RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000318988.10

CTDNEP1-201, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDNEP1, Length 1,549 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-201ENST00000318988 TIMM29Q9BSF4 260 aa26.92■■□□□ 1.9
CTDNEP1-201ENST00000318988 COG4Q9H9E3 785 aa26.92■■□□□ 1.9
CTDNEP1-201ENST00000318988 INTS9Q9NV88 658 aaKnown RBP26.92■■□□□ 1.9
CTDNEP1-201ENST00000318988 DNAJC16Q9Y2G8 782 aa26.92■■□□□ 1.9
CTDNEP1-201ENST00000318988 BTN3A1O00481 513 aa26.91■■□□□ 1.9
CTDNEP1-201ENST00000318988 HRO43593 1189 aa26.91■■□□□ 1.9
CTDNEP1-201ENST00000318988 ZBTB14O43829 449 aa26.91■■□□□ 1.9
CTDNEP1-201ENST00000318988 PLIN3O60664 434 aa26.91■■□□□ 1.9
CTDNEP1-201ENST00000318988 GPR37L1O60883 481 aa26.91■■□□□ 1.9
CTDNEP1-201ENST00000318988 GPC4O75487 556 aa26.91■■□□□ 1.9
CTDNEP1-201ENST00000318988 TSPAN12O95859 305 aa26.91■■□□□ 1.9
CTDNEP1-201ENST00000318988 ACP5P13686 325 aa26.91■■□□□ 1.9
CTDNEP1-201ENST00000318988 TPRG1LQ5T0D9 272 aa26.91■■□□□ 1.9
CTDNEP1-201ENST00000318988 PIWIL4Q7Z3Z4 852 aaKnown RBP26.91■■□□□ 1.9
CTDNEP1-201ENST00000318988 TAX1BP1Q86VP1 789 aa26.91■■□□□ 1.9
CTDNEP1-201ENST00000318988 HID1Q8IV36 788 aa26.91■■□□□ 1.9
CTDNEP1-201ENST00000318988 SLC22A18ASQ8N1D0 253 aa26.91■■□□□ 1.9
CTDNEP1-201ENST00000318988 FSTL5Q8N475 847 aaPredicted RBP26.91■■□□□ 1.9
CTDNEP1-201ENST00000318988 OXR1Q8N573 874 aa26.91■■□□□ 1.9
CTDNEP1-201ENST00000318988 DYDC1Q8WWB3 177 aa26.91■■□□□ 1.9
CTDNEP1-201ENST00000318988 GLMNQ92990 594 aa26.91■■□□□ 1.9
CTDNEP1-201ENST00000318988 PDXPQ96GD0 296 aa26.91■■□□□ 1.9
CTDNEP1-201ENST00000318988 GPR78Q96P69 363 aa26.91■■□□□ 1.9
CTDNEP1-201ENST00000318988 MRPL46Q9H2W6 279 aaKnown RBP26.91■■□□□ 1.9
CTDNEP1-201ENST00000318988 TFB2MQ9H5Q4 396 aaKnown RBP26.91■■□□□ 1.9
CTDNEP1-201ENST00000318988 ALG9Q9H6U8 611 aa26.91■■□□□ 1.9
CTDNEP1-201ENST00000318988 MLXIPLQ9NP71 852 aa26.91■■□□□ 1.9
CTDNEP1-201ENST00000318988 PCYT1BQ9Y5K3 369 aaPredicted RBP26.91■■□□□ 1.9
CTDNEP1-201ENST00000318988 SLCO1B1Q9Y6L6 691 aa26.91■■□□□ 1.9
CTDNEP1-201ENST00000318988 EML5Q05BV3 1969 aa26.91■■□□□ 1.9
CTDNEP1-201ENST00000318988 SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 76 aa26.9■■□□□ 1.9
CTDNEP1-201ENST00000318988 SLC5A10A0PJK1 596 aa26.9■■□□□ 1.9
CTDNEP1-201ENST00000318988 BCAT2O15382 392 aaPredicted RBP26.9■■□□□ 1.9
CTDNEP1-201ENST00000318988 SLCO2B1O94956 709 aa26.9■■□□□ 1.9
CTDNEP1-201ENST00000318988 TNFP01375 233 aa26.9■■□□□ 1.9
CTDNEP1-201ENST00000318988 FUCA1P04066 466 aa26.9■■□□□ 1.9
CTDNEP1-201ENST00000318988 GNSP15586 552 aa26.9■■□□□ 1.9
CTDNEP1-201ENST00000318988 GBX1Q14549 363 aa26.9■■□□□ 1.9
CTDNEP1-201ENST00000318988 DENND1AQ8TEH3 1009 aa26.9■■□□□ 1.9
CTDNEP1-201ENST00000318988 NELL1Q92832 810 aa26.9■■□□□ 1.9
CTDNEP1-201ENST00000318988 TM7SF3Q9NS93 570 aa26.9■■□□□ 1.9
CTDNEP1-201ENST00000318988 PIKFYVEQ9Y2I7 2098 aa26.9■■□□□ 1.9
CTDNEP1-201ENST00000318988 A0A1W2PR77 199 aa26.9■■□□□ 1.9
CTDNEP1-201ENST00000318988 H3BM21 787 aa26.9■■□□□ 1.9
CTDNEP1-201ENST00000318988 TLR4O00206 839 aa26.9■■□□□ 1.9
CTDNEP1-201ENST00000318988 PROCP04070 461 aa26.9■■□□□ 1.9
CTDNEP1-201ENST00000318988 MPC1LP0DKB6 136 aa26.9■■□□□ 1.9
CTDNEP1-201ENST00000318988 PREPP48147 710 aa26.9■■□□□ 1.9
CTDNEP1-201ENST00000318988 RPA4Q13156 261 aa26.9■■□□□ 1.9
CTDNEP1-201ENST00000318988 NFE2L1Q14494 772 aa26.9■■□□□ 1.9
CTDNEP1-201ENST00000318988 TEAD4Q15561 434 aa26.9■■□□□ 1.9
CTDNEP1-201ENST00000318988 ALG11Q2TAA5 492 aa26.9■■□□□ 1.9
CTDNEP1-201ENST00000318988 PLK5Q496M5 336 aa26.9■■□□□ 1.9
CTDNEP1-201ENST00000318988 NEK10Q6ZWH5 1172 aa26.9■■□□□ 1.9
CTDNEP1-201ENST00000318988 STAG3L4Q8TBR4 150 aa26.9■■□□□ 1.9
CTDNEP1-201ENST00000318988 KIAA1191Q96A73 305 aa26.9■■□□□ 1.9
CTDNEP1-201ENST00000318988 GPR27Q9NS67 375 aa26.9■■□□□ 1.9
CTDNEP1-201ENST00000318988 KLC4Q9NSK0 619 aa26.9■■□□□ 1.9
CTDNEP1-201ENST00000318988 CPSF2Q9P2I0 782 aaKnown RBP26.9■■□□□ 1.9
CTDNEP1-201ENST00000318988 XPR1Q9UBH6 696 aa26.9■■□□□ 1.9
CTDNEP1-201ENST00000318988 SLC23A2Q9UGH3 650 aa26.9■■□□□ 1.9
CTDNEP1-201ENST00000318988 EMCNQ9ULC0 261 aa26.9■■□□□ 1.9
CTDNEP1-201ENST00000318988 MUC3AQ02505 3323 aa26.89■■□□□ 1.9
CTDNEP1-201ENST00000318988 CCDC189A1A4V9 331 aa26.89■■□□□ 1.89
CTDNEP1-201ENST00000318988 NPEPPSL1A6NEC2 478 aa26.89■■□□□ 1.89
CTDNEP1-201ENST00000318988 PRR5-ARHGAP8B1AHC4 643 aa26.89■■□□□ 1.89
CTDNEP1-201ENST00000318988 RASGRP1O95267 797 aa26.89■■□□□ 1.89
CTDNEP1-201ENST00000318988 ITPKAP23677 461 aa26.89■■□□□ 1.89
CTDNEP1-201ENST00000318988 AFF3P51826 1226 aaKnown RBP26.89■■□□□ 1.89
CTDNEP1-201ENST00000318988 C21orf59P57076 290 aa26.89■■□□□ 1.89
CTDNEP1-201ENST00000318988 ISCA2Q86U28 154 aa26.89■■□□□ 1.89
CTDNEP1-201ENST00000318988 PARGQ86W56 976 aa26.89■■□□□ 1.89
CTDNEP1-201ENST00000318988 FOPNLQ96NB1 174 aa26.89■■□□□ 1.89
CTDNEP1-201ENST00000318988 OSGEPL1Q9H4B0 414 aa26.89■■□□□ 1.89
CTDNEP1-201ENST00000318988 RNF112Q9ULX5 631 aa26.89■■□□□ 1.89
CTDNEP1-201ENST00000318988 CDYLQ9Y232 598 aa26.89■■□□□ 1.89
CTDNEP1-201ENST00000318988 A0A0C4DFX4 3053 aa26.89■■□□□ 1.89
CTDNEP1-201ENST00000318988 NEFHP12036 1026 aa26.88■■□□□ 1.89
CTDNEP1-201ENST00000318988 TAC1P20366 129 aa26.88■■□□□ 1.89
CTDNEP1-201ENST00000318988 MAPK9P45984 424 aa26.88■■□□□ 1.89
CTDNEP1-201ENST00000318988 BLKP51451 505 aa26.88■■□□□ 1.89
CTDNEP1-201ENST00000318988 IL9RQ01113 521 aa26.88■■□□□ 1.89
CTDNEP1-201ENST00000318988 FZD2Q14332 565 aa26.88■■□□□ 1.89
CTDNEP1-201ENST00000318988 TSNQ15631 228 aaKnown RBP26.88■■□□□ 1.89
CTDNEP1-201ENST00000318988 TECRLQ5HYJ1 363 aa26.88■■□□□ 1.89
CTDNEP1-201ENST00000318988 ADAMTSL2Q86TH1 951 aa26.88■■□□□ 1.89
CTDNEP1-201ENST00000318988 VRK3Q8IV63 474 aa26.88■■□□□ 1.89
CTDNEP1-201ENST00000318988 SLC22A15Q8IZD6 547 aa26.88■■□□□ 1.89
CTDNEP1-201ENST00000318988 LILRA3Q8N6C8 439 aaPredicted RBP26.88■■□□□ 1.89
CTDNEP1-201ENST00000318988 C1orf216Q8TAB5 229 aa26.88■■□□□ 1.89
CTDNEP1-201ENST00000318988 RHEBL1Q8TAI7 183 aa26.88■■□□□ 1.89
CTDNEP1-201ENST00000318988 RDH11Q8TC12 318 aa26.88■■□□□ 1.89
CTDNEP1-201ENST00000318988 PTERQ96BW5 349 aa26.88■■□□□ 1.89
CTDNEP1-201ENST00000318988 DPEP2Q9H4A9 486 aa26.88■■□□□ 1.89
CTDNEP1-201ENST00000318988 GULP1Q9UBP9 304 aa26.88■■□□□ 1.89
CTDNEP1-201ENST00000318988 ACSL5Q9ULC5 683 aa26.88■■□□□ 1.89
CTDNEP1-201ENST00000318988 PCDHGA2Q9Y5H1 932 aa26.88■■□□□ 1.89
CTDNEP1-201ENST00000318988 DGKBQ9Y6T7 804 aa26.88■■□□□ 1.89
CTDNEP1-201ENST00000318988 PABPN1LA6NDY0 278 aaKnown RBP26.87■■□□□ 1.89
CTDNEP1-201ENST00000318988 PRR33A8MZF0 331 aa26.87■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.8 ms