RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000328839.3

PPP4R4-202, Transcript of protein phosphatase 4 regulatory subunit 4, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PPP4R4, Length 876 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP4R4-202ENST00000328839 MR1Q95460 341 aa24.44■■□□□ 1.5
PPP4R4-202ENST00000328839 TUBB2BQ9BVA1 445 aa24.44■■□□□ 1.5
PPP4R4-202ENST00000328839 HEMGNQ9BXL5 484 aa24.44■■□□□ 1.5
PPP4R4-202ENST00000328839 GPR87Q9BY21 358 aa24.44■■□□□ 1.5
PPP4R4-202ENST00000328839 TRIM55Q9BYV6 548 aa24.44■■□□□ 1.5
PPP4R4-202ENST00000328839 ASB8Q9H765 288 aa24.44■■□□□ 1.5
PPP4R4-202ENST00000328839 C10orf88Q9H8K7 445 aa24.44■■□□□ 1.5
PPP4R4-202ENST00000328839 SLC24A2Q9UI40 661 aa24.44■■□□□ 1.5
PPP4R4-202ENST00000328839 ACSL5Q9ULC5 683 aa24.44■■□□□ 1.5
PPP4R4-202ENST00000328839 C2orf81A6NN90 581 aa24.43■■□□□ 1.5
PPP4R4-202ENST00000328839 ZBTB11O95625 1053 aaPredicted RBP24.43■■□□□ 1.5
PPP4R4-202ENST00000328839 POLBP06746 335 aa24.43■■□□□ 1.5
PPP4R4-202ENST00000328839 LPOP22079 712 aaPredicted RBP24.43■■□□□ 1.5
PPP4R4-202ENST00000328839 GEMP55040 296 aa24.43■■□□□ 1.5
PPP4R4-202ENST00000328839 TMTC4Q5T4D3 741 aa24.43■■□□□ 1.5
PPP4R4-202ENST00000328839 CCDC181Q5TID7 509 aa24.43■■□□□ 1.5
PPP4R4-202ENST00000328839 APLFQ8IW19 511 aaPredicted RBP24.43■■□□□ 1.5
PPP4R4-202ENST00000328839 FAM26EQ8N5C1 309 aa24.43■■□□□ 1.5
PPP4R4-202ENST00000328839 OR2L2Q8NH16 312 aa24.43■■□□□ 1.5
PPP4R4-202ENST00000328839 RBM41Q96IZ5 413 aaKnown RBP24.43■■□□□ 1.5
PPP4R4-202ENST00000328839 APOL2Q9BQE5 337 aa24.43■■□□□ 1.5
PPP4R4-202ENST00000328839 GBA3Q9H227 469 aa24.43■■□□□ 1.5
PPP4R4-202ENST00000328839 FKBPLQ9UIM3 349 aa24.43■■□□□ 1.5
PPP4R4-202ENST00000328839 SBDSQ9Y3A5 250 aaKnown RBP eCLIP24.43■■□□□ 1.5
PPP4R4-202ENST00000328839 SPENQ96T58 3664 aaKnown RBP24.43■■□□□ 1.5
PPP4R4-202ENST00000328839 MACROD2A1Z1Q3 448 aa24.42■■□□□ 1.5
PPP4R4-202ENST00000328839 AKR1B15C9JRZ8 316 aaPredicted RBP24.42■■□□□ 1.5
PPP4R4-202ENST00000328839 ANXA9O76027 345 aa24.42■■□□□ 1.5
PPP4R4-202ENST00000328839 SRP72O76094 671 aaKnown RBP24.42■■□□□ 1.5
PPP4R4-202ENST00000328839 PDGFAP04085 211 aa24.42■■□□□ 1.5
PPP4R4-202ENST00000328839 RBL1P28749 1068 aa24.42■■□□□ 1.5
PPP4R4-202ENST00000328839 MAGEA1P43355 309 aa24.42■■□□□ 1.5
PPP4R4-202ENST00000328839 CHAF1BQ13112 559 aa24.42■■□□□ 1.5
PPP4R4-202ENST00000328839 TAF1AQ15573 450 aaPredicted RBP24.42■■□□□ 1.5
PPP4R4-202ENST00000328839 UGT8Q16880 541 aa24.42■■□□□ 1.5
PPP4R4-202ENST00000328839 ITPRIPL1Q6GPH6 555 aa24.42■■□□□ 1.5
PPP4R4-202ENST00000328839 FBXO38Q6PIJ6 1188 aa24.42■■□□□ 1.5
PPP4R4-202ENST00000328839 DCUN1D1Q96GG9 259 aa24.42■■□□□ 1.5
PPP4R4-202ENST00000328839 KIR3DX1Q9H7L2 352 aa24.42■■□□□ 1.5
PPP4R4-202ENST00000328839 KCND1Q9NSA2 647 aa24.42■■□□□ 1.5
PPP4R4-202ENST00000328839 CRLS1Q9UJA2 301 aa24.42■■□□□ 1.5
PPP4R4-202ENST00000328839 DDX3YO15523 660 aaKnown RBP24.41■■□□□ 1.5
PPP4R4-202ENST00000328839 POLR2CP19387 275 aaPredicted RBP24.41■■□□□ 1.5
PPP4R4-202ENST00000328839 KPNA2P52292 529 aaKnown RBP24.41■■□□□ 1.5
PPP4R4-202ENST00000328839 PRKAA1Q13131 559 aa24.41■■□□□ 1.5
PPP4R4-202ENST00000328839 IL10RAQ13651 578 aa24.41■■□□□ 1.5
PPP4R4-202ENST00000328839 CPZQ66K79 652 aa24.41■■□□□ 1.5
PPP4R4-202ENST00000328839 DAAM2Q86T65 1068 aa24.41■■□□□ 1.5
PPP4R4-202ENST00000328839 SYVN1Q86TM6 617 aa24.41■■□□□ 1.5
PPP4R4-202ENST00000328839 CFAP206Q8IYR0 622 aa24.41■■□□□ 1.5
PPP4R4-202ENST00000328839 THAP4Q8WY91 577 aa24.41■■□□□ 1.5
PPP4R4-202ENST00000328839 ZNF501Q96CX3 271 aaPredicted RBP24.41■■□□□ 1.5
PPP4R4-202ENST00000328839 RMDN2Q96LZ7 410 aa24.41■■□□□ 1.5
PPP4R4-202ENST00000328839 PPM1MQ96MI6 270 aa24.41■■□□□ 1.5
PPP4R4-202ENST00000328839 FERMT1Q9BQL6 677 aa24.41■■□□□ 1.5
PPP4R4-202ENST00000328839 TLR10Q9BXR5 811 aa24.41■■□□□ 1.5
PPP4R4-202ENST00000328839 FARSAQ9Y285 508 aaKnown RBP24.41■■□□□ 1.5
PPP4R4-202ENST00000328839 COLEC10Q9Y6Z7 277 aa24.41■■□□□ 1.5
PPP4R4-202ENST00000328839 CLEC18AA5D8T8 446 aa24.4■■□□□ 1.5
PPP4R4-202ENST00000328839 ARGFXA6NJG6 315 aa24.4■■□□□ 1.5
PPP4R4-202ENST00000328839 RALBP11234 206 aa24.4■■□□□ 1.5
PPP4R4-202ENST00000328839 PTMSP20962 102 aa24.4■■□□□ 1.5
PPP4R4-202ENST00000328839 CDH3P22223 829 aa24.4■■□□□ 1.5
PPP4R4-202ENST00000328839 HADHBP55084 474 aaKnown RBP24.4■■□□□ 1.5
PPP4R4-202ENST00000328839 GPS2Q13227 327 aa24.4■■□□□ 1.5
PPP4R4-202ENST00000328839 OLIG2Q13516 323 aa24.4■■□□□ 1.5
PPP4R4-202ENST00000328839 BCL7AQ4VC05 210 aa24.4■■□□□ 1.5
PPP4R4-202ENST00000328839 CLEC18BQ6UXF7 455 aa24.4■■□□□ 1.5
PPP4R4-202ENST00000328839 BBS12Q6ZW61 710 aa24.4■■□□□ 1.5
PPP4R4-202ENST00000328839 LILRA3Q8N6C8 439 aaPredicted RBP24.4■■□□□ 1.5
PPP4R4-202ENST00000328839 CLEC18CQ8NCF0 446 aa24.4■■□□□ 1.5
PPP4R4-202ENST00000328839 OR4E2Q8NGC2 313 aa24.4■■□□□ 1.5
PPP4R4-202ENST00000328839 ZFPM2Q8WW38 1151 aa24.4■■□□□ 1.5
PPP4R4-202ENST00000328839 KRT35Q92764 455 aa24.4■■□□□ 1.5
PPP4R4-202ENST00000328839 GORASP1Q9BQQ3 440 aa24.4■■□□□ 1.5
PPP4R4-202ENST00000328839 FANCEQ9HB96 536 aa24.4■■□□□ 1.5
PPP4R4-202ENST00000328839 ACSS2Q9NR19 701 aa24.4■■□□□ 1.5
PPP4R4-202ENST00000328839 TFR2Q9UP52 801 aa24.4■■□□□ 1.5
PPP4R4-202ENST00000328839 SPTBP11277 2137 aa24.4■■□□□ 1.5
PPP4R4-202ENST00000328839 KLHL33A6NCF5 533 aa24.39■■□□□ 1.49
PPP4R4-202ENST00000328839 TTLL8A6PVC2 850 aa24.39■■□□□ 1.49
PPP4R4-202ENST00000328839 APOC4-APOC2K7ER74 178 aa24.39■■□□□ 1.49
PPP4R4-202ENST00000328839 APOC2P02655 101 aa24.39■■□□□ 1.49
PPP4R4-202ENST00000328839 KLK3P07288 261 aaPredicted RBP24.39■■□□□ 1.49
PPP4R4-202ENST00000328839 GP1BBP13224 206 aa24.39■■□□□ 1.49
PPP4R4-202ENST00000328839 CD97P48960 835 aa24.39■■□□□ 1.49
PPP4R4-202ENST00000328839 PGDP52209 483 aa24.39■■□□□ 1.49
PPP4R4-202ENST00000328839 TMPRSS15P98073 1019 aa24.39■■□□□ 1.49
PPP4R4-202ENST00000328839 EFCAB3Q8N7B9 438 aa24.39■■□□□ 1.49
PPP4R4-202ENST00000328839 RNF214Q8ND24 703 aa24.39■■□□□ 1.49
PPP4R4-202ENST00000328839 OR8K5Q8NH50 307 aa24.39■■□□□ 1.49
PPP4R4-202ENST00000328839 SLC25A23Q9BV35 468 aa24.39■■□□□ 1.49
PPP4R4-202ENST00000328839 LRRK2Q5S007 2527 aa24.39■■□□□ 1.49
PPP4R4-202ENST00000328839 MED13Q9UHV7 2174 aa24.39■■□□□ 1.49
PPP4R4-202ENST00000328839 GSAPA4D1B5 854 aa24.38■■□□□ 1.49
PPP4R4-202ENST00000328839 C5orf60A6NFR6 353 aa24.38■■□□□ 1.49
PPP4R4-202ENST00000328839 PYGMP11217 842 aa24.38■■□□□ 1.49
PPP4R4-202ENST00000328839 PSMB4P28070 264 aa24.38■■□□□ 1.49
PPP4R4-202ENST00000328839 NDUFS1P28331 727 aa24.38■■□□□ 1.49
PPP4R4-202ENST00000328839 CCL11P51671 97 aa24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.8 ms