RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000548557.1

CASC18-202, Transcript of cancer susceptibility 18, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CASC18, Length 2,503 nt, Biotype lincRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASC18-202ENST00000548557 AP1M2Q9Y6Q5 423 aa6.5□□□□□ -1.37
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CASC18-202ENST00000548557 EIF4E1BA6NMX2 242 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
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CASC18-202ENST00000548557 KLHL2O95198 593 aa6.49□□□□□ -1.37
CASC18-202ENST00000548557 SERPINF2P08697 491 aa6.49□□□□□ -1.37
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CASC18-202ENST00000548557 TYK2P29597 1187 aa6.49□□□□□ -1.37
CASC18-202ENST00000548557 ARRB2P32121 409 aa6.49□□□□□ -1.37
CASC18-202ENST00000548557 CTSOP43234 321 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
CASC18-202ENST00000548557 GEMP55040 296 aa6.49□□□□□ -1.37
CASC18-202ENST00000548557 RHOAP61586 193 aa6.49□□□□□ -1.37
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CASC18-202ENST00000548557 PRKCQQ04759 706 aa6.49□□□□□ -1.37
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CASC18-202ENST00000548557 MINDY4Q4G0A6 757 aa6.49□□□□□ -1.37
CASC18-202ENST00000548557 FBXO43Q4G163 708 aa6.49□□□□□ -1.37
CASC18-202ENST00000548557 SLC44A4Q53GD3 710 aa6.49□□□□□ -1.37
CASC18-202ENST00000548557 HSP90AA5PQ58FG0 334 aa6.49□□□□□ -1.37
CASC18-202ENST00000548557 TMEM196Q5HYL7 178 aa6.49□□□□□ -1.37
CASC18-202ENST00000548557 GRTP1Q5TC63 336 aa6.49□□□□□ -1.37
CASC18-202ENST00000548557 C6orf163Q5TEZ5 329 aa6.49□□□□□ -1.37
CASC18-202ENST00000548557 SLC30A6Q6NXT4 461 aa6.49□□□□□ -1.37
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CASC18-202ENST00000548557 TADA1Q96BN2 335 aa6.49□□□□□ -1.37
CASC18-202ENST00000548557 MAELQ96JY0 434 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
CASC18-202ENST00000548557 RPL10LQ96L21 214 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
CASC18-202ENST00000548557 MRGPRX3Q96LB0 322 aa6.49□□□□□ -1.37
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CASC18-202ENST00000548557 DNAJC28Q9NX36 388 aa6.49□□□□□ -1.37
CASC18-202ENST00000548557 WNT16Q9UBV4 365 aa6.49□□□□□ -1.37
CASC18-202ENST00000548557 SOX13Q9UN79 622 aa6.49□□□□□ -1.37
CASC18-202ENST00000548557 APOBEC2Q9Y235 224 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
CASC18-202ENST00000548557 NYNRINQ9P2P1 1898 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
CASC18-202ENST00000548557 COL6A3P12111 3177 aa6.49□□□□□ -1.37
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