RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487269.1

FAM204A-208, Transcript of family with sequence similarity 204 member A, human

TSL 2

Gene FAM204A, Length 659 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FAM204A-208	ENST00000487269	HLA-DPA1	P20036	260 aa		11.65	□□□□□ -0.54
FAM204A-208	ENST00000487269	FECH	P22830	423 aa		11.65	□□□□□ -0.54
FAM204A-208	ENST00000487269	ADRA1A	P35348	466 aa		11.65	□□□□□ -0.54
FAM204A-208	ENST00000487269	ATP5O	P48047	213 aa		11.65	□□□□□ -0.54
FAM204A-208	ENST00000487269	ARCN1	P48444	511 aa	Known RBP	11.65	□□□□□ -0.54
FAM204A-208	ENST00000487269	DMPK	Q09013	629 aa		11.65	□□□□□ -0.54
FAM204A-208	ENST00000487269	MPP3	Q13368	585 aa		11.65	□□□□□ -0.54
FAM204A-208	ENST00000487269	MAP7	Q14244	749 aa		11.65	□□□□□ -0.54
FAM204A-208	ENST00000487269	ERV3-1	Q14264	604 aa		11.65	□□□□□ -0.54
FAM204A-208	ENST00000487269	IGFBP7	Q16270	282 aa		11.65	□□□□□ -0.54
FAM204A-208	ENST00000487269	FBXO38	Q6PIJ6	1188 aa		11.65	□□□□□ -0.54
FAM204A-208	ENST00000487269	DAAM2	Q86T65	1068 aa		11.65	□□□□□ -0.54
FAM204A-208	ENST00000487269	RCOR2	Q8IZ40	523 aa		11.65	□□□□□ -0.54
FAM204A-208	ENST00000487269	C9orf43	Q8TAL5	461 aa	Predicted RBP	11.65	□□□□□ -0.54
FAM204A-208	ENST00000487269	ZNF398	Q8TD17	642 aa		11.65	□□□□□ -0.54
FAM204A-208	ENST00000487269	INSM2	Q96T92	566 aa	Predicted RBP	11.65	□□□□□ -0.54
FAM204A-208	ENST00000487269	MAP3K3	Q99759	626 aa		11.65	□□□□□ -0.54
FAM204A-208	ENST00000487269	WWP1	Q9H0M0	922 aa		11.65	□□□□□ -0.54
FAM204A-208	ENST00000487269	GBA3	Q9H227	469 aa		11.65	□□□□□ -0.54
FAM204A-208	ENST00000487269	TRIT1	Q9H3H1	467 aa	Known RBP	11.65	□□□□□ -0.54
FAM204A-208	ENST00000487269	IMP3	Q9NV31	184 aa	Known RBP	11.65	□□□□□ -0.54
FAM204A-208	ENST00000487269	HACD3	Q9P035	362 aa		11.65	□□□□□ -0.54
FAM204A-208	ENST00000487269	SEMA5B	Q9P283	1151 aa		11.65	□□□□□ -0.54
FAM204A-208	ENST00000487269	FKBPL	Q9UIM3	349 aa		11.65	□□□□□ -0.54
FAM204A-208	ENST00000487269	TUBD1	Q9UJT1	453 aa		11.65	□□□□□ -0.54
FAM204A-208	ENST00000487269	KCNMB2	Q9Y691	235 aa		11.65	□□□□□ -0.54
FAM204A-208	ENST00000487269	DUSP10	Q9Y6W6	482 aa		11.65	□□□□□ -0.54
FAM204A-208	ENST00000487269	DOPEY2	Q9Y3R5	2298 aa		11.64	□□□□□ -0.55
FAM204A-208	ENST00000487269	HACD1	B0YJ81	288 aa		11.64	□□□□□ -0.55
FAM204A-208	ENST00000487269	STX7	O15400	261 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
FAM204A-208	ENST00000487269	TOX3	O15405	576 aa	Predicted RBP	11.64	□□□□□ -0.55
FAM204A-208	ENST00000487269	MTSS1	O43312	755 aa		11.64	□□□□□ -0.55
FAM204A-208	ENST00000487269	PRAMEF1	O95521	474 aa		11.64	□□□□□ -0.55
FAM204A-208	ENST00000487269	MTHFD1	P11586	935 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
FAM204A-208	ENST00000487269	PSMB4	P28070	264 aa		11.64	□□□□□ -0.55
FAM204A-208	ENST00000487269	AKT1	P31749	480 aa		11.64	□□□□□ -0.55
FAM204A-208	ENST00000487269	HAL	P42357	657 aa		11.64	□□□□□ -0.55
FAM204A-208	ENST00000487269	XIAP	P98170	497 aa		11.64	□□□□□ -0.55
FAM204A-208	ENST00000487269	OTUD4	Q01804	1114 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
FAM204A-208	ENST00000487269	MSLN	Q13421	630 aa	Predicted RBP	11.64	□□□□□ -0.55
FAM204A-208	ENST00000487269	SPARCL1	Q14515	664 aa		11.64	□□□□□ -0.55
FAM204A-208	ENST00000487269	IL11RA	Q14626	422 aa		11.64	□□□□□ -0.55
FAM204A-208	ENST00000487269	LDLRAP1	Q5SW96	308 aa		11.64	□□□□□ -0.55
FAM204A-208	ENST00000487269	METRNL	Q641Q3	311 aa		11.64	□□□□□ -0.55
FAM204A-208	ENST00000487269	PWWP2B	Q6NUJ5	590 aa		11.64	□□□□□ -0.55
FAM204A-208	ENST00000487269	C11orf63	Q6NUN7	778 aa		11.64	□□□□□ -0.55
FAM204A-208	ENST00000487269	FAM199X	Q6PEV8	388 aa	Predicted RBP	11.64	□□□□□ -0.55
FAM204A-208	ENST00000487269	RANBP10	Q6VN20	620 aa		11.64	□□□□□ -0.55
FAM204A-208	ENST00000487269	RBM12B	Q8IXT5	1001 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
FAM204A-208	ENST00000487269	OR4K2	Q8NGD2	314 aa		11.64	□□□□□ -0.55
FAM204A-208	ENST00000487269	OR13C4	Q8NGS5	318 aa		11.64	□□□□□ -0.55
FAM204A-208	ENST00000487269	ACTL9	Q8TC94	416 aa		11.64	□□□□□ -0.55
FAM204A-208	ENST00000487269	DTX3L	Q8TDB6	740 aa		11.64	□□□□□ -0.55
FAM204A-208	ENST00000487269	BRSK1	Q8TDC3	778 aa		11.64	□□□□□ -0.55
FAM204A-208	ENST00000487269	CT55	Q8WUE5	264 aa		11.64	□□□□□ -0.55
FAM204A-208	ENST00000487269	APOBEC4	Q8WW27	367 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
FAM204A-208	ENST00000487269	STAMBPL1	Q96FJ0	436 aa		11.64	□□□□□ -0.55
FAM204A-208	ENST00000487269	ZDHHC12	Q96GR4	267 aa		11.64	□□□□□ -0.55
FAM204A-208	ENST00000487269	SLC41A2	Q96JW4	573 aa		11.64	□□□□□ -0.55
FAM204A-208	ENST00000487269	VAT1	Q99536	393 aa		11.64	□□□□□ -0.55
FAM204A-208	ENST00000487269	EFHD1	Q9BUP0	239 aa		11.64	□□□□□ -0.55
FAM204A-208	ENST00000487269	FSD1L	Q9BXM9	530 aa		11.64	□□□□□ -0.55
FAM204A-208	ENST00000487269	FAM96A	Q9H5X1	160 aa		11.64	□□□□□ -0.55
FAM204A-208	ENST00000487269	SMOX	Q9NWM0	555 aa		11.64	□□□□□ -0.55
FAM204A-208	ENST00000487269	TRHDE	Q9UKU6	1024 aa		11.64	□□□□□ -0.55
FAM204A-208	ENST00000487269	PKP3	Q9Y446	797 aa		11.64	□□□□□ -0.55
FAM204A-208	ENST00000487269	MACROD2	A1Z1Q3	448 aa		11.63	□□□□□ -0.55
FAM204A-208	ENST00000487269	GOLGA6L3	A6NEY3	463 aa		11.63	□□□□□ -0.55
FAM204A-208	ENST00000487269	APOC4-APOC2	K7ER74	178 aa		11.63	□□□□□ -0.55
FAM204A-208	ENST00000487269	APOC2	P02655	101 aa		11.63	□□□□□ -0.55
FAM204A-208	ENST00000487269	NTRK1	P04629	796 aa		11.63	□□□□□ -0.55
FAM204A-208	ENST00000487269	POLB	P06746	335 aa		11.63	□□□□□ -0.55
FAM204A-208	ENST00000487269	PRSS56	P0CW18	603 aa		11.63	□□□□□ -0.55
FAM204A-208	ENST00000487269	MSH3	P20585	1137 aa		11.63	□□□□□ -0.55
FAM204A-208	ENST00000487269	PTMS	P20962	102 aa		11.63	□□□□□ -0.55
FAM204A-208	ENST00000487269	LPO	P22079	712 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
FAM204A-208	ENST00000487269	RPS18	P62269	152 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
FAM204A-208	ENST00000487269	TMPRSS15	P98073	1019 aa		11.63	□□□□□ -0.55
FAM204A-208	ENST00000487269	TUBB3	Q13509	450 aa		11.63	□□□□□ -0.55
FAM204A-208	ENST00000487269	DNASE1L3	Q13609	305 aa		11.63	□□□□□ -0.55
FAM204A-208	ENST00000487269	PLCL1	Q15111	1095 aa		11.63	□□□□□ -0.55
FAM204A-208	ENST00000487269	SKOR2	Q2VWA4	1001 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
FAM204A-208	ENST00000487269	LARP7	Q4G0J3	582 aa	Known RBP eCLIP	11.63	□□□□□ -0.55
FAM204A-208	ENST00000487269	ANKRD20A2	Q5SQ80	823 aa		11.63	□□□□□ -0.55
FAM204A-208	ENST00000487269	ANKRD20A1	Q5TYW2	823 aa		11.63	□□□□□ -0.55
FAM204A-208	ENST00000487269	PRAMEF17	Q5VTA0	474 aa		11.63	□□□□□ -0.55
FAM204A-208	ENST00000487269	ANKRD20A3	Q5VUR7	823 aa		11.63	□□□□□ -0.55
FAM204A-208	ENST00000487269	ZDHHC20	Q5W0Z9	365 aa		11.63	□□□□□ -0.55
FAM204A-208	ENST00000487269	DENND5A	Q6IQ26	1287 aa		11.63	□□□□□ -0.55
FAM204A-208	ENST00000487269	PPP1R3B	Q86XI6	285 aa		11.63	□□□□□ -0.55
FAM204A-208	ENST00000487269	SIDT2	Q8NBJ9	832 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
FAM204A-208	ENST00000487269	CCDC110	Q8TBZ0	833 aa		11.63	□□□□□ -0.55
FAM204A-208	ENST00000487269	ALG3	Q92685	438 aa		11.63	□□□□□ -0.55
FAM204A-208	ENST00000487269	RBM41	Q96IZ5	413 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
FAM204A-208	ENST00000487269	RMDN2	Q96LZ7	410 aa		11.63	□□□□□ -0.55
FAM204A-208	ENST00000487269	ZCCHC2	Q9C0B9	1178 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
FAM204A-208	ENST00000487269	RAB33B	Q9H082	229 aa		11.63	□□□□□ -0.55
FAM204A-208	ENST00000487269	ASB8	Q9H765	288 aa		11.63	□□□□□ -0.55
FAM204A-208	ENST00000487269	TP53TG5	Q9Y2B4	290 aa		11.63	□□□□□ -0.55
FAM204A-208	ENST00000487269	REXO2	Q9Y3B8	237 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55

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