RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439720.3

RABGEF1-203, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RABGEF1, Length 3,065 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-203ENST00000439720 EFCAB9A8MZ26 197 aa8.29□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 AGRPO00253 132 aa8.29□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 NFIBO00712 420 aa8.29□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 CTDSP2O14595 271 aa8.29□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 DNAJB5O75953 348 aa8.29□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 FADS2O95864 444 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 TSPAN8P19075 237 aa8.29□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 RAP1GAPP47736 663 aa8.29□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 NR2C2P49116 596 aa8.29□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 ZNF143P52747 638 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 PPP1R8Q12972 351 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 SPANXN3Q5MJ09 141 aa8.29□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 VARS2Q5ST30 1063 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 CLEC6AQ6EIG7 209 aa8.29□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 CRTC1Q6UUV9 634 aa8.29□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 ABI1Q8IZP0 508 aa8.29□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 TCAIMQ8N3R3 496 aa8.29□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 TXNDC5Q8NBS9 432 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 OR52K1Q8NGK4 314 aa8.29□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 CD99L2Q8TCZ2 262 aa8.29□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 UTP15Q8TED0 518 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 RADILQ96JH8 1075 aa8.29□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 NEDD4LQ96PU5 975 aa8.29□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 PSKH2Q96QS6 385 aa8.29□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 CGRRF1Q99675 332 aa8.29□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 BCL7BQ9BQE9 202 aa8.29□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 SNRNP25Q9BV90 132 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 TEKT2Q9UIF3 430 aa8.29□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 ALPK3Q96L96 1907 aa8.29□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 MN1Q10571 1320 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 ATP6V1G2-DDX39BF2Z307 99 aa8.29□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 TRIM77I1YAP6 450 aa8.29□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 TFECO14948 347 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 SHOXO15266 292 aa8.29□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 NOS1APO75052 506 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 ASS1P00966 412 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 GJB1P08034 283 aa8.29□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 PSMB4P28070 264 aa8.29□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 PLK1P53350 603 aa8.29□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 PRKCEQ02156 737 aa8.29□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 SLAMF1Q13291 335 aa8.29□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 KCNAB2Q13303 367 aa8.29□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 SNTA1Q13424 505 aa8.29□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 TARBP2Q15633 366 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 PNCKQ6P2M8 343 aa8.29□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 KCTD20Q7Z5Y7 419 aa8.29□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 GPR142Q7Z601 462 aa8.29□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 NRARPQ7Z6K4 114 aa8.29□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 ZBTB33Q86T24 672 aa8.29□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 MICU2Q8IYU8 434 aa8.29□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 CENPLQ8N0S6 344 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 GLB1L3Q8NCI6 653 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 LRRC20Q8TCA0 184 aa8.29□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 ITCHQ96J02 903 aa8.29□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 HEXIM2Q96MH2 286 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 NECTIN4Q96NY8 510 aa8.29□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 ASB2Q96Q27 587 aa8.29□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 MBOAT4Q96T53 435 aa8.29□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 LGMNQ99538 433 aa8.29□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 GDF15Q99988 308 aa8.29□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 FEM1AQ9BSK4 669 aa8.29□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 CNPY3Q9BT09 278 aa8.29□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 NAT9Q9BTE0 207 aa8.29□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 NUAK2Q9H093 628 aa8.29□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 MMP27Q9H306 513 aa8.29□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 TMEM134Q9H6X4 195 aa8.29□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 EHD3Q9NZN3 535 aa8.29□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 CDV3Q9UKY7 258 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 HCN4Q9Y3Q4 1203 aa8.29□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 TRIP11Q15643 1979 aa8.28□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 A0A0A0MRY4 1105 aa8.28□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 METTL15A6NJ78 407 aa8.28□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 OGTO15294 1046 aa8.28□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 ALDOCP09972 364 aaKnown RBP8.28□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 FMO3P31513 532 aa8.28□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 MAPK8P45983 427 aa8.28□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 AP2S1P53680 142 aaPredicted RBP8.28□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 TARDBPQ13148 414 aaKnown RBP eCLIP8.28□□□□□ -1.083e-8■■■□□ 15.8
RABGEF1-203ENST00000439720 KRR1Q13601 381 aaKnown RBP8.28□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 CLCA4Q14CN2 919 aa8.28□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 TRIP4Q15650 581 aaPredicted RBP8.28□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 UGT3A2Q3SY77 523 aa8.28□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 TOR2AQ5JU69 321 aa8.28□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 GLYATQ6IB77 296 aa8.28□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 PRMT9Q6P2P2 845 aa8.28□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 ZNF517Q6ZMY9 492 aaPredicted RBP8.28□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 PRSS48Q7RTY5 328 aa8.28□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 SPATA2LQ8IUW3 424 aaPredicted RBP8.28□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 SLC41A1Q8IVJ1 513 aa8.28□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 CCDC116Q8IYX3 515 aa8.28□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 POF1BQ8WVV4 589 aa8.28□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 HTR3CQ8WXA8 447 aa8.28□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 LRRC58Q96CX6 371 aa8.28□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 CEP170P1Q96L14 293 aa8.28□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 UBXN10Q96LJ8 280 aa8.28□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 SPATA13Q96N96 652 aa8.28□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 RHNO1Q9BSD3 238 aa8.28□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 MSTO1Q9BUK6 570 aa8.28□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 ROGDIQ9GZN7 287 aa8.28□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 NIF3L1Q9GZT8 377 aa8.28□□□□□ -1.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.3 ms