RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000617451.4

PTPRF-216, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type F, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPRF, Length 1,129 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRF-216ENST00000617451 CD180Q99467 661 aa24.37■■□□□ 1.49
PTPRF-216ENST00000617451 GPR87Q9BY21 358 aa24.37■■□□□ 1.49
PTPRF-216ENST00000617451 FGF21Q9NSA1 209 aa24.37■■□□□ 1.49
PTPRF-216ENST00000617451 OR2AG2A6NM03 316 aa24.36■■□□□ 1.49
PTPRF-216ENST00000617451 NTRK1P04629 796 aa24.36■■□□□ 1.49
PTPRF-216ENST00000617451 MTHFD1P11586 935 aaKnown RBP24.36■■□□□ 1.49
PTPRF-216ENST00000617451 COMTP21964 271 aa24.36■■□□□ 1.49
PTPRF-216ENST00000617451 SEMA5AQ13591 1074 aa24.36■■□□□ 1.49
PTPRF-216ENST00000617451 ITGA9Q13797 1035 aa24.36■■□□□ 1.49
PTPRF-216ENST00000617451 TCEAL1Q15170 157 aa24.36■■□□□ 1.49
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PTPRF-216ENST00000617451 GLT6D1Q7Z4J2 308 aa24.36■■□□□ 1.49
PTPRF-216ENST00000617451 ATCAYQ86WG3 371 aa24.36■■□□□ 1.49
PTPRF-216ENST00000617451 BLOC1S5Q8TDH9 187 aa24.36■■□□□ 1.49
PTPRF-216ENST00000617451 SEC14L1Q92503 715 aa24.36■■□□□ 1.49
PTPRF-216ENST00000617451 RUFY1Q96T51 708 aa24.36■■□□□ 1.49
PTPRF-216ENST00000617451 NHEJ1Q9H9Q4 299 aaPredicted RBP24.36■■□□□ 1.49
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PTPRF-216ENST00000617451 TLCD2A6NGC4 264 aa24.35■■□□□ 1.49
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PTPRF-216ENST00000617451 VAT1Q99536 393 aa24.35■■□□□ 1.49
PTPRF-216ENST00000617451 TRIM55Q9BYV6 548 aa24.35■■□□□ 1.49
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PTPRF-216ENST00000617451 SPOPO43791 374 aa24.34■■□□□ 1.49
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PTPRF-216ENST00000617451 KAZNQ674X7 775 aa24.34■■□□□ 1.49
PTPRF-216ENST00000617451 SPOCD1Q6ZMY3 1216 aa24.34■■□□□ 1.49
PTPRF-216ENST00000617451 PID1Q7Z2X4 250 aa24.34■■□□□ 1.49
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PTPRF-216ENST00000617451 P3H4Q92791 437 aa24.34■■□□□ 1.49
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PTPRF-216ENST00000617451 LAMB3Q13751 1172 aa24.33■■□□□ 1.49
PTPRF-216ENST00000617451 TUBB2AQ13885 445 aa24.33■■□□□ 1.49
PTPRF-216ENST00000617451 LONRF2Q1L5Z9 754 aa24.33■■□□□ 1.49
PTPRF-216ENST00000617451 SYVN1Q86TM6 617 aa24.33■■□□□ 1.49
PTPRF-216ENST00000617451 BEND7Q8N7W2 519 aaPredicted RBP24.33■■□□□ 1.49
PTPRF-216ENST00000617451 ZNF398Q8TD17 642 aa24.33■■□□□ 1.49
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PTPRF-216ENST00000617451 TUBB2BQ9BVA1 445 aa24.33■■□□□ 1.49
PTPRF-216ENST00000617451 WWP1Q9H0M0 922 aa24.33■■□□□ 1.49
PTPRF-216ENST00000617451 INTUQ9ULD6 942 aa24.33■■□□□ 1.49
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PTPRF-216ENST00000617451 PSTPIP1O43586 416 aa24.32■■□□□ 1.48
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PTPRF-216ENST00000617451 AKT1P31749 480 aa24.32■■□□□ 1.48
PTPRF-216ENST00000617451 RPS15P62841 145 aaKnown RBP24.32■■□□□ 1.48
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PTPRF-216ENST00000617451 OOSP2Q86WS3 158 aa24.32■■□□□ 1.48
PTPRF-216ENST00000617451 OR8K5Q8NH50 307 aa24.32■■□□□ 1.48
PTPRF-216ENST00000617451 ACSL5Q9ULC5 683 aa24.32■■□□□ 1.48
PTPRF-216ENST00000617451 TEX15Q9BXT5 2789 aa24.31■■□□□ 1.48
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PTPRF-216ENST00000617451 ZBTB11O95625 1053 aaPredicted RBP24.31■■□□□ 1.48
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PTPRF-216ENST00000617451 TFDP3Q5H9I0 405 aa24.31■■□□□ 1.48
PTPRF-216ENST00000617451 DUS1LQ6P1R4 473 aaKnown RBP24.31■■□□□ 1.48
PTPRF-216ENST00000617451 ZNF517Q6ZMY9 492 aaPredicted RBP24.31■■□□□ 1.48
PTPRF-216ENST00000617451 DET1Q7L5Y6 550 aa24.31■■□□□ 1.48
PTPRF-216ENST00000617451 CARFQ8N187 725 aa24.31■■□□□ 1.48
PTPRF-216ENST00000617451 SPDYE1Q8NFV5 336 aaPredicted RBP24.31■■□□□ 1.48
PTPRF-216ENST00000617451 OR2L2Q8NH16 312 aa24.31■■□□□ 1.48
PTPRF-216ENST00000617451 ZNF501Q96CX3 271 aaPredicted RBP24.31■■□□□ 1.48
PTPRF-216ENST00000617451 C12orf66Q96MD2 445 aa24.31■■□□□ 1.48
PTPRF-216ENST00000617451 QKIQ96PU8 341 aaKnown RBP eCLIP24.31■■□□□ 1.48
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