RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000306324.3

HOXD4-201, Transcript of homeobox D4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD4, Length 1,464 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD4-201ENST00000306324 UBXN4Q92575 508 aa21.94■■□□□ 1.1
HOXD4-201ENST00000306324 ANKZF1Q9H8Y5 726 aa21.94■■□□□ 1.1
HOXD4-201ENST00000306324 TRBV23OR9-2A0A075B6M9 112 aa21.93■■□□□ 1.1
HOXD4-201ENST00000306324 TCRBV9S1A1TA0A576 114 aa21.93■■□□□ 1.1
HOXD4-201ENST00000306324 HAUS5O94927 633 aa21.93■■□□□ 1.1
HOXD4-201ENST00000306324 TRIM16O95361 564 aa21.93■■□□□ 1.1
HOXD4-201ENST00000306324 GSTA2P09210 222 aa21.93■■□□□ 1.1
HOXD4-201ENST00000306324 NOVA1P51513 510 aaKnown RBP21.93■■□□□ 1.1
HOXD4-201ENST00000306324 TRIP6Q15654 476 aaKnown RBP21.93■■□□□ 1.1
HOXD4-201ENST00000306324 KYNUQ16719 465 aa21.93■■□□□ 1.1
HOXD4-201ENST00000306324 GSPT2Q8IYD1 628 aaKnown RBP21.93■■□□□ 1.1
HOXD4-201ENST00000306324 NAGSQ8N159 534 aa21.93■■□□□ 1.1
HOXD4-201ENST00000306324 KRT222Q8N1A0 295 aa21.93■■□□□ 1.1
HOXD4-201ENST00000306324 ELMO1Q92556 727 aa21.93■■□□□ 1.1
HOXD4-201ENST00000306324 BIRC8Q96P09 236 aa21.93■■□□□ 1.1
HOXD4-201ENST00000306324 TSSK1BQ9BXA7 367 aa21.93■■□□□ 1.1
HOXD4-201ENST00000306324 PSMD13Q9UNM6 376 aa21.93■■□□□ 1.1
HOXD4-201ENST00000306324 PCDHB1Q9Y5F3 818 aa21.93■■□□□ 1.1
HOXD4-201ENST00000306324 C17orf113A0A1B0GUU1 675 aa21.92■■□□□ 1.1
HOXD4-201ENST00000306324 DCDC2BA2VCK2 349 aa21.92■■□□□ 1.1
HOXD4-201ENST00000306324 PRR19A6NJB7 356 aa21.92■■□□□ 1.1
HOXD4-201ENST00000306324 NOBOXO60393 691 aa21.92■■□□□ 1.1
HOXD4-201ENST00000306324 ESR1P03372 595 aa21.92■■□□□ 1.1
HOXD4-201ENST00000306324 F3P13726 295 aa21.92■■□□□ 1.1
HOXD4-201ENST00000306324 KCNA4P22459 653 aa21.92■■□□□ 1.1
HOXD4-201ENST00000306324 RPIAP49247 311 aa21.92■■□□□ 1.1
HOXD4-201ENST00000306324 ADARP55265 1226 aaKnown RBP21.92■■□□□ 1.1
HOXD4-201ENST00000306324 DNAJC3Q13217 504 aa21.92■■□□□ 1.1
HOXD4-201ENST00000306324 BOP1Q14137 746 aaKnown RBP21.92■■□□□ 1.1
HOXD4-201ENST00000306324 NR0B2Q15466 257 aa21.92■■□□□ 1.1
HOXD4-201ENST00000306324 CTSL3PQ5NE16 218 aa21.92■■□□□ 1.1
HOXD4-201ENST00000306324 METRNLQ641Q3 311 aa21.92■■□□□ 1.1
HOXD4-201ENST00000306324 CNSTQ6PJW8 725 aa21.92■■□□□ 1.1
HOXD4-201ENST00000306324 OGFOD3Q6PK18 319 aa21.92■■□□□ 1.1
HOXD4-201ENST00000306324 NAPRTQ6XQN6 538 aa21.92■■□□□ 1.1
HOXD4-201ENST00000306324 KIAA0408Q6ZU52 694 aa21.92■■□□□ 1.1
HOXD4-201ENST00000306324 LILRA3Q8N6C8 439 aaPredicted RBP21.92■■□□□ 1.1
HOXD4-201ENST00000306324 GPR156Q8NFN8 814 aa21.92■■□□□ 1.1
HOXD4-201ENST00000306324 LKAAEAR1Q8TD35 194 aa21.92■■□□□ 1.1
HOXD4-201ENST00000306324 CCDC68Q9H2F9 335 aa21.92■■□□□ 1.1
HOXD4-201ENST00000306324 CDC42EP4Q9H3Q1 356 aaKnown RBP21.92■■□□□ 1.1
HOXD4-201ENST00000306324 DLL3Q9NYJ7 618 aa21.92■■□□□ 1.1
HOXD4-201ENST00000306324 NINJ2Q9NZG7 142 aa21.92■■□□□ 1.1
HOXD4-201ENST00000306324 NCKIPSDQ9NZQ3 722 aa21.92■■□□□ 1.1
HOXD4-201ENST00000306324 TNFSF14O43557 240 aa21.91■■□□□ 1.1
HOXD4-201ENST00000306324 SPAG6O75602 509 aa21.91■■□□□ 1.1
HOXD4-201ENST00000306324 PIAS1O75925 651 aa21.91■■□□□ 1.1
HOXD4-201ENST00000306324 GSTM1P09488 218 aa21.91■■□□□ 1.1
HOXD4-201ENST00000306324 LEPRP48357 1165 aaKnown RBP21.91■■□□□ 1.1
HOXD4-201ENST00000306324 GSTM4Q03013 218 aa21.91■■□□□ 1.1
HOXD4-201ENST00000306324 BRD3Q15059 726 aa21.91■■□□□ 1.1
HOXD4-201ENST00000306324 SYTL3Q4VX76 610 aa21.91■■□□□ 1.1
HOXD4-201ENST00000306324 C14orf28Q4W4Y0 310 aa21.91■■□□□ 1.1
HOXD4-201ENST00000306324 RELL1Q8IUW5 271 aa21.91■■□□□ 1.1
HOXD4-201ENST00000306324 CDKL2Q92772 493 aa21.91■■□□□ 1.1
HOXD4-201ENST00000306324 PANX3Q96QZ0 392 aa21.91■■□□□ 1.1
HOXD4-201ENST00000306324 COG4Q9H9E3 785 aa21.91■■□□□ 1.1
HOXD4-201ENST00000306324 EVA1BQ9NVM1 165 aa21.91■■□□□ 1.1
HOXD4-201ENST00000306324 PADI4Q9UM07 663 aa21.91■■□□□ 1.1
HOXD4-201ENST00000306324 LY6G6EA0A0G2JKS1 128 aa21.9■■□□□ 1.1
HOXD4-201ENST00000306324 CPED1A4D0V7 1026 aa21.9■■□□□ 1.1
HOXD4-201ENST00000306324 A6NCN8 305 aa21.9■■□□□ 1.1
HOXD4-201ENST00000306324 GIPC1O14908 333 aa21.9■■□□□ 1.1
HOXD4-201ENST00000306324 AHSGP02765 367 aa21.9■■□□□ 1.1
HOXD4-201ENST00000306324 CKMT1AP12532 417 aa21.9■■□□□ 1.1
HOXD4-201ENST00000306324 CEACAM1P13688 526 aa21.9■■□□□ 1.1
HOXD4-201ENST00000306324 PKMP14618 531 aaKnown RBP21.9■■□□□ 1.1
HOXD4-201ENST00000306324 SLC2A4P14672 509 aa21.9■■□□□ 1.1
HOXD4-201ENST00000306324 CKMT2P17540 419 aa21.9■■□□□ 1.1
HOXD4-201ENST00000306324 DUSP3P51452 185 aaPredicted RBP21.9■■□□□ 1.1
HOXD4-201ENST00000306324 CSE1LP55060 971 aaKnown RBP21.9■■□□□ 1.1
HOXD4-201ENST00000306324 MAZP56270 477 aaKnown RBP21.9■■□□□ 1.1
HOXD4-201ENST00000306324 BIRC2Q13490 618 aa21.9■■□□□ 1.1
HOXD4-201ENST00000306324 SLMAPQ14BN4 828 aa21.9■■□□□ 1.1
HOXD4-201ENST00000306324 IYDQ6PHW0 289 aa21.9■■□□□ 1.1
HOXD4-201ENST00000306324 FBF1Q8TES7 1133 aa21.9■■□□□ 1.1
HOXD4-201ENST00000306324 FAM136AQ96C01 138 aa21.9■■□□□ 1.1
HOXD4-201ENST00000306324 SMYD2Q9NRG4 433 aa21.9■■□□□ 1.1
HOXD4-201ENST00000306324 SCHIP1Q9P0W5 487 aaPredicted RBP21.9■■□□□ 1.1
HOXD4-201ENST00000306324 ACSL5Q9ULC5 683 aa21.9■■□□□ 1.1
HOXD4-201ENST00000306324 WDR37Q9Y2I8 494 aa21.9■■□□□ 1.1
HOXD4-201ENST00000306324 U3KQA8 63 aa21.9■■□□□ 1.1
HOXD4-201ENST00000306324 SPAARA0A1B0GVQ0 90 aa21.9■■□□□ 1.1
HOXD4-201ENST00000306324 E5RI56 91 aa21.9■■□□□ 1.1
HOXD4-201ENST00000306324 H3BMM5 538 aa21.9■■□□□ 1.1
HOXD4-201ENST00000306324 NIPSNAP2O75323 286 aa21.9■■□□□ 1.1
HOXD4-201ENST00000306324 KCNK5O95279 499 aa21.9■■□□□ 1.1
HOXD4-201ENST00000306324 ACSL3O95573 720 aa21.9■■□□□ 1.1
HOXD4-201ENST00000306324 FAM153BP0C7A2 387 aa21.9■■□□□ 1.1
HOXD4-201ENST00000306324 SLC35G4P0C7Q5 338 aa21.9■■□□□ 1.1
HOXD4-201ENST00000306324 MYBL2P10244 700 aa21.9■■□□□ 1.1
HOXD4-201ENST00000306324 BRAFP15056 766 aa21.9■■□□□ 1.1
HOXD4-201ENST00000306324 CHRM3P20309 590 aa21.9■■□□□ 1.1
HOXD4-201ENST00000306324 GABRB3P28472 473 aa21.9■■□□□ 1.1
HOXD4-201ENST00000306324 CCR7P32248 378 aa21.9■■□□□ 1.1
HOXD4-201ENST00000306324 STX2P32856 288 aa21.9■■□□□ 1.1
HOXD4-201ENST00000306324 HALP42357 657 aa21.9■■□□□ 1.1
HOXD4-201ENST00000306324 ABCG1P45844 678 aa21.9■■□□□ 1.1
HOXD4-201ENST00000306324 PREPP48147 710 aa21.9■■□□□ 1.1
HOXD4-201ENST00000306324 ERCC6LQ2NKX8 1250 aa21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.9 ms