RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000597730.1

PTOV1-208, Transcript of prostate tumor overexpressed 1, human

TSL 2

Gene PTOV1, Length 327 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTOV1-208	ENST00000597730	PCDHB11	Q9Y5F2	797 aa		15.19	■□□□□ 0.02
PTOV1-208	ENST00000597730	PRRC2C	Q9Y520	2896 aa	Known RBP	15.19	■□□□□ 0.02
PTOV1-208	ENST00000597730	SPTB	P11277	2137 aa		15.19	■□□□□ 0.02
PTOV1-208	ENST00000597730	PIKFYVE	Q9Y2I7	2098 aa		15.18	■□□□□ 0.02
PTOV1-208	ENST00000597730	NBAS	A2RRP1	2371 aa		15.18	■□□□□ 0.02
PTOV1-208	ENST00000597730	STK17B	O94768	372 aa		15.18	■□□□□ 0.02
PTOV1-208	ENST00000597730	DLGAP3	O95886	979 aa		15.18	■□□□□ 0.02
PTOV1-208	ENST00000597730	TPH1	P17752	444 aa		15.18	■□□□□ 0.02
PTOV1-208	ENST00000597730	SEPHS1	P49903	392 aa		15.18	■□□□□ 0.02
PTOV1-208	ENST00000597730	GTF2H3	Q13889	308 aa		15.18	■□□□□ 0.02
PTOV1-208	ENST00000597730	CERS6	Q6ZMG9	384 aa		15.18	■□□□□ 0.02
PTOV1-208	ENST00000597730	FAM92B	Q6ZTR7	304 aa		15.18	■□□□□ 0.02
PTOV1-208	ENST00000597730	PIANP	Q8IYJ0	282 aa		15.18	■□□□□ 0.02
PTOV1-208	ENST00000597730	AVL9	Q8NBF6	648 aa		15.18	■□□□□ 0.02
PTOV1-208	ENST00000597730	CCDC112	Q8NEF3	446 aa		15.18	■□□□□ 0.02
PTOV1-208	ENST00000597730	CXorf40B	Q96DE9	158 aa		15.18	■□□□□ 0.02
PTOV1-208	ENST00000597730	RMDN2	Q96LZ7	410 aa		15.18	■□□□□ 0.02
PTOV1-208	ENST00000597730	TTC25	Q96NG3	672 aa		15.18	■□□□□ 0.02
PTOV1-208	ENST00000597730	TMEM121	Q9BTD3	319 aa		15.18	■□□□□ 0.02
PTOV1-208	ENST00000597730	ZNF768	Q9H5H4	540 aa	Known RBP	15.18	■□□□□ 0.02
PTOV1-208	ENST00000597730	ASB8	Q9H765	288 aa		15.18	■□□□□ 0.02
PTOV1-208	ENST00000597730	SEMA5B	Q9P283	1151 aa		15.18	■□□□□ 0.02
PTOV1-208	ENST00000597730	IL17B	Q9UHF5	180 aa		15.18	■□□□□ 0.02
PTOV1-208	ENST00000597730	TMEM184B	Q9Y519	407 aa	Predicted RBP	15.18	■□□□□ 0.02
PTOV1-208	ENST00000597730	IGLV3-16	A0A075B6K0	115 aa		15.17	■□□□□ 0.02
PTOV1-208	ENST00000597730	IGHV5-51	A0A0C4DH38	117 aa		15.17	■□□□□ 0.02
PTOV1-208	ENST00000597730	MGAT4D	A6NG13	374 aa		15.17	■□□□□ 0.02
PTOV1-208	ENST00000597730	C2orf81	A6NN90	581 aa		15.17	■□□□□ 0.02
PTOV1-208	ENST00000597730	ZIC2	O95409	532 aa	Predicted RBP	15.17	■□□□□ 0.02
PTOV1-208	ENST00000597730	TIAF1	O95411	115 aa		15.17	■□□□□ 0.02
PTOV1-208	ENST00000597730	F8A1	P23610	371 aa		15.17	■□□□□ 0.02
PTOV1-208	ENST00000597730	AKT1	P31749	480 aa		15.17	■□□□□ 0.02
PTOV1-208	ENST00000597730	KIF5A	Q12840	1032 aa		15.17	■□□□□ 0.02
PTOV1-208	ENST00000597730	BCL7A	Q4VC05	210 aa		15.17	■□□□□ 0.02
PTOV1-208	ENST00000597730	PRSS42	Q7Z5A4	293 aa		15.17	■□□□□ 0.02
PTOV1-208	ENST00000597730	PRUNE1	Q86TP1	453 aa		15.17	■□□□□ 0.02
PTOV1-208	ENST00000597730	NXPE1	Q8N323	547 aa		15.17	■□□□□ 0.02
PTOV1-208	ENST00000597730	KLHL6	Q8WZ60	621 aa		15.17	■□□□□ 0.02
PTOV1-208	ENST00000597730	LINC00615	Q96LM1	132 aa	Predicted RBP	15.17	■□□□□ 0.02
PTOV1-208	ENST00000597730	PPM1M	Q96MI6	270 aa		15.17	■□□□□ 0.02
PTOV1-208	ENST00000597730	WWP1	Q9H0M0	922 aa		15.17	■□□□□ 0.02
PTOV1-208	ENST00000597730	IMPACT	Q9P2X3	320 aa		15.17	■□□□□ 0.02
PTOV1-208	ENST00000597730	FAM8A1	Q9UBU6	413 aa		15.17	■□□□□ 0.02
PTOV1-208	ENST00000597730	EPHA6	Q9UF33	1036 aa		15.17	■□□□□ 0.02
PTOV1-208	ENST00000597730	DNMT3A	Q9Y6K1	912 aa	Predicted RBP	15.17	■□□□□ 0.02
PTOV1-208	ENST00000597730	TRBV5-4	A0A0C4DH59	114 aa		15.16	■□□□□ 0.02
PTOV1-208	ENST00000597730	GOLGA6L6	A8MZA4	724 aa		15.16	■□□□□ 0.02
PTOV1-208	ENST00000597730	MIF4GD	A9UHW6	222 aa	Known RBP	15.16	■□□□□ 0.02
PTOV1-208	ENST00000597730	PYCARD-AS1	I3L0S3	204 aa		15.16	■□□□□ 0.02
PTOV1-208	ENST00000597730	KCNJ13	O60928	360 aa		15.16	■□□□□ 0.02
PTOV1-208	ENST00000597730	STK10	O94804	968 aa	Known RBP	15.16	■□□□□ 0.02
PTOV1-208	ENST00000597730	ITGB2	P05107	769 aa		15.16	■□□□□ 0.02
PTOV1-208	ENST00000597730	MTHFD1	P11586	935 aa	Known RBP	15.16	■□□□□ 0.02
PTOV1-208	ENST00000597730	AMD1	P17707	334 aa		15.16	■□□□□ 0.02
PTOV1-208	ENST00000597730	VCL	P18206	1134 aa		15.16	■□□□□ 0.02
PTOV1-208	ENST00000597730	MSH3	P20585	1137 aa		15.16	■□□□□ 0.02
PTOV1-208	ENST00000597730	PSMA3	P25788	255 aa		15.16	■□□□□ 0.02
PTOV1-208	ENST00000597730	PRPSAP1	Q14558	356 aa		15.16	■□□□□ 0.02
PTOV1-208	ENST00000597730	KCNAB1	Q14722	419 aa		15.16	■□□□□ 0.02
PTOV1-208	ENST00000597730	OASL	Q15646	514 aa	Known RBP	15.16	■□□□□ 0.02
PTOV1-208	ENST00000597730	KCTD19	Q17RG1	926 aa	Predicted RBP	15.16	■□□□□ 0.02
PTOV1-208	ENST00000597730	LONRF2	Q1L5Z9	754 aa		15.16	■□□□□ 0.02
PTOV1-208	ENST00000597730	PARP6	Q2NL67	630 aa		15.16	■□□□□ 0.02
PTOV1-208	ENST00000597730	CAPRIN2	Q6IMN6	1127 aa	Known RBP	15.16	■□□□□ 0.02
PTOV1-208	ENST00000597730	TXLNB	Q8N3L3	684 aa		15.16	■□□□□ 0.02
PTOV1-208	ENST00000597730	IL22RA1	Q8N6P7	574 aa		15.16	■□□□□ 0.02
PTOV1-208	ENST00000597730	UBL4B	Q8N7F7	174 aa		15.16	■□□□□ 0.02
PTOV1-208	ENST00000597730	OR2L2	Q8NH16	312 aa		15.16	■□□□□ 0.02
PTOV1-208	ENST00000597730	TEFM	Q96QE5	360 aa	Known RBP	15.16	■□□□□ 0.02
PTOV1-208	ENST00000597730	ZCCHC2	Q9C0B9	1178 aa	Known RBP	15.16	■□□□□ 0.02
PTOV1-208	ENST00000597730	IMP3	Q9NV31	184 aa	Known RBP	15.16	■□□□□ 0.02
PTOV1-208	ENST00000597730	TERT	O14746	1132 aa	Known RBP	15.15	■□□□□ 0.02
PTOV1-208	ENST00000597730	POLR1C	O15160	346 aa	Predicted RBP	15.15	■□□□□ 0.02
PTOV1-208	ENST00000597730	NKX2-8	O15522	239 aa		15.15	■□□□□ 0.02
PTOV1-208	ENST00000597730	CRTAM	O95727	393 aa		15.15	■□□□□ 0.02
PTOV1-208	ENST00000597730	AP2A1	O95782	977 aa		15.15	■□□□□ 0.02
PTOV1-208	ENST00000597730	FOLR1	P15328	257 aa		15.15	■□□□□ 0.02
PTOV1-208	ENST00000597730	MC4R	P32245	332 aa		15.15	■□□□□ 0.02
PTOV1-208	ENST00000597730	GRIA1	P42261	906 aa		15.15	■□□□□ 0.02
PTOV1-208	ENST00000597730	PRLHR	P49683	370 aa		15.15	■□□□□ 0.02
PTOV1-208	ENST00000597730	NFKB2	Q00653	900 aa		15.15	■□□□□ 0.02
PTOV1-208	ENST00000597730	POU6F1	Q14863	301 aa		15.15	■□□□□ 0.02
PTOV1-208	ENST00000597730	ATP1A1-AS1	Q5TC04	95 aa		15.15	■□□□□ 0.02
PTOV1-208	ENST00000597730	IRGC	Q6NXR0	463 aa		15.15	■□□□□ 0.02
PTOV1-208	ENST00000597730	CEACAM20	Q6UY09	585 aa		15.15	■□□□□ 0.02
PTOV1-208	ENST00000597730	ARHGEF18	Q6ZSZ5	1173 aa		15.15	■□□□□ 0.02
PTOV1-208	ENST00000597730	ZNF605	Q86T29	641 aa		15.15	■□□□□ 0.02
PTOV1-208	ENST00000597730	RBM12B	Q8IXT5	1001 aa	Known RBP	15.15	■□□□□ 0.02
PTOV1-208	ENST00000597730	SYCE1	Q8N0S2	351 aa		15.15	■□□□□ 0.02
PTOV1-208	ENST00000597730	NLGN4X	Q8N0W4	816 aa		15.15	■□□□□ 0.02
PTOV1-208	ENST00000597730	CLDN19	Q8N6F1	224 aa		15.15	■□□□□ 0.02
PTOV1-208	ENST00000597730	GLIS1	Q8NBF1	620 aa		15.15	■□□□□ 0.02
PTOV1-208	ENST00000597730	NLGN4Y	Q8NFZ3	816 aa	Predicted RBP	15.15	■□□□□ 0.02
PTOV1-208	ENST00000597730	ELMO2	Q96JJ3	720 aa		15.15	■□□□□ 0.02
PTOV1-208	ENST00000597730	SLC41A2	Q96JW4	573 aa		15.15	■□□□□ 0.02
PTOV1-208	ENST00000597730	OR6C1	Q96RD1	312 aa		15.15	■□□□□ 0.02
PTOV1-208	ENST00000597730	RAB33B	Q9H082	229 aa		15.15	■□□□□ 0.02
PTOV1-208	ENST00000597730	MRPS18B	Q9Y676	258 aa	Known RBP	15.15	■□□□□ 0.02
PTOV1-208	ENST00000597730	HECTD1	Q9ULT8	2610 aa		15.15	■□□□□ 0.02
PTOV1-208	ENST00000597730	CCDC78	A2IDD5	438 aa		15.14	■□□□□ 0.01

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