RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628018.2

CAPNS1-215, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,509 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-215ENST00000628018 ABCE1P61221 599 aaKnown RBP24.47■■□□□ 1.51
CAPNS1-215ENST00000628018 GKAP1Q5VSY0 366 aaPredicted RBP24.47■■□□□ 1.51
CAPNS1-215ENST00000628018 ATG14Q6ZNE5 492 aa24.47■■□□□ 1.51
CAPNS1-215ENST00000628018 TSTD1Q8NFU3 115 aa24.47■■□□□ 1.51
CAPNS1-215ENST00000628018 ELMO1Q92556 727 aa24.47■■□□□ 1.51
CAPNS1-215ENST00000628018 ZNF514Q96K75 400 aaPredicted RBP24.47■■□□□ 1.51
CAPNS1-215ENST00000628018 LGR4Q9BXB1 951 aa24.47■■□□□ 1.51
CAPNS1-215ENST00000628018 GPR34Q9UPC5 381 aa24.47■■□□□ 1.51
CAPNS1-215ENST00000628018 CDYLQ9Y232 598 aa24.47■■□□□ 1.51
CAPNS1-215ENST00000628018 TRIOO75962 3097 aa24.46■■□□□ 1.51
CAPNS1-215ENST00000628018 LRRC72A6NJI9 287 aa24.46■■□□□ 1.51
CAPNS1-215ENST00000628018 GPC4O75487 556 aa24.46■■□□□ 1.51
CAPNS1-215ENST00000628018 ZNF8P17098 575 aaPredicted RBP24.46■■□□□ 1.51
CAPNS1-215ENST00000628018 HSPA14Q0VDF9 509 aa24.46■■□□□ 1.51
CAPNS1-215ENST00000628018 GTF2H3Q13889 308 aa24.46■■□□□ 1.51
CAPNS1-215ENST00000628018 BOP1Q14137 746 aaKnown RBP24.46■■□□□ 1.51
CAPNS1-215ENST00000628018 TMEM31Q5JXX7 168 aa24.46■■□□□ 1.51
CAPNS1-215ENST00000628018 ANO7Q6IWH7 933 aa24.46■■□□□ 1.51
CAPNS1-215ENST00000628018 SBSNQ6UWP8 590 aa24.46■■□□□ 1.51
CAPNS1-215ENST00000628018 ADAMTSL2Q86TH1 951 aa24.46■■□□□ 1.51
CAPNS1-215ENST00000628018 ASZ1Q8WWH4 475 aa24.46■■□□□ 1.51
CAPNS1-215ENST00000628018 EXT2Q93063 718 aa24.46■■□□□ 1.51
CAPNS1-215ENST00000628018 DRC3Q9H069 523 aa24.46■■□□□ 1.51
CAPNS1-215ENST00000628018 WDR26Q9H7D7 661 aa24.46■■□□□ 1.51
CAPNS1-215ENST00000628018 CYP4F12Q9HCS2 524 aa24.46■■□□□ 1.51
CAPNS1-215ENST00000628018 NCKIPSDQ9NZQ3 722 aa24.46■■□□□ 1.51
CAPNS1-215ENST00000628018 TSR3Q9UJK0 312 aaKnown RBP24.46■■□□□ 1.51
CAPNS1-215ENST00000628018 KLK8O60259 260 aa24.45■■□□□ 1.51
CAPNS1-215ENST00000628018 LYPLA1O75608 230 aaPredicted RBP24.45■■□□□ 1.51
CAPNS1-215ENST00000628018 TGDSO95455 350 aa24.45■■□□□ 1.51
CAPNS1-215ENST00000628018 IGFALSP35858 605 aa24.45■■□□□ 1.51
CAPNS1-215ENST00000628018 OVGP1Q12889 678 aa24.45■■□□□ 1.51
CAPNS1-215ENST00000628018 ZNF658BQ4V348 819 aaPredicted RBP24.45■■□□□ 1.51
CAPNS1-215ENST00000628018 CLDN23Q96B33 292 aa24.45■■□□□ 1.51
CAPNS1-215ENST00000628018 PHF21BQ96EK2 531 aa24.45■■□□□ 1.51
CAPNS1-215ENST00000628018 MOCOSQ96EN8 888 aa24.45■■□□□ 1.51
CAPNS1-215ENST00000628018 SEC16BQ96JE7 1060 aa24.45■■□□□ 1.51
CAPNS1-215ENST00000628018 LINC00615Q96LM1 132 aaPredicted RBP24.45■■□□□ 1.51
CAPNS1-215ENST00000628018 TMEM237Q96Q45 408 aa24.45■■□□□ 1.51
CAPNS1-215ENST00000628018 HHIPQ96QV1 700 aa24.45■■□□□ 1.51
CAPNS1-215ENST00000628018 SORT1Q99523 831 aa24.45■■□□□ 1.51
CAPNS1-215ENST00000628018 TMEM98Q9Y2Y6 226 aa24.45■■□□□ 1.51
CAPNS1-215ENST00000628018 COL6A3P12111 3177 aa24.45■■□□□ 1.5
CAPNS1-215ENST00000628018 TMEM202A6NGA9 273 aa24.45■■□□□ 1.5
CAPNS1-215ENST00000628018 CHUKO15111 745 aa24.45■■□□□ 1.5
CAPNS1-215ENST00000628018 SLCO2B1O94956 709 aa24.45■■□□□ 1.5
CAPNS1-215ENST00000628018 MPC1LP0DKB6 136 aa24.45■■□□□ 1.5
CAPNS1-215ENST00000628018 IMPDH1P20839 514 aa24.45■■□□□ 1.5
CAPNS1-215ENST00000628018 HK3P52790 923 aa24.45■■□□□ 1.5
CAPNS1-215ENST00000628018 PPP1R3AQ16821 1122 aa24.45■■□□□ 1.5
CAPNS1-215ENST00000628018 SPATA21Q7Z572 469 aa24.45■■□□□ 1.5
CAPNS1-215ENST00000628018 GPSM1Q86YR5 675 aa24.45■■□□□ 1.5
CAPNS1-215ENST00000628018 VRK3Q8IV63 474 aa24.45■■□□□ 1.5
CAPNS1-215ENST00000628018 ZNF547Q8IVP9 402 aa24.45■■□□□ 1.5
CAPNS1-215ENST00000628018 PJA1Q8NG27 643 aa24.45■■□□□ 1.5
CAPNS1-215ENST00000628018 L3HYPDHQ96EM0 354 aa24.45■■□□□ 1.5
CAPNS1-215ENST00000628018 FAM126AQ9BYI3 521 aaPredicted RBP24.45■■□□□ 1.5
CAPNS1-215ENST00000628018 CHRDQ9H2X0 955 aa24.45■■□□□ 1.5
CAPNS1-215ENST00000628018 MUTYHQ9UIF7 546 aa24.45■■□□□ 1.5
CAPNS1-215ENST00000628018 OR1A2Q9Y585 309 aa24.45■■□□□ 1.5
CAPNS1-215ENST00000628018 SLC5A10A0PJK1 596 aa24.44■■□□□ 1.5
CAPNS1-215ENST00000628018 SUPT3HB4E1H0 165 aa24.44■■□□□ 1.5
CAPNS1-215ENST00000628018 SLC31A1O15431 190 aa24.44■■□□□ 1.5
CAPNS1-215ENST00000628018 NPHS1O60500 1241 aa24.44■■□□□ 1.5
CAPNS1-215ENST00000628018 SUPT3HO75486 399 aa24.44■■□□□ 1.5
CAPNS1-215ENST00000628018 SEMA4FO95754 770 aa24.44■■□□□ 1.5
CAPNS1-215ENST00000628018 RCN2Q14257 317 aa24.44■■□□□ 1.5
CAPNS1-215ENST00000628018 TGFBIQ15582 683 aa24.44■■□□□ 1.5
CAPNS1-215ENST00000628018 NEK10Q6ZWH5 1172 aa24.44■■□□□ 1.5
CAPNS1-215ENST00000628018 CRLF3Q8IUI8 442 aa24.44■■□□□ 1.5
CAPNS1-215ENST00000628018 TRAPPC5Q8IUR0 188 aa24.44■■□□□ 1.5
CAPNS1-215ENST00000628018 PTGR2Q8N8N7 351 aaPredicted RBP24.44■■□□□ 1.5
CAPNS1-215ENST00000628018 DENND6BQ8NEG7 585 aa24.44■■□□□ 1.5
CAPNS1-215ENST00000628018 FZD3Q9NPG1 666 aa24.44■■□□□ 1.5
CAPNS1-215ENST00000628018 ACSS2Q9NR19 701 aa24.44■■□□□ 1.5
CAPNS1-215ENST00000628018 PHPT1Q9NRX4 125 aaPredicted RBP24.44■■□□□ 1.5
CAPNS1-215ENST00000628018 GULP1Q9UBP9 304 aa24.44■■□□□ 1.5
CAPNS1-215ENST00000628018 ADAMTS6Q9UKP5 1117 aa24.44■■□□□ 1.5
CAPNS1-215ENST00000628018 TMCO1Q9UM00 188 aa24.44■■□□□ 1.5
CAPNS1-215ENST00000628018 GSTM1P09488 218 aa24.43■■□□□ 1.5
CAPNS1-215ENST00000628018 MYCLP1P12525 358 aaPredicted RBP24.43■■□□□ 1.5
CAPNS1-215ENST00000628018 GSTM4Q03013 218 aa24.43■■□□□ 1.5
CAPNS1-215ENST00000628018 SF3A3Q12874 501 aaKnown RBP eCLIP24.43■■□□□ 1.59e-8■■■■■ 39.8
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CAPNS1-215ENST00000628018 ZNF678Q5SXM1 525 aa24.43■■□□□ 1.5
CAPNS1-215ENST00000628018 FBXO39Q8N4B4 442 aa24.43■■□□□ 1.5
CAPNS1-215ENST00000628018 CCNYL1Q8N7R7 359 aa24.43■■□□□ 1.5
CAPNS1-215ENST00000628018 FOXJ1Q92949 421 aa24.43■■□□□ 1.5
CAPNS1-215ENST00000628018 CYP8B1Q9UNU6 501 aa24.43■■□□□ 1.5
CAPNS1-215ENST00000628018 OARD1Q9Y530 152 aa24.43■■□□□ 1.5
CAPNS1-215ENST00000628018 C17orf113A0A1B0GUU1 675 aa24.42■■□□□ 1.5
CAPNS1-215ENST00000628018 GPR89AB7ZAQ6 455 aa24.42■■□□□ 1.5
CAPNS1-215ENST00000628018 LATO43561 262 aa24.42■■□□□ 1.5
CAPNS1-215ENST00000628018 GPR89BP0CG08 455 aa24.42■■□□□ 1.5
CAPNS1-215ENST00000628018 TROVE2P10155 538 aaKnown RBP eCLIP24.42■■□□□ 1.5
CAPNS1-215ENST00000628018 GFAPP14136 432 aa24.42■■□□□ 1.5
CAPNS1-215ENST00000628018 OXTRP30559 389 aa24.42■■□□□ 1.5
CAPNS1-215ENST00000628018 SERPINB5P36952 375 aa24.42■■□□□ 1.5
CAPNS1-215ENST00000628018 RPS9P46781 194 aaKnown RBP24.42■■□□□ 1.5
CAPNS1-215ENST00000628018 HERVK_113P63132 956 aa24.42■■□□□ 1.5
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