RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550208.1

BRF1-216, Transcript of BRF1, RNA polymerase III transcription initiation factor subunit, humanhuman

TSL 3

Gene BRF1, Length 1,040 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRF1-216ENST00000550208 PRMT5O14744 637 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
BRF1-216ENST00000550208 B4GAT1O43505 415 aa22.09■■□□□ 1.13
BRF1-216ENST00000550208 TTC4O95801 387 aa22.09■■□□□ 1.13
BRF1-216ENST00000550208 F7P08709 466 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
BRF1-216ENST00000550208 OR56A5P0C7T3 313 aa22.09■■□□□ 1.13
BRF1-216ENST00000550208 PNLIPP16233 465 aa22.09■■□□□ 1.13
BRF1-216ENST00000550208 ITGB6P18564 788 aa22.09■■□□□ 1.13
BRF1-216ENST00000550208 XRCC1P18887 633 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
BRF1-216ENST00000550208 SLC19A1P41440 591 aa22.09■■□□□ 1.13
BRF1-216ENST00000550208 OR1D5P58170 312 aa22.09■■□□□ 1.13
BRF1-216ENST00000550208 CBLBQ13191 982 aa22.09■■□□□ 1.13
BRF1-216ENST00000550208 CRYMQ14894 314 aa22.09■■□□□ 1.13
BRF1-216ENST00000550208 SPANXN3Q5MJ09 141 aa22.09■■□□□ 1.13
BRF1-216ENST00000550208 CHCHD2P9Q5T1J5 151 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
BRF1-216ENST00000550208 ZDHHC24Q6UX98 284 aa22.09■■□□□ 1.13
BRF1-216ENST00000550208 UNC5AQ6ZN44 842 aa22.09■■□□□ 1.13
BRF1-216ENST00000550208 ZNF438Q7Z4V0 828 aa22.09■■□□□ 1.13
BRF1-216ENST00000550208 SLC9B2Q86UD5 537 aa22.09■■□□□ 1.13
BRF1-216ENST00000550208 MARCH9Q86YJ5 346 aa22.09■■□□□ 1.13
BRF1-216ENST00000550208 CCNJLQ8IV13 435 aa22.09■■□□□ 1.13
BRF1-216ENST00000550208 HM13Q8TCT9 377 aa22.09■■□□□ 1.13
BRF1-216ENST00000550208 TCF12Q99081 682 aa22.09■■□□□ 1.13
BRF1-216ENST00000550208 WWP1Q9H0M0 922 aa22.09■■□□□ 1.13
BRF1-216ENST00000550208 P2RY12Q9H244 342 aa22.09■■□□□ 1.13
BRF1-216ENST00000550208 CPNE7Q9UBL6 633 aa22.09■■□□□ 1.13
BRF1-216ENST00000550208 ZC3H7BQ9UGR2 993 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
BRF1-216ENST00000550208 DMGDHQ9UI17 866 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
BRF1-216ENST00000550208 ACSL5Q9ULC5 683 aa22.09■■□□□ 1.13
BRF1-216ENST00000550208 PIKFYVEQ9Y2I7 2098 aa22.09■■□□□ 1.13
BRF1-216ENST00000550208 CACNA1AO00555 2505 aa22.08■■□□□ 1.13
BRF1-216ENST00000550208 PRAMEF33A0A0G2JMD5 474 aa22.08■■□□□ 1.13
BRF1-216ENST00000550208 OR52A4PA6NMU1 304 aa22.08■■□□□ 1.13
BRF1-216ENST00000550208 IQCF5A8MTL0 148 aa22.08■■□□□ 1.13
BRF1-216ENST00000550208 QSOX1O00391 747 aa22.08■■□□□ 1.13
BRF1-216ENST00000550208 S1PR4O95977 384 aa22.08■■□□□ 1.13
BRF1-216ENST00000550208 OGNP20774 298 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
BRF1-216ENST00000550208 FASLGP48023 281 aa22.08■■□□□ 1.13
BRF1-216ENST00000550208 UBE2IP63279 158 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
BRF1-216ENST00000550208 GUCY2DQ02846 1103 aa22.08■■□□□ 1.13
BRF1-216ENST00000550208 CTBP1Q13363 440 aa22.08■■□□□ 1.13
BRF1-216ENST00000550208 FASTKD3Q14CZ7 662 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
BRF1-216ENST00000550208 TYSND1Q2T9J0 566 aa22.08■■□□□ 1.13
BRF1-216ENST00000550208 HSP90AA5PQ58FG0 334 aa22.08■■□□□ 1.13
BRF1-216ENST00000550208 ZNF789Q5FWF6 425 aa22.08■■□□□ 1.13
BRF1-216ENST00000550208 NAPRTQ6XQN6 538 aa22.08■■□□□ 1.13
BRF1-216ENST00000550208 TMPRSS7Q7RTY8 843 aa22.08■■□□□ 1.13
BRF1-216ENST00000550208 ZNF761Q86XN6 746 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
BRF1-216ENST00000550208 CILP2Q8IUL8 1156 aa22.08■■□□□ 1.13
BRF1-216ENST00000550208 DENND6AQ8IWF6 608 aa22.08■■□□□ 1.13
BRF1-216ENST00000550208 FBXO36Q8NEA4 188 aa22.08■■□□□ 1.13
BRF1-216ENST00000550208 INSM2Q96T92 566 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
BRF1-216ENST00000550208 LRRN3Q9H3W5 708 aa22.08■■□□□ 1.13
BRF1-216ENST00000550208 COG4Q9H9E3 785 aa22.08■■□□□ 1.13
BRF1-216ENST00000550208 VPS37BQ9H9H4 285 aa22.08■■□□□ 1.13
BRF1-216ENST00000550208 SARS2Q9NP81 518 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
BRF1-216ENST00000550208 IARS2Q9NSE4 1012 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
BRF1-216ENST00000550208 A0A1W2PQM1 296 aa22.07■■□□□ 1.12
BRF1-216ENST00000550208 UBA6A0AVT1 1052 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
BRF1-216ENST00000550208 FAM149AA5PLN7 773 aa22.07■■□□□ 1.12
BRF1-216ENST00000550208 BHMG1C9JSJ3 638 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
BRF1-216ENST00000550208 MT-CO3P00414 261 aa22.07■■□□□ 1.12
BRF1-216ENST00000550208 FTH1P02794 183 aa22.07■■□□□ 1.12
BRF1-216ENST00000550208 ERVK-10P10266 1014 aa22.07■■□□□ 1.12
BRF1-216ENST00000550208 ALDH4A1P30038 563 aa22.07■■□□□ 1.12
BRF1-216ENST00000550208 FMO4P31512 558 aa22.07■■□□□ 1.12
BRF1-216ENST00000550208 EIF3BP55884 814 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
BRF1-216ENST00000550208 HHEXQ03014 270 aa22.07■■□□□ 1.12
BRF1-216ENST00000550208 CAV1Q03135 178 aa22.07■■□□□ 1.12
BRF1-216ENST00000550208 RPE65Q16518 533 aa22.07■■□□□ 1.12
BRF1-216ENST00000550208 HES3Q5TGS1 186 aa22.07■■□□□ 1.12
BRF1-216ENST00000550208 CDCP2Q5VXM1 449 aa22.07■■□□□ 1.12
BRF1-216ENST00000550208 ZNF470Q6ECI4 717 aa22.07■■□□□ 1.12
BRF1-216ENST00000550208 KCNMB4Q86W47 210 aa22.07■■□□□ 1.12
BRF1-216ENST00000550208 KRT222Q8N1A0 295 aa22.07■■□□□ 1.12
BRF1-216ENST00000550208 SPDYE1Q8NFV5 336 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
BRF1-216ENST00000550208 FBXO25Q8TCJ0 367 aa22.07■■□□□ 1.12
BRF1-216ENST00000550208 LKAAEAR1Q8TD35 194 aa22.07■■□□□ 1.12
BRF1-216ENST00000550208 SEC14L1Q92503 715 aa22.07■■□□□ 1.12
BRF1-216ENST00000550208 ELMO1Q92556 727 aa22.07■■□□□ 1.12
BRF1-216ENST00000550208 LPGAT1Q92604 370 aa22.07■■□□□ 1.12
BRF1-216ENST00000550208 SCNM1Q9BWG6 230 aa22.07■■□□□ 1.12
BRF1-216ENST00000550208 EPB41L5Q9HCM4 733 aa22.07■■□□□ 1.12
BRF1-216ENST00000550208 KLK13Q9UKR3 277 aa22.07■■□□□ 1.12
BRF1-216ENST00000550208 CRYL1Q9Y2S2 319 aa22.07■■□□□ 1.12
BRF1-216ENST00000550208 ZNF500O60304 480 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
BRF1-216ENST00000550208 VIPP01282 170 aa22.06■■□□□ 1.12
BRF1-216ENST00000550208 RPLP0P05388 317 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
BRF1-216ENST00000550208 GSTM1P09488 218 aa22.06■■□□□ 1.12
BRF1-216ENST00000550208 RPS3P23396 243 aaKnown RBP eCLIP22.06■■□□□ 1.12
BRF1-216ENST00000550208 PDHA2P29803 388 aa22.06■■□□□ 1.12
BRF1-216ENST00000550208 HALP42357 657 aa22.06■■□□□ 1.12
BRF1-216ENST00000550208 GSTM4Q03013 218 aa22.06■■□□□ 1.12
BRF1-216ENST00000550208 NR1D2Q14995 579 aa22.06■■□□□ 1.12
BRF1-216ENST00000550208 BRD3Q15059 726 aa22.06■■□□□ 1.12
BRF1-216ENST00000550208 GLE1Q53GS7 698 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
BRF1-216ENST00000550208 STEAP4Q687X5 459 aa22.06■■□□□ 1.12
BRF1-216ENST00000550208 PTRHD1Q6GMV3 140 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
BRF1-216ENST00000550208 CAPRIN2Q6IMN6 1127 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
BRF1-216ENST00000550208 SPRED1Q7Z699 444 aa22.06■■□□□ 1.12
BRF1-216ENST00000550208 TMPRSS12Q86WS5 348 aa22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.2 ms