RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000301730.12

RNPS1-201, Transcript of RNA binding protein with serine rich domain 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene RNPS1, Length 1,276 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNPS1-201ENST00000301730 IMP3Q9NV31 184 aaKnown RBP20.21■□□□□ 0.83
RNPS1-201ENST00000301730 EIF2AK3Q9NZJ5 1116 aaKnown RBP20.21■□□□□ 0.83
RNPS1-201ENST00000301730 TMEM9Q9P0T7 183 aa20.21■□□□□ 0.83
RNPS1-201ENST00000301730 PCDHGA8Q9Y5G5 932 aa20.21■□□□□ 0.83
RNPS1-201ENST00000301730 CFAP20Q9Y6A4 193 aaKnown RBP20.21■□□□□ 0.83
RNPS1-201ENST00000301730 ZZEF1O43149 2961 aa20.21■□□□□ 0.83
RNPS1-201ENST00000301730 OR56A5P0C7T3 313 aa20.2■□□□□ 0.82
RNPS1-201ENST00000301730 THRAP10827 490 aa20.2■□□□□ 0.82
RNPS1-201ENST00000301730 PAMP19021 973 aa20.2■□□□□ 0.82
RNPS1-201ENST00000301730 PPM1FP49593 454 aaPredicted RBP20.2■□□□□ 0.82
RNPS1-201ENST00000301730 RPA4Q13156 261 aa20.2■□□□□ 0.82
RNPS1-201ENST00000301730 ANKRD20A4Q4UJ75 823 aa20.2■□□□□ 0.82
RNPS1-201ENST00000301730 CAPRIN2Q6IMN6 1127 aaKnown RBP20.2■□□□□ 0.82
RNPS1-201ENST00000301730 DUS1LQ6P1R4 473 aaKnown RBP20.2■□□□□ 0.82
RNPS1-201ENST00000301730 TMEM71Q6P5X7 295 aa20.2■□□□□ 0.82
RNPS1-201ENST00000301730 WDR74Q6RFH5 385 aaPredicted RBP20.2■□□□□ 0.82
RNPS1-201ENST00000301730 IGF2-ASQ6U949 168 aa20.2■□□□□ 0.82
RNPS1-201ENST00000301730 RAB11FIP2Q7L804 512 aa20.2■□□□□ 0.82
RNPS1-201ENST00000301730 LSMEM2Q8N112 164 aa20.2■□□□□ 0.82
RNPS1-201ENST00000301730 ZNF669Q96BR6 464 aaPredicted RBP20.2■□□□□ 0.82
RNPS1-201ENST00000301730 CCDC74BQ96LY2 380 aa20.2■□□□□ 0.82
RNPS1-201ENST00000301730 FCRL3Q96P31 734 aaPredicted RBP20.2■□□□□ 0.82
RNPS1-201ENST00000301730 ZMYND15Q9H091 742 aa20.2■□□□□ 0.82
RNPS1-201ENST00000301730 OR52A5Q9H2C5 316 aa20.2■□□□□ 0.82
RNPS1-201ENST00000301730 OGFRQ9NZT2 677 aa20.2■□□□□ 0.82
RNPS1-201ENST00000301730 CELSR3Q9NYQ7 3312 aa20.2■□□□□ 0.82
RNPS1-201ENST00000301730 ZCWPW2A0A1B0GU75 182 aa20.19■□□□□ 0.82
RNPS1-201ENST00000301730 GOLGA8KD6RF30 607 aa20.19■□□□□ 0.82
RNPS1-201ENST00000301730 GOLGA8TH3BQL2 631 aa20.19■□□□□ 0.82
RNPS1-201ENST00000301730 PRMT5O14744 637 aaPredicted RBP20.19■□□□□ 0.82
RNPS1-201ENST00000301730 PLD2O14939 933 aa20.19■□□□□ 0.82
RNPS1-201ENST00000301730 UBXN7O94888 489 aa20.19■□□□□ 0.82
RNPS1-201ENST00000301730 PDHA2P29803 388 aa20.19■□□□□ 0.82
RNPS1-201ENST00000301730 PREPP48147 710 aa20.19■□□□□ 0.82
RNPS1-201ENST00000301730 C16orf72Q14CZ0 275 aa20.19■□□□□ 0.82
RNPS1-201ENST00000301730 MORF4L2Q15014 288 aa20.19■□□□□ 0.82
RNPS1-201ENST00000301730 TYSND1Q2T9J0 566 aa20.19■□□□□ 0.82
RNPS1-201ENST00000301730 OTUD6BQ8N6M0 293 aa20.19■□□□□ 0.82
RNPS1-201ENST00000301730 RCBTB1Q8NDN9 531 aa20.19■□□□□ 0.82
RNPS1-201ENST00000301730 NCSTNQ92542 709 aa20.19■□□□□ 0.82
RNPS1-201ENST00000301730 ASCL3Q9NQ33 180 aa20.19■□□□□ 0.82
RNPS1-201ENST00000301730 PDP2Q9P2J9 529 aa20.19■□□□□ 0.82
RNPS1-201ENST00000301730 LOXL2Q9Y4K0 774 aa20.19■□□□□ 0.82
RNPS1-201ENST00000301730 MAD1L1Q9Y6D9 718 aa20.19■□□□□ 0.82
RNPS1-201ENST00000301730 RPS6KL1Q9Y6S9 549 aa20.19■□□□□ 0.82
RNPS1-201ENST00000301730 KMT2BQ9UMN6 2715 aaPredicted RBP20.18■□□□□ 0.82
RNPS1-201ENST00000301730 F8W8V4 182 aa20.18■□□□□ 0.82
RNPS1-201ENST00000301730 LIN7AO14910 233 aaPredicted RBP20.18■□□□□ 0.82
RNPS1-201ENST00000301730 USP1O94782 785 aa20.18■□□□□ 0.82
RNPS1-201ENST00000301730 MPSTP25325 297 aa20.18■□□□□ 0.82
RNPS1-201ENST00000301730 C2orf54Q08AI8 447 aa20.18■□□□□ 0.82
RNPS1-201ENST00000301730 TRA2AQ13595 282 aaKnown RBP eCLIP20.18■□□□□ 0.82
RNPS1-201ENST00000301730 TBC1D25Q3MII6 688 aa20.18■□□□□ 0.82
RNPS1-201ENST00000301730 MRNIPQ6NTE8 343 aa20.18■□□□□ 0.82
RNPS1-201ENST00000301730 HIBCHQ6NVY1 386 aaPredicted RBP20.18■□□□□ 0.82
RNPS1-201ENST00000301730 FBXO39Q8N4B4 442 aa20.18■□□□□ 0.82
RNPS1-201ENST00000301730 LKAAEAR1Q8TD35 194 aa20.18■□□□□ 0.82
RNPS1-201ENST00000301730 ELMO1Q92556 727 aa20.18■□□□□ 0.82
RNPS1-201ENST00000301730 TMEM159Q96B96 161 aa20.18■□□□□ 0.82
RNPS1-201ENST00000301730 P2RY12Q9H244 342 aa20.18■□□□□ 0.82
RNPS1-201ENST00000301730 IL1RAPL1Q9NZN1 696 aa20.18■□□□□ 0.82
RNPS1-201ENST00000301730 MN1Q10571 1320 aaPredicted RBP20.18■□□□□ 0.82
RNPS1-201ENST00000301730 PKD1L2Q7Z442 2459 aa20.17■□□□□ 0.82
RNPS1-201ENST00000301730 SLC5A10A0PJK1 596 aa20.17■□□□□ 0.82
RNPS1-201ENST00000301730 HGSO14964 777 aaPredicted RBP20.17■□□□□ 0.82
RNPS1-201ENST00000301730 TLX3O43711 291 aaPredicted RBP20.17■□□□□ 0.82
RNPS1-201ENST00000301730 NDUFS3O75489 264 aa20.17■□□□□ 0.82
RNPS1-201ENST00000301730 SEC31AO94979 1220 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
RNPS1-201ENST00000301730 HGFP14210 728 aa20.17■□□□□ 0.82
RNPS1-201ENST00000301730 TYRP1P17643 537 aa20.17■□□□□ 0.82
RNPS1-201ENST00000301730 OGNP20774 298 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
RNPS1-201ENST00000301730 CAPZBP47756 277 aa20.17■□□□□ 0.82
RNPS1-201ENST00000301730 CD151P48509 253 aa20.17■□□□□ 0.82
RNPS1-201ENST00000301730 DHX9Q08211 1270 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
RNPS1-201ENST00000301730 BOP1Q14137 746 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
RNPS1-201ENST00000301730 MSS51Q4VC12 460 aa20.17■□□□□ 0.82
RNPS1-201ENST00000301730 ZNF449Q6P9G9 518 aa20.17■□□□□ 0.82
RNPS1-201ENST00000301730 FOXR1Q6PIV2 292 aa20.17■□□□□ 0.82
RNPS1-201ENST00000301730 PDZD3Q86UT5 571 aa20.17■□□□□ 0.82
RNPS1-201ENST00000301730 RSC1A1Q92681 617 aa20.17■□□□□ 0.82
RNPS1-201ENST00000301730 STAMBPL1Q96FJ0 436 aa20.17■□□□□ 0.82
RNPS1-201ENST00000301730 SNF8Q96H20 258 aa20.17■□□□□ 0.82
RNPS1-201ENST00000301730 SLC46A1Q96NT5 459 aa20.17■□□□□ 0.82
RNPS1-201ENST00000301730 CMKLR1Q99788 373 aa20.17■□□□□ 0.82
RNPS1-201ENST00000301730 TRIM31Q9BZY9 425 aa20.17■□□□□ 0.82
RNPS1-201ENST00000301730 RAXQ9Y2V3 346 aa20.17■□□□□ 0.82
RNPS1-201ENST00000301730 URB1O60287 2271 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
RNPS1-201ENST00000301730 IQCF5A8MTL0 148 aa20.16■□□□□ 0.82
RNPS1-201ENST00000301730 EFCAB8A8MWE9 144 aa20.16■□□□□ 0.82
RNPS1-201ENST00000301730 SMAPO00193 183 aa20.16■□□□□ 0.82
RNPS1-201ENST00000301730 AGRPO00253 132 aa20.16■□□□□ 0.82
RNPS1-201ENST00000301730 IFRD1O00458 451 aaPredicted RBP20.16■□□□□ 0.82
RNPS1-201ENST00000301730 TP73O15350 636 aa20.16■□□□□ 0.82
RNPS1-201ENST00000301730 BANF1O75531 89 aa20.16■□□□□ 0.82
RNPS1-201ENST00000301730 TNFSF15O95150 251 aa20.16■□□□□ 0.82
RNPS1-201ENST00000301730 C9P02748 559 aa20.16■□□□□ 0.82
RNPS1-201ENST00000301730 ITGA2BP08514 1039 aa20.16■□□□□ 0.82
RNPS1-201ENST00000301730 AMD1P17707 334 aa20.16■□□□□ 0.82
RNPS1-201ENST00000301730 RPS3P23396 243 aaKnown RBP eCLIP20.16■□□□□ 0.82
RNPS1-201ENST00000301730 RBMS1P29558 406 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 67.5 ms