RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000132397.1

Gm20517-202, Transcript of Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 20, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Gm20517, Length 4,807 nt, Biotype nonsense mediated decay.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Lix1Q6P566 282 aa16.68■□□□□ 0.26
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Ubap2lQ80X50 1107 aaKnown RBP16.68■□□□□ 0.26
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Tmem209Q8BRG8 561 aaKnown RBP16.68■□□□□ 0.26
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Parp12Q8BZ20 711 aaKnown RBP16.68■□□□□ 0.26
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Zbtb9Q8CDC7 459 aa16.68■□□□□ 0.26
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Tp53inp2Q8CFU8 221 aa16.68■□□□□ 0.26
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Nudt13Q8JZU0 352 aa16.68■□□□□ 0.26
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Prorsd1Q9D820 169 aa16.68■□□□□ 0.26
Gm20517-202ENSMUST00000132397 DnpepQ9Z2W0 473 aa16.68■□□□□ 0.26
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Gm4924A0A1B0GR71 966 aa16.68■□□□□ 0.26
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Tex28B1AYN9 409 aa16.68■□□□□ 0.26
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Vmn2r2L7N2E9 908 aa16.68■□□□□ 0.26
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Polr3bP59470 1133 aa16.68■□□□□ 0.26
Gm20517-202ENSMUST00000132397 KapP61110 121 aa16.68■□□□□ 0.26
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Slc22a23Q3UHH2 689 aa16.68■□□□□ 0.26
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Upf3aQ3ULJ3 422 aa16.68■□□□□ 0.26
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Olfr273Q8VG87 317 aa16.68■□□□□ 0.26
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Gkn2Q9CQS6 184 aa16.68■□□□□ 0.26
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Fam217bA2AJW5 387 aa16.68■□□□□ 0.26
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Slfn9B1ARD6 910 aa16.68■□□□□ 0.26
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Atxn1lP0C7T6 687 aa16.68■□□□□ 0.26
Gm20517-202ENSMUST00000132397 MtpnP62774 118 aa16.68■□□□□ 0.26
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Angptl1Q640P2 490 aa16.68■□□□□ 0.26
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Olfr299Q7TS05 330 aa16.68■□□□□ 0.26
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Gpc2Q8BKV1 579 aa16.68■□□□□ 0.26
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Cndp1Q8BUG2 492 aa16.68■□□□□ 0.26
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Tbc1d17Q8BYH7 645 aa16.68■□□□□ 0.26
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Olfr1311Q8VET0 312 aa16.68■□□□□ 0.26
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Olfr342Q8VGK7 312 aa16.68■□□□□ 0.26
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Chid1Q922Q9 393 aa16.68■□□□□ 0.26
Gm20517-202ENSMUST00000132397 NwcQ9CQI4 244 aa16.68■□□□□ 0.26
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Prdm5Q9CXE0 599 aa16.68■□□□□ 0.26
Gm20517-202ENSMUST00000132397 KelQ9EQF2 713 aa16.68■□□□□ 0.26
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Slc7a8Q9QXW9 531 aa16.68■□□□□ 0.26
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Htatip2Q9Z2G9 242 aa16.68■□□□□ 0.26
Gm20517-202ENSMUST00000132397 2610021A01RikE9Q0Q3 834 aa16.68■□□□□ 0.26
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Tsga10ipF7A1F0 157 aa16.68■□□□□ 0.26
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Gm3336J3QMQ6 198 aa16.68■□□□□ 0.26
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Tgm3Q08189 693 aa16.68■□□□□ 0.26
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Grb10Q60760 621 aa16.68■□□□□ 0.26
Gm20517-202ENSMUST00000132397 CilpQ66K08 1184 aa16.68■□□□□ 0.26
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Olfr855Q7TRF8 312 aa16.68■□□□□ 0.26
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Olfr809Q8VEX8 328 aa16.68■□□□□ 0.26
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Tmem150aQ91WN2 271 aa16.68■□□□□ 0.26
Gm20517-202ENSMUST00000132397 HnrnpabQ99020 285 aaKnown RBP16.68■□□□□ 0.26
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Sesn3Q9CYP7 492 aa16.68■□□□□ 0.26
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Mtif3Q9CZD5 276 aa16.68■□□□□ 0.26
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Tex44Q9DA60 530 aa16.68■□□□□ 0.26
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Mageb4A2A9R3 556 aa16.67■□□□□ 0.26
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Adh6aE9Q5Z6 375 aa16.67■□□□□ 0.26
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Rc3h2P0C090 1187 aaKnown RBP16.67■□□□□ 0.26
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Cxcr5Q04683 374 aa16.67■□□□□ 0.26
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Tas2r106Q7M724 308 aa16.67■□□□□ 0.26
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Q8BGK9 164 aa16.67■□□□□ 0.26
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Cnksr3Q8BMA3 555 aa16.67■□□□□ 0.26
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Trmt2bQ8BQJ6 493 aa16.67■□□□□ 0.26
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Olfr371Q8VGB8 312 aa16.67■□□□□ 0.26
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Olfr853Q8VGG6 305 aa16.67■□□□□ 0.26
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Dkk3Q9QUN9 349 aa16.67■□□□□ 0.26
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Orc6Q9WUJ8 262 aa16.67■□□□□ 0.26
Gm20517-202ENSMUST00000132397 CercamA3KGW5 592 aa16.67■□□□□ 0.26
Gm20517-202ENSMUST00000132397 LynP25911 512 aa16.67■□□□□ 0.26
Gm20517-202ENSMUST00000132397 CtskP55097 329 aa16.67■□□□□ 0.26
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Tff2Q03404 129 aa16.67■□□□□ 0.26
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Ap5b1Q3TAP4 876 aa16.67■□□□□ 0.26
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Capn3Q64691 821 aa16.67■□□□□ 0.26
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Znf366Q6NS86 746 aa16.67■□□□□ 0.26
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Prpf38bQ80SY5 542 aaKnown RBP16.67■□□□□ 0.26
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Adam29Q811Q4 763 aa16.67■□□□□ 0.26
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Q8BWQ6 963 aa16.67■□□□□ 0.26
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Rgs8Q8BXT1 180 aa16.67■□□□□ 0.26
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Slco6c1Q8C0X7 706 aa16.67■□□□□ 0.26
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Trmt10aQ8C1Z8 328 aaKnown RBP16.67■□□□□ 0.26
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Fars2Q99M01 451 aa16.67■□□□□ 0.26
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Arl2Q9D0J4 184 aa16.67■□□□□ 0.26
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Slc19a2Q9EQN9 498 aa16.67■□□□□ 0.26
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Spag17Q5S003 2320 aa16.67■□□□□ 0.26
Gm20517-202ENSMUST00000132397 2310061I04RikB8JJ69 315 aa16.67■□□□□ 0.26
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Ccdc7bE9Q9Y3 381 aa16.67■□□□□ 0.26
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Gm10324L7N208 604 aa16.67■□□□□ 0.26
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Cpa3P15089 417 aa16.67■□□□□ 0.26
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Nckap1P28660 1128 aaKnown RBP16.67■□□□□ 0.26
Gm20517-202ENSMUST00000132397 FaddQ61160 205 aa16.67■□□□□ 0.26
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Slc25a23Q6GQS1 467 aa16.67■□□□□ 0.26
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Olfr293Q7TS10 336 aa16.67■□□□□ 0.26
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Lrrc66Q8K0B3 872 aa16.67■□□□□ 0.26
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Dclre1cQ8K4J0 705 aa16.67■□□□□ 0.26
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Zfp709Q8VC29 727 aa16.67■□□□□ 0.26
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Ssr2Q9CPW5 183 aa16.67■□□□□ 0.26
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Sh3glb1Q9JK48 365 aa16.67■□□□□ 0.26
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Fkbp9Q9Z247 570 aa16.67■□□□□ 0.26
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Myh11O08638 1972 aa16.67■□□□□ 0.26
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Lama4P97927 1816 aa16.67■□□□□ 0.26
Gm20517-202ENSMUST00000132397 NoctO35710 429 aa16.67■□□□□ 0.26
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Rgs14P97492 547 aa16.67■□□□□ 0.26
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Trim24Q64127 1051 aaKnown RBP16.67■□□□□ 0.26
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Q810N5 247 aa16.67■□□□□ 0.26
Gm20517-202ENSMUST00000132397 PvrQ8K094 408 aa16.67■□□□□ 0.26
Gm20517-202ENSMUST00000132397 St7lQ8K4P7 559 aa16.67■□□□□ 0.26
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Pcdh18Q8VHR0 1134 aa16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 168.4 ms