RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000545193.5

GRSF1-208, Transcript of G-rich RNA sequence binding factor 1, human

TSL 2 BASIC

Gene GRSF1, Length 2,682 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GRSF1-208	ENST00000545193	UGT1A5	P35504	534 aa		15.49	■□□□□ 0.07
GRSF1-208	ENST00000545193	CLCN7	P51798	805 aa		15.49	■□□□□ 0.07
GRSF1-208	ENST00000545193	C1QTNF12	Q5T7M4	302 aa		15.49	■□□□□ 0.07
GRSF1-208	ENST00000545193	TPRG1	Q6ZUI0	275 aa		15.49	■□□□□ 0.07
GRSF1-208	ENST00000545193	USP45	Q70EL2	814 aa		15.49	■□□□□ 0.07
GRSF1-208	ENST00000545193	KIAA0907	Q7Z7F0	614 aa	Predicted RBP	15.49	■□□□□ 0.07
GRSF1-208	ENST00000545193	CPNE9	Q8IYJ1	553 aa		15.49	■□□□□ 0.07
GRSF1-208	ENST00000545193	AFAP1L2	Q8N4X5	818 aa		15.49	■□□□□ 0.07
GRSF1-208	ENST00000545193	C12orf76	Q8N812	135 aa	Predicted RBP	15.49	■□□□□ 0.07
GRSF1-208	ENST00000545193	CHST14	Q8NCH0	376 aa		15.49	■□□□□ 0.07
GRSF1-208	ENST00000545193	LINGO1	Q96FE5	620 aa		15.49	■□□□□ 0.07
GRSF1-208	ENST00000545193	ZNF641	Q96N77	438 aa	Predicted RBP	15.49	■□□□□ 0.07
GRSF1-208	ENST00000545193	BOC	Q9BWV1	1114 aa		15.49	■□□□□ 0.07
GRSF1-208	ENST00000545193	CLPB	Q9H078	707 aa		15.49	■□□□□ 0.07
GRSF1-208	ENST00000545193	TRAF6	Q9Y4K3	522 aa		15.49	■□□□□ 0.07
GRSF1-208	ENST00000545193	SLC9A3R1	O14745	358 aa	Predicted RBP	15.48	■□□□□ 0.07
GRSF1-208	ENST00000545193	POU2F2	P09086	479 aa		15.48	■□□□□ 0.07
GRSF1-208	ENST00000545193	ZNF26	P17031	533 aa	Predicted RBP	15.48	■□□□□ 0.07
GRSF1-208	ENST00000545193	POLR2E	P19388	210 aa	Known RBP	15.48	■□□□□ 0.07
GRSF1-208	ENST00000545193	SPAM1	P38567	509 aa		15.48	■□□□□ 0.07
GRSF1-208	ENST00000545193	PSME3	P61289	254 aa		15.48	■□□□□ 0.07
GRSF1-208	ENST00000545193	CHRNA6	Q15825	494 aa		15.48	■□□□□ 0.07
GRSF1-208	ENST00000545193	PPP1R3A	Q16821	1122 aa		15.48	■□□□□ 0.07
GRSF1-208	ENST00000545193	LRRC66	Q68CR7	880 aa		15.48	■□□□□ 0.07
GRSF1-208	ENST00000545193	GRAMD4	Q6IC98	578 aa		15.48	■□□□□ 0.07
GRSF1-208	ENST00000545193	UGT3A1	Q6NUS8	523 aa		15.48	■□□□□ 0.07
GRSF1-208	ENST00000545193	MYO1H	Q8N1T3	1032 aa		15.48	■□□□□ 0.07
GRSF1-208	ENST00000545193	CBARP	Q8N350	705 aa	Predicted RBP	15.48	■□□□□ 0.07
GRSF1-208	ENST00000545193	OR2A12	Q8NGT7	310 aa		15.48	■□□□□ 0.07
GRSF1-208	ENST00000545193	CEP70	Q8NHQ1	597 aa		15.48	■□□□□ 0.07
GRSF1-208	ENST00000545193	SMG7	Q92540	1137 aa	Known RBP	15.48	■□□□□ 0.07
GRSF1-208	ENST00000545193	ASIC4	Q96FT7	647 aa		15.48	■□□□□ 0.07
GRSF1-208	ENST00000545193	PLEKHG4B	Q96PX9	1271 aa		15.48	■□□□□ 0.07
GRSF1-208	ENST00000545193	CCDC167	Q9P0B6	97 aa		15.48	■□□□□ 0.07
GRSF1-208	ENST00000545193	BCAP29	Q9UHQ4	241 aa		15.48	■□□□□ 0.07
GRSF1-208	ENST00000545193	TMCO1	Q9UM00	188 aa		15.48	■□□□□ 0.07
GRSF1-208	ENST00000545193	RNF11	Q9Y3C5	154 aa		15.48	■□□□□ 0.07
GRSF1-208	ENST00000545193	TRBV5-4	A0A0C4DH59	114 aa		15.48	■□□□□ 0.07
GRSF1-208	ENST00000545193	SYCE1L	A8MT33	242 aa		15.48	■□□□□ 0.07
GRSF1-208	ENST00000545193	PSMC3	P17980	439 aa		15.48	■□□□□ 0.07
GRSF1-208	ENST00000545193	RPL10	P27635	214 aa	Known RBP	15.48	■□□□□ 0.07
GRSF1-208	ENST00000545193	WEE1	P30291	646 aa		15.48	■□□□□ 0.07
GRSF1-208	ENST00000545193	APOF	Q13790	326 aa		15.48	■□□□□ 0.07
GRSF1-208	ENST00000545193	GEN1	Q17RS7	908 aa		15.48	■□□□□ 0.07
GRSF1-208	ENST00000545193	PTRHD1	Q6GMV3	140 aa	Known RBP	15.48	■□□□□ 0.07
GRSF1-208	ENST00000545193	RBFA	Q8N0V3	343 aa		15.48	■□□□□ 0.07
GRSF1-208	ENST00000545193	FBXO39	Q8N4B4	442 aa		15.48	■□□□□ 0.07
GRSF1-208	ENST00000545193	CELF5	Q8N6W0	485 aa	Known RBP	15.48	■□□□□ 0.07
GRSF1-208	ENST00000545193	GPR26	Q8NDV2	337 aa		15.48	■□□□□ 0.07
GRSF1-208	ENST00000545193	SORCS1	Q8WY21	1168 aa		15.48	■□□□□ 0.07
GRSF1-208	ENST00000545193	MCCC1	Q96RQ3	725 aa	Predicted RBP	15.48	■□□□□ 0.07
GRSF1-208	ENST00000545193	SLC2A11	Q9BYW1	496 aa		15.48	■□□□□ 0.07
GRSF1-208	ENST00000545193	MEAF6	Q9HAF1	191 aa		15.48	■□□□□ 0.07
GRSF1-208	ENST00000545193	GMPR2	Q9P2T1	348 aa	Known RBP	15.48	■□□□□ 0.07
GRSF1-208	ENST00000545193	ERVW-1	Q9UQF0	538 aa		15.48	■□□□□ 0.07
GRSF1-208	ENST00000545193	DMTF1	Q9Y222	760 aa		15.48	■□□□□ 0.07
GRSF1-208	ENST00000545193	DHRS7	Q9Y394	339 aa		15.48	■□□□□ 0.07
GRSF1-208	ENST00000545193	PCDHGA7	Q9Y5G6	932 aa		15.48	■□□□□ 0.07
GRSF1-208	ENST00000545193	SNX13	Q9Y5W8	968 aa		15.48	■□□□□ 0.07
GRSF1-208	ENST00000545193	ACRV1	P26436	265 aa		15.47	■□□□□ 0.07
GRSF1-208	ENST00000545193	MAGEA8	P43361	318 aa		15.47	■□□□□ 0.07
GRSF1-208	ENST00000545193	SH3BGR	P55822	239 aa	Predicted RBP	15.47	■□□□□ 0.07
GRSF1-208	ENST00000545193	SH3BP2	P78314	561 aa		15.47	■□□□□ 0.07
GRSF1-208	ENST00000545193	DHCR24	Q15392	516 aa		15.47	■□□□□ 0.07
GRSF1-208	ENST00000545193	CLEC6A	Q6EIG7	209 aa		15.47	■□□□□ 0.07
GRSF1-208	ENST00000545193	TMC5	Q6UXY8	1006 aa		15.47	■□□□□ 0.07
GRSF1-208	ENST00000545193	RBM12B	Q8IXT5	1001 aa	Known RBP	15.47	■□□□□ 0.07
GRSF1-208	ENST00000545193	CYB5D2	Q8WUJ1	264 aa		15.47	■□□□□ 0.07
GRSF1-208	ENST00000545193	DLG3	Q92796	817 aa		15.47	■□□□□ 0.07
GRSF1-208	ENST00000545193	SLC29A1	Q99808	456 aa		15.47	■□□□□ 0.07
GRSF1-208	ENST00000545193	CIPC	Q9C0C6	399 aa		15.47	■□□□□ 0.07
GRSF1-208	ENST00000545193	CAAP1	Q9H8G2	361 aa		15.47	■□□□□ 0.07
GRSF1-208	ENST00000545193	EPS15L1	Q9UBC2	864 aa		15.47	■□□□□ 0.07
GRSF1-208	ENST00000545193	AP4S1	Q9Y587	144 aa		15.47	■□□□□ 0.07
GRSF1-208	ENST00000545193	GOLGA8CP	A6NN73	597 aa		15.47	■□□□□ 0.07
GRSF1-208	ENST00000545193	TRIM38	O00635	465 aa		15.47	■□□□□ 0.07
GRSF1-208	ENST00000545193	PPP6C	O00743	305 aa		15.47	■□□□□ 0.07
GRSF1-208	ENST00000545193	CDK4	P11802	303 aa		15.47	■□□□□ 0.07
GRSF1-208	ENST00000545193	LHCGR	P22888	699 aa		15.47	■□□□□ 0.07
GRSF1-208	ENST00000545193	RPS3	P23396	243 aa	Known RBP eCLIP	15.47	■□□□□ 0.07
GRSF1-208	ENST00000545193	PTS	Q03393	145 aa		15.47	■□□□□ 0.07
GRSF1-208	ENST00000545193	GPR33	Q49SQ1	333 aa		15.47	■□□□□ 0.07
GRSF1-208	ENST00000545193	MTX3	Q5HYI7	312 aa		15.47	■□□□□ 0.07
GRSF1-208	ENST00000545193	CLDN19	Q8N6F1	224 aa		15.47	■□□□□ 0.07
GRSF1-208	ENST00000545193	HMGCLL1	Q8TB92	370 aa		15.47	■□□□□ 0.07
GRSF1-208	ENST00000545193	FAM110B	Q8TC76	370 aa		15.47	■□□□□ 0.07
GRSF1-208	ENST00000545193	NSUN5	Q96P11	429 aa	Known RBP	15.47	■□□□□ 0.07
GRSF1-208	ENST00000545193	ASB2	Q96Q27	587 aa		15.47	■□□□□ 0.07
GRSF1-208	ENST00000545193	CIB1	Q99828	191 aa		15.47	■□□□□ 0.07
GRSF1-208	ENST00000545193	SLC39A3	Q9BRY0	314 aa		15.47	■□□□□ 0.07
GRSF1-208	ENST00000545193	BRD9	Q9H8M2	597 aa		15.47	■□□□□ 0.07
GRSF1-208	ENST00000545193	CERS4	Q9HA82	394 aa		15.47	■□□□□ 0.07
GRSF1-208	ENST00000545193	RHBDL2	Q9NX52	303 aa		15.47	■□□□□ 0.07
GRSF1-208	ENST00000545193	CRLS1	Q9UJA2	301 aa		15.47	■□□□□ 0.07
GRSF1-208	ENST00000545193	NCF1B	A6NI72	391 aa	Predicted RBP	15.46	■□□□□ 0.07
GRSF1-208	ENST00000545193	NCF1C	A8MVU1	366 aa	Predicted RBP	15.46	■□□□□ 0.07
GRSF1-208	ENST00000545193	CDK14	O94921	469 aa		15.46	■□□□□ 0.07
GRSF1-208	ENST00000545193	NCF1	P14598	390 aa	Predicted RBP	15.46	■□□□□ 0.07
GRSF1-208	ENST00000545193	EEF1D	P29692	281 aa	Known RBP	15.46	■□□□□ 0.07
GRSF1-208	ENST00000545193	RECQL	P46063	649 aa	Predicted RBP	15.46	■□□□□ 0.07

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.6 ms