RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000226382.3

PHOX2B-201, Transcript of paired like homeobox 2B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PHOX2B, Length 3,030 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHOX2B-201ENST00000226382 SIGIRRQ6IA17 410 aa20.35■□□□□ 0.85
PHOX2B-201ENST00000226382 TIGD7Q6NT04 549 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
PHOX2B-201ENST00000226382 STAG3L4Q8TBR4 150 aa20.35■□□□□ 0.85
PHOX2B-201ENST00000226382 METTL6Q8TCB7 284 aa20.35■□□□□ 0.85
PHOX2B-201ENST00000226382 RMDN1Q96DB5 314 aa20.35■□□□□ 0.85
PHOX2B-201ENST00000226382 SMOC2Q9H3U7 446 aa20.35■□□□□ 0.85
PHOX2B-201ENST00000226382 RASSF1Q9NS23 344 aa20.35■□□□□ 0.85
PHOX2B-201ENST00000226382 CATSPERZQ9NTU4 200 aa20.35■□□□□ 0.85
PHOX2B-201ENST00000226382 ZMAT5Q9UDW3 170 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
PHOX2B-201ENST00000226382 FBXO10Q9UK96 956 aa20.35■□□□□ 0.85
PHOX2B-201ENST00000226382 CDH1P12830 882 aa20.35■□□□□ 0.85
PHOX2B-201ENST00000226382 ACVRL1P37023 503 aa20.35■□□□□ 0.85
PHOX2B-201ENST00000226382 OXA1LQ15070 435 aa20.35■□□□□ 0.85
PHOX2B-201ENST00000226382 ADPRMQ3LIE5 342 aa20.35■□□□□ 0.85
PHOX2B-201ENST00000226382 MRNIPQ6NTE8 343 aa20.35■□□□□ 0.85
PHOX2B-201ENST00000226382 PAGE2Q7Z2X7 111 aa20.35■□□□□ 0.85
PHOX2B-201ENST00000226382 HID1Q8IV36 788 aa20.35■□□□□ 0.85
PHOX2B-201ENST00000226382 FKBP10Q96AY3 582 aa20.35■□□□□ 0.85
PHOX2B-201ENST00000226382 MBOAT4Q96T53 435 aa20.35■□□□□ 0.85
PHOX2B-201ENST00000226382 RIBC2Q9H4K1 309 aa20.35■□□□□ 0.85
PHOX2B-201ENST00000226382 TRIP12Q14669 1992 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
PHOX2B-201ENST00000226382 MUSKO15146 869 aa20.34■□□□□ 0.85
PHOX2B-201ENST00000226382 EEDO75530 441 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
PHOX2B-201ENST00000226382 JRKO75564 520 aa20.34■□□□□ 0.85
PHOX2B-201ENST00000226382 B3GALT4O96024 378 aa20.34■□□□□ 0.85
PHOX2B-201ENST00000226382 THP07101 528 aa20.34■□□□□ 0.85
PHOX2B-201ENST00000226382 CAPN1P07384 714 aa20.34■□□□□ 0.85
PHOX2B-201ENST00000226382 BMP4P12644 408 aa20.34■□□□□ 0.85
PHOX2B-201ENST00000226382 LHX1P48742 406 aa20.34■□□□□ 0.85
PHOX2B-201ENST00000226382 GPR15P49685 360 aa20.34■□□□□ 0.85
PHOX2B-201ENST00000226382 ZNF846Q147U1 533 aa20.34■□□□□ 0.85
PHOX2B-201ENST00000226382 SKIV2LQ15477 1246 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
PHOX2B-201ENST00000226382 USP43Q70EL4 1123 aa20.34■□□□□ 0.85
PHOX2B-201ENST00000226382 DET1Q7L5Y6 550 aa20.34■□□□□ 0.85
PHOX2B-201ENST00000226382 OR10T2Q8NGX3 314 aa20.34■□□□□ 0.85
PHOX2B-201ENST00000226382 TUBA1CQ9BQE3 449 aa20.34■□□□□ 0.85
PHOX2B-201ENST00000226382 ZNF408Q9H9D4 720 aa20.34■□□□□ 0.85
PHOX2B-201ENST00000226382 MRM3Q9HC36 420 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
PHOX2B-201ENST00000226382 GMIPQ9P107 970 aa20.34■□□□□ 0.85
PHOX2B-201ENST00000226382 VPS4AQ9UN37 437 aa20.34■□□□□ 0.85
PHOX2B-201ENST00000226382 A0A0G2JMZ2 1700 aa20.34■□□□□ 0.85
PHOX2B-201ENST00000226382 LRRC37A2A6NM11 1700 aa20.34■□□□□ 0.85
PHOX2B-201ENST00000226382 C16orf96A6NNT2 1141 aa20.34■□□□□ 0.85
PHOX2B-201ENST00000226382 MYO1GB0I1T2 1018 aa20.34■□□□□ 0.85
PHOX2B-201ENST00000226382 SOAT2O75908 522 aa20.34■□□□□ 0.85
PHOX2B-201ENST00000226382 RAP2AP10114 183 aa20.34■□□□□ 0.85
PHOX2B-201ENST00000226382 PFKLP17858 780 aa20.34■□□□□ 0.85
PHOX2B-201ENST00000226382 VAC14Q08AM6 782 aa20.34■□□□□ 0.85
PHOX2B-201ENST00000226382 EFEMP1Q12805 493 aa20.34■□□□□ 0.85
PHOX2B-201ENST00000226382 GTF2H3Q13889 308 aa20.34■□□□□ 0.85
PHOX2B-201ENST00000226382 RAP1GAP2Q684P5 730 aa20.34■□□□□ 0.85
PHOX2B-201ENST00000226382 PTRH1Q86Y79 214 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
PHOX2B-201ENST00000226382 SLC38A6Q8IZM9 456 aa20.34■□□□□ 0.85
PHOX2B-201ENST00000226382 CFAP52Q8N1V2 620 aa20.34■□□□□ 0.85
PHOX2B-201ENST00000226382 EFHBQ8N7U6 833 aa20.34■□□□□ 0.85
PHOX2B-201ENST00000226382 OR2T12Q8NG77 320 aa20.34■□□□□ 0.85
PHOX2B-201ENST00000226382 OR4L1Q8NH43 312 aa20.34■□□□□ 0.85
PHOX2B-201ENST00000226382 MCOLN3Q8TDD5 553 aa20.34■□□□□ 0.85
PHOX2B-201ENST00000226382 UBE2FQ969M7 185 aa20.34■□□□□ 0.85
PHOX2B-201ENST00000226382 OSER1Q9NX31 292 aa20.34■□□□□ 0.85
PHOX2B-201ENST00000226382 ABI2Q9NYB9 513 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
PHOX2B-201ENST00000226382 MYL3P08590 195 aa20.33■□□□□ 0.85
PHOX2B-201ENST00000226382 GSTM2P28161 218 aa20.33■□□□□ 0.85
PHOX2B-201ENST00000226382 CTF1Q16619 201 aa20.33■□□□□ 0.85
PHOX2B-201ENST00000226382 CATSPEREQ5SY80 951 aa20.33■□□□□ 0.85
PHOX2B-201ENST00000226382 LIMS2Q7Z4I7 341 aa20.33■□□□□ 0.85
PHOX2B-201ENST00000226382 ANKRD13BQ86YJ7 626 aa20.33■□□□□ 0.85
PHOX2B-201ENST00000226382 COLGALT2Q8IYK4 626 aa20.33■□□□□ 0.85
PHOX2B-201ENST00000226382 MTFMTQ96DP5 389 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.85
PHOX2B-201ENST00000226382 BARD1Q99728 777 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.85
PHOX2B-201ENST00000226382 RTP3Q9BQQ7 232 aa20.33■□□□□ 0.85
PHOX2B-201ENST00000226382 ACTR8Q9H981 624 aa20.33■□□□□ 0.85
PHOX2B-201ENST00000226382 WDR70Q9NW82 654 aa20.33■□□□□ 0.85
PHOX2B-201ENST00000226382 COL1A2P08123 1366 aa20.33■□□□□ 0.85
PHOX2B-201ENST00000226382 TANC1Q9C0D5 1861 aa20.33■□□□□ 0.84
PHOX2B-201ENST00000226382 MIA3Q5JRA6 1907 aa20.33■□□□□ 0.84
PHOX2B-201ENST00000226382 H0YAE9 185 aa20.33■□□□□ 0.84
PHOX2B-201ENST00000226382 ITGB1P05556 798 aa20.33■□□□□ 0.84
PHOX2B-201ENST00000226382 POLR2EP19388 210 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.84
PHOX2B-201ENST00000226382 EEFSECP57772 596 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.84
PHOX2B-201ENST00000226382 ADAM17P78536 824 aa20.33■□□□□ 0.84
PHOX2B-201ENST00000226382 EMX1Q04741 257 aaPredicted RBP20.33■□□□□ 0.84
PHOX2B-201ENST00000226382 EMX2Q04743 252 aa20.33■□□□□ 0.84
PHOX2B-201ENST00000226382 RAPSNQ13702 412 aa20.33■□□□□ 0.84
PHOX2B-201ENST00000226382 MAPRE1Q15691 268 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.84
PHOX2B-201ENST00000226382 RFTN2Q52LD8 501 aaPredicted RBP20.33■□□□□ 0.84
PHOX2B-201ENST00000226382 LAIR2Q6ISS4 152 aa20.33■□□□□ 0.84
PHOX2B-201ENST00000226382 LETMD1Q6P1Q0 360 aa20.33■□□□□ 0.84
PHOX2B-201ENST00000226382 Q6ZSR9 355 aa20.33■□□□□ 0.84
PHOX2B-201ENST00000226382 ANKRD46Q86W74 232 aa20.33■□□□□ 0.84
PHOX2B-201ENST00000226382 RIMKLAQ8IXN7 391 aa20.33■□□□□ 0.84
PHOX2B-201ENST00000226382 EEF1AKMT1Q8WVE0 214 aa20.33■□□□□ 0.84
PHOX2B-201ENST00000226382 FUBP1Q96AE4 644 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.84
PHOX2B-201ENST00000226382 GPN2Q9H9Y4 310 aaPredicted RBP20.33■□□□□ 0.84
PHOX2B-201ENST00000226382 COMMD8Q9NX08 183 aa20.33■□□□□ 0.84
PHOX2B-201ENST00000226382 GPSM3Q9Y4H4 160 aa20.33■□□□□ 0.84
PHOX2B-201ENST00000226382 SLC1A7O00341 560 aa20.32■□□□□ 0.84
PHOX2B-201ENST00000226382 NDUFS3O75489 264 aa20.32■□□□□ 0.84
PHOX2B-201ENST00000226382 PRSS23O95084 383 aa20.32■□□□□ 0.84
PHOX2B-201ENST00000226382 SLC2A4P14672 509 aa20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.2 ms