RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000483538.1

POLR1A-207, Transcript of RNA polymerase I subunit A, humanhuman

TSL 4

Gene POLR1A, Length 593 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1A-207ENST00000483538 C17orf113A0A1B0GUU1 675 aa8.7□□□□□ -1.02
POLR1A-207ENST00000483538 SDR42E2A6NKP2 422 aa8.7□□□□□ -1.02
POLR1A-207ENST00000483538 TLX3O43711 291 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
POLR1A-207ENST00000483538 DXOO77932 396 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
POLR1A-207ENST00000483538 USP1O94782 785 aa8.7□□□□□ -1.02
POLR1A-207ENST00000483538 POLBP06746 335 aa8.7□□□□□ -1.02
POLR1A-207ENST00000483538 SLC35G4P0C7Q5 338 aa8.7□□□□□ -1.02
POLR1A-207ENST00000483538 TPBGLP0DKB5 382 aa8.7□□□□□ -1.02
POLR1A-207ENST00000483538 SLC2A4P14672 509 aa8.7□□□□□ -1.02
POLR1A-207ENST00000483538 ITGB6P18564 788 aa8.7□□□□□ -1.02
POLR1A-207ENST00000483538 MPSTP25325 297 aa8.7□□□□□ -1.02
POLR1A-207ENST00000483538 ACADLP28330 430 aa8.7□□□□□ -1.02
POLR1A-207ENST00000483538 CCR7P32248 378 aa8.7□□□□□ -1.02
POLR1A-207ENST00000483538 ETV5P41161 510 aa8.7□□□□□ -1.02
POLR1A-207ENST00000483538 SLC1A2P43004 574 aa8.7□□□□□ -1.02
POLR1A-207ENST00000483538 PAFAH1B1P43034 410 aa8.7□□□□□ -1.02
POLR1A-207ENST00000483538 ITGA8P53708 1063 aa8.7□□□□□ -1.02
POLR1A-207ENST00000483538 INHBCP55103 352 aa8.7□□□□□ -1.02
POLR1A-207ENST00000483538 GFERP55789 205 aa8.7□□□□□ -1.02
POLR1A-207ENST00000483538 GABREP78334 506 aa8.7□□□□□ -1.02
POLR1A-207ENST00000483538 GPLD1P80108 840 aa8.7□□□□□ -1.02
POLR1A-207ENST00000483538 CYP4F3Q08477 520 aa8.7□□□□□ -1.02
POLR1A-207ENST00000483538 CBLBQ13191 982 aa8.7□□□□□ -1.02
POLR1A-207ENST00000483538 CRYMQ14894 314 aa8.7□□□□□ -1.02
POLR1A-207ENST00000483538 TRADDQ15628 312 aa8.7□□□□□ -1.02
POLR1A-207ENST00000483538 FASTKD1Q53R41 847 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
POLR1A-207ENST00000483538 C3orf38Q5JPI3 329 aa8.7□□□□□ -1.02
POLR1A-207ENST00000483538 LYPLAL1Q5VWZ2 237 aa8.7□□□□□ -1.02
POLR1A-207ENST00000483538 DUPD1Q68J44 220 aa8.7□□□□□ -1.02
POLR1A-207ENST00000483538 CASC4Q6P4E1 433 aa8.7□□□□□ -1.02
POLR1A-207ENST00000483538 IGF2-ASQ6U949 168 aa8.7□□□□□ -1.02
POLR1A-207ENST00000483538 CERS6Q6ZMG9 384 aa8.7□□□□□ -1.02
POLR1A-207ENST00000483538 TMEM26Q6ZUK4 368 aa8.7□□□□□ -1.02
POLR1A-207ENST00000483538 SLC9B2Q86UD5 537 aa8.7□□□□□ -1.02
POLR1A-207ENST00000483538 PDZD3Q86UT5 571 aa8.7□□□□□ -1.02
POLR1A-207ENST00000483538 PROSER1Q86XN7 944 aa8.7□□□□□ -1.02
POLR1A-207ENST00000483538 CILP2Q8IUL8 1156 aa8.7□□□□□ -1.02
POLR1A-207ENST00000483538 DENND6AQ8IWF6 608 aa8.7□□□□□ -1.02
POLR1A-207ENST00000483538 CFAP206Q8IYR0 622 aa8.7□□□□□ -1.02
POLR1A-207ENST00000483538 KRT222Q8N1A0 295 aa8.7□□□□□ -1.02
POLR1A-207ENST00000483538 RCBTB1Q8NDN9 531 aa8.7□□□□□ -1.02
POLR1A-207ENST00000483538 PMEPA1Q969W9 287 aa8.7□□□□□ -1.02
POLR1A-207ENST00000483538 STAMBPL1Q96FJ0 436 aa8.7□□□□□ -1.02
POLR1A-207ENST00000483538 SNF8Q96H20 258 aa8.7□□□□□ -1.02
POLR1A-207ENST00000483538 RUNDC3BQ96NL0 473 aa8.7□□□□□ -1.02
POLR1A-207ENST00000483538 SLC38A3Q99624 504 aa8.7□□□□□ -1.02
POLR1A-207ENST00000483538 TWSG1Q9GZX9 223 aa8.7□□□□□ -1.02
POLR1A-207ENST00000483538 EPB41L5Q9HCM4 733 aa8.7□□□□□ -1.02
POLR1A-207ENST00000483538 IMP3Q9NV31 184 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
POLR1A-207ENST00000483538 SLC17A6Q9P2U8 582 aa8.7□□□□□ -1.02
POLR1A-207ENST00000483538 CDC23Q9UJX2 597 aa8.7□□□□□ -1.02
POLR1A-207ENST00000483538 SNX24Q9Y343 169 aa8.7□□□□□ -1.02
POLR1A-207ENST00000483538 MRFAP1Q9Y605 127 aa8.7□□□□□ -1.02
POLR1A-207ENST00000483538 TEX264Q9Y6I9 313 aa8.7□□□□□ -1.02
POLR1A-207ENST00000483538 RPS6KL1Q9Y6S9 549 aa8.7□□□□□ -1.02
POLR1A-207ENST00000483538 DSPP15924 2871 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
POLR1A-207ENST00000483538 CCDC187A0A096LP49 1063 aa8.69□□□□□ -1.02
POLR1A-207ENST00000483538 KLHL33A6NCF5 533 aa8.69□□□□□ -1.02
POLR1A-207ENST00000483538 EFCAB8A8MWE9 144 aa8.69□□□□□ -1.02
POLR1A-207ENST00000483538 E7ESA3 106 aa8.69□□□□□ -1.02
POLR1A-207ENST00000483538 AGRPO00253 132 aa8.69□□□□□ -1.02
POLR1A-207ENST00000483538 PRMT5O14744 637 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
POLR1A-207ENST00000483538 DUX1O43812 170 aa8.69□□□□□ -1.02
POLR1A-207ENST00000483538 NIPSNAP2O75323 286 aa8.69□□□□□ -1.02
POLR1A-207ENST00000483538 S1PR4O95977 384 aa8.69□□□□□ -1.02
POLR1A-207ENST00000483538 C9P02748 559 aa8.69□□□□□ -1.02
POLR1A-207ENST00000483538 TYRP1P17643 537 aa8.69□□□□□ -1.02
POLR1A-207ENST00000483538 PGAM1P18669 254 aa8.69□□□□□ -1.02
POLR1A-207ENST00000483538 ITIH1P19827 911 aa8.69□□□□□ -1.02
POLR1A-207ENST00000483538 OGNP20774 298 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
POLR1A-207ENST00000483538 RPS3P23396 243 aaKnown RBP eCLIP8.69□□□□□ -1.02
POLR1A-207ENST00000483538 HALP42357 657 aa8.69□□□□□ -1.02
POLR1A-207ENST00000483538 CAPZBP47756 277 aa8.69□□□□□ -1.02
POLR1A-207ENST00000483538 LEPRP48357 1165 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
POLR1A-207ENST00000483538 LSSP48449 732 aa8.69□□□□□ -1.02
POLR1A-207ENST00000483538 TTPAP49638 278 aa8.69□□□□□ -1.02
POLR1A-207ENST00000483538 LIMK2P53671 638 aa8.69□□□□□ -1.02
POLR1A-207ENST00000483538 SARNPP82979 210 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
POLR1A-207ENST00000483538 MPP1Q00013 466 aa8.69□□□□□ -1.02
POLR1A-207ENST00000483538 BOP1Q14137 746 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
POLR1A-207ENST00000483538 GBX1Q14549 363 aa8.69□□□□□ -1.02
POLR1A-207ENST00000483538 CLPPQ16740 277 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
POLR1A-207ENST00000483538 AARS2Q5JTZ9 985 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
POLR1A-207ENST00000483538 HP1BP3Q5SSJ5 553 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
POLR1A-207ENST00000483538 STEAP4Q687X5 459 aa8.69□□□□□ -1.02
POLR1A-207ENST00000483538 ZNF470Q6ECI4 717 aa8.69□□□□□ -1.02
POLR1A-207ENST00000483538 ZNF549Q6P9A3 640 aa8.69□□□□□ -1.02
POLR1A-207ENST00000483538 TRMT10BQ6PF06 316 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
POLR1A-207ENST00000483538 WDR74Q6RFH5 385 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
POLR1A-207ENST00000483538 ZDHHC24Q6UX98 284 aa8.69□□□□□ -1.02
POLR1A-207ENST00000483538 UNC5AQ6ZN44 842 aa8.69□□□□□ -1.02
POLR1A-207ENST00000483538 BMPERQ8N8U9 685 aa8.69□□□□□ -1.02
POLR1A-207ENST00000483538 NOA1Q8NC60 698 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
POLR1A-207ENST00000483538 OR4D9Q8NGE8 314 aa8.69□□□□□ -1.02
POLR1A-207ENST00000483538 GIMAP7Q8NHV1 300 aa8.69□□□□□ -1.02
POLR1A-207ENST00000483538 ELMO1Q92556 727 aa8.69□□□□□ -1.02
POLR1A-207ENST00000483538 TBRG4Q969Z0 631 aaKnown RBP eCLIP8.69□□□□□ -1.02
POLR1A-207ENST00000483538 C12orf66Q96MD2 445 aa8.69□□□□□ -1.02
POLR1A-207ENST00000483538 EBNA1BP2Q99848 306 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
POLR1A-207ENST00000483538 ERP44Q9BS26 406 aa8.69□□□□□ -1.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46.2 ms