RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000249440.4

HOXD3-201, Transcript of homeobox D3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD3, Length 2,303 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD3-201ENST00000249440 RIMKLAQ8IXN7 391 aa16.16■□□□□ 0.18
HOXD3-201ENST00000249440 LRRC43Q8N309 656 aa16.16■□□□□ 0.18
HOXD3-201ENST00000249440 DRAXINQ8NBI3 349 aaPredicted RBP16.16■□□□□ 0.18
HOXD3-201ENST00000249440 PDPRQ8NCN5 879 aa16.16■□□□□ 0.18
HOXD3-201ENST00000249440 OR8J3Q8NGG0 315 aa16.16■□□□□ 0.18
HOXD3-201ENST00000249440 MRPL9Q9BYD2 267 aaKnown RBP16.16■□□□□ 0.18
HOXD3-201ENST00000249440 LHX3Q9UBR4 397 aa16.16■□□□□ 0.18
HOXD3-201ENST00000249440 CIDEBQ9UHD4 219 aa16.16■□□□□ 0.18
HOXD3-201ENST00000249440 POLR3HQ9Y535 204 aaPredicted RBP16.16■□□□□ 0.18
HOXD3-201ENST00000249440 ANKRD28O15084 1053 aa16.16■□□□□ 0.18
HOXD3-201ENST00000249440 KCNH1O95259 989 aa16.16■□□□□ 0.18
HOXD3-201ENST00000249440 RAP2AP10114 183 aa16.16■□□□□ 0.18
HOXD3-201ENST00000249440 OR1D2P34982 312 aa16.16■□□□□ 0.18
HOXD3-201ENST00000249440 FAM98BQ52LJ0 330 aaKnown RBP16.16■□□□□ 0.18
HOXD3-201ENST00000249440 LYSMD3Q7Z3D4 306 aa16.16■□□□□ 0.18
HOXD3-201ENST00000249440 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP16.16■□□□□ 0.18
HOXD3-201ENST00000249440 DTWD1Q8N5C7 304 aa16.16■□□□□ 0.18
HOXD3-201ENST00000249440 ITFG1Q8TB96 612 aa16.16■□□□□ 0.18
HOXD3-201ENST00000249440 EID2BQ96D98 161 aa16.16■□□□□ 0.18
HOXD3-201ENST00000249440 RNF38Q9H0F5 515 aa16.16■□□□□ 0.18
HOXD3-201ENST00000249440 STARD7Q9NQZ5 370 aa16.16■□□□□ 0.18
HOXD3-201ENST00000249440 TSR3Q9UJK0 312 aaKnown RBP16.16■□□□□ 0.18
HOXD3-201ENST00000249440 HOXA2O43364 376 aa16.15■□□□□ 0.18
HOXD3-201ENST00000249440 NBNO60934 754 aa16.15■□□□□ 0.18
HOXD3-201ENST00000249440 ALBP02768 609 aa16.15■□□□□ 0.18
HOXD3-201ENST00000249440 ANXA6P08133 673 aa16.15■□□□□ 0.18
HOXD3-201ENST00000249440 HMGA1P17096 107 aaKnown RBP16.15■□□□□ 0.18
HOXD3-201ENST00000249440 ADARB1P78563 741 aaKnown RBP16.15■□□□□ 0.18
HOXD3-201ENST00000249440 PYCR3Q53H96 274 aa16.15■□□□□ 0.18
HOXD3-201ENST00000249440 ARMC12Q5T9G4 340 aa16.15■□□□□ 0.18
HOXD3-201ENST00000249440 NPAS4Q8IUM7 802 aa16.15■□□□□ 0.18
HOXD3-201ENST00000249440 CARNMT1Q8N4J0 409 aa16.15■□□□□ 0.18
HOXD3-201ENST00000249440 ZNF420Q8TAQ5 688 aaPredicted RBP16.15■□□□□ 0.18
HOXD3-201ENST00000249440 RAET1EQ8TD07 263 aa16.15■□□□□ 0.18
HOXD3-201ENST00000249440 FAM126AQ9BYI3 521 aaPredicted RBP16.15■□□□□ 0.18
HOXD3-201ENST00000249440 NSUN3Q9H649 340 aaKnown RBP16.15■□□□□ 0.18
HOXD3-201ENST00000249440 CXorf21Q9HAI6 301 aa16.15■□□□□ 0.18
HOXD3-201ENST00000249440 WBP1LQ9NX94 342 aa16.15■□□□□ 0.18
HOXD3-201ENST00000249440 PCDH10Q9P2E7 1040 aa16.15■□□□□ 0.18
HOXD3-201ENST00000249440 EBF1Q9UH73 591 aa16.15■□□□□ 0.18
HOXD3-201ENST00000249440 ZMYM5Q9UJ78 669 aa16.15■□□□□ 0.18
HOXD3-201ENST00000249440 GNPTGQ9UJJ9 305 aa16.15■□□□□ 0.18
HOXD3-201ENST00000249440 RGS14O43566 566 aa16.14■□□□□ 0.18
HOXD3-201ENST00000249440 PRAMEF12O95522 483 aa16.14■□□□□ 0.18
HOXD3-201ENST00000249440 GUCA1CO95843 209 aa16.14■□□□□ 0.18
HOXD3-201ENST00000249440 GLUD1P00367 558 aa16.14■□□□□ 0.18
HOXD3-201ENST00000249440 CTPS1P17812 591 aa16.14■□□□□ 0.18
HOXD3-201ENST00000249440 RPL17P18621 184 aaKnown RBP16.14■□□□□ 0.18
HOXD3-201ENST00000249440 GGT1P19440 569 aa16.14■□□□□ 0.18
HOXD3-201ENST00000249440 RPS3P23396 243 aaKnown RBP eCLIP16.14■□□□□ 0.18
HOXD3-201ENST00000249440 DGKQP52824 942 aa16.14■□□□□ 0.18
HOXD3-201ENST00000249440 TRAF3Q13114 568 aa16.14■□□□□ 0.18
HOXD3-201ENST00000249440 MAD2L1Q13257 205 aaPredicted RBP16.14■□□□□ 0.18
HOXD3-201ENST00000249440 SELPLGQ14242 412 aa16.14■□□□□ 0.18
HOXD3-201ENST00000249440 OTUD3Q5T2D3 398 aaPredicted RBP16.14■□□□□ 0.18
HOXD3-201ENST00000249440 CCNYL2Q5T2Q4 361 aa16.14■□□□□ 0.18
HOXD3-201ENST00000249440 DHRS4L2Q6PKH6 230 aa16.14■□□□□ 0.18
HOXD3-201ENST00000249440 TBPL2Q6SJ96 375 aa16.14■□□□□ 0.18
HOXD3-201ENST00000249440 SERPINA9Q86WD7 417 aa16.14■□□□□ 0.18
HOXD3-201ENST00000249440 SLC43A3Q8NBI5 491 aa16.14■□□□□ 0.18
HOXD3-201ENST00000249440 PNPT1Q8TCS8 783 aaKnown RBP16.14■□□□□ 0.18
HOXD3-201ENST00000249440 C12orf43Q96C57 262 aaKnown RBP16.14■□□□□ 0.18
HOXD3-201ENST00000249440 ZBTB18Q99592 522 aa16.14■□□□□ 0.18
HOXD3-201ENST00000249440 HIPK3Q9H422 1215 aa16.14■□□□□ 0.18
HOXD3-201ENST00000249440 MTRRQ9UBK8 725 aa16.14■□□□□ 0.18
HOXD3-201ENST00000249440 EIF3LQ9Y262 564 aaKnown RBP16.14■□□□□ 0.18
HOXD3-201ENST00000249440 OARD1Q9Y530 152 aa16.14■□□□□ 0.18
HOXD3-201ENST00000249440 ANGPTL3Q9Y5C1 460 aa16.14■□□□□ 0.18
HOXD3-201ENST00000249440 A0A1W2PQ45 241 aaPredicted RBP16.14■□□□□ 0.17
HOXD3-201ENST00000249440 A0A1W2PQY0 241 aa16.14■□□□□ 0.17
HOXD3-201ENST00000249440 PRSS23O95084 383 aa16.14■□□□□ 0.17
HOXD3-201ENST00000249440 PRAMEF1O95521 474 aa16.14■□□□□ 0.17
HOXD3-201ENST00000249440 SLC2A4P14672 509 aa16.14■□□□□ 0.17
HOXD3-201ENST00000249440 DGKAP23743 735 aa16.14■□□□□ 0.17
HOXD3-201ENST00000249440 NFKBIAP25963 317 aa16.14■□□□□ 0.17
HOXD3-201ENST00000249440 MZF1P28698 734 aaPredicted RBP16.14■□□□□ 0.17
HOXD3-201ENST00000249440 HSPA7P48741 367 aa16.14■□□□□ 0.17
HOXD3-201ENST00000249440 ALDH3A2P51648 485 aa16.14■□□□□ 0.17
HOXD3-201ENST00000249440 ARSFP54793 590 aa16.14■□□□□ 0.17
HOXD3-201ENST00000249440 CHRNB3Q05901 458 aa16.14■□□□□ 0.17
HOXD3-201ENST00000249440 PLCL1Q15111 1095 aa16.14■□□□□ 0.17
HOXD3-201ENST00000249440 TAF12Q16514 161 aa16.14■□□□□ 0.17
HOXD3-201ENST00000249440 TMEM214Q6NUQ4 689 aaKnown RBP16.14■□□□□ 0.17
HOXD3-201ENST00000249440 FAM151BQ6UXP7 276 aa16.14■□□□□ 0.17
HOXD3-201ENST00000249440 RBFAQ8N0V3 343 aa16.14■□□□□ 0.17
HOXD3-201ENST00000249440 BCL7CQ8WUZ0 217 aaPredicted RBP16.14■□□□□ 0.17
HOXD3-201ENST00000249440 FEM1AQ9BSK4 669 aa16.14■□□□□ 0.17
HOXD3-201ENST00000249440 TSEN34Q9BSV6 310 aaKnown RBP16.14■□□□□ 0.17
HOXD3-201ENST00000249440 KLF16Q9BXK1 252 aaPredicted RBP16.14■□□□□ 0.17
HOXD3-201ENST00000249440 NTN4Q9HB63 628 aa16.14■□□□□ 0.17
HOXD3-201ENST00000249440 FCF1Q9Y324 198 aaKnown RBP16.14■□□□□ 0.17
HOXD3-201ENST00000249440 TBKBP1A7MCY6 615 aa16.13■□□□□ 0.17
HOXD3-201ENST00000249440 TBL1XO60907 577 aa16.13■□□□□ 0.17
HOXD3-201ENST00000249440 RSL1D1O76021 490 aaKnown RBP16.13■□□□□ 0.17
HOXD3-201ENST00000249440 INHAP05111 366 aa16.13■□□□□ 0.17
HOXD3-201ENST00000249440 ALPIP09923 528 aa16.13■□□□□ 0.17
HOXD3-201ENST00000249440 AKT1P31749 480 aa16.13■□□□□ 0.17
HOXD3-201ENST00000249440 EMP3P54852 163 aa16.13■□□□□ 0.17
HOXD3-201ENST00000249440 RPL38P63173 70 aaKnown RBP16.13■□□□□ 0.17
HOXD3-201ENST00000249440 PMS2P3Q13401 168 aa16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.7 ms