RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000414253.5

FAAP20-206, Transcript of FA core complex associated protein 20, humanhuman

TSL 2

Gene FAAP20, Length 2,216 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAAP20-206ENST00000414253 SLC22A3O75751 556 aa24.22■■□□□ 1.47
FAAP20-206ENST00000414253 SEC14L2O76054 403 aa24.22■■□□□ 1.47
FAAP20-206ENST00000414253 KLKB1P03952 638 aa24.22■■□□□ 1.47
FAAP20-206ENST00000414253 EEF1B2P24534 225 aaKnown RBP24.22■■□□□ 1.47
FAAP20-206ENST00000414253 ELK4P28324 431 aa24.22■■□□□ 1.47
FAAP20-206ENST00000414253 RGRP47804 291 aa24.22■■□□□ 1.47
FAAP20-206ENST00000414253 UFM1P61960 85 aa24.22■■□□□ 1.47
FAAP20-206ENST00000414253 ANKS6Q68DC2 871 aa24.22■■□□□ 1.47
FAAP20-206ENST00000414253 CENPSQ8N2Z9 138 aa24.22■■□□□ 1.47
FAAP20-206ENST00000414253 PDPRQ8NCN5 879 aa24.22■■□□□ 1.47
FAAP20-206ENST00000414253 STAG3L4Q8TBR4 150 aa24.22■■□□□ 1.47
FAAP20-206ENST00000414253 OVCA2Q8WZ82 227 aa24.22■■□□□ 1.47
FAAP20-206ENST00000414253 RNF145Q96MT1 663 aa24.22■■□□□ 1.47
FAAP20-206ENST00000414253 AARSD1Q9BTE6 412 aaKnown RBP24.22■■□□□ 1.47
FAAP20-206ENST00000414253 CINPQ9BW66 212 aaPredicted RBP24.22■■□□□ 1.47
FAAP20-206ENST00000414253 VN1R3Q9BXE9 311 aa24.22■■□□□ 1.47
FAAP20-206ENST00000414253 SLAMF8Q9P0V8 285 aa24.22■■□□□ 1.47
FAAP20-206ENST00000414253 USP22Q9UPT9 525 aa24.22■■□□□ 1.47
FAAP20-206ENST00000414253 FUOMA2VDF0 154 aa24.22■■□□□ 1.47
FAAP20-206ENST00000414253 PQBP1O60828 265 aaKnown RBP24.22■■□□□ 1.47
FAAP20-206ENST00000414253 SEC24AO95486 1093 aa24.22■■□□□ 1.47
FAAP20-206ENST00000414253 HMGA1P17096 107 aaKnown RBP24.22■■□□□ 1.47
FAAP20-206ENST00000414253 POLR2JP52435 117 aaKnown RBP24.22■■□□□ 1.47
FAAP20-206ENST00000414253 OXCT1P55809 520 aa24.22■■□□□ 1.47
FAAP20-206ENST00000414253 RELAQ04206 551 aa24.22■■□□□ 1.47
FAAP20-206ENST00000414253 EMX2Q04743 252 aa24.22■■□□□ 1.47
FAAP20-206ENST00000414253 TUBA3CQ13748 450 aa24.22■■□□□ 1.47
FAAP20-206ENST00000414253 PDCD4Q53EL6 469 aaKnown RBP24.22■■□□□ 1.47
FAAP20-206ENST00000414253 BROXQ5VW32 411 aa24.22■■□□□ 1.47
FAAP20-206ENST00000414253 OR4L1Q8NH43 312 aa24.22■■□□□ 1.47
FAAP20-206ENST00000414253 DEFB118Q96PH6 123 aa24.22■■□□□ 1.47
FAAP20-206ENST00000414253 NUSAP1Q9BXS6 441 aaKnown RBP24.22■■□□□ 1.47
FAAP20-206ENST00000414253 CCDC68Q9H2F9 335 aa24.22■■□□□ 1.47
FAAP20-206ENST00000414253 GKN1Q9NS71 199 aa24.22■■□□□ 1.47
FAAP20-206ENST00000414253 RIMKLBQ9ULI2 386 aa24.22■■□□□ 1.47
FAAP20-206ENST00000414253 RNF112Q9ULX5 631 aa24.22■■□□□ 1.47
FAAP20-206ENST00000414253 PCDHGA11Q9Y5H2 935 aa24.22■■□□□ 1.47
FAAP20-206ENST00000414253 BACE2Q9Y5Z0 518 aa24.22■■□□□ 1.47
FAAP20-206ENST00000414253 V9GYQ6 96 aa24.22■■□□□ 1.47
FAAP20-206ENST00000414253 CLDN11O75508 207 aa24.21■■□□□ 1.47
FAAP20-206ENST00000414253 ENO2P09104 434 aaPredicted RBP24.21■■□□□ 1.47
FAAP20-206ENST00000414253 CASP2P42575 452 aa24.21■■□□□ 1.47
FAAP20-206ENST00000414253 SGSHP51688 502 aa24.21■■□□□ 1.47
FAAP20-206ENST00000414253 CBX2Q14781 532 aaPredicted RBP24.21■■□□□ 1.47
FAAP20-206ENST00000414253 CRY1Q16526 586 aa24.21■■□□□ 1.47
FAAP20-206ENST00000414253 OTUD3Q5T2D3 398 aaPredicted RBP24.21■■□□□ 1.47
FAAP20-206ENST00000414253 RIMKLAQ8IXN7 391 aa24.21■■□□□ 1.47
FAAP20-206ENST00000414253 CHPT1Q8WUD6 406 aa24.21■■□□□ 1.47
FAAP20-206ENST00000414253 TRUB1Q8WWH5 349 aaKnown RBP24.21■■□□□ 1.47
FAAP20-206ENST00000414253 C1orf50Q9BV19 199 aa24.21■■□□□ 1.47
FAAP20-206ENST00000414253 CATSPERZQ9NTU4 200 aa24.21■■□□□ 1.47
FAAP20-206ENST00000414253 INTS7Q9NVH2 962 aaKnown RBP24.21■■□□□ 1.47
FAAP20-206ENST00000414253 SOBPA7XYQ1 873 aa24.2■■□□□ 1.47
FAAP20-206ENST00000414253 B4GAT1O43505 415 aa24.2■■□□□ 1.47
FAAP20-206ENST00000414253 STC2O76061 302 aa24.2■■□□□ 1.47
FAAP20-206ENST00000414253 BCL10O95999 233 aa24.2■■□□□ 1.47
FAAP20-206ENST00000414253 RPS17P08708 135 aaKnown RBP24.2■■□□□ 1.47
FAAP20-206ENST00000414253 CDH1P12830 882 aa24.2■■□□□ 1.47
FAAP20-206ENST00000414253 CES1P23141 567 aa24.2■■□□□ 1.47
FAAP20-206ENST00000414253 ALDH3A2P51648 485 aa24.2■■□□□ 1.47
FAAP20-206ENST00000414253 CCR3P51677 355 aa24.2■■□□□ 1.47
FAAP20-206ENST00000414253 ARSFP54793 590 aa24.2■■□□□ 1.47
FAAP20-206ENST00000414253 CCL23P55773 120 aa24.2■■□□□ 1.47
FAAP20-206ENST00000414253 XKR7Q5GH72 579 aa24.2■■□□□ 1.47
FAAP20-206ENST00000414253 EFL1Q7Z2Z2 1120 aaKnown RBP24.2■■□□□ 1.47
FAAP20-206ENST00000414253 PLD4Q96BZ4 506 aa24.2■■□□□ 1.47
FAAP20-206ENST00000414253 NSMCE2Q96MF7 247 aa24.2■■□□□ 1.47
FAAP20-206ENST00000414253 NTN4Q9HB63 628 aa24.2■■□□□ 1.47
FAAP20-206ENST00000414253 PAIP2BQ9ULR5 123 aaKnown RBP24.2■■□□□ 1.47
FAAP20-206ENST00000414253 ANKRD12Q6UB98 2062 aa24.2■■□□□ 1.46
FAAP20-206ENST00000414253 NPPAP01160 153 aa24.2■■□□□ 1.46
FAAP20-206ENST00000414253 OGNP20774 298 aaKnown RBP24.2■■□□□ 1.46
FAAP20-206ENST00000414253 CORO1AP31146 461 aaKnown RBP24.2■■□□□ 1.46
FAAP20-206ENST00000414253 MAPK10P53779 464 aa24.2■■□□□ 1.46
FAAP20-206ENST00000414253 ZIK1Q3SY52 487 aaPredicted RBP24.2■■□□□ 1.46
FAAP20-206ENST00000414253 TMEM214Q6NUQ4 689 aaKnown RBP24.2■■□□□ 1.46
FAAP20-206ENST00000414253 RAB2BQ8WUD1 216 aa24.2■■□□□ 1.46
FAAP20-206ENST00000414253 SNX19Q92543 992 aa24.2■■□□□ 1.46
FAAP20-206ENST00000414253 NRBF2Q96F24 287 aa24.2■■□□□ 1.46
FAAP20-206ENST00000414253 CDKN2AIPNLQ96HQ2 116 aa24.2■■□□□ 1.46
FAAP20-206ENST00000414253 EXOC2Q96KP1 924 aa24.2■■□□□ 1.46
FAAP20-206ENST00000414253 LRRC3Q9BY71 257 aa24.2■■□□□ 1.46
FAAP20-206ENST00000414253 DERL2Q9GZP9 239 aa24.2■■□□□ 1.46
FAAP20-206ENST00000414253 SYTL2Q9HCH5 934 aa24.2■■□□□ 1.46
FAAP20-206ENST00000414253 SUN2Q9UH99 717 aa24.2■■□□□ 1.46
FAAP20-206ENST00000414253 SPO11Q9Y5K1 396 aa24.2■■□□□ 1.46
FAAP20-206ENST00000414253 K7EPI3 171 aa24.19■■□□□ 1.46
FAAP20-206ENST00000414253 SNX2O60749 519 aa24.19■■□□□ 1.46
FAAP20-206ENST00000414253 SHMT2P34897 504 aa24.19■■□□□ 1.46
FAAP20-206ENST00000414253 OR4D2P58180 307 aa24.19■■□□□ 1.46
FAAP20-206ENST00000414253 ARHGEF6Q15052 776 aa24.19■■□□□ 1.46
FAAP20-206ENST00000414253 TIGD2Q4W5G0 525 aa24.19■■□□□ 1.46
FAAP20-206ENST00000414253 GRAMD4Q6IC98 578 aa24.19■■□□□ 1.46
FAAP20-206ENST00000414253 CLSTN3Q9BQT9 956 aa24.19■■□□□ 1.46
FAAP20-206ENST00000414253 TDRD1Q9BXT4 1180 aaKnown RBP24.19■■□□□ 1.46
FAAP20-206ENST00000414253 ING2Q9H160 280 aa24.19■■□□□ 1.46
FAAP20-206ENST00000414253 GPN2Q9H9Y4 310 aaPredicted RBP24.19■■□□□ 1.46
FAAP20-206ENST00000414253 ZIM2Q9NZV7 527 aa24.19■■□□□ 1.46
FAAP20-206ENST00000414253 AFF4Q9UHB7 1163 aaKnown RBP24.19■■□□□ 1.46
FAAP20-206ENST00000414253 MAGEL2Q9UJ55 1249 aa24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.7 ms