RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000447402.7

SELENBP1-208, Transcript of selenium binding protein 1, human

TSL 2 BASIC

Gene SELENBP1, Length 1,530 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SELENBP1-208	ENST00000447402		H3BMM5	538 aa		13.45	□□□□□ -0.26
SELENBP1-208	ENST00000447402	KCNJ13	O60928	360 aa		13.45	□□□□□ -0.26
SELENBP1-208	ENST00000447402	NIPSNAP2	O75323	286 aa		13.45	□□□□□ -0.26
SELENBP1-208	ENST00000447402	FAM155B	O75949	473 aa		13.45	□□□□□ -0.26
SELENBP1-208	ENST00000447402	ALPPL2	P10696	532 aa		13.45	□□□□□ -0.26
SELENBP1-208	ENST00000447402	SAT1	P21673	171 aa		13.45	□□□□□ -0.26
SELENBP1-208	ENST00000447402	IDS	P22304	550 aa		13.45	□□□□□ -0.26
SELENBP1-208	ENST00000447402	SLC14A1	Q13336	389 aa		13.45	□□□□□ -0.26
SELENBP1-208	ENST00000447402	MAP9	Q49MG5	647 aa		13.45	□□□□□ -0.26
SELENBP1-208	ENST00000447402	ZNF549	Q6P9A3	640 aa		13.45	□□□□□ -0.26
SELENBP1-208	ENST00000447402	FAM83H	Q6ZRV2	1179 aa	Predicted RBP	13.45	□□□□□ -0.26
SELENBP1-208	ENST00000447402	OTOA	Q7RTW8	1153 aa		13.45	□□□□□ -0.26
SELENBP1-208	ENST00000447402	GALNT7	Q86SF2	657 aa		13.45	□□□□□ -0.26
SELENBP1-208	ENST00000447402	SDR16C5	Q8N3Y7	309 aa		13.45	□□□□□ -0.26
SELENBP1-208	ENST00000447402	LILRA3	Q8N6C8	439 aa	Predicted RBP	13.45	□□□□□ -0.26
SELENBP1-208	ENST00000447402	RHBDD1	Q8TEB9	315 aa		13.45	□□□□□ -0.26
SELENBP1-208	ENST00000447402	AEN	Q8WTP8	325 aa	Known RBP	13.45	□□□□□ -0.26
SELENBP1-208	ENST00000447402	LINC00615	Q96LM1	132 aa	Predicted RBP	13.45	□□□□□ -0.26
SELENBP1-208	ENST00000447402	ACSS3	Q9H6R3	686 aa		13.45	□□□□□ -0.26
SELENBP1-208	ENST00000447402	PRDM8	Q9NQV8	689 aa		13.45	□□□□□ -0.26
SELENBP1-208	ENST00000447402	GULP1	Q9UBP9	304 aa		13.45	□□□□□ -0.26
SELENBP1-208	ENST00000447402	TBC1D29	Q9UFV1	150 aa		13.45	□□□□□ -0.26
SELENBP1-208	ENST00000447402	PSMD13	Q9UNM6	376 aa		13.45	□□□□□ -0.26
SELENBP1-208	ENST00000447402	IKBKG	Q9Y6K9	419 aa		13.45	□□□□□ -0.26
SELENBP1-208	ENST00000447402	C17orf113	A0A1B0GUU1	675 aa		13.44	□□□□□ -0.26
SELENBP1-208	ENST00000447402	EXOC1L	A0A1B0GW35	172 aa		13.44	□□□□□ -0.26
SELENBP1-208	ENST00000447402	KLHL33	A6NCF5	533 aa		13.44	□□□□□ -0.26
SELENBP1-208	ENST00000447402	C1QA	P02745	245 aa		13.44	□□□□□ -0.26
SELENBP1-208	ENST00000447402	CCR7	P32248	378 aa		13.44	□□□□□ -0.26
SELENBP1-208	ENST00000447402	GP5	P40197	560 aa		13.44	□□□□□ -0.26
SELENBP1-208	ENST00000447402	HSPA14	Q0VDF9	509 aa		13.44	□□□□□ -0.26
SELENBP1-208	ENST00000447402	KLHL38	Q2WGJ6	581 aa		13.44	□□□□□ -0.26
SELENBP1-208	ENST00000447402	RBM20	Q5T481	1227 aa	Known RBP	13.44	□□□□□ -0.26
SELENBP1-208	ENST00000447402	LVRN	Q6Q4G3	990 aa		13.44	□□□□□ -0.26
SELENBP1-208	ENST00000447402	KANSL1	Q7Z3B3	1105 aa		13.44	□□□□□ -0.26
SELENBP1-208	ENST00000447402	ZC3HC1	Q86WB0	502 aa	Known RBP	13.44	□□□□□ -0.26
SELENBP1-208	ENST00000447402	HM13	Q8TCT9	377 aa		13.44	□□□□□ -0.26
SELENBP1-208	ENST00000447402	LKAAEAR1	Q8TD35	194 aa		13.44	□□□□□ -0.26
SELENBP1-208	ENST00000447402	ZDHHC1	Q8WTX9	485 aa		13.44	□□□□□ -0.26
SELENBP1-208	ENST00000447402	TMEM159	Q96B96	161 aa		13.44	□□□□□ -0.26
SELENBP1-208	ENST00000447402	ELMO2	Q96JJ3	720 aa		13.44	□□□□□ -0.26
SELENBP1-208	ENST00000447402	AARSD1	Q9BTE6	412 aa	Known RBP	13.44	□□□□□ -0.26
SELENBP1-208	ENST00000447402	DUSP23	Q9BVJ7	150 aa		13.44	□□□□□ -0.26
SELENBP1-208	ENST00000447402	NLGN3	Q9NZ94	848 aa		13.44	□□□□□ -0.26
SELENBP1-208	ENST00000447402	BTBD3	Q9Y2F9	522 aa		13.44	□□□□□ -0.26
SELENBP1-208	ENST00000447402	PCDHGB2	Q9Y5G2	931 aa		13.44	□□□□□ -0.26
SELENBP1-208	ENST00000447402	COMMD10	Q9Y6G5	202 aa		13.44	□□□□□ -0.26
SELENBP1-208	ENST00000447402	EP300	Q09472	2414 aa	Predicted RBP	13.44	□□□□□ -0.26
SELENBP1-208	ENST00000447402	TRIM38	O00635	465 aa		13.44	□□□□□ -0.26
SELENBP1-208	ENST00000447402	TPP1	O14773	563 aa		13.44	□□□□□ -0.26
SELENBP1-208	ENST00000447402	KPNA5	O15131	536 aa		13.44	□□□□□ -0.26
SELENBP1-208	ENST00000447402	FLRT2	O43155	660 aa		13.44	□□□□□ -0.26
SELENBP1-208	ENST00000447402	SH3BP5	O60239	455 aa		13.44	□□□□□ -0.26
SELENBP1-208	ENST00000447402	VPS26A	O75436	327 aa		13.44	□□□□□ -0.26
SELENBP1-208	ENST00000447402	ERLIN1	O75477	346 aa		13.44	□□□□□ -0.26
SELENBP1-208	ENST00000447402	APOA4	P06727	396 aa		13.44	□□□□□ -0.26
SELENBP1-208	ENST00000447402	INHBA	P08476	426 aa		13.44	□□□□□ -0.26
SELENBP1-208	ENST00000447402	ABHD2	P08910	425 aa		13.44	□□□□□ -0.26
SELENBP1-208	ENST00000447402	GSTM1	P09488	218 aa		13.44	□□□□□ -0.26
SELENBP1-208	ENST00000447402	CD59	P13987	128 aa		13.44	□□□□□ -0.26
SELENBP1-208	ENST00000447402	SPR	P35270	261 aa	Predicted RBP	13.44	□□□□□ -0.26
SELENBP1-208	ENST00000447402	GRK6	P43250	576 aa		13.44	□□□□□ -0.26
SELENBP1-208	ENST00000447402	PREP	P48147	710 aa		13.44	□□□□□ -0.26
SELENBP1-208	ENST00000447402	CLCNKA	P51800	687 aa		13.44	□□□□□ -0.26
SELENBP1-208	ENST00000447402	GSTM4	Q03013	218 aa		13.44	□□□□□ -0.26
SELENBP1-208	ENST00000447402	NAB1	Q13506	487 aa		13.44	□□□□□ -0.26
SELENBP1-208	ENST00000447402	INAVA	Q3KP66	663 aa		13.44	□□□□□ -0.26
SELENBP1-208	ENST00000447402	GRTP1	Q5TC63	336 aa		13.44	□□□□□ -0.26
SELENBP1-208	ENST00000447402	METRNL	Q641Q3	311 aa		13.44	□□□□□ -0.26
SELENBP1-208	ENST00000447402	ALYREF	Q86V81	257 aa	Known RBP	13.44	□□□□□ -0.26
SELENBP1-208	ENST00000447402	MYRIP	Q8NFW9	859 aa		13.44	□□□□□ -0.26
SELENBP1-208	ENST00000447402	OR4C6	Q8NH72	309 aa		13.44	□□□□□ -0.26
SELENBP1-208	ENST00000447402	ASZ1	Q8WWH4	475 aa		13.44	□□□□□ -0.26
SELENBP1-208	ENST00000447402	CAVIN3	Q969G5	261 aa		13.44	□□□□□ -0.26
SELENBP1-208	ENST00000447402	VPS39	Q96JC1	886 aa		13.44	□□□□□ -0.26
SELENBP1-208	ENST00000447402	CCDC77	Q9BR77	488 aa		13.44	□□□□□ -0.26
SELENBP1-208	ENST00000447402	RHOJ	Q9H4E5	214 aa		13.44	□□□□□ -0.26
SELENBP1-208	ENST00000447402	COG4	Q9H9E3	785 aa		13.44	□□□□□ -0.26
SELENBP1-208	ENST00000447402	TAS2R13	Q9NYV9	303 aa		13.44	□□□□□ -0.26
SELENBP1-208	ENST00000447402	GALP	Q9UBC7	116 aa		13.44	□□□□□ -0.26
SELENBP1-208	ENST00000447402	ACSL5	Q9ULC5	683 aa		13.44	□□□□□ -0.26
SELENBP1-208	ENST00000447402	VWA7	Q9Y334	891 aa		13.44	□□□□□ -0.26
SELENBP1-208	ENST00000447402	FAM95C	A0A1B0GW59	222 aa		13.43	□□□□□ -0.26
SELENBP1-208	ENST00000447402	LIN7A	O14910	233 aa	Predicted RBP	13.43	□□□□□ -0.26
SELENBP1-208	ENST00000447402	SIGLEC6	O43699	453 aa		13.43	□□□□□ -0.26
SELENBP1-208	ENST00000447402	EML2	O95834	649 aa		13.43	□□□□□ -0.26
SELENBP1-208	ENST00000447402	SLC35G4	P0C7Q5	338 aa		13.43	□□□□□ -0.26
SELENBP1-208	ENST00000447402	AOAH	P28039	575 aa		13.43	□□□□□ -0.26
SELENBP1-208	ENST00000447402	PDHA2	P29803	388 aa		13.43	□□□□□ -0.26
SELENBP1-208	ENST00000447402	HSD17B3	P37058	310 aa		13.43	□□□□□ -0.26
SELENBP1-208	ENST00000447402	HAL	P42357	657 aa		13.43	□□□□□ -0.26
SELENBP1-208	ENST00000447402	MSH2	P43246	934 aa		13.43	□□□□□ -0.26
SELENBP1-208	ENST00000447402	SLC12A2	P55011	1212 aa		13.43	□□□□□ -0.26
SELENBP1-208	ENST00000447402	DMPK	Q09013	629 aa		13.43	□□□□□ -0.26
SELENBP1-208	ENST00000447402	BIRC2	Q13490	618 aa		13.43	□□□□□ -0.26
SELENBP1-208	ENST00000447402	TMED2	Q15363	201 aa		13.43	□□□□□ -0.26
SELENBP1-208	ENST00000447402	C6orf132	Q5T0Z8	1188 aa		13.43	□□□□□ -0.26
SELENBP1-208	ENST00000447402	HECTD2	Q5U5R9	776 aa		13.43	□□□□□ -0.26
SELENBP1-208	ENST00000447402	FAM45BP	Q6NSW5	357 aa		13.43	□□□□□ -0.26
SELENBP1-208	ENST00000447402	NAXD	Q8IW45	347 aa		13.43	□□□□□ -0.26

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.9 ms