RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000229387.6

RFX4-201, Transcript of regulatory factor X4, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene RFX4, Length 3,378 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFX4-201ENST00000229387 ZNF518BQ9C0D4 1074 aa5.63□□□□□ -1.51
RFX4-201ENST00000229387 TWSG1Q9GZX9 223 aa5.63□□□□□ -1.51
RFX4-201ENST00000229387 OR51M1Q9H341 326 aa5.63□□□□□ -1.51
RFX4-201ENST00000229387 OSGEPL1Q9H4B0 414 aa5.63□□□□□ -1.51
RFX4-201ENST00000229387 ELP3Q9H9T3 547 aa5.63□□□□□ -1.51
RFX4-201ENST00000229387 JPH1Q9HDC5 661 aaPredicted RBP5.63□□□□□ -1.51
RFX4-201ENST00000229387 XPNPEP1Q9NQW7 623 aa5.63□□□□□ -1.51
RFX4-201ENST00000229387 PSMC3IPQ9P2W1 217 aaPredicted RBP5.63□□□□□ -1.51
RFX4-201ENST00000229387 CTSFQ9UBX1 484 aa5.63□□□□□ -1.51
RFX4-201ENST00000229387 EPHA6Q9UF33 1036 aa5.63□□□□□ -1.51
RFX4-201ENST00000229387 ZMYM5Q9UJ78 669 aa5.63□□□□□ -1.51
RFX4-201ENST00000229387 ELF5Q9UKW6 265 aaPredicted RBP5.63□□□□□ -1.51
RFX4-201ENST00000229387 USP22Q9UPT9 525 aa5.63□□□□□ -1.51
RFX4-201ENST00000229387 FKBP7Q9Y680 259 aa5.63□□□□□ -1.51
RFX4-201ENST00000229387 AP1M2Q9Y6Q5 423 aa5.63□□□□□ -1.51
RFX4-201ENST00000229387 PTPRJQ12913 1337 aa5.63□□□□□ -1.51
RFX4-201ENST00000229387 ACOD1A6NK06 481 aa5.63□□□□□ -1.51
RFX4-201ENST00000229387 EIF3DO15371 548 aaKnown RBP eCLIP5.63□□□□□ -1.51
RFX4-201ENST00000229387 RGS5O15539 181 aa5.63□□□□□ -1.51
RFX4-201ENST00000229387 CLDN3O15551 220 aa5.63□□□□□ -1.51
RFX4-201ENST00000229387 SYNCRIPO60506 623 aaKnown RBP5.63□□□□□ -1.51
RFX4-201ENST00000229387 TRIM3O75382 744 aaPredicted RBP5.63□□□□□ -1.51
RFX4-201ENST00000229387 CDC123O75794 336 aaPredicted RBP5.63□□□□□ -1.51
RFX4-201ENST00000229387 FAM155BO75949 473 aa5.63□□□□□ -1.51
RFX4-201ENST00000229387 TSPAN12O95859 305 aa5.63□□□□□ -1.51
RFX4-201ENST00000229387 EDN1P05305 212 aa5.63□□□□□ -1.51
RFX4-201ENST00000229387 APOA4P06727 396 aa5.63□□□□□ -1.51
RFX4-201ENST00000229387 NFICP08651 508 aa5.63□□□□□ -1.51
RFX4-201ENST00000229387 DARSP14868 501 aaKnown RBP5.63□□□□□ -1.51
RFX4-201ENST00000229387 TMEM11P17152 192 aa5.63□□□□□ -1.51
RFX4-201ENST00000229387 TNFSF9P41273 254 aa5.63□□□□□ -1.51
RFX4-201ENST00000229387 ARCN1P48444 511 aaKnown RBP5.63□□□□□ -1.51
RFX4-201ENST00000229387 GZMKP49863 264 aa5.63□□□□□ -1.51
RFX4-201ENST00000229387 ABCE1P61221 599 aaKnown RBP5.63□□□□□ -1.51
RFX4-201ENST00000229387 BFSP2Q13515 415 aa5.63□□□□□ -1.51
RFX4-201ENST00000229387 TNFAIP1Q13829 316 aa5.63□□□□□ -1.51
RFX4-201ENST00000229387 CTF1Q16619 201 aa5.63□□□□□ -1.51
RFX4-201ENST00000229387 EIF2S3LQ2VIR3 472 aaKnown RBP5.63□□□□□ -1.51
RFX4-201ENST00000229387 GPAT3Q53EU6 434 aa5.63□□□□□ -1.51
RFX4-201ENST00000229387 XAF1Q6GPH4 301 aa5.63□□□□□ -1.51
RFX4-201ENST00000229387 LRFN4Q6PJG9 635 aa5.63□□□□□ -1.51
RFX4-201ENST00000229387 CRTC3Q6UUV7 619 aa5.63□□□□□ -1.51
RFX4-201ENST00000229387 B3GNT9Q6UX72 402 aa5.63□□□□□ -1.51
RFX4-201ENST00000229387 RRM2BQ7LG56 351 aa5.63□□□□□ -1.51
RFX4-201ENST00000229387 GALNT10Q86SR1 603 aa5.63□□□□□ -1.51
RFX4-201ENST00000229387 OR8H2Q8N162 312 aa5.63□□□□□ -1.51
RFX4-201ENST00000229387 UBE2J2Q8N2K1 259 aa5.63□□□□□ -1.51
RFX4-201ENST00000229387 METTL4Q8N3J2 472 aa5.63□□□□□ -1.51
RFX4-201ENST00000229387 MPP5Q8N3R9 675 aa5.63□□□□□ -1.51
RFX4-201ENST00000229387 ZNF540Q8NDQ6 660 aa5.63□□□□□ -1.51
RFX4-201ENST00000229387 HIPK4Q8NE63 616 aa5.63□□□□□ -1.51
RFX4-201ENST00000229387 IPMKQ8NFU5 416 aa5.63□□□□□ -1.51
RFX4-201ENST00000229387 OLIG1Q8TAK6 271 aa5.63□□□□□ -1.51
RFX4-201ENST00000229387 PROX1Q92786 737 aa5.63□□□□□ -1.51
RFX4-201ENST00000229387 NINJ1Q92982 152 aa5.63□□□□□ -1.51
RFX4-201ENST00000229387 TOP1MTQ969P6 601 aa5.63□□□□□ -1.51
RFX4-201ENST00000229387 SLC9A7Q96T83 725 aa5.63□□□□□ -1.51
RFX4-201ENST00000229387 C11orf70Q9BRQ4 267 aa5.63□□□□□ -1.51
RFX4-201ENST00000229387 LRRC4Q9HBW1 653 aa5.63□□□□□ -1.51
RFX4-201ENST00000229387 DMAC2Q9NW81 257 aa5.63□□□□□ -1.51
RFX4-201ENST00000229387 CMTM6Q9NX76 183 aa5.63□□□□□ -1.51
RFX4-201ENST00000229387 FBXL12Q9NXK8 326 aa5.63□□□□□ -1.51
RFX4-201ENST00000229387 KLHL21Q9UJP4 597 aa5.63□□□□□ -1.51
RFX4-201ENST00000229387 ZNF214Q9UL59 606 aaPredicted RBP5.63□□□□□ -1.51
RFX4-201ENST00000229387 A0A0G2JPF8 293 aa5.63□□□□□ -1.51
RFX4-201ENST00000229387 KRT87PA6NCN2 255 aa5.63□□□□□ -1.51
RFX4-201ENST00000229387 C2orf71A6NGG8 1288 aa5.63□□□□□ -1.51
RFX4-201ENST00000229387 HNRNPCL3B7ZW38 293 aa5.63□□□□□ -1.51
RFX4-201ENST00000229387 TERTO14746 1132 aaKnown RBP5.63□□□□□ -1.51
RFX4-201ENST00000229387 SLC16A3O15427 465 aaKnown RBP5.63□□□□□ -1.51
RFX4-201ENST00000229387 SLC7A4O43246 635 aa5.63□□□□□ -1.51
RFX4-201ENST00000229387 DGAT1O75907 488 aa5.63□□□□□ -1.51
RFX4-201ENST00000229387 IGHV2-70P01814 119 aa5.63□□□□□ -1.51
RFX4-201ENST00000229387 SUPT20HL2P0C7V6 817 aa5.63□□□□□ -1.51
RFX4-201ENST00000229387 HNRNPCL4P0DMR1 293 aa5.63□□□□□ -1.51
RFX4-201ENST00000229387 RALBP11234 206 aa5.63□□□□□ -1.51
RFX4-201ENST00000229387 IFI30P13284 250 aa5.63□□□□□ -1.51
RFX4-201ENST00000229387 FMO4P31512 558 aa5.63□□□□□ -1.51
RFX4-201ENST00000229387 BMP8BP34820 402 aa5.63□□□□□ -1.51
RFX4-201ENST00000229387 RPL35P42766 123 aaKnown RBP5.63□□□□□ -1.51
RFX4-201ENST00000229387 SEPHS1P49903 392 aa5.63□□□□□ -1.51
RFX4-201ENST00000229387 CLCN5P51795 746 aa5.63□□□□□ -1.51
RFX4-201ENST00000229387 TKTL1P51854 596 aa5.63□□□□□ -1.51
RFX4-201ENST00000229387 GDF10P55107 478 aa5.63□□□□□ -1.51
RFX4-201ENST00000229387 ZNF45Q02386 682 aa5.63□□□□□ -1.51
RFX4-201ENST00000229387 TUBB3Q13509 450 aa5.63□□□□□ -1.51
RFX4-201ENST00000229387 FLOT2Q14254 428 aa5.63□□□□□ -1.51
RFX4-201ENST00000229387 STARD3Q14849 445 aa5.63□□□□□ -1.51
RFX4-201ENST00000229387 MAPK11Q15759 364 aa5.63□□□□□ -1.51
RFX4-201ENST00000229387 SMAD2Q15796 467 aaKnown RBP5.63□□□□□ -1.51
RFX4-201ENST00000229387 MAPKAPK3Q16644 382 aa5.63□□□□□ -1.51
RFX4-201ENST00000229387 INTS11Q5TA45 600 aaKnown RBP5.63□□□□□ -1.51
RFX4-201ENST00000229387 TMEM270Q6UE05 265 aa5.63□□□□□ -1.51
RFX4-201ENST00000229387 GK5Q6ZS86 529 aa5.63□□□□□ -1.51
RFX4-201ENST00000229387 BMP8AQ7Z5Y6 402 aa5.63□□□□□ -1.51
RFX4-201ENST00000229387 VSIG10LQ86VR7 867 aa5.63□□□□□ -1.51
RFX4-201ENST00000229387 ZC3H3Q8IXZ2 948 aaKnown RBP5.63□□□□□ -1.51
RFX4-201ENST00000229387 OR5B17Q8NGF7 314 aa5.63□□□□□ -1.51
RFX4-201ENST00000229387 SETD6Q8TBK2 473 aa5.63□□□□□ -1.51
RFX4-201ENST00000229387 PDCD6IPQ8WUM4 868 aaKnown RBP5.63□□□□□ -1.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.2 ms