RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000365490.1

RN7SKP249-201, Transcript of RNA, 7SK small nuclear pseudogene 249, humanhuman

BASIC

Gene RN7SKP249, Length 355 nt, Biotype misc RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RN7SKP249-201ENST00000365490 SUFUQ9UMX1 484 aa9.6□□□□□ -0.87
RN7SKP249-201ENST00000365490 NOVA2Q9UNW9 492 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
RN7SKP249-201ENST00000365490 ANKRD6Q9Y2G4 727 aa9.6□□□□□ -0.87
RN7SKP249-201ENST00000365490 GON4LQ3T8J9 2241 aa9.59□□□□□ -0.87
RN7SKP249-201ENST00000365490 CCDC189A1A4V9 331 aa9.59□□□□□ -0.87
RN7SKP249-201ENST00000365490 E5RI56 91 aa9.59□□□□□ -0.87
RN7SKP249-201ENST00000365490 LIN7AO14910 233 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
RN7SKP249-201ENST00000365490 PHGDHO43175 533 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
RN7SKP249-201ENST00000365490 TYROBPO43914 113 aa9.59□□□□□ -0.87
RN7SKP249-201ENST00000365490 KLHL2O95198 593 aa9.59□□□□□ -0.87
RN7SKP249-201ENST00000365490 GSTA1P08263 222 aa9.59□□□□□ -0.87
RN7SKP249-201ENST00000365490 GNSP15586 552 aa9.59□□□□□ -0.87
RN7SKP249-201ENST00000365490 CREB1P16220 341 aa9.59□□□□□ -0.87
RN7SKP249-201ENST00000365490 SAT1P21673 171 aa9.59□□□□□ -0.87
RN7SKP249-201ENST00000365490 CRHR1P34998 444 aa9.59□□□□□ -0.87
RN7SKP249-201ENST00000365490 DHPSP49366 369 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
RN7SKP249-201ENST00000365490 CLCNKAP51800 687 aa9.59□□□□□ -0.87
RN7SKP249-201ENST00000365490 HK3P52790 923 aa9.59□□□□□ -0.87
RN7SKP249-201ENST00000365490 NXPH1P58417 271 aa9.59□□□□□ -0.87
RN7SKP249-201ENST00000365490 SRP54P61011 504 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
RN7SKP249-201ENST00000365490 PLOD1Q02809 727 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
RN7SKP249-201ENST00000365490 RPA4Q13156 261 aa9.59□□□□□ -0.87
RN7SKP249-201ENST00000365490 PDAP1Q13442 181 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
RN7SKP249-201ENST00000365490 LRP8Q14114 963 aa9.59□□□□□ -0.87
RN7SKP249-201ENST00000365490 ZNF460Q14592 562 aa9.59□□□□□ -0.87
RN7SKP249-201ENST00000365490 INSCQ1MX18 579 aa9.59□□□□□ -0.87
RN7SKP249-201ENST00000365490 METRNLQ641Q3 311 aa9.59□□□□□ -0.87
RN7SKP249-201ENST00000365490 CRTC3Q6UUV7 619 aa9.59□□□□□ -0.87
RN7SKP249-201ENST00000365490 CYHR1Q6ZMK1 362 aa9.59□□□□□ -0.87
RN7SKP249-201ENST00000365490 NEK10Q6ZWH5 1172 aa9.59□□□□□ -0.87
RN7SKP249-201ENST00000365490 CEP68Q76N32 757 aa9.59□□□□□ -0.87
RN7SKP249-201ENST00000365490 ARMCX6Q7L4S7 300 aa9.59□□□□□ -0.87
RN7SKP249-201ENST00000365490 OTOAQ7RTW8 1153 aa9.59□□□□□ -0.87
RN7SKP249-201ENST00000365490 AMZ2Q86W34 360 aa9.59□□□□□ -0.87
RN7SKP249-201ENST00000365490 GALNT13Q8IUC8 556 aa9.59□□□□□ -0.87
RN7SKP249-201ENST00000365490 TRAPPC5Q8IUR0 188 aa9.59□□□□□ -0.87
RN7SKP249-201ENST00000365490 SYT12Q8IV01 421 aa9.59□□□□□ -0.87
RN7SKP249-201ENST00000365490 SRRM1Q8IYB3 904 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
RN7SKP249-201ENST00000365490 RGL4Q8IZJ4 473 aa9.59□□□□□ -0.87
RN7SKP249-201ENST00000365490 CENPLQ8N0S6 344 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
RN7SKP249-201ENST00000365490 PLD6Q8N2A8 252 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
RN7SKP249-201ENST00000365490 ZBTB2Q8N680 514 aa9.59□□□□□ -0.87
RN7SKP249-201ENST00000365490 GOLGA6L1Q8N7Z2 621 aa9.59□□□□□ -0.87
RN7SKP249-201ENST00000365490 SIDT2Q8NBJ9 832 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
RN7SKP249-201ENST00000365490 ANKRD49Q8WVL7 239 aa9.59□□□□□ -0.87
RN7SKP249-201ENST00000365490 SKA1Q96BD8 255 aa9.59□□□□□ -0.87
RN7SKP249-201ENST00000365490 FAM136AQ96C01 138 aa9.59□□□□□ -0.87
RN7SKP249-201ENST00000365490 PRRX2Q99811 253 aa9.59□□□□□ -0.87
RN7SKP249-201ENST00000365490 DPEP2Q9H4A9 486 aa9.59□□□□□ -0.87
RN7SKP249-201ENST00000365490 GPAMQ9HCL2 828 aa9.59□□□□□ -0.87
RN7SKP249-201ENST00000365490 MRPL40Q9NQ50 206 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
RN7SKP249-201ENST00000365490 TM7SF3Q9NS93 570 aa9.59□□□□□ -0.87
RN7SKP249-201ENST00000365490 IGSF5Q9NSI5 407 aa9.59□□□□□ -0.87
RN7SKP249-201ENST00000365490 KLQ9UEF7 1012 aa9.59□□□□□ -0.87
RN7SKP249-201ENST00000365490 SUSD2Q9UGT4 822 aa9.59□□□□□ -0.87
RN7SKP249-201ENST00000365490 DCDC2Q9UHG0 476 aa9.59□□□□□ -0.87
RN7SKP249-201ENST00000365490 ZNHIT2Q9UHR6 403 aa9.59□□□□□ -0.87
RN7SKP249-201ENST00000365490 KLF15Q9UIH9 416 aa9.59□□□□□ -0.87
RN7SKP249-201ENST00000365490 TRMT6Q9UJA5 497 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
RN7SKP249-201ENST00000365490 TLK1Q9UKI8 766 aa9.59□□□□□ -0.87
RN7SKP249-201ENST00000365490 ST14Q9Y5Y6 855 aa9.59□□□□□ -0.87
RN7SKP249-201ENST00000365490 GOLGA8RI6L899 631 aa9.58□□□□□ -0.88
RN7SKP249-201ENST00000365490 PRPF4O43172 522 aaKnown RBP eCLIP9.58□□□□□ -0.88
RN7SKP249-201ENST00000365490 RASGRP1O95267 797 aa9.58□□□□□ -0.88
RN7SKP249-201ENST00000365490 TNFP01375 233 aa9.58□□□□□ -0.88
RN7SKP249-201ENST00000365490 CSF2P04141 144 aa9.58□□□□□ -0.88
RN7SKP249-201ENST00000365490 APOA4P06727 396 aa9.58□□□□□ -0.88
RN7SKP249-201ENST00000365490 LTA4HP09960 611 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
RN7SKP249-201ENST00000365490 CCDC166P0CW27 439 aa9.58□□□□□ -0.88
RN7SKP249-201ENST00000365490 ENO3P13929 434 aaPredicted RBP9.58□□□□□ -0.88
RN7SKP249-201ENST00000365490 BRAFP15056 766 aa9.58□□□□□ -0.88
RN7SKP249-201ENST00000365490 NME1P15531 152 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
RN7SKP249-201ENST00000365490 ITGB6P18564 788 aa9.58□□□□□ -0.88
RN7SKP249-201ENST00000365490 DGKAP23743 735 aa9.58□□□□□ -0.88
RN7SKP249-201ENST00000365490 CTSKP43235 329 aa9.58□□□□□ -0.88
RN7SKP249-201ENST00000365490 GNPDA1P46926 289 aa9.58□□□□□ -0.88
RN7SKP249-201ENST00000365490 CCT5P48643 541 aa9.58□□□□□ -0.88
RN7SKP249-201ENST00000365490 CSNK1EP49674 416 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
RN7SKP249-201ENST00000365490 BLKP51451 505 aa9.58□□□□□ -0.88
RN7SKP249-201ENST00000365490 IL2P60568 153 aa9.58□□□□□ -0.88
RN7SKP249-201ENST00000365490 MAGOHP61326 146 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
RN7SKP249-201ENST00000365490 BNC1Q01954 994 aa9.58□□□□□ -0.88
RN7SKP249-201ENST00000365490 PPARDQ03181 441 aa9.58□□□□□ -0.88
RN7SKP249-201ENST00000365490 DLG1Q12959 904 aa9.58□□□□□ -0.88
RN7SKP249-201ENST00000365490 GPS2Q13227 327 aa9.58□□□□□ -0.88
RN7SKP249-201ENST00000365490 TEAD4Q15561 434 aa9.58□□□□□ -0.88
RN7SKP249-201ENST00000365490 TTLL9Q3SXZ7 439 aa9.58□□□□□ -0.88
RN7SKP249-201ENST00000365490 TAF1BQ53T94 588 aaPredicted RBP9.58□□□□□ -0.88
RN7SKP249-201ENST00000365490 ACSBG2Q5FVE4 666 aa9.58□□□□□ -0.88
RN7SKP249-201ENST00000365490 LRRC8EQ6NSJ5 796 aa9.58□□□□□ -0.88
RN7SKP249-201ENST00000365490 FAM83HQ6ZRV2 1179 aaPredicted RBP9.58□□□□□ -0.88
RN7SKP249-201ENST00000365490 CDHR3Q6ZTQ4 885 aa9.58□□□□□ -0.88
RN7SKP249-201ENST00000365490 RAPH1Q70E73 1250 aa9.58□□□□□ -0.88
RN7SKP249-201ENST00000365490 PARGQ86W56 976 aa9.58□□□□□ -0.88
RN7SKP249-201ENST00000365490 VRK3Q8IV63 474 aa9.58□□□□□ -0.88
RN7SKP249-201ENST00000365490 SPNS2Q8IVW8 549 aa9.58□□□□□ -0.88
RN7SKP249-201ENST00000365490 CPNE9Q8IYJ1 553 aa9.58□□□□□ -0.88
RN7SKP249-201ENST00000365490 CFAP206Q8IYR0 622 aa9.58□□□□□ -0.88
RN7SKP249-201ENST00000365490 SLC22A15Q8IZD6 547 aa9.58□□□□□ -0.88
RN7SKP249-201ENST00000365490 TMEM151AQ8N4L1 468 aa9.58□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.2 ms