RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000376854.5

C9orf40-201, Transcript of chromosome 9 open reading frame 40, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene C9orf40, Length 2,327 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf40-201ENST00000376854 HMOX2P30519 316 aa24.9■■□□□ 1.58
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C9orf40-201ENST00000376854 PRSS23O95084 383 aa24.89■■□□□ 1.58
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C9orf40-201ENST00000376854 GUCA1CO95843 209 aa24.88■■□□□ 1.57
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C9orf40-201ENST00000376854 THAP11Q96EK4 314 aa24.88■■□□□ 1.57
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C9orf40-201ENST00000376854 ANKS3Q6ZW76 656 aa24.87■■□□□ 1.57
C9orf40-201ENST00000376854 AADATQ8N5Z0 425 aa24.87■■□□□ 1.57
C9orf40-201ENST00000376854 PDPRQ8NCN5 879 aa24.87■■□□□ 1.57
C9orf40-201ENST00000376854 FNDC8Q8TC99 324 aa24.87■■□□□ 1.57
C9orf40-201ENST00000376854 SLC13A3Q8WWT9 602 aa24.87■■□□□ 1.57
C9orf40-201ENST00000376854 FIG4Q92562 907 aa24.87■■□□□ 1.57
C9orf40-201ENST00000376854 ABTB1Q969K4 478 aaPredicted RBP24.87■■□□□ 1.57
C9orf40-201ENST00000376854 CIPCQ9C0C6 399 aa24.87■■□□□ 1.57
C9orf40-201ENST00000376854 CWH43Q9H720 699 aa24.87■■□□□ 1.57
C9orf40-201ENST00000376854 STARD7Q9NQZ5 370 aa24.87■■□□□ 1.57
C9orf40-201ENST00000376854 ZNHIT2Q9UHR6 403 aa24.87■■□□□ 1.57
C9orf40-201ENST00000376854 A0A1W2PPW3 197 aa24.87■■□□□ 1.57
C9orf40-201ENST00000376854 THRBP10828 461 aa24.87■■□□□ 1.57
C9orf40-201ENST00000376854 COL6A1P12109 1028 aa24.87■■□□□ 1.57
C9orf40-201ENST00000376854 ITGB6P18564 788 aa24.87■■□□□ 1.57
C9orf40-201ENST00000376854 KIAA0040Q15053 153 aa24.87■■□□□ 1.57
C9orf40-201ENST00000376854 ADGRF1Q5T601 910 aa24.87■■□□□ 1.57
C9orf40-201ENST00000376854 ZNF773Q6PK81 442 aa24.87■■□□□ 1.57
C9orf40-201ENST00000376854 EGFL6Q8IUX8 553 aa24.87■■□□□ 1.57
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