RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460170.2

PTPRU-205, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type U, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRU, Length 5,337 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRU-205ENST00000460170 SLAIN1Q8ND83 568 aa14.56□□□□□ -0.08
PTPRU-205ENST00000460170 CNOT6Q9ULM6 557 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
PTPRU-205ENST00000460170 MYH15Q9Y2K3 1946 aa14.56□□□□□ -0.08
PTPRU-205ENST00000460170 AP3D1O14617 1153 aa14.56□□□□□ -0.08
PTPRU-205ENST00000460170 FADS2O95864 444 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
PTPRU-205ENST00000460170 MED27Q6P2C8 311 aa14.56□□□□□ -0.08
PTPRU-205ENST00000460170 CILP2Q8IUL8 1156 aa14.56□□□□□ -0.08
PTPRU-205ENST00000460170 ENDOVQ8N8Q3 282 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
PTPRU-205ENST00000460170 TSGA13Q96PP4 275 aa14.56□□□□□ -0.08
PTPRU-205ENST00000460170 SLC2A13Q96QE2 648 aa14.56□□□□□ -0.08
PTPRU-205ENST00000460170 CYP2S1Q96SQ9 504 aa14.56□□□□□ -0.08
PTPRU-205ENST00000460170 HEPHQ9BQS7 1158 aa14.56□□□□□ -0.08
PTPRU-205ENST00000460170 WDR12Q9GZL7 423 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
PTPRU-205ENST00000460170 GALPQ9UBC7 116 aa14.56□□□□□ -0.08
PTPRU-205ENST00000460170 SH3GLB1Q9Y371 365 aa14.56□□□□□ -0.08
PTPRU-205ENST00000460170 UBR2Q8IWV8 1755 aa14.56□□□□□ -0.08
PTPRU-205ENST00000460170 PDE4DIPQ5VU43 2346 aa14.56□□□□□ -0.08
PTPRU-205ENST00000460170 TCF3P15923 654 aa14.56□□□□□ -0.08
PTPRU-205ENST00000460170 TCEA2Q15560 299 aa14.56□□□□□ -0.08
PTPRU-205ENST00000460170 MS4A13Q5J8X5 152 aa14.56□□□□□ -0.08
PTPRU-205ENST00000460170 CYS1Q717R9 158 aa14.56□□□□□ -0.08
PTPRU-205ENST00000460170 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
PTPRU-205ENST00000460170 HID1Q8IV36 788 aa14.56□□□□□ -0.08
PTPRU-205ENST00000460170 TOP1MTQ969P6 601 aa14.56□□□□□ -0.08
PTPRU-205ENST00000460170 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa14.56□□□□□ -0.08
PTPRU-205ENST00000460170 PAPSS2O95340 614 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
PTPRU-205ENST00000460170 PRKCGP05129 697 aa14.56□□□□□ -0.08
PTPRU-205ENST00000460170 PROZP22891 400 aa14.56□□□□□ -0.08
PTPRU-205ENST00000460170 CSKP41240 450 aa14.56□□□□□ -0.08
PTPRU-205ENST00000460170 TMC5Q6UXY8 1006 aa14.56□□□□□ -0.08
PTPRU-205ENST00000460170 CACTIN-AS1Q8N1I8 211 aa14.56□□□□□ -0.08
PTPRU-205ENST00000460170 BEND7Q8N7W2 519 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
PTPRU-205ENST00000460170 C2CD4AQ8NCU7 369 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
PTPRU-205ENST00000460170 MCFD2Q8NI22 146 aa14.56□□□□□ -0.08
PTPRU-205ENST00000460170 FAM81AQ8TBF8 368 aa14.56□□□□□ -0.08
PTPRU-205ENST00000460170 UBASH3BQ8TF42 649 aa14.56□□□□□ -0.08
PTPRU-205ENST00000460170 CDK15Q96Q40 435 aa14.56□□□□□ -0.08
PTPRU-205ENST00000460170 SLC39A3Q9BRY0 314 aa14.56□□□□□ -0.08
PTPRU-205ENST00000460170 MRM3Q9HC36 420 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
PTPRU-205ENST00000460170 TLL1O43897 1013 aa14.56□□□□□ -0.08
PTPRU-205ENST00000460170 PRNPP04156 253 aa14.56□□□□□ -0.08
PTPRU-205ENST00000460170 MTHFD1P11586 935 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
PTPRU-205ENST00000460170 PSMA3P25788 255 aa14.56□□□□□ -0.08
PTPRU-205ENST00000460170 STX4Q12846 297 aa14.56□□□□□ -0.08
PTPRU-205ENST00000460170 RFTN2Q52LD8 501 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
PTPRU-205ENST00000460170 GCNT6Q5T4J0 391 aa14.56□□□□□ -0.08
PTPRU-205ENST00000460170 MACC1Q6ZN28 852 aa14.56□□□□□ -0.08
PTPRU-205ENST00000460170 CRISPLD1Q9H336 500 aa14.56□□□□□ -0.08
PTPRU-205ENST00000460170 IMP3Q9NV31 184 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
PTPRU-205ENST00000460170 TOR4AQ9NXH8 423 aa14.56□□□□□ -0.08
PTPRU-205ENST00000460170 CIDEBQ9UHD4 219 aa14.56□□□□□ -0.08
PTPRU-205ENST00000460170 KCTD3Q9Y597 815 aa14.56□□□□□ -0.08
PTPRU-205ENST00000460170 URADA6NGE7 173 aa14.55□□□□□ -0.08
PTPRU-205ENST00000460170 TNFRSF11BO00300 401 aa14.55□□□□□ -0.08
PTPRU-205ENST00000460170 EI24O14681 340 aa14.55□□□□□ -0.08
PTPRU-205ENST00000460170 FGBP02675 491 aa14.55□□□□□ -0.08
PTPRU-205ENST00000460170 GALK1P51570 392 aa14.55□□□□□ -0.08
PTPRU-205ENST00000460170 SRSF11Q05519 484 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
PTPRU-205ENST00000460170 TPGS2Q68CL5 300 aa14.55□□□□□ -0.08
PTPRU-205ENST00000460170 CFAP206Q8IYR0 622 aa14.55□□□□□ -0.08
PTPRU-205ENST00000460170 AHI1Q8N157 1196 aa14.55□□□□□ -0.08
PTPRU-205ENST00000460170 KLHL32Q96NJ5 620 aa14.55□□□□□ -0.08
PTPRU-205ENST00000460170 NODALQ96S42 347 aa14.55□□□□□ -0.08
PTPRU-205ENST00000460170 EBPLQ9BY08 206 aa14.55□□□□□ -0.08
PTPRU-205ENST00000460170 PCDHGA11Q9Y5H2 935 aa14.55□□□□□ -0.08
PTPRU-205ENST00000460170 MAGEB17A8MXT2 336 aa14.55□□□□□ -0.08
PTPRU-205ENST00000460170 BHMG1C9JSJ3 638 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
PTPRU-205ENST00000460170 NR2F6P10588 404 aa14.55□□□□□ -0.08
PTPRU-205ENST00000460170 UGT1A6P19224 532 aa14.55□□□□□ -0.08
PTPRU-205ENST00000460170 UGT1A1P22309 533 aa14.55□□□□□ -0.08
PTPRU-205ENST00000460170 UGT1A4P22310 534 aa14.55□□□□□ -0.08
PTPRU-205ENST00000460170 UGT1A3P35503 534 aa14.55□□□□□ -0.08
PTPRU-205ENST00000460170 UGT1A5P35504 534 aa14.55□□□□□ -0.08
PTPRU-205ENST00000460170 SOX4Q06945 474 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
PTPRU-205ENST00000460170 HLA-DQA1Q5Y7H0 255 aa14.55□□□□□ -0.08
PTPRU-205ENST00000460170 DNAJB8Q8NHS0 232 aa14.55□□□□□ -0.08
PTPRU-205ENST00000460170 FCRL3Q96P31 734 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
PTPRU-205ENST00000460170 FANCEQ9HB96 536 aa14.55□□□□□ -0.08
PTPRU-205ENST00000460170 DNAJB9Q9UBS3 223 aa14.55□□□□□ -0.08
PTPRU-205ENST00000460170 ADAMTS5Q9UNA0 930 aa14.55□□□□□ -0.08
PTPRU-205ENST00000460170 PDE10AQ9Y233 779 aa14.55□□□□□ -0.08
PTPRU-205ENST00000460170 ENPP3O14638 875 aa14.55□□□□□ -0.08
PTPRU-205ENST00000460170 CNTN5O94779 1100 aa14.55□□□□□ -0.08
PTPRU-205ENST00000460170 CTSEP14091 401 aa14.55□□□□□ -0.08
PTPRU-205ENST00000460170 MERTKQ12866 999 aa14.55□□□□□ -0.08
PTPRU-205ENST00000460170 SERINC3Q13530 473 aa14.55□□□□□ -0.08
PTPRU-205ENST00000460170 CES5AQ6NT32 575 aa14.55□□□□□ -0.08
PTPRU-205ENST00000460170 ZDHHC21Q8IVQ6 265 aa14.55□□□□□ -0.08
PTPRU-205ENST00000460170 SPRTNQ9H040 489 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
PTPRU-205ENST00000460170 CD320Q9NPF0 282 aa14.55□□□□□ -0.08
PTPRU-205ENST00000460170 TMEM248Q9NWD8 314 aa14.55□□□□□ -0.08
PTPRU-205ENST00000460170 RUVBL1Q9Y265 456 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
PTPRU-205ENST00000460170 BEST1O76090 585 aa14.55□□□□□ -0.08
PTPRU-205ENST00000460170 CCR3P51677 355 aa14.55□□□□□ -0.08
PTPRU-205ENST00000460170 COPZ1P61923 177 aa14.55□□□□□ -0.08
PTPRU-205ENST00000460170 GHRHRQ02643 423 aa14.55□□□□□ -0.08
PTPRU-205ENST00000460170 RGS1Q08116 209 aa14.55□□□□□ -0.08
PTPRU-205ENST00000460170 ZNHIT3Q15649 155 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
PTPRU-205ENST00000460170 CNPY1Q3B7I2 92 aa14.55□□□□□ -0.08
PTPRU-205ENST00000460170 DEPDC7Q96QD5 511 aa14.55□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.6 ms