RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000077935.5

Trps1-201, Transcript of Zinc finger transcription factor Trps1, mousemouse

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene Trps1, Length 4,436 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Exosome, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trps1-201ENSMUST00000077935 Clp1Q99LI9 425 aa6.96□□□□□ -1.3
Trps1-201ENSMUST00000077935 Trim16Q99PP9 556 aa6.96□□□□□ -1.3
Trps1-201ENSMUST00000077935 Zfp623Q9CY99 499 aa6.96□□□□□ -1.3
Trps1-201ENSMUST00000077935 Katnal2Q9D3R6 539 aa6.96□□□□□ -1.3
Trps1-201ENSMUST00000077935 Znf354bQ9QXT9 601 aa6.96□□□□□ -1.3
Trps1-201ENSMUST00000077935 EmcnQ9R0H2 261 aa6.96□□□□□ -1.3
Trps1-201ENSMUST00000077935 Ap4s1Q9WVL1 144 aa6.96□□□□□ -1.3
Trps1-201ENSMUST00000077935 Slc22a4Q9Z306 553 aa6.96□□□□□ -1.3
Trps1-201ENSMUST00000077935 Btaf1E9QAE3 1848 aa6.95□□□□□ -1.3
Trps1-201ENSMUST00000077935 Gm4756A0A140LIS8 335 aa6.95□□□□□ -1.3
Trps1-201ENSMUST00000077935 Lrrc72A0A1Y7VMI0 288 aa6.95□□□□□ -1.3
Trps1-201ENSMUST00000077935 Olfr1049A2ARZ0 308 aa6.95□□□□□ -1.3
Trps1-201ENSMUST00000077935 Cldn34b1B1AZQ8 209 aa6.95□□□□□ -1.3
Trps1-201ENSMUST00000077935 Osbpl8B9EJ86 889 aa6.95□□□□□ -1.3
Trps1-201ENSMUST00000077935 Ptar1E9QAB6 424 aa6.95□□□□□ -1.3
Trps1-201ENSMUST00000077935 Dnajb5O89114 348 aa6.95□□□□□ -1.3
Trps1-201ENSMUST00000077935 P01652 108 aa6.95□□□□□ -1.3
Trps1-201ENSMUST00000077935 Zfp1P08042 402 aa6.95□□□□□ -1.3
Trps1-201ENSMUST00000077935 Gon7P0C8B4 98 aa6.95□□□□□ -1.3
Trps1-201ENSMUST00000077935 Il1rnP25085 178 aa6.95□□□□□ -1.3
Trps1-201ENSMUST00000077935 TktP40142 623 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
Trps1-201ENSMUST00000077935 Dlg3P70175 849 aa6.95□□□□□ -1.3
Trps1-201ENSMUST00000077935 Cct7P80313 544 aa6.95□□□□□ -1.3
Trps1-201ENSMUST00000077935 Tnfrsf26P83626 204 aa6.95□□□□□ -1.3
Trps1-201ENSMUST00000077935 Lrrc74bQ14BP6 391 aa6.95□□□□□ -1.3
Trps1-201ENSMUST00000077935 Pabpc2Q62029 628 aa6.95□□□□□ -1.3
Trps1-201ENSMUST00000077935 Ndrg1Q62433 394 aa6.95□□□□□ -1.3
Trps1-201ENSMUST00000077935 Hbs1lQ69ZS7 682 aa6.95□□□□□ -1.3
Trps1-201ENSMUST00000077935 Zdhhc24Q6IR37 284 aa6.95□□□□□ -1.3
Trps1-201ENSMUST00000077935 Efr3bQ6ZQ18 817 aa6.95□□□□□ -1.3
Trps1-201ENSMUST00000077935 Mapk15Q80Y86 549 aa6.95□□□□□ -1.3
Trps1-201ENSMUST00000077935 Stkld1Q80YS9 662 aa6.95□□□□□ -1.3
Trps1-201ENSMUST00000077935 Ubash3bQ8BGG7 638 aa6.95□□□□□ -1.3
Trps1-201ENSMUST00000077935 Fbxo9Q8BK06 437 aa6.95□□□□□ -1.3
Trps1-201ENSMUST00000077935 Usp27Q8CEG8 438 aa6.95□□□□□ -1.3
Trps1-201ENSMUST00000077935 Atg10Q8R1P4 215 aa6.95□□□□□ -1.3
Trps1-201ENSMUST00000077935 Mtfr2Q8VED8 361 aa6.95□□□□□ -1.3
Trps1-201ENSMUST00000077935 Olfr809Q8VEX8 328 aa6.95□□□□□ -1.3
Trps1-201ENSMUST00000077935 MrgprdQ91ZB8 321 aa6.95□□□□□ -1.3
Trps1-201ENSMUST00000077935 Senp2Q91ZX6 588 aa6.95□□□□□ -1.3
Trps1-201ENSMUST00000077935 MpstQ99J99 297 aa6.95□□□□□ -1.3
Trps1-201ENSMUST00000077935 Ints11Q9CWS4 600 aa6.95□□□□□ -1.3
Trps1-201ENSMUST00000077935 Cldn34b2Q9D9N2 209 aa6.95□□□□□ -1.3
Trps1-201ENSMUST00000077935 Rrp8Q9DB85 457 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
Trps1-201ENSMUST00000077935 Coro1bQ9WUM3 484 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
Trps1-201ENSMUST00000077935 TinagQ9WUR0 475 aa6.95□□□□□ -1.3
Trps1-201ENSMUST00000077935 Carm1Q9WVG6 608 aa6.95□□□□□ -1.3
Trps1-201ENSMUST00000077935 Armc4B2RY50 1037 aa6.95□□□□□ -1.3
Trps1-201ENSMUST00000077935 H2-M9O19442 342 aa6.95□□□□□ -1.3
Trps1-201ENSMUST00000077935 Azin1O35484 448 aa6.95□□□□□ -1.3
Trps1-201ENSMUST00000077935 Pmm1O35621 262 aa6.95□□□□□ -1.3
Trps1-201ENSMUST00000077935 Akap3O88987 864 aa6.95□□□□□ -1.3
Trps1-201ENSMUST00000077935 Itm2bO89051 266 aa6.95□□□□□ -1.3
Trps1-201ENSMUST00000077935 Cd40lgP27548 260 aa6.95□□□□□ -1.3
Trps1-201ENSMUST00000077935 Plin2P43883 425 aa6.95□□□□□ -1.3
Trps1-201ENSMUST00000077935 Epb41P48193 858 aa6.95□□□□□ -1.3
Trps1-201ENSMUST00000077935 Npy2rP97295 381 aa6.95□□□□□ -1.3
Trps1-201ENSMUST00000077935 StacP97306 403 aa6.95□□□□□ -1.3
Trps1-201ENSMUST00000077935 Slc17a7Q3TXX4 560 aa6.95□□□□□ -1.3
Trps1-201ENSMUST00000077935 Fcho2Q3UQN2 809 aa6.95□□□□□ -1.3
Trps1-201ENSMUST00000077935 Fam189a2Q4FZH1 290 aa6.95□□□□□ -1.3
Trps1-201ENSMUST00000077935 AbrQ5SSL4 859 aa6.95□□□□□ -1.3
Trps1-201ENSMUST00000077935 Chst10Q6PGK7 356 aa6.95□□□□□ -1.3
Trps1-201ENSMUST00000077935 Cand1Q6ZQ38 1230 aa6.95□□□□□ -1.3
Trps1-201ENSMUST00000077935 Xylt1Q811B1 953 aa6.95□□□□□ -1.3
Trps1-201ENSMUST00000077935 Prmt5Q8CIG8 637 aa6.95□□□□□ -1.3
Trps1-201ENSMUST00000077935 Ipo13Q8K0C1 963 aa6.95□□□□□ -1.3
Trps1-201ENSMUST00000077935 Il17cQ8K4C5 194 aa6.95□□□□□ -1.3
Trps1-201ENSMUST00000077935 Ace2Q8R0I0 805 aa6.95□□□□□ -1.3
Trps1-201ENSMUST00000077935 Akr1c21Q91WR5 323 aa6.95□□□□□ -1.3
Trps1-201ENSMUST00000077935 Pcdhga4Q91XY4 930 aa6.95□□□□□ -1.3
Trps1-201ENSMUST00000077935 Ccdc130Q9D516 385 aa6.95□□□□□ -1.3
Trps1-201ENSMUST00000077935 Syvn1Q9DBY1 612 aa6.95□□□□□ -1.3
Trps1-201ENSMUST00000077935 Aif1lQ9EQX4 150 aa6.95□□□□□ -1.3
Trps1-201ENSMUST00000077935 Htra2Q9JIY5 458 aa6.95□□□□□ -1.3
Trps1-201ENSMUST00000077935 Ccnl2Q9JJA7 518 aa6.95□□□□□ -1.3
Trps1-201ENSMUST00000077935 Dnajb2Q9QYI5 324 aa6.95□□□□□ -1.3
Trps1-201ENSMUST00000077935 Hao1Q9WU19 370 aa6.95□□□□□ -1.3
Trps1-201ENSMUST00000077935 HnrnpdlQ9Z130 301 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
Trps1-201ENSMUST00000077935 Zscan12Q9Z1D7 501 aa6.95□□□□□ -1.3
Trps1-201ENSMUST00000077935 Pdpk1Q9Z2A0 559 aa6.95□□□□□ -1.3
Trps1-201ENSMUST00000077935 Col11a2Q64739 1736 aa6.95□□□□□ -1.3
Trps1-201ENSMUST00000077935 Ttc3O88196 1979 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
Trps1-201ENSMUST00000077935 Gm14401A2ARV7 303 aa6.95□□□□□ -1.3
Trps1-201ENSMUST00000077935 TriqkB2B9E1 86 aa6.95□□□□□ -1.3
Trps1-201ENSMUST00000077935 Zfp277E9Q6D6 583 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
Trps1-201ENSMUST00000077935 H2-Q1O19441 368 aa6.95□□□□□ -1.3
Trps1-201ENSMUST00000077935 Dnmt3aO88508 908 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
Trps1-201ENSMUST00000077935 Hoxa4P06798 285 aa6.95□□□□□ -1.3
Trps1-201ENSMUST00000077935 Oprl1P35377 367 aa6.95□□□□□ -1.3
Trps1-201ENSMUST00000077935 Sephs2P97364 452 aa6.95□□□□□ -1.3
Trps1-201ENSMUST00000077935 Csf2raQ00941 388 aa6.95□□□□□ -1.3
Trps1-201ENSMUST00000077935 Cdk18Q04899 451 aa6.95□□□□□ -1.3
Trps1-201ENSMUST00000077935 Gdpd4Q3TT99 632 aa6.95□□□□□ -1.3
Trps1-201ENSMUST00000077935 Mapkapk3Q3UMW7 384 aa6.95□□□□□ -1.3
Trps1-201ENSMUST00000077935 Dnajc11Q5U458 559 aa6.95□□□□□ -1.3
Trps1-201ENSMUST00000077935 PmlQ60953 885 aa6.95□□□□□ -1.3
Trps1-201ENSMUST00000077935 MogQ61885 246 aa6.95□□□□□ -1.3
Trps1-201ENSMUST00000077935 S100a15aQ6S5I3 108 aa6.95□□□□□ -1.3
Trps1-201ENSMUST00000077935 Rxfp4Q7TQP4 414 aa6.95□□□□□ -1.3
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 28.1 ms