RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000509638.5

LIMCH1-211, Transcript of LIM and calponin homology domains 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene LIMCH1, Length 1,570 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMCH1-211ENST00000509638 A0A087WUV0 522 aaPredicted RBP29.09■■■□□ 2.25
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LIMCH1-211ENST00000509638 H3BMM5 538 aa29.09■■■□□ 2.25
LIMCH1-211ENST00000509638 TRIM16O95361 564 aa29.09■■■□□ 2.25
LIMCH1-211ENST00000509638 GIMD1P0DJR0 217 aa29.09■■■□□ 2.25
LIMCH1-211ENST00000509638 NAB1Q13506 487 aa29.09■■■□□ 2.25
LIMCH1-211ENST00000509638 SUZ12Q15022 739 aaKnown RBP29.09■■■□□ 2.25
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LIMCH1-211ENST00000509638 ELMO1Q92556 727 aa29.09■■■□□ 2.25
LIMCH1-211ENST00000509638 FAM136AQ96C01 138 aa29.09■■■□□ 2.25
LIMCH1-211ENST00000509638 FAM122AQ96E09 287 aa29.09■■■□□ 2.25
LIMCH1-211ENST00000509638 PANX3Q96QZ0 392 aa29.09■■■□□ 2.25
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LIMCH1-211ENST00000509638 NLGN3Q9NZ94 848 aa29.09■■■□□ 2.25
LIMCH1-211ENST00000509638 FLRT2O43155 660 aa29.08■■■□□ 2.25
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LIMCH1-211ENST00000509638 GSTM4Q03013 218 aa29.08■■■□□ 2.25
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LIMCH1-211ENST00000509638 ZNF658BQ4V348 819 aaPredicted RBP29.08■■■□□ 2.25
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LIMCH1-211ENST00000509638 PLA2G5P39877 138 aa29.07■■■□□ 2.24
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LIMCH1-211ENST00000509638 ZC3HC1Q86WB0 502 aaKnown RBP29.07■■■□□ 2.24
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LIMCH1-211ENST00000509638 CHRM3P20309 590 aa29.05■■■□□ 2.24
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LIMCH1-211ENST00000509638 A6NCN8 305 aa29.04■■■□□ 2.24
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LIMCH1-211ENST00000509638 FAM155BO75949 473 aa29.04■■■□□ 2.24
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LIMCH1-211ENST00000509638 SFTPA2Q8IWL1 248 aa29.04■■■□□ 2.24
LIMCH1-211ENST00000509638 MYRIPQ8NFW9 859 aa29.04■■■□□ 2.24
LIMCH1-211ENST00000509638 NETO1Q8TDF5 533 aa29.04■■■□□ 2.24
LIMCH1-211ENST00000509638 EXOC1LA0A1B0GW35 172 aa29.03■■■□□ 2.24
LIMCH1-211ENST00000509638 LIN7AO14910 233 aaPredicted RBP29.03■■■□□ 2.24
LIMCH1-211ENST00000509638 AOAHP28039 575 aa29.03■■■□□ 2.24
LIMCH1-211ENST00000509638 HSD17B3P37058 310 aa29.03■■■□□ 2.24
LIMCH1-211ENST00000509638 TMED2Q15363 201 aa29.03■■■□□ 2.24
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