RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511747.5

SH3BP2-221, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP2, Length 2,351 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-221ENST00000511747 SLC11A2P49281 568 aa26.65■■□□□ 1.86
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SH3BP2-221ENST00000511747 TRIM32Q13049 653 aa26.65■■□□□ 1.86
SH3BP2-221ENST00000511747 GPR17Q13304 367 aa26.65■■□□□ 1.86
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SH3BP2-221ENST00000511747 THAP5Q7Z6K1 395 aa26.65■■□□□ 1.86
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SH3BP2-221ENST00000511747 SLC2A4P14672 509 aa26.63■■□□□ 1.85
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SH3BP2-221ENST00000511747 SNX19Q92543 992 aa26.63■■□□□ 1.85
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SH3BP2-221ENST00000511747 ZNF177Q13360 481 aaPredicted RBP26.62■■□□□ 1.85
SH3BP2-221ENST00000511747 C8orf59Q8N0T1 100 aaPredicted RBP26.62■■□□□ 1.85
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SH3BP2-221ENST00000511747 STK40Q8N2I9 435 aa26.62■■□□□ 1.85
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SH3BP2-221ENST00000511747 GTF2H4Q92759 462 aa26.62■■□□□ 1.85
SH3BP2-221ENST00000511747 SDCCAG3Q96C92 435 aa26.62■■□□□ 1.85
SH3BP2-221ENST00000511747 PLEKHA8Q96JA3 519 aa26.62■■□□□ 1.85
SH3BP2-221ENST00000511747 LHPPQ9H008 270 aa26.62■■□□□ 1.85
SH3BP2-221ENST00000511747 FAM118AQ9NWS6 357 aa26.62■■□□□ 1.85
SH3BP2-221ENST00000511747 LIMD1Q9UGP4 676 aa26.62■■□□□ 1.85
SH3BP2-221ENST00000511747 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP26.61■■□□□ 1.85
SH3BP2-221ENST00000511747 PRMT5O14744 637 aaPredicted RBP26.61■■□□□ 1.85
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