RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000365430.1

RNU6-487P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 487, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-487P, Length 104 nt, Biotype snRNA, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-487P-201ENST00000365430 NME6O75414 186 aaPredicted RBP2.51□□□□□ -2.01
RNU6-487P-201ENST00000365430 SLU7O95391 586 aaKnown RBP2.51□□□□□ -2.01
RNU6-487P-201ENST00000365430 PMS2P2O95744 297 aa2.51□□□□□ -2.01
RNU6-487P-201ENST00000365430 LINGO3P0C6S8 592 aa2.51□□□□□ -2.01
RNU6-487P-201ENST00000365430 TMEM191BP0C7N4 346 aa2.51□□□□□ -2.01
RNU6-487P-201ENST00000365430 FAM58BPP0C7Q3 252 aa2.51□□□□□ -2.01
RNU6-487P-201ENST00000365430 SUPT20HL2P0C7V6 817 aa2.51□□□□□ -2.01
RNU6-487P-201ENST00000365430 SMIM18P0DKX4 95 aa2.51□□□□□ -2.01
RNU6-487P-201ENST00000365430 PDGFRAP16234 1089 aa2.51□□□□□ -2.01
RNU6-487P-201ENST00000365430 POLR2CP19387 275 aaPredicted RBP2.51□□□□□ -2.01
RNU6-487P-201ENST00000365430 JAK1P23458 1154 aa2.51□□□□□ -2.01
RNU6-487P-201ENST00000365430 CTNNA1P35221 906 aaKnown RBP2.51□□□□□ -2.01
RNU6-487P-201ENST00000365430 COPB2P35606 906 aa2.51□□□□□ -2.01
RNU6-487P-201ENST00000365430 AMPHP49418 695 aa2.51□□□□□ -2.01
RNU6-487P-201ENST00000365430 MMP15P51511 669 aa2.51□□□□□ -2.01
RNU6-487P-201ENST00000365430 MAPK12P53778 367 aa2.51□□□□□ -2.01
RNU6-487P-201ENST00000365430 CDK3Q00526 305 aa2.51□□□□□ -2.01
RNU6-487P-201ENST00000365430 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP2.51□□□□□ -2.01
RNU6-487P-201ENST00000365430 E2F5Q15329 346 aa2.51□□□□□ -2.01
RNU6-487P-201ENST00000365430 ARMC4Q5T2S8 1044 aa2.51□□□□□ -2.01
RNU6-487P-201ENST00000365430 PIWIL3Q7Z3Z3 882 aaKnown RBP2.51□□□□□ -2.01
RNU6-487P-201ENST00000365430 IQCA1Q86XH1 822 aa2.51□□□□□ -2.01
RNU6-487P-201ENST00000365430 ARHGAP24Q8N264 748 aa2.51□□□□□ -2.01
RNU6-487P-201ENST00000365430 CLIP4Q8N3C7 705 aa2.51□□□□□ -2.01
RNU6-487P-201ENST00000365430 GCSAMQ8N6F7 178 aa2.51□□□□□ -2.01
RNU6-487P-201ENST00000365430 IQUBQ8NA54 791 aa2.51□□□□□ -2.01
RNU6-487P-201ENST00000365430 KBTBD3Q8NAB2 608 aa2.51□□□□□ -2.01
RNU6-487P-201ENST00000365430 SYN2Q92777 582 aaPredicted RBP2.51□□□□□ -2.01
RNU6-487P-201ENST00000365430 NEUROG1Q92886 237 aa2.51□□□□□ -2.01
RNU6-487P-201ENST00000365430 DAZLQ92904 295 aaKnown RBP2.51□□□□□ -2.01
RNU6-487P-201ENST00000365430 SPSB1Q96BD6 273 aa2.51□□□□□ -2.01
RNU6-487P-201ENST00000365430 CCDC34Q96HJ3 373 aa2.51□□□□□ -2.01
RNU6-487P-201ENST00000365430 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP2.51□□□□□ -2.01
RNU6-487P-201ENST00000365430 MUS81Q96NY9 551 aa2.51□□□□□ -2.01
RNU6-487P-201ENST00000365430 QRFPRQ96P65 431 aa2.51□□□□□ -2.01
RNU6-487P-201ENST00000365430 CPNE1Q99829 537 aa2.51□□□□□ -2.01
RNU6-487P-201ENST00000365430 SLX1AQ9BQ83 275 aa2.51□□□□□ -2.01
RNU6-487P-201ENST00000365430 SF3B5Q9BWJ5 86 aaKnown RBP2.51□□□□□ -2.01
RNU6-487P-201ENST00000365430 TMEM39BQ9GZU3 492 aa2.51□□□□□ -2.01
RNU6-487P-201ENST00000365430 GAREM1Q9H706 876 aa2.51□□□□□ -2.01
RNU6-487P-201ENST00000365430 ZWILCHQ9H900 591 aa2.51□□□□□ -2.01
RNU6-487P-201ENST00000365430 HHATLQ9HCP6 504 aa2.51□□□□□ -2.01
RNU6-487P-201ENST00000365430 ZNF224Q9NZL3 707 aa2.51□□□□□ -2.01
RNU6-487P-201ENST00000365430 WNT16Q9UBV4 365 aa2.51□□□□□ -2.01
RNU6-487P-201ENST00000365430 GTF3C4Q9UKN8 822 aa2.51□□□□□ -2.01
RNU6-487P-201ENST00000365430 PADI2Q9Y2J8 665 aa2.51□□□□□ -2.01
RNU6-487P-201ENST00000365430 ZFP37Q9Y6Q3 630 aaPredicted RBP2.51□□□□□ -2.01
RNU6-487P-201ENST00000365430 A0A0U1RQK1 487 aa2.5□□□□□ -2.01
RNU6-487P-201ENST00000365430 ZNF320A2RRD8 509 aa2.5□□□□□ -2.01
RNU6-487P-201ENST00000365430 HYKKA2RU49 373 aa2.5□□□□□ -2.01
RNU6-487P-201ENST00000365430 ASPDHA6ND91 283 aa2.5□□□□□ -2.01
RNU6-487P-201ENST00000365430 CD8B2A6NJW9 211 aa2.5□□□□□ -2.01
RNU6-487P-201ENST00000365430 ENO4A6NNW6 628 aa2.5□□□□□ -2.01
RNU6-487P-201ENST00000365430 ST8SIA3O43173 380 aa2.5□□□□□ -2.01
RNU6-487P-201ENST00000365430 AP5Z1O43299 807 aa2.5□□□□□ -2.01
RNU6-487P-201ENST00000365430 RFPL2O75678 378 aa2.5□□□□□ -2.01
RNU6-487P-201ENST00000365430 BMP10O95393 424 aa2.5□□□□□ -2.01
RNU6-487P-201ENST00000365430 LIPFP07098 398 aa2.5□□□□□ -2.01
RNU6-487P-201ENST00000365430 SRCP12931 536 aa2.5□□□□□ -2.01
RNU6-487P-201ENST00000365430 SCG2P13521 617 aa2.5□□□□□ -2.01
RNU6-487P-201ENST00000365430 CD27P26842 260 aa2.5□□□□□ -2.01
RNU6-487P-201ENST00000365430 OAS2P29728 719 aaKnown RBP2.5□□□□□ -2.01
RNU6-487P-201ENST00000365430 HOXC8P31273 242 aa2.5□□□□□ -2.01
RNU6-487P-201ENST00000365430 PCGF2P35227 344 aa2.5□□□□□ -2.01
RNU6-487P-201ENST00000365430 FASLGP48023 281 aa2.5□□□□□ -2.01
RNU6-487P-201ENST00000365430 HTR6P50406 440 aa2.5□□□□□ -2.01
RNU6-487P-201ENST00000365430 RAD23BP54727 409 aa2.5□□□□□ -2.01
RNU6-487P-201ENST00000365430 PTENP60484 403 aa2.5□□□□□ -2.01
RNU6-487P-201ENST00000365430 POLR2LP62875 67 aaKnown RBP2.5□□□□□ -2.01
RNU6-487P-201ENST00000365430 BFSP1Q12934 665 aa2.5□□□□□ -2.01
RNU6-487P-201ENST00000365430 DLG1Q12959 904 aa2.5□□□□□ -2.01
RNU6-487P-201ENST00000365430 HSPB3Q12988 150 aa2.5□□□□□ -2.01
RNU6-487P-201ENST00000365430 ZBTB17Q13105 803 aa2.5□□□□□ -2.01
RNU6-487P-201ENST00000365430 PTK6Q13882 451 aa2.5□□□□□ -2.01
RNU6-487P-201ENST00000365430 SF3B4Q15427 424 aaKnown RBP eCLIP2.5□□□□□ -2.01
RNU6-487P-201ENST00000365430 UGP2Q16851 508 aa2.5□□□□□ -2.01
RNU6-487P-201ENST00000365430 ZNF674Q2M3X9 581 aa2.5□□□□□ -2.01
RNU6-487P-201ENST00000365430 TCTE1Q5JU00 501 aa2.5□□□□□ -2.01
RNU6-487P-201ENST00000365430 GCNT6Q5T4J0 391 aa2.5□□□□□ -2.01
RNU6-487P-201ENST00000365430 GRTP1Q5TC63 336 aa2.5□□□□□ -2.01
RNU6-487P-201ENST00000365430 FAM171BQ6P995 826 aa2.5□□□□□ -2.01
RNU6-487P-201ENST00000365430 PLXDC2Q6UX71 529 aa2.5□□□□□ -2.01
RNU6-487P-201ENST00000365430 ZNF517Q6ZMY9 492 aaPredicted RBP2.5□□□□□ -2.01
RNU6-487P-201ENST00000365430 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP2.5□□□□□ -2.01
RNU6-487P-201ENST00000365430 TMEM182Q6ZP80 229 aaPredicted RBP2.5□□□□□ -2.01
RNU6-487P-201ENST00000365430 ASB18Q6ZVZ8 466 aa2.5□□□□□ -2.01
RNU6-487P-201ENST00000365430 ERN2Q76MJ5 926 aaKnown RBP2.5□□□□□ -2.01
RNU6-487P-201ENST00000365430 OTOAQ7RTW8 1153 aa2.5□□□□□ -2.01
RNU6-487P-201ENST00000365430 ARHGAP22Q7Z5H3 698 aa2.5□□□□□ -2.01
RNU6-487P-201ENST00000365430 SLC9B2Q86UD5 537 aa2.5□□□□□ -2.01
RNU6-487P-201ENST00000365430 METTL23Q86XA0 190 aa2.5□□□□□ -2.01
RNU6-487P-201ENST00000365430 CFAP206Q8IYR0 622 aa2.5□□□□□ -2.01
RNU6-487P-201ENST00000365430 NAT8LQ8N9F0 302 aa2.5□□□□□ -2.01
RNU6-487P-201ENST00000365430 LMNTD1Q8N9Z9 388 aa2.5□□□□□ -2.01
RNU6-487P-201ENST00000365430 TSPAN14Q8NG11 270 aa2.5□□□□□ -2.01
RNU6-487P-201ENST00000365430 LILRB1Q8NHL6 650 aaPredicted RBP2.5□□□□□ -2.01
RNU6-487P-201ENST00000365430 B4GALNT2Q8NHY0 566 aa2.5□□□□□ -2.01
RNU6-487P-201ENST00000365430 SPATA20Q8TB22 786 aa2.5□□□□□ -2.01
RNU6-487P-201ENST00000365430 TRAF3IP1Q8TDR0 691 aaPredicted RBP2.5□□□□□ -2.01
RNU6-487P-201ENST00000365430 CORO2AQ92828 525 aa2.5□□□□□ -2.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.5 ms