RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000367379.5

PTPRC-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRC, Length 517 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-204ENST00000367379 FBXO38Q6PIJ6 1188 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRC-204ENST00000367379 MEX3BQ6ZN04 569 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
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PTPRC-204ENST00000367379 APPL2Q8NEU8 664 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRC-204ENST00000367379 PJA1Q8NG27 643 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRC-204ENST00000367379 ZNF461Q8TAF7 563 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRC-204ENST00000367379 CLEC4CQ8WTT0 213 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRC-204ENST00000367379 FGF13Q92913 245 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRC-204ENST00000367379 TBCBQ99426 244 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRC-204ENST00000367379 DDX19AQ9NUU7 478 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
PTPRC-204ENST00000367379 MTRRQ9UBK8 725 aa4.85□□□□□ -1.63
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PTPRC-204ENST00000367379 ANKRD11Q6UB99 2663 aaPredicted RBP4.84□□□□□ -1.63
PTPRC-204ENST00000367379 ARHGEF37A1IGU5 675 aa4.84□□□□□ -1.63
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PTPRC-204ENST00000367379 ECI2O75521 394 aa4.84□□□□□ -1.63
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PTPRC-204ENST00000367379 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP4.84□□□□□ -1.63
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PTPRC-204ENST00000367379 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP4.84□□□□□ -1.63
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PTPRC-204ENST00000367379 ZNF852Q6ZMS4 543 aa4.84□□□□□ -1.63
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PTPRC-204ENST00000367379 RILPL1Q5EBL4 403 aa4.83□□□□□ -1.64
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PTPRC-204ENST00000367379 ZNF280DQ6N043 979 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRC-204ENST00000367379 RINT1Q6NUQ1 792 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRC-204ENST00000367379 SLC30A9Q6PML9 568 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRC-204ENST00000367379 C1orf186Q6ZWK4 172 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRC-204ENST00000367379 TBC1D3Q8IZP1 549 aaPredicted RBP4.83□□□□□ -1.64
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