RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000262460.4

GINS1-201, Transcript of GINS complex subunit 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GINS1, Length 3,249 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS1-201ENST00000262460 INPP5KQ9BT40 448 aa8.54□□□□□ -1.04
GINS1-201ENST00000262460 PCDH12Q9NPG4 1184 aa8.54□□□□□ -1.04
GINS1-201ENST00000262460 SLC30A1Q9Y6M5 507 aa8.54□□□□□ -1.04
GINS1-201ENST00000262460 LOC730098B7Z3J9 87 aa8.53□□□□□ -1.04
GINS1-201ENST00000262460 SLC22A2O15244 555 aa8.53□□□□□ -1.04
GINS1-201ENST00000262460 AP1G1O43747 822 aa8.53□□□□□ -1.04
GINS1-201ENST00000262460 SEC22BO75396 215 aa8.53□□□□□ -1.04
GINS1-201ENST00000262460 CHRM1P11229 460 aaPredicted RBP8.53□□□□□ -1.04
GINS1-201ENST00000262460 IDO1P14902 403 aa8.53□□□□□ -1.04
GINS1-201ENST00000262460 ZNF182P17025 639 aaPredicted RBP8.53□□□□□ -1.04
GINS1-201ENST00000262460 CLCN7P51798 805 aa8.53□□□□□ -1.04
GINS1-201ENST00000262460 SLC14A1Q13336 389 aa8.53□□□□□ -1.04
GINS1-201ENST00000262460 GTF2H2Q13888 395 aa8.53□□□□□ -1.04
GINS1-201ENST00000262460 RCAN2Q14206 197 aa8.53□□□□□ -1.04
GINS1-201ENST00000262460 INPP5AQ14642 412 aa8.53□□□□□ -1.04
GINS1-201ENST00000262460 TAF1AQ15573 450 aaPredicted RBP8.53□□□□□ -1.04
GINS1-201ENST00000262460 CHRNA6Q15825 494 aa8.53□□□□□ -1.04
GINS1-201ENST00000262460 MEP1AQ16819 746 aa8.53□□□□□ -1.04
GINS1-201ENST00000262460 ZXDCQ2QGD7 858 aaPredicted RBP8.53□□□□□ -1.04
GINS1-201ENST00000262460 TYSND1Q2T9J0 566 aa8.53□□□□□ -1.04
GINS1-201ENST00000262460 CYP27C1Q4G0S4 372 aa8.53□□□□□ -1.04
GINS1-201ENST00000262460 CYBRD1Q53TN4 286 aa8.53□□□□□ -1.04
GINS1-201ENST00000262460 HECTD3Q5T447 861 aa8.53□□□□□ -1.04
GINS1-201ENST00000262460 OGFOD2Q6N063 350 aa8.53□□□□□ -1.04
GINS1-201ENST00000262460 GTF2H2CQ6P1K8 395 aa8.53□□□□□ -1.04
GINS1-201ENST00000262460 SUSD1Q6UWL2 747 aa8.53□□□□□ -1.04
GINS1-201ENST00000262460 SBSNQ6UWP8 590 aa8.53□□□□□ -1.04
GINS1-201ENST00000262460 KCTD8Q6ZWB6 473 aa8.53□□□□□ -1.04
GINS1-201ENST00000262460 UTS2BQ765I0 119 aa8.53□□□□□ -1.04
GINS1-201ENST00000262460 RNF180Q86T96 592 aa8.53□□□□□ -1.04
GINS1-201ENST00000262460 LIX1Q8N485 282 aa8.53□□□□□ -1.04
GINS1-201ENST00000262460 PSD4Q8NDX1 1056 aa8.53□□□□□ -1.04
GINS1-201ENST00000262460 CATSPER1Q8NEC5 780 aa8.53□□□□□ -1.04
GINS1-201ENST00000262460 SORCS1Q8WY21 1168 aa8.53□□□□□ -1.04
GINS1-201ENST00000262460 UBE2FQ969M7 185 aa8.53□□□□□ -1.04
GINS1-201ENST00000262460 TMBIM1Q969X1 311 aa8.53□□□□□ -1.04
GINS1-201ENST00000262460 FUBP3Q96I24 572 aaKnown RBP eCLIP8.53□□□□□ -1.04
GINS1-201ENST00000262460 MYRFLQ96LU7 910 aa8.53□□□□□ -1.04
GINS1-201ENST00000262460 NRTNQ99748 197 aa8.53□□□□□ -1.04
GINS1-201ENST00000262460 CLK4Q9HAZ1 481 aaKnown RBP8.53□□□□□ -1.04
GINS1-201ENST00000262460 NTN4Q9HB63 628 aa8.53□□□□□ -1.04
GINS1-201ENST00000262460 SYTL2Q9HCH5 934 aa8.53□□□□□ -1.04
GINS1-201ENST00000262460 ZDHHC4Q9NPG8 344 aa8.53□□□□□ -1.04
GINS1-201ENST00000262460 PNPLA3Q9NST1 481 aa8.53□□□□□ -1.04
GINS1-201ENST00000262460 FBXO10Q9UK96 956 aa8.53□□□□□ -1.04
GINS1-201ENST00000262460 DMTF1Q9Y222 760 aa8.53□□□□□ -1.04
GINS1-201ENST00000262460 ANGPTL3Q9Y5C1 460 aa8.53□□□□□ -1.04
GINS1-201ENST00000262460 SCN5AQ14524 2016 aa8.53□□□□□ -1.04
GINS1-201ENST00000262460 TCRBV5S2A0A599 114 aa8.53□□□□□ -1.04
GINS1-201ENST00000262460 H0Y858 1186 aa8.53□□□□□ -1.04
GINS1-201ENST00000262460 FFAR2O15552 330 aa8.53□□□□□ -1.04
GINS1-201ENST00000262460 KDELR3O43731 214 aa8.53□□□□□ -1.04
GINS1-201ENST00000262460 PFDN1O60925 122 aa8.53□□□□□ -1.04
GINS1-201ENST00000262460 PIM1P11309 404 aaPredicted RBP8.53□□□□□ -1.04
GINS1-201ENST00000262460 HMGA1P17096 107 aaKnown RBP8.53□□□□□ -1.04
GINS1-201ENST00000262460 CR2P20023 1033 aa8.53□□□□□ -1.04
GINS1-201ENST00000262460 MATN1P21941 496 aa8.53□□□□□ -1.04
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GINS1-201ENST00000262460 HMOX2P30519 316 aa8.53□□□□□ -1.04
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GINS1-201ENST00000262460 POLD2P49005 469 aa8.53□□□□□ -1.04
GINS1-201ENST00000262460 TXNL4AP83876 142 aaKnown RBP8.53□□□□□ -1.04
GINS1-201ENST00000262460 ACVR1Q04771 509 aa8.53□□□□□ -1.04
GINS1-201ENST00000262460 CDH18Q13634 790 aa8.53□□□□□ -1.04
GINS1-201ENST00000262460 SPIDRQ14159 915 aa8.53□□□□□ -1.04
GINS1-201ENST00000262460 PGS1Q32NB8 556 aa8.53□□□□□ -1.04
GINS1-201ENST00000262460 SPESP1Q6UW49 350 aa8.53□□□□□ -1.04
GINS1-201ENST00000262460 SERPINA13PQ6UXR4 307 aa8.53□□□□□ -1.04
GINS1-201ENST00000262460 DLEU7Q6UYE1 221 aa8.53□□□□□ -1.04
GINS1-201ENST00000262460 VRK3Q8IV63 474 aa8.53□□□□□ -1.04
GINS1-201ENST00000262460 SCML4Q8N228 414 aa8.53□□□□□ -1.04
GINS1-201ENST00000262460 TMEM199Q8N511 208 aa8.53□□□□□ -1.04
GINS1-201ENST00000262460 LILRA3Q8N6C8 439 aaPredicted RBP8.53□□□□□ -1.04
GINS1-201ENST00000262460 TRPV3Q8NET8 790 aa8.53□□□□□ -1.04
GINS1-201ENST00000262460 GAB3Q8WWW8 586 aa8.53□□□□□ -1.04
GINS1-201ENST00000262460 ISOC1Q96CN7 298 aa8.53□□□□□ -1.04
GINS1-201ENST00000262460 DPH2Q9BQC3 489 aaPredicted RBP8.53□□□□□ -1.04
GINS1-201ENST00000262460 CLSTN3Q9BQT9 956 aa8.53□□□□□ -1.04
GINS1-201ENST00000262460 TRMOQ9BU70 441 aa8.53□□□□□ -1.04
GINS1-201ENST00000262460 CCDC90BQ9GZT6 254 aa8.53□□□□□ -1.04
GINS1-201ENST00000262460 ZNF334Q9HCZ1 680 aaPredicted RBP8.53□□□□□ -1.04
GINS1-201ENST00000262460 IL26Q9NPH9 171 aa8.53□□□□□ -1.04
GINS1-201ENST00000262460 ANAPC2Q9UJX6 822 aa8.53□□□□□ -1.04
GINS1-201ENST00000262460 DLGAP4Q9Y2H0 992 aa8.53□□□□□ -1.04
GINS1-201ENST00000262460 PRRG1O14668 218 aa8.52□□□□□ -1.04
GINS1-201ENST00000262460 CA12O43570 354 aa8.52□□□□□ -1.04
GINS1-201ENST00000262460 XPNPEP2O43895 674 aa8.52□□□□□ -1.04
GINS1-201ENST00000262460 CHEK2O96017 543 aa8.52□□□□□ -1.04
GINS1-201ENST00000262460 FGF4P08620 206 aa8.52□□□□□ -1.04
GINS1-201ENST00000262460 BMP2P12643 396 aa8.52□□□□□ -1.04
GINS1-201ENST00000262460 RFC2P35250 354 aa8.52□□□□□ -1.04
GINS1-201ENST00000262460 TGFBR1P36897 503 aa8.52□□□□□ -1.04
GINS1-201ENST00000262460 CDKN2CP42773 168 aa8.52□□□□□ -1.04
GINS1-201ENST00000262460 MTHFRP42898 656 aa8.52□□□□□ -1.04
GINS1-201ENST00000262460 RPS9P46781 194 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.04
GINS1-201ENST00000262460 ACADVLP49748 655 aa8.52□□□□□ -1.04
GINS1-201ENST00000262460 ATP6V0D1P61421 351 aa8.52□□□□□ -1.04
GINS1-201ENST00000262460 PHC1P78364 1004 aa8.52□□□□□ -1.04
GINS1-201ENST00000262460 HPCAP84074 193 aa8.52□□□□□ -1.04
GINS1-201ENST00000262460 BOP1Q14137 746 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.04
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