RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460766.5

IMP4-208, Transcript of IMP4, U3 small nucleolar ribonucleoprotein, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene IMP4, Length 2,379 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMP4-208ENST00000460766 CLSTN3Q9BQT9 956 aa20.15■□□□□ 0.82
IMP4-208ENST00000460766 MAGEL2Q9UJ55 1249 aa20.15■□□□□ 0.82
IMP4-208ENST00000460766 ANKRD12Q6UB98 2062 aa20.15■□□□□ 0.82
IMP4-208ENST00000460766 C1orf232A0A0U1RR37 186 aa20.14■□□□□ 0.82
IMP4-208ENST00000460766 FFAR3O14843 346 aa20.14■□□□□ 0.82
IMP4-208ENST00000460766 GPR42O15529 346 aa20.14■□□□□ 0.82
IMP4-208ENST00000460766 PGLSO95336 258 aa20.14■□□□□ 0.82
IMP4-208ENST00000460766 SLC2A4P14672 509 aa20.14■□□□□ 0.82
IMP4-208ENST00000460766 CAPGP40121 348 aa20.14■□□□□ 0.82
IMP4-208ENST00000460766 GDF5P43026 501 aa20.14■□□□□ 0.82
IMP4-208ENST00000460766 PIK3CGP48736 1102 aa20.14■□□□□ 0.82
IMP4-208ENST00000460766 RGS4P49798 205 aa20.14■□□□□ 0.82
IMP4-208ENST00000460766 RPS6KA3P51812 740 aa20.14■□□□□ 0.82
IMP4-208ENST00000460766 RPL38P63173 70 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.82
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IMP4-208ENST00000460766 ZNF783Q6ZMS7 281 aa20.14■□□□□ 0.82
IMP4-208ENST00000460766 WFDC5Q8TCV5 224 aa20.14■□□□□ 0.82
IMP4-208ENST00000460766 CGREF1Q99674 301 aa20.14■□□□□ 0.82
IMP4-208ENST00000460766 BDH2Q9BUT1 245 aa20.14■□□□□ 0.82
IMP4-208ENST00000460766 VN1R3Q9BXE9 311 aa20.14■□□□□ 0.82
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IMP4-208ENST00000460766 CD320Q9NPF0 282 aa20.14■□□□□ 0.82
IMP4-208ENST00000460766 ELOVL2Q9NXB9 296 aa20.14■□□□□ 0.82
IMP4-208ENST00000460766 TUBA8Q9NY65 449 aaPredicted RBP20.14■□□□□ 0.82
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IMP4-208ENST00000460766 PTBP2Q9UKA9 531 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.82
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IMP4-208ENST00000460766 PCDHB3Q9Y5E6 796 aa20.14■□□□□ 0.82
IMP4-208ENST00000460766 SLC25A14O95258 325 aaPredicted RBP20.14■□□□□ 0.81
IMP4-208ENST00000460766 SNAP29O95721 258 aa20.14■□□□□ 0.81
IMP4-208ENST00000460766 CYBRD1Q53TN4 286 aa20.14■□□□□ 0.81
IMP4-208ENST00000460766 OTUD3Q5T2D3 398 aaPredicted RBP20.14■□□□□ 0.81
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IMP4-208ENST00000460766 ERI1Q8IV48 349 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.81
IMP4-208ENST00000460766 CRIPAKQ8N1N5 446 aa20.14■□□□□ 0.81
IMP4-208ENST00000460766 DTWD1Q8N5C7 304 aa20.14■□□□□ 0.81
IMP4-208ENST00000460766 PDPRQ8NCN5 879 aa20.14■□□□□ 0.81
IMP4-208ENST00000460766 ZNF461Q8TAF7 563 aa20.14■□□□□ 0.81
IMP4-208ENST00000460766 PIH1D2Q8WWB5 315 aa20.14■□□□□ 0.81
IMP4-208ENST00000460766 FAM126AQ9BYI3 521 aaPredicted RBP20.14■□□□□ 0.81
IMP4-208ENST00000460766 TIMMDC1Q9NPL8 285 aa20.14■□□□□ 0.81
IMP4-208ENST00000460766 YIPF1Q9Y548 306 aa20.14■□□□□ 0.81
IMP4-208ENST00000460766 BACE2Q9Y5Z0 518 aa20.14■□□□□ 0.81
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IMP4-208ENST00000460766 CASP8AP2Q9UKL3 1982 aa20.14■□□□□ 0.81
IMP4-208ENST00000460766 RBFAQ8N0V3 343 aa20.13■□□□□ 0.81
IMP4-208ENST00000460766 C17orf80Q9BSJ5 609 aa20.13■□□□□ 0.81
IMP4-208ENST00000460766 EVLQ9UI08 416 aaPredicted RBP20.13■□□□□ 0.81
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IMP4-208ENST00000460766 GRXCR2A6NFK2 248 aa20.13■□□□□ 0.81
IMP4-208ENST00000460766 A8MX80 341 aa20.13■□□□□ 0.81
IMP4-208ENST00000460766 GAPDHSO14556 408 aaPredicted RBP20.13■□□□□ 0.81
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IMP4-208ENST00000460766 TAPBPO15533 448 aa20.13■□□□□ 0.81
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IMP4-208ENST00000460766 TMEM214Q6NUQ4 689 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
IMP4-208ENST00000460766 TBPL2Q6SJ96 375 aa20.13■□□□□ 0.81
IMP4-208ENST00000460766 CLVS1Q8IUQ0 354 aaPredicted RBP20.13■□□□□ 0.81
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IMP4-208ENST00000460766 SCLYQ96I15 445 aa20.13■□□□□ 0.81
IMP4-208ENST00000460766 SLC22A12Q96S37 553 aa20.13■□□□□ 0.81
IMP4-208ENST00000460766 SEZ6LQ9BYH1 1024 aa20.13■□□□□ 0.81
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IMP4-208ENST00000460766 HEMK1Q9Y5R4 338 aaPredicted RBP20.12■□□□□ 0.81
IMP4-208ENST00000460766 ANKRD33BA6NCL7 494 aa20.12■□□□□ 0.81
IMP4-208ENST00000460766 SMAD6O43541 496 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
IMP4-208ENST00000460766 CLDN7O95471 211 aa20.12■□□□□ 0.81
IMP4-208ENST00000460766 GLUD1P00367 558 aa20.12■□□□□ 0.81
IMP4-208ENST00000460766 PCNAP12004 261 aa20.12■□□□□ 0.81
IMP4-208ENST00000460766 JAK1P23458 1154 aa20.12■□□□□ 0.81
IMP4-208ENST00000460766 VEPH1Q14D04 833 aa20.12■□□□□ 0.81
IMP4-208ENST00000460766 PRR23BQ6ZRT6 265 aa20.12■□□□□ 0.81
IMP4-208ENST00000460766 SNX20Q7Z614 316 aa20.12■□□□□ 0.81
IMP4-208ENST00000460766 BPIFB1Q8TDL5 484 aa20.12■□□□□ 0.81
IMP4-208ENST00000460766 PHF12Q96QT6 1004 aa20.12■□□□□ 0.81
IMP4-208ENST00000460766 IL26Q9NPH9 171 aa20.12■□□□□ 0.81
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