RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000438120.5

PTPRF-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type F, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRF, Length 6,377 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRF-209ENST00000438120 KCT2Q8NC54 265 aa16.99■□□□□ 0.31
PTPRF-209ENST00000438120 MARCH7Q9H992 704 aa16.99■□□□□ 0.31
PTPRF-209ENST00000438120 WRAP73Q9P2S5 460 aaPredicted RBP16.99■□□□□ 0.31
PTPRF-209ENST00000438120 OR51F1A6NGY5 319 aa16.99■□□□□ 0.31
PTPRF-209ENST00000438120 AHCYL1O43865 530 aa16.99■□□□□ 0.31
PTPRF-209ENST00000438120 UGT1A9O60656 530 aa16.99■□□□□ 0.31
PTPRF-209ENST00000438120 ILF3Q12906 894 aaKnown RBP eCLIP16.99■□□□□ 0.31
PTPRF-209ENST00000438120 LARS2Q15031 903 aaKnown RBP16.99■□□□□ 0.31
PTPRF-209ENST00000438120 OLFML2AQ68BL7 652 aa16.99■□□□□ 0.31
PTPRF-209ENST00000438120 GDF6Q6KF10 455 aaPredicted RBP16.99■□□□□ 0.31
PTPRF-209ENST00000438120 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP16.99■□□□□ 0.31
PTPRF-209ENST00000438120 KREMEN2Q8NCW0 462 aa16.99■□□□□ 0.31
PTPRF-209ENST00000438120 TRIM63Q969Q1 353 aa16.99■□□□□ 0.31
PTPRF-209ENST00000438120 GPER1Q99527 375 aa16.99■□□□□ 0.31
PTPRF-209ENST00000438120 UGT1A7Q9HAW7 530 aa16.99■□□□□ 0.31
PTPRF-209ENST00000438120 UGT1A10Q9HAW8 530 aa16.99■□□□□ 0.31
PTPRF-209ENST00000438120 UGT1A8Q9HAW9 530 aa16.99■□□□□ 0.31
PTPRF-209ENST00000438120 TRIM39Q9HCM9 518 aa16.99■□□□□ 0.31
PTPRF-209ENST00000438120 NECTIN3Q9NQS3 549 aa16.99■□□□□ 0.31
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PTPRF-209ENST00000438120 SRRM3A6NNA2 597 aaPredicted RBP16.99■□□□□ 0.31
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PTPRF-209ENST00000438120 COX4I2Q96KJ9 171 aa16.99■□□□□ 0.31
PTPRF-209ENST00000438120 A0A1W2PRU2 124 aa16.99■□□□□ 0.31
PTPRF-209ENST00000438120 NDST2P52849 883 aa16.99■□□□□ 0.31
PTPRF-209ENST00000438120 KLF1Q13351 362 aaPredicted RBP16.99■□□□□ 0.31
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PTPRF-209ENST00000438120 VNN1O95497 513 aa16.98■□□□□ 0.31
PTPRF-209ENST00000438120 UROSP10746 265 aa16.98■□□□□ 0.31
PTPRF-209ENST00000438120 CSKP41240 450 aa16.98■□□□□ 0.31
PTPRF-209ENST00000438120 ASMTP46597 345 aa16.98■□□□□ 0.31
PTPRF-209ENST00000438120 NDUFA9Q16795 377 aa16.98■□□□□ 0.31
PTPRF-209ENST00000438120 CROCCP3Q8IVE0 287 aa16.98■□□□□ 0.31
PTPRF-209ENST00000438120 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa16.98■□□□□ 0.31
PTPRF-209ENST00000438120 RHPN2P1A8MT19 583 aa16.98■□□□□ 0.31
PTPRF-209ENST00000438120 BCKDKO14874 412 aa16.98■□□□□ 0.31
PTPRF-209ENST00000438120 HCN1O60741 890 aa16.98■□□□□ 0.31
PTPRF-209ENST00000438120 TRMT10BQ6PF06 316 aaKnown RBP16.98■□□□□ 0.31
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PTPRF-209ENST00000438120 OR10A6Q8NH74 314 aa16.98■□□□□ 0.31
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PTPRF-209ENST00000438120 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa16.98■□□□□ 0.31
PTPRF-209ENST00000438120 A0A0G2JN53 185 aa16.98■□□□□ 0.31
PTPRF-209ENST00000438120 TRAP1Q12931 704 aaKnown RBP16.98■□□□□ 0.31
PTPRF-209ENST00000438120 RIPK1Q13546 671 aa16.98■□□□□ 0.31
PTPRF-209ENST00000438120 LDLRAP1Q5SW96 308 aa16.98■□□□□ 0.31
PTPRF-209ENST00000438120 FBXO15Q8NCQ5 510 aaPredicted RBP16.98■□□□□ 0.31
PTPRF-209ENST00000438120 AP3S1Q92572 193 aa16.98■□□□□ 0.31
PTPRF-209ENST00000438120 OR2AG1Q9H205 316 aa16.98■□□□□ 0.31
PTPRF-209ENST00000438120 LRRC72A6NJI9 287 aa16.98■□□□□ 0.31
PTPRF-209ENST00000438120 H7C0S8 307 aa16.98■□□□□ 0.31
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PTPRF-209ENST00000438120 SYPL2Q5VXT5 272 aa16.98■□□□□ 0.31
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PTPRF-209ENST00000438120 FOXM1Q08050 763 aa16.98■□□□□ 0.31
PTPRF-209ENST00000438120 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP16.98■□□□□ 0.312e-7■■□□□ 12
PTPRF-209ENST00000438120 IL18R1Q13478 541 aa16.98■□□□□ 0.31
PTPRF-209ENST00000438120 PRRT2Q7Z6L0 340 aaPredicted RBP16.98■□□□□ 0.31
PTPRF-209ENST00000438120 TRPV3Q8NET8 790 aa16.98■□□□□ 0.31
PTPRF-209ENST00000438120 PLGRKTQ9HBL7 147 aa16.98■□□□□ 0.31
PTPRF-209ENST00000438120 GKN1Q9NS71 199 aa16.98■□□□□ 0.31
PTPRF-209ENST00000438120 DTLQ9NZJ0 730 aa16.98■□□□□ 0.31
PTPRF-209ENST00000438120 AP2A2O94973 939 aa16.97■□□□□ 0.31
PTPRF-209ENST00000438120 RPS24P62847 133 aaKnown RBP16.97■□□□□ 0.31
PTPRF-209ENST00000438120 IL10RBQ08334 325 aa16.97■□□□□ 0.31
PTPRF-209ENST00000438120 FITM2Q8N6M3 262 aa16.97■□□□□ 0.31
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PTPRF-209ENST00000438120 CEP295NLQ96MC4 621 aa16.97■□□□□ 0.31
PTPRF-209ENST00000438120 CCNB1IP1Q9NPC3 277 aa16.97■□□□□ 0.31
PTPRF-209ENST00000438120 RAPGEFL1Q9UHV5 662 aa16.97■□□□□ 0.31
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PTPRF-209ENST00000438120 CCDC28BQ9BUN5 200 aa16.97■□□□□ 0.31
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PTPRF-209ENST00000438120 LCA5LO95447 670 aa16.97■□□□□ 0.31
PTPRF-209ENST00000438120 SOWAHAQ2M3V2 549 aa16.97■□□□□ 0.31
PTPRF-209ENST00000438120 RALGPS1Q5JS13 557 aa16.97■□□□□ 0.31
PTPRF-209ENST00000438120 OR13C4Q8NGS5 318 aa16.97■□□□□ 0.31
PTPRF-209ENST00000438120 TSEN15Q8WW01 171 aaKnown RBP16.97■□□□□ 0.31
PTPRF-209ENST00000438120 LRTOMTQ8WZ04 291 aa16.97■□□□□ 0.31
PTPRF-209ENST00000438120 MCCC1Q96RQ3 725 aaPredicted RBP16.97■□□□□ 0.31
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