RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000001226.9

Sh3bp1-201, Transcript of SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

TSL 5 BASIC

Gene Sh3bp1, Length 2,510 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Gpr142Q7TQN9 365 aa16.83■□□□□ 0.28
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Wipi2Q80W47 445 aa16.83■□□□□ 0.28
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Insig1Q8BGI3 259 aa16.83■□□□□ 0.28
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Ikzf5Q8BU00 419 aa16.83■□□□□ 0.28
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Rbms3Q8BWL5 431 aaKnown RBP16.83■□□□□ 0.28
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Ebf4Q8K4J2 599 aa16.83■□□□□ 0.28
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Lsm1Q8VC85 133 aa16.83■□□□□ 0.28
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Nrif1Q923B3 828 aa16.83■□□□□ 0.28
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Gins4Q99LZ3 223 aa16.83■□□□□ 0.28
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Ilf2Q9CXY6 390 aaKnown RBP16.83■□□□□ 0.28
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Rnf146Q9CZW6 359 aa16.83■□□□□ 0.28
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Ribc2Q9D4Q1 309 aa16.83■□□□□ 0.28
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 MrrfQ9D6S7 262 aaKnown RBP16.83■□□□□ 0.28
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Haus5Q9D786 619 aa16.83■□□□□ 0.28
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 KelQ9EQF2 713 aa16.83■□□□□ 0.28
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Wdr46Q9Z0H1 622 aaKnown RBP16.83■□□□□ 0.28
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Sept5Q9Z2Q6 369 aa16.83■□□□□ 0.28
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Gm10406A6NAS4 205 aa16.83■□□□□ 0.28
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Gm3373A6NAS7 205 aa16.83■□□□□ 0.28
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Gm3752A6NAT4 150 aa16.83■□□□□ 0.28
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Gm3298E9PW80 205 aa16.83■□□□□ 0.28
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Gm3667K7N757 205 aa16.83■□□□□ 0.28
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Plin4O88492 1403 aa16.83■□□□□ 0.28
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Gnrh1P13562 90 aa16.83■□□□□ 0.28
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Htr5bP31387 370 aa16.83■□□□□ 0.28
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Rab8aP55258 207 aa16.83■□□□□ 0.28
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Olfr616Q3KPB0 317 aa16.83■□□□□ 0.28
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Abraxas2Q3TCJ1 415 aa16.83■□□□□ 0.28
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Ccdc61Q3UJV1 511 aa16.83■□□□□ 0.28
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Nr2c1Q505F1 590 aa16.83■□□□□ 0.28
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Gm3558Q5FWC9 205 aa16.83■□□□□ 0.28
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Phlda1Q62392 405 aa16.83■□□□□ 0.28
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Slc25a23Q6GQS1 467 aa16.83■□□□□ 0.28
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Zbtb24Q80X44 710 aa16.83■□□□□ 0.28
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 4932411N23RikQ8C0S0 470 aa16.83■□□□□ 0.28
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Dmtf1Q8CE22 761 aa16.83■□□□□ 0.28
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 BicralQ8CHH5 1074 aa16.83■□□□□ 0.28
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Zcchc9Q8R1J3 271 aaKnown RBP16.83■□□□□ 0.28
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Mospd1Q8VEL0 213 aa16.83■□□□□ 0.28
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Golga7Q91W53 137 aa16.83■□□□□ 0.28
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Ola1Q9CZ30 396 aaKnown RBP16.83■□□□□ 0.28
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Hipk3Q9ERH7 1192 aa16.83■□□□□ 0.28
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Col5a3Q9JLI2 1739 aa16.83■□□□□ 0.28
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Sae1Q9R1T2 350 aa16.83■□□□□ 0.28
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Spin2gA0A0N4SW15 236 aa16.82■□□□□ 0.28
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Olfr625-ps1A0A140T8L4 321 aa16.82■□□□□ 0.28
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Gm8334F7CD45 553 aa16.82■□□□□ 0.28
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2610008E11RikG3X964 669 aa16.82■□□□□ 0.28
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Spin2eJ3QNQ0 234 aa16.82■□□□□ 0.28
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Ring1O35730 406 aa16.82■□□□□ 0.28
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 St3gal5O88829 414 aa16.82■□□□□ 0.28
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Pcmt1P23506 227 aa16.82■□□□□ 0.28
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Ppp3ccP48455 513 aa16.82■□□□□ 0.28
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Rnf19aP50636 840 aa16.82■□□□□ 0.28
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Pdx1P52946 284 aa16.82■□□□□ 0.28
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 NogP97466 232 aa16.82■□□□□ 0.28
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Q3KNL4 93 aa16.82■□□□□ 0.28
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Sema4aQ62178 760 aa16.82■□□□□ 0.28
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Inppl1Q6P549 1257 aa16.82■□□□□ 0.28
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Mrps35Q8BJZ4 320 aaKnown RBP16.82■□□□□ 0.28
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Fignl1Q8BPY9 683 aa16.82■□□□□ 0.28
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Trib2Q8K4K3 343 aa16.82■□□□□ 0.28
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Olfr617Q8VGA1 318 aa16.82■□□□□ 0.28
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Olfr330Q8VGD9 315 aa16.82■□□□□ 0.28
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Mrps18bQ99N84 254 aa16.82■□□□□ 0.28
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 NtpcrQ9CQA9 190 aaKnown RBP16.82■□□□□ 0.28
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Dcdc2cQ9D1B8 347 aa16.82■□□□□ 0.28
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Efhd2Q9D8Y0 240 aaKnown RBP16.82■□□□□ 0.28
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 AgkQ9ESW4 421 aa16.82■□□□□ 0.28
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Olfr237-ps1K9J725 310 aa16.81■□□□□ 0.28
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Cdh1P09803 884 aa16.81■□□□□ 0.28
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Nfatc3P97305 1075 aa16.81■□□□□ 0.28
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Hddc2Q3SXD3 199 aa16.81■□□□□ 0.28
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Plk5Q4FZD7 595 aa16.81■□□□□ 0.28
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Spata48Q5NC83 441 aa16.81■□□□□ 0.28
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 HadhQ61425 314 aa16.81■□□□□ 0.28
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Creb3Q61817 404 aa16.81■□□□□ 0.28
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Znf219Q6IQX8 726 aa16.81■□□□□ 0.28
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Txndc15Q6P6J9 344 aa16.81■□□□□ 0.28
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Dna2Q6ZQJ5 1062 aa16.81■□□□□ 0.28
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Coq4Q8BGB8 266 aa16.81■□□□□ 0.28
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Susd6Q8BGE4 302 aa16.81■□□□□ 0.28
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Q8BHR8 331 aa16.81■□□□□ 0.28
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Cars2Q8BYM8 551 aa16.81■□□□□ 0.28
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Gpr22Q8BZL4 432 aa16.81■□□□□ 0.28
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Piwil2Q8CDG1 971 aa16.81■□□□□ 0.28
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 ManbaQ8K2I4 879 aa16.81■□□□□ 0.28
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Alg13Q9D8C3 1166 aaKnown RBP16.81■□□□□ 0.28
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 GabrqQ9JLF1 638 aa16.81■□□□□ 0.28
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Gbf1Q6DFZ1 1861 aa16.81■□□□□ 0.28
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Vmn2r8L7N472 848 aa16.81■□□□□ 0.28
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Psmd7P26516 321 aa16.81■□□□□ 0.28
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Foxk1P42128 719 aaKnown RBP16.81■□□□□ 0.28
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Aldh2P47738 519 aaKnown RBP16.81■□□□□ 0.28
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Ptpn5P54830 541 aa16.81■□□□□ 0.28
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Cyp2c38P56655 490 aa16.81■□□□□ 0.28
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Galnt3P70419 633 aa16.81■□□□□ 0.28
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Kcnj13P86046 360 aa16.81■□□□□ 0.28
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Gdpgp1Q3TLS3 386 aa16.81■□□□□ 0.28
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Bhlha9Q5RJB0 231 aa16.81■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 41.2 ms