ND76 341 aa7.13□□□□□ -1.27
SMIM20-202ENST00000514384 OR6B3Q8NGW1 331 aa7.13□□□□□ -1.27
SMIM20-202ENST00000514384 HMGCLL1Q8TB92 370 aa7.13□□□□□ -1.27
SMIM20-202ENST00000514384 CLEC4CQ8WTT0 213 aa7.13□□□□□ -1.27
SMIM20-202ENST00000514384 SMARCD2Q92925 531 aa7.13□□□□□ -1.27
SMIM20-202ENST00000514384 BORCS5Q969J3 196 aa7.13□□□□□ -1.27
SMIM20-202ENST00000514384 ATP6V1E2Q96A05 226 aa7.13□□□□□ -1.27
SMIM20-202ENST00000514384 C18orf25Q96B23 403 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
SMIM20-202ENST00000514384 NXPE2Q96DL1 559 aa7.13□□□□□ -1.27
SMIM20-202ENST00000514384 L3HYPDHQ96EM0 354 aa7.13□□□□□ -1.27
SMIM20-202ENST00000514384 MFSD3Q96ES6 412 aa7.13□□□□□ -1.27
SMIM20-202ENST00000514384 TSPAN17Q96FV3 270 aa7.13□□□□□ -1.27
SMIM20-202ENST00000514384 TMEM175Q9BSA9 504 aa7.13□□□□□ -1.27
SMIM20-202ENST00000514384 TMEM79Q9BSE2 394 aa7.13□□□□□ -1.27
SMIM20-202ENST00000514384 C9orf16Q9BUW7 83 aa7.13□□□□□ -1.27
SMIM20-202ENST00000514384 TRIM62Q9BVG3 475 aa7.13□□□□□ -1.27
SMIM20-202ENST00000514384 TDRD1Q9BXT4 1180 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
SMIM20-202ENST00000514384 OSBPL2Q9H1P3 480 aa7.13□□□□□ -1.27
SMIM20-202ENST00000514384 ARNT2Q9HBZ2 717 aa7.13□□□□□ -1.27
SMIM20-202ENST00000514384 MAGEE1Q9HCI5 957 aa7.13□□□□□ -1.27
SMIM20-202ENST00000514384 CNGB3Q9NQW8 809 aa7.13□□□□□ -1.27
SMIM20-202ENST00000514384 TREX1Q9NSU2 369 aa7.13□□□□□ -1.27
SMIM20-202ENST00000514384 FAM49BQ9NUQ9 324 aa7.13□□□□□ -1.27
SMIM20-202ENST00000514384 XPR1Q9UBH6 696 aa7.13□□□□□ -1.27
SMIM20-202ENST00000514384 PLEKHB1Q9UF11 243 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
SMIM20-202ENST00000514384 ZNF639Q9UID6 485 aa7.13□□□□□ -1.27
SMIM20-202ENST00000514384 PILRBQ9UKJ0 227 aa7.13□□□□□ -1.27
SMIM20-202ENST00000514384 SLC39A10Q9ULF5 831 aa7.13□□□□□ -1.27
SMIM20-202ENST00000514384 CNOT6Q9ULM6 557 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
SMIM20-202ENST00000514384 PCDHGB4Q9UN71 923 aa7.13□□□□□ -1.27
SMIM20-202ENST00000514384 NDUFAF1Q9Y375 327 aa7.13□□□□□ -1.27
SMIM20-202ENST00000514384 PCDHGB5Q9Y5G0 923 aa7.13□□□□□ -1.27
SMIM20-202ENST00000514384 LRRK2Q5S007 2527 aa7.13□□□□□ -1.27
SMIM20-202ENST00000514384 SPENQ96T58 3664 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
SMIM20-202ENST00000514384 MTCL1Q9Y4B5 1905 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
SMIM20-202ENST00000514384 FAM95CA0A1B0GW59 222 aa7.12□□□□□ -1.27
SMIM20-202ENST00000514384 CLEC18AA5D8T8 446 aa7.12□□□□□ -1.27
SMIM20-202ENST00000514384 CARNS1A5YM72 827 aa7.12□□□□□ -1.27
SMIM20-202ENST00000514384 PRORSD1PA6NEY8 169 aa7.12□□□□□ -1.27
SMIM20-202ENST00000514384 KCNU1A8MYU2 1149 aa7.12□□□□□ -1.27
SMIM20-202ENST00000514384 H0YAE9 185 aa7.12□□□□□ -1.27
SMIM20-202ENST00000514384 M0QYT0 321 aa7.12□□□□□ -1.27
SMIM20-202ENST00000514384 NEMP1O14524 444 aa7.12□□□□□ -1.27
SMIM20-202ENST00000514384 TNFRSF10BO14763 440 aa7.12□□□□□ -1.27
SMIM20-202ENST00000514384 MSTNO14793 375 aa7.12□□□□□ -1.27
SMIM20-202ENST00000514384 MRASO14807 208 aa7.12□□□□□ -1.27
SMIM20-202ENST00000514384 SNAP91O60641 907 aa7.12□□□□□ -1.27
SMIM20-202ENST00000514384 COQ9O75208 318 aa7.12□□□□□ -1.27
SMIM20-202ENST00000514384 VPS4BO75351 444 aa7.12□□□□□ -1.27
SMIM20-202ENST00000514384 GJB3O75712 270 aa7.12□□□□□ -1.27
SMIM20-202ENST00000514384 IPO13O94829 963 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
SMIM20-202ENST00000514384 AHSGP02765 367 aa7.12□□□□□ -1.27
SMIM20-202ENST00000514384 INHBBP09529 407 aa7.12□□□□□ -1.27
SMIM20-202ENST00000514384 LCP1P13796 627 aa7.12□□□□□ -1.27
SMIM20-202ENST00000514384 PTPN1P18031 435 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
SMIM20-202ENST00000514384 NFKB1P19838 968 aa7.12□□□□□ -1.27
SMIM20-202ENST00000514384 IMPDH1P20839 514 aa7.12□□□□□ -1.27
SMIM20-202ENST00000514384 NMBRP28336 390 aa7.12□□□□□ -1.27
SMIM20-202ENST00000514384 GRNP28799 593 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
SMIM20-202ENST00000514384 LRPAP1P30533 357 aa7.12□□□□□ -1.27
SMIM20-202ENST00000514384 HOXA11P31270 313 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
SMIM20-202ENST00000514384 ADRA1AP35348 466 aa7.12□□□□□ -1.27
SMIM20-202ENST00000514384 CD151P48509 253 aa7.12□□□□□ -1.27
SMIM20-202ENST00000514384 CXCR3P49682 368 aa7.12□□□□□ -1.27
SMIM20-202ENST00000514384 GSK3AP49840 483 aa7.12□□□□□ -1.27
SMIM20-202ENST00000514384 GEMP55040 296 aa7.12□□□□□ -1.27
SMIM20-202ENST00000514384 MLLT6P55198 1093 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
SMIM20-202ENST00000514384 TPI1P60174 286 aa7.12□□□□□ -1.27
SMIM20-202ENST00000514384 PHEXP78562 749 aa7.12□□□□□ -1.27
SMIM20-202ENST00000514384 TLE1Q04724 770 aa7.12□□□□□ -1.27
SMIM20-202ENST00000514384 TUBA3CQ13748 450 aa7.12□□□□□ -1.27
SMIM20-202ENST00000514384 GK3PQ14409 553 aa7.12□□□□□ -1.27
SMIM20-202ENST00000514384 DMC1Q14565 340 aa7.12□□□□□ -1.27
SMIM20-202ENST00000514384 ACAP2Q15057 778 aa7.12□□□□□ -1.27
SMIM20-202ENST00000514384 ATP6AP1Q15904 470 aa7.12□□□□□ -1.27
SMIM20-202ENST00000514384 MOGQ16653 247 aa7.12□□□□□ -1.27
SMIM20-202ENST00000514384 FAM83EQ2M2I3 478 aa7.12□□□□□ -1.27
SMIM20-202ENST00000514384 SLC36A3Q495N2 470 aa7.12□□□□□ -1.27
SMIM20-202ENST00000514384 PDCD4Q53EL6 469 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
SMIM20-202ENST00000514384 TECRLQ5HYJ1 363 aa7.12□□□□□ -1.27
SMIM20-202ENST00000514384 RAB41Q5JT25 222 aa7.12□□□□□ -1.27
SMIM20-202ENST00000514384 PRSS36Q5K4E3 855 aa7.12□□□□□ -1.27
SMIM20-202ENST00000514384 RTP2Q5QGT7 225 aa7.12□□□□□ -1.27
SMIM20-202ENST00000514384 CERCAMQ5T4B2 595 aa7.12□□□□□ -1.27
SMIM20-202ENST00000514384 TMTC4Q5T4D3 741 aa7.12□□□□□ -1.27
SMIM20-202ENST00000514384 AGAP9Q5VTM2 703 aa7.12□□□□□ -1.27
SMIM20-202ENST00000514384 TMEM198Q66K66 360 aa7.12□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.2 ms