RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000467435.1

HDLBP-231, Transcript of high density lipoprotein binding protein, human

TSL 2

Gene HDLBP, Length 639 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HDLBP-231	ENST00000467435	SAR1A	Q9NR31	198 aa		12.1	□□□□□ -0.47
HDLBP-231	ENST00000467435	SERGEF	Q9UGK8	458 aa		12.1	□□□□□ -0.47
HDLBP-231	ENST00000467435	EIF2B4	Q9UI10	523 aa	Known RBP	12.1	□□□□□ -0.47
HDLBP-231	ENST00000467435	PCTP	Q9UKL6	214 aa		12.1	□□□□□ -0.47
HDLBP-231	ENST00000467435	ADAMTS6	Q9UKP5	1117 aa		12.1	□□□□□ -0.47
HDLBP-231	ENST00000467435	CDYL	Q9Y232	598 aa		12.1	□□□□□ -0.47
HDLBP-231	ENST00000467435	ATG2B	Q96BY7	2078 aa		12.1	□□□□□ -0.47
HDLBP-231	ENST00000467435	TNRC18	O15417	2968 aa	Predicted RBP	12.1	□□□□□ -0.47
HDLBP-231	ENST00000467435	ZFC3H1	O60293	1989 aa	Known RBP	12.09	□□□□□ -0.47
HDLBP-231	ENST00000467435	GOLGA8Q	A0A0J9YX86	632 aa		12.09	□□□□□ -0.47
HDLBP-231	ENST00000467435	GOLGA8O	A6NCC3	632 aa		12.09	□□□□□ -0.47
HDLBP-231	ENST00000467435	GOLGA8N	F8WBI6	632 aa		12.09	□□□□□ -0.47
HDLBP-231	ENST00000467435		K7ESM1	405 aa		12.09	□□□□□ -0.47
HDLBP-231	ENST00000467435	UBFD1	O14562	309 aa	Known RBP	12.09	□□□□□ -0.47
HDLBP-231	ENST00000467435	FFAR2	O15552	330 aa		12.09	□□□□□ -0.47
HDLBP-231	ENST00000467435	TSPAN6	O43657	245 aa		12.09	□□□□□ -0.47
HDLBP-231	ENST00000467435	NUAK1	O60285	661 aa		12.09	□□□□□ -0.47
HDLBP-231	ENST00000467435	ADAM23	O75077	832 aa		12.09	□□□□□ -0.47
HDLBP-231	ENST00000467435	ATG13	O75143	517 aa		12.09	□□□□□ -0.47
HDLBP-231	ENST00000467435	SKAP2	O75563	359 aa	Predicted RBP	12.09	□□□□□ -0.47
HDLBP-231	ENST00000467435	RNASEH2A	O75792	299 aa	Known RBP	12.09	□□□□□ -0.47
HDLBP-231	ENST00000467435	ATP5H	O75947	161 aa		12.09	□□□□□ -0.47
HDLBP-231	ENST00000467435	JUN	P05412	331 aa	Known RBP	12.09	□□□□□ -0.47
HDLBP-231	ENST00000467435	MPC1L	P0DKB6	136 aa		12.09	□□□□□ -0.47
HDLBP-231	ENST00000467435	COL9A1	P20849	921 aa		12.09	□□□□□ -0.47
HDLBP-231	ENST00000467435	PRLHR	P49683	370 aa		12.09	□□□□□ -0.47
HDLBP-231	ENST00000467435	RGS19	P49795	217 aa		12.09	□□□□□ -0.47
HDLBP-231	ENST00000467435	AGTR2	P50052	363 aa		12.09	□□□□□ -0.47
HDLBP-231	ENST00000467435	CTSC	P53634	463 aa		12.09	□□□□□ -0.47
HDLBP-231	ENST00000467435	TAS2R38	P59533	333 aa		12.09	□□□□□ -0.47
HDLBP-231	ENST00000467435	CLC	Q05315	142 aa		12.09	□□□□□ -0.47
HDLBP-231	ENST00000467435	HSPA14	Q0VDF9	509 aa		12.09	□□□□□ -0.47
HDLBP-231	ENST00000467435	LCP2	Q13094	533 aa		12.09	□□□□□ -0.47
HDLBP-231	ENST00000467435	GTF2H3	Q13889	308 aa		12.09	□□□□□ -0.47
HDLBP-231	ENST00000467435	KRT72	Q14CN4	511 aa		12.09	□□□□□ -0.47
HDLBP-231	ENST00000467435	TBCC	Q15814	346 aa		12.09	□□□□□ -0.47
HDLBP-231	ENST00000467435	SYTL3	Q4VX76	610 aa		12.09	□□□□□ -0.47
HDLBP-231	ENST00000467435	FBXO48	Q5FWF7	155 aa		12.09	□□□□□ -0.47
HDLBP-231	ENST00000467435	CYHR1	Q6ZMK1	362 aa		12.09	□□□□□ -0.47
HDLBP-231	ENST00000467435	TRIM74	Q86UV6	250 aa		12.09	□□□□□ -0.47
HDLBP-231	ENST00000467435	SLC44A3	Q8N4M1	653 aa		12.09	□□□□□ -0.47
HDLBP-231	ENST00000467435	BEND7	Q8N7W2	519 aa	Predicted RBP	12.09	□□□□□ -0.47
HDLBP-231	ENST00000467435	IL17RC	Q8NAC3	791 aa		12.09	□□□□□ -0.47
HDLBP-231	ENST00000467435	TRPC4AP	Q8TEL6	797 aa		12.09	□□□□□ -0.47
HDLBP-231	ENST00000467435	OR52B2	Q96RD2	323 aa		12.09	□□□□□ -0.47
HDLBP-231	ENST00000467435	PHF7	Q9BWX1	381 aa	Predicted RBP	12.09	□□□□□ -0.47
HDLBP-231	ENST00000467435	TNFRSF12A	Q9NP84	129 aa		12.09	□□□□□ -0.47
HDLBP-231	ENST00000467435	MID1IP1	Q9NPA3	183 aa		12.09	□□□□□ -0.47
HDLBP-231	ENST00000467435	TCF7L2	Q9NQB0	619 aa		12.09	□□□□□ -0.47
HDLBP-231	ENST00000467435	ARL8B	Q9NVJ2	186 aa		12.09	□□□□□ -0.47
HDLBP-231	ENST00000467435	ARMCX1	Q9P291	453 aa		12.09	□□□□□ -0.47
HDLBP-231	ENST00000467435	CNOT6	Q9ULM6	557 aa	Known RBP	12.09	□□□□□ -0.47
HDLBP-231	ENST00000467435		E9PBE3	544 aa		12.08	□□□□□ -0.48
HDLBP-231	ENST00000467435	KLHL41	O60662	606 aa		12.08	□□□□□ -0.48
HDLBP-231	ENST00000467435	TM7SF2	O76062	418 aa		12.08	□□□□□ -0.48
HDLBP-231	ENST00000467435	CDK14	O94921	469 aa		12.08	□□□□□ -0.48
HDLBP-231	ENST00000467435	PCDH8	O95206	1070 aa		12.08	□□□□□ -0.48
HDLBP-231	ENST00000467435	DNTT	P04053	509 aa		12.08	□□□□□ -0.48
HDLBP-231	ENST00000467435	ASGR2	P07307	311 aa		12.08	□□□□□ -0.48
HDLBP-231	ENST00000467435	C8G	P07360	202 aa		12.08	□□□□□ -0.48
HDLBP-231	ENST00000467435	VCL	P18206	1134 aa		12.08	□□□□□ -0.48
HDLBP-231	ENST00000467435	PBLD	P30039	288 aa	Predicted RBP	12.08	□□□□□ -0.48
HDLBP-231	ENST00000467435	MRPS21	P82921	87 aa	Known RBP	12.08	□□□□□ -0.48
HDLBP-231	ENST00000467435	BTK	Q06187	659 aa		12.08	□□□□□ -0.48
HDLBP-231	ENST00000467435	TMEM115	Q12893	351 aa	Predicted RBP	12.08	□□□□□ -0.48
HDLBP-231	ENST00000467435	SP140	Q13342	867 aa		12.08	□□□□□ -0.48
HDLBP-231	ENST00000467435	UBAP2L	Q14157	1087 aa	Known RBP	12.08	□□□□□ -0.48
HDLBP-231	ENST00000467435	RBBP7	Q16576	425 aa		12.08	□□□□□ -0.48
HDLBP-231	ENST00000467435	PHKG1	Q16816	387 aa		12.08	□□□□□ -0.48
HDLBP-231	ENST00000467435	BCL7A	Q4VC05	210 aa		12.08	□□□□□ -0.48
HDLBP-231	ENST00000467435	CLEC6A	Q6EIG7	209 aa		12.08	□□□□□ -0.48
HDLBP-231	ENST00000467435	NLRP8	Q86W28	1048 aa		12.08	□□□□□ -0.48
HDLBP-231	ENST00000467435	VRK3	Q8IV63	474 aa		12.08	□□□□□ -0.48
HDLBP-231	ENST00000467435	GANC	Q8TET4	914 aa		12.08	□□□□□ -0.48
HDLBP-231	ENST00000467435	AGAP11	Q8TF27	550 aa		12.08	□□□□□ -0.48
HDLBP-231	ENST00000467435	SKA2	Q8WVK7	121 aa	Predicted RBP	12.08	□□□□□ -0.48
HDLBP-231	ENST00000467435	MSANTD3	Q96H12	275 aa		12.08	□□□□□ -0.48
HDLBP-231	ENST00000467435	LRCH3	Q96II8	777 aa		12.08	□□□□□ -0.48
HDLBP-231	ENST00000467435	EGFL8	Q99944	293 aa		12.08	□□□□□ -0.48
HDLBP-231	ENST00000467435	TUBB6	Q9BUF5	446 aa		12.08	□□□□□ -0.48
HDLBP-231	ENST00000467435	CCDC28B	Q9BUN5	200 aa		12.08	□□□□□ -0.48
HDLBP-231	ENST00000467435	CCDC106	Q9BWC9	280 aa		12.08	□□□□□ -0.48
HDLBP-231	ENST00000467435	WDR55	Q9H6Y2	383 aa	Predicted RBP	12.08	□□□□□ -0.48
HDLBP-231	ENST00000467435	SEMA4B	Q9NPR2	832 aa	Predicted RBP	12.08	□□□□□ -0.48
HDLBP-231	ENST00000467435	WWOX	Q9NZC7	414 aa		12.08	□□□□□ -0.48
HDLBP-231	ENST00000467435	FAM8A1	Q9UBU6	413 aa		12.08	□□□□□ -0.48
HDLBP-231	ENST00000467435	SORCS3	Q9UPU3	1222 aa		12.08	□□□□□ -0.48
HDLBP-231	ENST00000467435	CAPN7	Q9Y6W3	813 aa		12.08	□□□□□ -0.48
HDLBP-231	ENST00000467435		A0A1W2PQF6	199 aa		12.07	□□□□□ -0.48
HDLBP-231	ENST00000467435	PABPN1L	A6NDY0	278 aa	Known RBP	12.07	□□□□□ -0.48
HDLBP-231	ENST00000467435	IGLON5	A6NGN9	336 aa		12.07	□□□□□ -0.48
HDLBP-231	ENST00000467435	CAPN14	A8MX76	684 aa		12.07	□□□□□ -0.48
HDLBP-231	ENST00000467435	MYO1C	O00159	1063 aa		12.07	□□□□□ -0.48
HDLBP-231	ENST00000467435	E2F3	O00716	465 aa		12.07	□□□□□ -0.48
HDLBP-231	ENST00000467435	SDHD	O14521	159 aa		12.07	□□□□□ -0.48
HDLBP-231	ENST00000467435	NARS	O43776	548 aa	Known RBP	12.07	□□□□□ -0.48
HDLBP-231	ENST00000467435	HNRNPCL1	O60812	293 aa	Known RBP	12.07	□□□□□ -0.48
HDLBP-231	ENST00000467435	MLYCD	O95822	493 aa		12.07	□□□□□ -0.48
HDLBP-231	ENST00000467435	GUCA1C	O95843	209 aa		12.07	□□□□□ -0.48
HDLBP-231	ENST00000467435	PCCB	P05166	539 aa		12.07	□□□□□ -0.48

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