RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000418331.6

PTPRJ-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type J, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRJ, Length 5,122 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJ-201ENST00000418331 CXorf49A8MYA2 514 aaPredicted RBP21.15■□□□□ 0.98
PTPRJ-201ENST00000418331 UGT2B11O75310 529 aa21.15■□□□□ 0.98
PTPRJ-201ENST00000418331 MFN2O95140 757 aa21.15■□□□□ 0.98
PTPRJ-201ENST00000418331 MED22Q15528 200 aa21.15■□□□□ 0.98
PTPRJ-201ENST00000418331 GLIS1Q8NBF1 620 aa21.15■□□□□ 0.98
PTPRJ-201ENST00000418331 FLCNQ8NFG4 579 aa21.15■□□□□ 0.98
PTPRJ-201ENST00000418331 RAD51AP1Q96B01 352 aa21.15■□□□□ 0.98
PTPRJ-201ENST00000418331 SMOC2Q9H3U7 446 aa21.15■□□□□ 0.98
PTPRJ-201ENST00000418331 C1orf109Q9NX04 203 aa21.15■□□□□ 0.98
PTPRJ-201ENST00000418331 GULP1Q9UBP9 304 aa21.15■□□□□ 0.98
PTPRJ-201ENST00000418331 TRPS1Q9UHF7 1281 aa21.15■□□□□ 0.98
PTPRJ-201ENST00000418331 NEMP2A6NFY4 417 aa21.14■□□□□ 0.98
PTPRJ-201ENST00000418331 PNLIPRP1P54315 467 aa21.14■□□□□ 0.98
PTPRJ-201ENST00000418331 CARD16Q5EG05 197 aa21.14■□□□□ 0.98
PTPRJ-201ENST00000418331 GPR135Q8IZ08 494 aa21.14■□□□□ 0.98
PTPRJ-201ENST00000418331 C11orf65Q8NCR3 313 aa21.14■□□□□ 0.98
PTPRJ-201ENST00000418331 C11orf84Q9BUA3 381 aaPredicted RBP21.14■□□□□ 0.98
PTPRJ-201ENST00000418331 PCDHGB3Q9Y5G1 929 aa21.14■□□□□ 0.98
PTPRJ-201ENST00000418331 FAM149AA5PLN7 773 aa21.14■□□□□ 0.97
PTPRJ-201ENST00000418331 LRRC14BA6NHZ5 514 aa21.14■□□□□ 0.97
PTPRJ-201ENST00000418331 H3BNH8 94 aa21.14■□□□□ 0.97
PTPRJ-201ENST00000418331 RASGRP1O95267 797 aa21.14■□□□□ 0.97
PTPRJ-201ENST00000418331 MT-ND1P03886 318 aa21.14■□□□□ 0.97
PTPRJ-201ENST00000418331 TAB1Q15750 504 aa21.14■□□□□ 0.97
PTPRJ-201ENST00000418331 KLHL12Q53G59 568 aa21.14■□□□□ 0.97
PTPRJ-201ENST00000418331 SLC9A4Q6AI14 798 aa21.14■□□□□ 0.97
PTPRJ-201ENST00000418331 EBF4Q9BQW3 602 aa21.14■□□□□ 0.97
PTPRJ-201ENST00000418331 GPIP06744 558 aa21.14■□□□□ 0.97
PTPRJ-201ENST00000418331 PCSK2P16519 638 aa21.14■□□□□ 0.97
PTPRJ-201ENST00000418331 SLC5A9Q2M3M2 681 aa21.14■□□□□ 0.97
PTPRJ-201ENST00000418331 UBXN11Q5T124 520 aa21.14■□□□□ 0.97
PTPRJ-201ENST00000418331 FAM182AQ5T1J6 154 aa21.14■□□□□ 0.97
PTPRJ-201ENST00000418331 GALNT5Q7Z7M9 940 aa21.14■□□□□ 0.97
PTPRJ-201ENST00000418331 ANKRD46Q86W74 232 aa21.14■□□□□ 0.97
PTPRJ-201ENST00000418331 S100A13Q99584 98 aa21.14■□□□□ 0.97
PTPRJ-201ENST00000418331 SMOQ99835 787 aa21.14■□□□□ 0.97
PTPRJ-201ENST00000418331 BRINP2Q9C0B6 783 aa21.14■□□□□ 0.97
PTPRJ-201ENST00000418331 PCDHGA11Q9Y5H2 935 aa21.14■□□□□ 0.97
PTPRJ-201ENST00000418331 FAM159BA6NKW6 160 aa21.14■□□□□ 0.97
PTPRJ-201ENST00000418331 NBNO60934 754 aa21.14■□□□□ 0.97
PTPRJ-201ENST00000418331 CMPK1P30085 196 aa21.14■□□□□ 0.97
PTPRJ-201ENST00000418331 ILF3Q12906 894 aaKnown RBP eCLIP21.14■□□□□ 0.97
PTPRJ-201ENST00000418331 SIM2Q14190 667 aaPredicted RBP21.14■□□□□ 0.97
PTPRJ-201ENST00000418331 LDLRAP1Q5SW96 308 aa21.14■□□□□ 0.97
PTPRJ-201ENST00000418331 PAQR3Q6TCH7 311 aa21.14■□□□□ 0.97
PTPRJ-201ENST00000418331 KLHL17Q6TDP4 642 aa21.14■□□□□ 0.97
PTPRJ-201ENST00000418331 SLC22A17Q8WUG5 538 aa21.14■□□□□ 0.97
PTPRJ-201ENST00000418331 WDR60Q8WVS4 1066 aa21.14■□□□□ 0.97
PTPRJ-201ENST00000418331 PIH1D2Q8WWB5 315 aa21.14■□□□□ 0.97
PTPRJ-201ENST00000418331 CDKN2AIPNLQ96HQ2 116 aa21.14■□□□□ 0.97
PTPRJ-201ENST00000418331 EBPLQ9BY08 206 aa21.14■□□□□ 0.97
PTPRJ-201ENST00000418331 SPATA2Q9UM82 520 aa21.14■□□□□ 0.97
PTPRJ-201ENST00000418331 SNAI1O95863 264 aaPredicted RBP21.13■□□□□ 0.97
PTPRJ-201ENST00000418331 GPR33Q49SQ1 333 aa21.13■□□□□ 0.97
PTPRJ-201ENST00000418331 TEPSINQ96N21 525 aa21.13■□□□□ 0.97
PTPRJ-201ENST00000418331 RBM4BQ9BQ04 359 aaKnown RBP21.13■□□□□ 0.97
PTPRJ-201ENST00000418331 RBM4Q9BWF3 364 aaKnown RBP21.13■□□□□ 0.97
PTPRJ-201ENST00000418331 SATB2Q9UPW6 733 aa21.13■□□□□ 0.97
PTPRJ-201ENST00000418331 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP21.13■□□□□ 0.97
PTPRJ-201ENST00000418331 SCELO95171 688 aa21.13■□□□□ 0.97
PTPRJ-201ENST00000418331 IGFBP5P24593 272 aa21.13■□□□□ 0.97
PTPRJ-201ENST00000418331 SNAP47Q5SQN1 464 aa21.13■□□□□ 0.97
PTPRJ-201ENST00000418331 SCAIQ8N9R8 606 aa21.13■□□□□ 0.97
PTPRJ-201ENST00000418331 LEMD2Q8NC56 503 aa21.13■□□□□ 0.97
PTPRJ-201ENST00000418331 DDX1Q92499 740 aaKnown RBP21.13■□□□□ 0.97
PTPRJ-201ENST00000418331 SCML2Q9UQR0 700 aa21.13■□□□□ 0.97
PTPRJ-201ENST00000418331 TTC24A2A3L6 582 aaPredicted RBP21.13■□□□□ 0.97
PTPRJ-201ENST00000418331 J3KR12 359 aa21.13■□□□□ 0.97
PTPRJ-201ENST00000418331 FABP3P05413 133 aa21.13■□□□□ 0.97
PTPRJ-201ENST00000418331 GNAZP19086 355 aa21.13■□□□□ 0.97
PTPRJ-201ENST00000418331 AUTS2Q8WXX7 1259 aa21.13■□□□□ 0.97
PTPRJ-201ENST00000418331 TMEM175Q9BSA9 504 aa21.13■□□□□ 0.97
PTPRJ-201ENST00000418331 SUV39H2Q9H5I1 410 aa21.13■□□□□ 0.97
PTPRJ-201ENST00000418331 SCN2BO60939 215 aa21.13■□□□□ 0.97
PTPRJ-201ENST00000418331 ZBTB11O95625 1053 aaPredicted RBP21.13■□□□□ 0.97
PTPRJ-201ENST00000418331 KCNQ1P51787 676 aa21.13■□□□□ 0.97
PTPRJ-201ENST00000418331 KHDC1Q4VXA5 237 aaKnown RBP21.13■□□□□ 0.97
PTPRJ-201ENST00000418331 CHST15Q7LFX5 561 aaPredicted RBP21.13■□□□□ 0.97
PTPRJ-201ENST00000418331 PARP8Q8N3A8 854 aa21.13■□□□□ 0.97
PTPRJ-201ENST00000418331 C10orf82Q8WW14 230 aa21.13■□□□□ 0.97
PTPRJ-201ENST00000418331 HERVK_113Q902F9 699 aa21.13■□□□□ 0.97
PTPRJ-201ENST00000418331 C8orf48Q96LL4 319 aa21.13■□□□□ 0.97
PTPRJ-201ENST00000418331 CYP2S1Q96SQ9 504 aa21.13■□□□□ 0.97
PTPRJ-201ENST00000418331 OXSMQ9NWU1 459 aa21.13■□□□□ 0.97
PTPRJ-201ENST00000418331 TAS2R1Q9NYW7 299 aa21.13■□□□□ 0.97
PTPRJ-201ENST00000418331 MYH2Q9UKX2 1941 aa21.12■□□□□ 0.97
PTPRJ-201ENST00000418331 OR1F1O43749 312 aa21.12■□□□□ 0.97
PTPRJ-201ENST00000418331 COL6A1P12109 1028 aa21.12■□□□□ 0.97
PTPRJ-201ENST00000418331 EIF2B2P49770 351 aaKnown RBP21.12■□□□□ 0.97
PTPRJ-201ENST00000418331 PAFAH1B3Q15102 231 aaKnown RBP21.12■□□□□ 0.97
PTPRJ-201ENST00000418331 SIRPB2Q5JXA9 342 aa21.12■□□□□ 0.97
PTPRJ-201ENST00000418331 ZSWIM7Q19AV6 140 aa21.12■□□□□ 0.97
PTPRJ-201ENST00000418331 VITQ6UXI7 678 aa21.12■□□□□ 0.97
PTPRJ-201ENST00000418331 ZNF248Q8NDW4 579 aa21.12■□□□□ 0.97
PTPRJ-201ENST00000418331 PCYT2Q99447 389 aa21.12■□□□□ 0.97
PTPRJ-201ENST00000418331 NPY6RQ99463 290 aa21.12■□□□□ 0.97
PTPRJ-201ENST00000418331 MRPS7Q9Y2R9 242 aaKnown RBP21.12■□□□□ 0.97
PTPRJ-201ENST00000418331 NIPSNAP2O75323 286 aa21.12■□□□□ 0.97
PTPRJ-201ENST00000418331 ZNF24P17028 368 aa21.12■□□□□ 0.97
PTPRJ-201ENST00000418331 IMPDH1P20839 514 aa21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 63.2 ms