RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000331222.5

CLN8-201, Transcript of CLN8, transmembrane ER and ERGIC protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CLN8, Length 7,169 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN8-201ENST00000331222 PTDSS1P48651 473 aaKnown RBP10.44□□□□□ -0.74
CLN8-201ENST00000331222 PER3P56645 1201 aa10.44□□□□□ -0.74
CLN8-201ENST00000331222 ZMYND11Q15326 602 aa10.44□□□□□ -0.74
CLN8-201ENST00000331222 KLHL26Q53HC5 615 aa10.44□□□□□ -0.74
CLN8-201ENST00000331222 DCST1Q5T197 706 aa10.44□□□□□ -0.74
CLN8-201ENST00000331222 FUT10Q6P4F1 479 aa10.44□□□□□ -0.74
CLN8-201ENST00000331222 TXNDC11Q6PKC3 985 aa10.44□□□□□ -0.74
CLN8-201ENST00000331222 THAP5Q7Z6K1 395 aa10.44□□□□□ -0.74
CLN8-201ENST00000331222 TMC8Q8IU68 726 aa10.44□□□□□ -0.74
CLN8-201ENST00000331222 SYNPOQ8N3V7 929 aa10.44□□□□□ -0.74
CLN8-201ENST00000331222 BOLLQ8N9W6 283 aaKnown RBP10.44□□□□□ -0.74
CLN8-201ENST00000331222 STK32AQ8WU08 396 aa10.44□□□□□ -0.74
CLN8-201ENST00000331222 PIWIL1Q96J94 861 aaKnown RBP10.44□□□□□ -0.74
CLN8-201ENST00000331222 KXD1Q9BQD3 176 aa10.44□□□□□ -0.74
CLN8-201ENST00000331222 TBC1D10AQ9BXI6 508 aa10.44□□□□□ -0.74
CLN8-201ENST00000331222 PRDM8Q9NQV8 689 aa10.44□□□□□ -0.74
CLN8-201ENST00000331222 KCTD5Q9NXV2 234 aa10.44□□□□□ -0.74
CLN8-201ENST00000331222 FBXO5Q9UKT4 447 aa10.44□□□□□ -0.74
CLN8-201ENST00000331222 DLC1Q96QB1 1528 aa10.44□□□□□ -0.74
CLN8-201ENST00000331222 FAM149AA5PLN7 773 aa10.44□□□□□ -0.74
CLN8-201ENST00000331222 ZNF726A6NNF4 738 aa10.44□□□□□ -0.74
CLN8-201ENST00000331222 TSPAN1O60635 241 aa10.44□□□□□ -0.74
CLN8-201ENST00000331222 AOC2O75106 756 aa10.44□□□□□ -0.74
CLN8-201ENST00000331222 GOT2P00505 430 aaKnown RBP10.44□□□□□ -0.74
CLN8-201ENST00000331222 PRLRP16471 622 aa10.44□□□□□ -0.74
CLN8-201ENST00000331222 ACTR3P61158 418 aa10.44□□□□□ -0.74
CLN8-201ENST00000331222 SLC25A52Q3SY17 297 aa10.44□□□□□ -0.74
CLN8-201ENST00000331222 MED27Q6P2C8 311 aa10.44□□□□□ -0.74
CLN8-201ENST00000331222 SERPINA9Q86WD7 417 aa10.44□□□□□ -0.74
CLN8-201ENST00000331222 BEND7Q8N7W2 519 aaPredicted RBP10.44□□□□□ -0.74
CLN8-201ENST00000331222 SPERTQ8NA61 448 aa10.44□□□□□ -0.74
CLN8-201ENST00000331222 TMEM161BQ8NDZ6 487 aa10.44□□□□□ -0.74
CLN8-201ENST00000331222 DGAT2Q96PD7 388 aa10.44□□□□□ -0.74
CLN8-201ENST00000331222 COMMD4Q9H0A8 199 aa10.44□□□□□ -0.74
CLN8-201ENST00000331222 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa10.44□□□□□ -0.74
CLN8-201ENST00000331222 SH3BGRL2Q9UJC5 107 aa10.44□□□□□ -0.74
CLN8-201ENST00000331222 ITGAVP06756 1048 aa10.44□□□□□ -0.74
CLN8-201ENST00000331222 FSHRP23945 695 aa10.44□□□□□ -0.74
CLN8-201ENST00000331222 GSTT1P30711 240 aa10.44□□□□□ -0.74
CLN8-201ENST00000331222 SSX6Q7RTT6 188 aa10.44□□□□□ -0.74
CLN8-201ENST00000331222 TLR10Q9BXR5 811 aa10.44□□□□□ -0.74
CLN8-201ENST00000331222 POLMQ9NP87 494 aaPredicted RBP10.44□□□□□ -0.74
CLN8-201ENST00000331222 CPQQ9Y646 472 aa10.44□□□□□ -0.74
CLN8-201ENST00000331222 ADGRB1O14514 1584 aa10.44□□□□□ -0.74
CLN8-201ENST00000331222 INHAP05111 366 aa10.44□□□□□ -0.74
CLN8-201ENST00000331222 NR2F6P10588 404 aa10.44□□□□□ -0.74
CLN8-201ENST00000331222 NMBRP28336 390 aa10.44□□□□□ -0.74
CLN8-201ENST00000331222 FAUP35544 74 aaKnown RBP10.44□□□□□ -0.74
CLN8-201ENST00000331222 MAPK8P45983 427 aa10.44□□□□□ -0.74
CLN8-201ENST00000331222 IL17AQ16552 155 aa10.44□□□□□ -0.74
CLN8-201ENST00000331222 ARHGAP22Q7Z5H3 698 aa10.44□□□□□ -0.74
CLN8-201ENST00000331222 NET1Q7Z628 596 aaPredicted RBP10.44□□□□□ -0.74
CLN8-201ENST00000331222 ATXN2LQ8WWM7 1075 aaKnown RBP10.44□□□□□ -0.74
CLN8-201ENST00000331222 CNDP2Q96KP4 475 aaKnown RBP10.44□□□□□ -0.74
CLN8-201ENST00000331222 RAPGEFL1Q9UHV5 662 aa10.44□□□□□ -0.74
CLN8-201ENST00000331222 IQGAP1P46940 1657 aa10.44□□□□□ -0.74
CLN8-201ENST00000331222 GRXCR1A8MXD5 290 aa10.43□□□□□ -0.74
CLN8-201ENST00000331222 SLC33A1O00400 549 aaPredicted RBP10.43□□□□□ -0.74
CLN8-201ENST00000331222 PDPK1O15530 556 aa10.43□□□□□ -0.74
CLN8-201ENST00000331222 CST3P01034 146 aaPredicted RBP10.43□□□□□ -0.74
CLN8-201ENST00000331222 ACP5P13686 325 aa10.43□□□□□ -0.74
CLN8-201ENST00000331222 FMO1Q01740 532 aa10.43□□□□□ -0.74
CLN8-201ENST00000331222 ATP13A5Q4VNC0 1218 aa10.43□□□□□ -0.74
CLN8-201ENST00000331222 ABCA11PQ4W5N1 156 aa10.43□□□□□ -0.74
CLN8-201ENST00000331222 JPH3Q8WXH2 748 aaPredicted RBP10.43□□□□□ -0.74
CLN8-201ENST00000331222 HAVCR1Q96D42 359 aa10.43□□□□□ -0.74
CLN8-201ENST00000331222 CAPNS2Q96L46 248 aa10.43□□□□□ -0.74
CLN8-201ENST00000331222 OR2AG1Q9H205 316 aa10.43□□□□□ -0.74
CLN8-201ENST00000331222 IL36AQ9UHA7 158 aa10.43□□□□□ -0.74
CLN8-201ENST00000331222 PCDHGA6Q9Y5G7 932 aa10.43□□□□□ -0.74
CLN8-201ENST00000331222 ANXA2P2A6NMY6 339 aa10.43□□□□□ -0.74
CLN8-201ENST00000331222 TRIM38O00635 465 aa10.43□□□□□ -0.74
CLN8-201ENST00000331222 NDUFS4O43181 175 aa10.43□□□□□ -0.74
CLN8-201ENST00000331222 B4GALT2O60909 372 aa10.43□□□□□ -0.74
CLN8-201ENST00000331222 ANXA2P07355 339 aaKnown RBP10.43□□□□□ -0.74
CLN8-201ENST00000331222 CD48P09326 243 aa10.43□□□□□ -0.74
CLN8-201ENST00000331222 NUDT17P0C025 328 aa10.43□□□□□ -0.74
CLN8-201ENST00000331222 LIPEQ05469 1076 aa10.43□□□□□ -0.74
CLN8-201ENST00000331222 NTRK3Q16288 839 aa10.43□□□□□ -0.74
CLN8-201ENST00000331222 IL23RQ5VWK5 629 aa10.43□□□□□ -0.74
CLN8-201ENST00000331222 GSTCDQ8NEC7 633 aa10.43□□□□□ -0.74
CLN8-201ENST00000331222 CARS2Q9HA77 564 aaKnown RBP10.43□□□□□ -0.74
CLN8-201ENST00000331222 EIF2B4Q9UI10 523 aaKnown RBP10.43□□□□□ -0.74
CLN8-201ENST00000331222 HPSEQ9Y251 543 aa10.43□□□□□ -0.74
CLN8-201ENST00000331222 FKBP7Q9Y680 259 aa10.43□□□□□ -0.74
CLN8-201ENST00000331222 BCKDKO14874 412 aa10.43□□□□□ -0.74
CLN8-201ENST00000331222 GBAP04062 536 aa10.43□□□□□ -0.74
CLN8-201ENST00000331222 TACR2P21452 398 aa10.43□□□□□ -0.74
CLN8-201ENST00000331222 CASRP41180 1078 aa10.43□□□□□ -0.74
CLN8-201ENST00000331222 CDH12P55289 794 aa10.43□□□□□ -0.74
CLN8-201ENST00000331222 DDR1Q08345 913 aa10.43□□□□□ -0.74
CLN8-201ENST00000331222 GLYATQ6IB77 296 aa10.43□□□□□ -0.74
CLN8-201ENST00000331222 PIK3R3Q92569 461 aa10.43□□□□□ -0.74
CLN8-201ENST00000331222 SLC35C1Q96A29 364 aa10.43□□□□□ -0.74
CLN8-201ENST00000331222 BTN2A3PQ96KV6 586 aa10.43□□□□□ -0.74
CLN8-201ENST00000331222 ZFP3Q96NJ6 502 aa10.43□□□□□ -0.74
CLN8-201ENST00000331222 HEPHQ9BQS7 1158 aa10.43□□□□□ -0.74
CLN8-201ENST00000331222 IFT27Q9BW83 186 aa10.43□□□□□ -0.74
CLN8-201ENST00000331222 GDF3Q9NR23 364 aa10.43□□□□□ -0.74
CLN8-201ENST00000331222 PLCL2Q9UPR0 1127 aa10.43□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.9 ms