RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000459758.5

TTLL3-222, Transcript of tubulin tyrosine ligase like 3, human

TSL 4

Gene TTLL3, Length 555 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TTLL3-222	ENST00000459758	JAK1	P23458	1154 aa		11.34	□□□□□ -0.59
TTLL3-222	ENST00000459758	CALR	P27797	417 aa	Known RBP	11.34	□□□□□ -0.59
TTLL3-222	ENST00000459758	AKT1	P31749	480 aa		11.34	□□□□□ -0.59
TTLL3-222	ENST00000459758	HNF1B	P35680	557 aa		11.34	□□□□□ -0.59
TTLL3-222	ENST00000459758	AQP4	P55087	323 aa		11.34	□□□□□ -0.59
TTLL3-222	ENST00000459758	PPIG	Q13427	754 aa	Known RBP eCLIP	11.34	□□□□□ -0.59	1e-7	■■□□□ 12.4
TTLL3-222	ENST00000459758	GPRC6A	Q5T6X5	926 aa		11.34	□□□□□ -0.59
TTLL3-222	ENST00000459758	LPCAT4	Q643R3	524 aa		11.34	□□□□□ -0.59
TTLL3-222	ENST00000459758	SBSN	Q6UWP8	590 aa		11.34	□□□□□ -0.59
TTLL3-222	ENST00000459758	GOLGA7	Q7Z5G4	137 aa		11.34	□□□□□ -0.59
TTLL3-222	ENST00000459758	PTRH1	Q86Y79	214 aa	Known RBP	11.34	□□□□□ -0.59
TTLL3-222	ENST00000459758	TMC8	Q8IU68	726 aa		11.34	□□□□□ -0.59
TTLL3-222	ENST00000459758	CAMK1D	Q8IU85	385 aa		11.34	□□□□□ -0.59
TTLL3-222	ENST00000459758	ANKFN1	Q8N957	763 aa		11.34	□□□□□ -0.59
TTLL3-222	ENST00000459758	WFIKKN2	Q8TEU8	576 aa		11.34	□□□□□ -0.59
TTLL3-222	ENST00000459758	STARD8	Q92502	1023 aa		11.34	□□□□□ -0.59
TTLL3-222	ENST00000459758	CLP1	Q92989	425 aa	Known RBP	11.34	□□□□□ -0.59
TTLL3-222	ENST00000459758	PPWD1	Q96BP3	646 aa	Known RBP	11.34	□□□□□ -0.59
TTLL3-222	ENST00000459758	METTL2A	Q96IZ6	378 aa	Known RBP	11.34	□□□□□ -0.59
TTLL3-222	ENST00000459758	C3orf30	Q96M34	536 aa		11.34	□□□□□ -0.59
TTLL3-222	ENST00000459758	TSC22D3	Q99576	134 aa		11.34	□□□□□ -0.59
TTLL3-222	ENST00000459758	C9orf16	Q9BUW7	83 aa		11.34	□□□□□ -0.59
TTLL3-222	ENST00000459758	CD244	Q9BZW8	370 aa		11.34	□□□□□ -0.59
TTLL3-222	ENST00000459758	EPB41L1	Q9H4G0	881 aa		11.34	□□□□□ -0.59
TTLL3-222	ENST00000459758	EBF3	Q9H4W6	596 aa		11.34	□□□□□ -0.59
TTLL3-222	ENST00000459758	COPS7B	Q9H9Q2	264 aa	Predicted RBP	11.34	□□□□□ -0.59
TTLL3-222	ENST00000459758	IL23A	Q9NPF7	189 aa		11.34	□□□□□ -0.59
TTLL3-222	ENST00000459758	ACSS2	Q9NR19	701 aa		11.34	□□□□□ -0.59
TTLL3-222	ENST00000459758	CCM2L	Q9NUG4	571 aa	Predicted RBP	11.34	□□□□□ -0.59
TTLL3-222	ENST00000459758	HECA	Q9UBI9	543 aa	Predicted RBP	11.34	□□□□□ -0.59
TTLL3-222	ENST00000459758	EIF2B4	Q9UI10	523 aa	Known RBP	11.34	□□□□□ -0.59
TTLL3-222	ENST00000459758	TMED5	Q9Y3A6	229 aa		11.34	□□□□□ -0.59
TTLL3-222	ENST00000459758	SNX13	Q9Y5W8	968 aa		11.34	□□□□□ -0.59
TTLL3-222	ENST00000459758	ACTL7A	Q9Y615	435 aa		11.34	□□□□□ -0.59
TTLL3-222	ENST00000459758	DPPA5	A6NC42	116 aa		11.33	□□□□□ -0.6
TTLL3-222	ENST00000459758	NCF1B	A6NI72	391 aa	Predicted RBP	11.33	□□□□□ -0.6
TTLL3-222	ENST00000459758	NCF1C	A8MVU1	366 aa	Predicted RBP	11.33	□□□□□ -0.6
TTLL3-222	ENST00000459758	UGDH	O60701	494 aa		11.33	□□□□□ -0.6
TTLL3-222	ENST00000459758	ULK1	O75385	1050 aa		11.33	□□□□□ -0.6
TTLL3-222	ENST00000459758	OR4F21	O95013	312 aa		11.33	□□□□□ -0.6
TTLL3-222	ENST00000459758	TRIM16	O95361	564 aa		11.33	□□□□□ -0.6
TTLL3-222	ENST00000459758	IL6	P05231	212 aa		11.33	□□□□□ -0.6
TTLL3-222	ENST00000459758	GSTM1	P09488	218 aa		11.33	□□□□□ -0.6
TTLL3-222	ENST00000459758	FAM58BP	P0C7Q3	252 aa		11.33	□□□□□ -0.6
TTLL3-222	ENST00000459758	PRPS2	P11908	318 aa		11.33	□□□□□ -0.6
TTLL3-222	ENST00000459758	SRC	P12931	536 aa		11.33	□□□□□ -0.6
TTLL3-222	ENST00000459758	NCF1	P14598	390 aa	Predicted RBP	11.33	□□□□□ -0.6
TTLL3-222	ENST00000459758	BPI	P17213	487 aa		11.33	□□□□□ -0.6
TTLL3-222	ENST00000459758	PSMC3	P17980	439 aa		11.33	□□□□□ -0.6
TTLL3-222	ENST00000459758	TSPAN8	P19075	237 aa		11.33	□□□□□ -0.6
TTLL3-222	ENST00000459758	POLR2E	P19388	210 aa	Known RBP	11.33	□□□□□ -0.6
TTLL3-222	ENST00000459758	FAS	P25445	335 aa		11.33	□□□□□ -0.6
TTLL3-222	ENST00000459758	HTR1E	P28566	365 aa		11.33	□□□□□ -0.6
TTLL3-222	ENST00000459758	HNRNPF	P52597	415 aa	Known RBP	11.33	□□□□□ -0.6
TTLL3-222	ENST00000459758	HTRA4	P83105	476 aa	Predicted RBP	11.33	□□□□□ -0.6
TTLL3-222	ENST00000459758	ECT2L	Q008S8	904 aa		11.33	□□□□□ -0.6
TTLL3-222	ENST00000459758	MS4A2	Q01362	244 aa		11.33	□□□□□ -0.6
TTLL3-222	ENST00000459758	GSTM4	Q03013	218 aa		11.33	□□□□□ -0.6
TTLL3-222	ENST00000459758	NR6A1	Q15406	480 aa		11.33	□□□□□ -0.6
TTLL3-222	ENST00000459758	IMPG1	Q17R60	797 aa		11.33	□□□□□ -0.6
TTLL3-222	ENST00000459758	GGTA1P	Q4G0N0	100 aa		11.33	□□□□□ -0.6
TTLL3-222	ENST00000459758	SFT2D3	Q587I9	215 aa		11.33	□□□□□ -0.6
TTLL3-222	ENST00000459758	C6orf136	Q5SQH8	315 aa		11.33	□□□□□ -0.6
TTLL3-222	ENST00000459758	C10orf62	Q5T681	223 aa	Predicted RBP	11.33	□□□□□ -0.6
TTLL3-222	ENST00000459758	INTS11	Q5TA45	600 aa	Known RBP	11.33	□□□□□ -0.6
TTLL3-222	ENST00000459758	OR52E8	Q6IFG1	317 aa		11.33	□□□□□ -0.6
TTLL3-222	ENST00000459758	PDE12	Q6L8Q7	609 aa	Known RBP	11.33	□□□□□ -0.6
TTLL3-222	ENST00000459758	IL27RA	Q6UWB1	636 aa		11.33	□□□□□ -0.6
TTLL3-222	ENST00000459758	CYHR1	Q6ZMK1	362 aa		11.33	□□□□□ -0.6
TTLL3-222	ENST00000459758	MSANTD1	Q6ZTZ1	278 aa		11.33	□□□□□ -0.6
TTLL3-222	ENST00000459758	GAREM2	Q75VX8	874 aa		11.33	□□□□□ -0.6
TTLL3-222	ENST00000459758	ZFAND4	Q86XD8	727 aa		11.33	□□□□□ -0.6
TTLL3-222	ENST00000459758	TICAM1	Q8IUC6	712 aa		11.33	□□□□□ -0.6
TTLL3-222	ENST00000459758	HID1	Q8IV36	788 aa		11.33	□□□□□ -0.6
TTLL3-222	ENST00000459758	FUNDC1	Q8IVP5	155 aa		11.33	□□□□□ -0.6
TTLL3-222	ENST00000459758	BBS7	Q8IWZ6	715 aa		11.33	□□□□□ -0.6
TTLL3-222	ENST00000459758	TBC1D21	Q8IYX1	336 aa		11.33	□□□□□ -0.6
TTLL3-222	ENST00000459758	APCDD1	Q8J025	514 aa		11.33	□□□□□ -0.6
TTLL3-222	ENST00000459758	OR8J3	Q8NGG0	315 aa		11.33	□□□□□ -0.6
TTLL3-222	ENST00000459758	HMGCLL1	Q8TB92	370 aa		11.33	□□□□□ -0.6
TTLL3-222	ENST00000459758	OSCP1	Q8WVF1	389 aa		11.33	□□□□□ -0.6
TTLL3-222	ENST00000459758	ATL1	Q8WXF7	558 aa		11.33	□□□□□ -0.6
TTLL3-222	ENST00000459758	NSUN5	Q96P11	429 aa	Known RBP	11.33	□□□□□ -0.6
TTLL3-222	ENST00000459758	KCTD14	Q9BQ13	255 aa	Predicted RBP	11.33	□□□□□ -0.6
TTLL3-222	ENST00000459758	ZBED2	Q9BTP6	218 aa		11.33	□□□□□ -0.6
TTLL3-222	ENST00000459758	LRRC3	Q9BY71	257 aa		11.33	□□□□□ -0.6
TTLL3-222	ENST00000459758	MRPS26	Q9BYN8	205 aa	Known RBP	11.33	□□□□□ -0.6
TTLL3-222	ENST00000459758	MTIF3	Q9H2K0	278 aa	Known RBP	11.33	□□□□□ -0.6
TTLL3-222	ENST00000459758	TUBB1	Q9H4B7	451 aa		11.33	□□□□□ -0.6
TTLL3-222	ENST00000459758	ALG2	Q9H553	416 aa		11.33	□□□□□ -0.6
TTLL3-222	ENST00000459758	SLC32A1	Q9H598	525 aa		11.33	□□□□□ -0.6
TTLL3-222	ENST00000459758	NOL11	Q9H8H0	719 aa	Known RBP	11.33	□□□□□ -0.6
TTLL3-222	ENST00000459758	IPPK	Q9H8X2	491 aa		11.33	□□□□□ -0.6
TTLL3-222	ENST00000459758	TNFRSF12A	Q9NP84	129 aa		11.33	□□□□□ -0.6
TTLL3-222	ENST00000459758	IL26	Q9NPH9	171 aa		11.33	□□□□□ -0.6
TTLL3-222	ENST00000459758	SNX6	Q9UNH7	406 aa		11.33	□□□□□ -0.6
TTLL3-222	ENST00000459758	FNDC3A	Q9Y2H6	1198 aa	Known RBP	11.33	□□□□□ -0.6
TTLL3-222	ENST00000459758	CROCC	Q5TZA2	2017 aa		11.32	□□□□□ -0.6
TTLL3-222	ENST00000459758	IGLV3-16	A0A075B6K0	115 aa		11.32	□□□□□ -0.6
TTLL3-222	ENST00000459758	DHRS12	A0PJE2	317 aa		11.32	□□□□□ -0.6

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