RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000284617.6

CCSAP-201, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCSAP, Length 5,121 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-201ENST00000284617 MAP4K5Q9Y4K4 846 aa20.89■□□□□ 0.94
CCSAP-201ENST00000284617 CLDN25C9JDP6 229 aa20.89■□□□□ 0.93
CCSAP-201ENST00000284617 PIGRP01833 764 aa20.89■□□□□ 0.93
CCSAP-201ENST00000284617 NOL9Q5SY16 702 aaKnown RBP20.89■□□□□ 0.93
CCSAP-201ENST00000284617 PEX5LQ8IYB4 626 aa20.89■□□□□ 0.93
CCSAP-201ENST00000284617 MEIOBQ8N635 442 aa20.89■□□□□ 0.93
CCSAP-201ENST00000284617 AIREO43918 545 aa20.89■□□□□ 0.93
CCSAP-201ENST00000284617 PSIP1O75475 530 aaKnown RBP20.89■□□□□ 0.93
CCSAP-201ENST00000284617 RAP2AP10114 183 aa20.89■□□□□ 0.93
CCSAP-201ENST00000284617 SLC1A2P43004 574 aa20.89■□□□□ 0.93
CCSAP-201ENST00000284617 RGS8P57771 180 aaPredicted RBP20.89■□□□□ 0.93
CCSAP-201ENST00000284617 PARGQ86W56 976 aa20.89■□□□□ 0.93
CCSAP-201ENST00000284617 CRYBG2Q8N1P7 616 aa20.89■□□□□ 0.93
CCSAP-201ENST00000284617 PLD4Q96BZ4 506 aa20.89■□□□□ 0.93
CCSAP-201ENST00000284617 EBF3Q9H4W6 596 aa20.89■□□□□ 0.93
CCSAP-201ENST00000284617 ELL3Q9HB65 397 aaPredicted RBP20.89■□□□□ 0.93
CCSAP-201ENST00000284617 FKBPLQ9UIM3 349 aa20.89■□□□□ 0.93
CCSAP-201ENST00000284617 AQP12BA6NM10 295 aa20.89■□□□□ 0.93
CCSAP-201ENST00000284617 C9JVG2 144 aa20.89■□□□□ 0.93
CCSAP-201ENST00000284617 STBD1O95210 358 aa20.89■□□□□ 0.93
CCSAP-201ENST00000284617 MNDAP41218 407 aa20.89■□□□□ 0.93
CCSAP-201ENST00000284617 MAPK12P53778 367 aa20.89■□□□□ 0.93
CCSAP-201ENST00000284617 CA9Q16790 459 aa20.89■□□□□ 0.93
CCSAP-201ENST00000284617 TMC8Q8IU68 726 aa20.89■□□□□ 0.93
CCSAP-201ENST00000284617 AQP12AQ8IXF9 295 aa20.89■□□□□ 0.93
CCSAP-201ENST00000284617 DIRAS2Q96HU8 199 aa20.89■□□□□ 0.93
CCSAP-201ENST00000284617 KLHL32Q96NJ5 620 aa20.89■□□□□ 0.93
CCSAP-201ENST00000284617 PCDHGA11Q9Y5H2 935 aa20.89■□□□□ 0.93
CCSAP-201ENST00000284617 MYOM1P52179 1685 aa20.88■□□□□ 0.93
CCSAP-201ENST00000284617 SAGP10523 405 aaPredicted RBP20.88■□□□□ 0.93
CCSAP-201ENST00000284617 CCDC80Q76M96 950 aa20.88■□□□□ 0.93
CCSAP-201ENST00000284617 TTC29Q8NA56 475 aaPredicted RBP20.88■□□□□ 0.93
CCSAP-201ENST00000284617 MTMR14Q8NCE2 650 aa20.88■□□□□ 0.93
CCSAP-201ENST00000284617 RAB2BQ8WUD1 216 aa20.88■□□□□ 0.93
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF354BQ96LW1 612 aa20.88■□□□□ 0.93
CCSAP-201ENST00000284617 HAPLN3Q96S86 360 aa20.88■□□□□ 0.93
CCSAP-201ENST00000284617 COQ10BQ9H8M1 238 aa20.88■□□□□ 0.93
CCSAP-201ENST00000284617 MTRRQ9UBK8 725 aa20.88■□□□□ 0.93
CCSAP-201ENST00000284617 OAS3Q9Y6K5 1087 aaKnown RBP20.88■□□□□ 0.93
CCSAP-201ENST00000284617 FAM234BA2RU67 622 aa20.88■□□□□ 0.93
CCSAP-201ENST00000284617 YJEFN3A6XGL0 299 aa20.88■□□□□ 0.93
CCSAP-201ENST00000284617 PALM2-AKAP2B1ALY0 433 aaPredicted RBP20.88■□□□□ 0.93
CCSAP-201ENST00000284617 AP2A2O94973 939 aa20.88■□□□□ 0.93
CCSAP-201ENST00000284617 C9P02748 559 aa20.88■□□□□ 0.93
CCSAP-201ENST00000284617 RPS14P62263 151 aaKnown RBP20.88■□□□□ 0.93
CCSAP-201ENST00000284617 TYSND1Q2T9J0 566 aa20.88■□□□□ 0.93
CCSAP-201ENST00000284617 FEM1CQ96JP0 617 aa20.88■□□□□ 0.93
CCSAP-201ENST00000284617 BCL2L14Q9BZR8 327 aa20.88■□□□□ 0.93
CCSAP-201ENST00000284617 EQTNQ9NQ60 294 aa20.88■□□□□ 0.93
CCSAP-201ENST00000284617 CALML5Q9NZT1 146 aa20.88■□□□□ 0.93
CCSAP-201ENST00000284617 CNTN3Q9P232 1028 aa20.88■□□□□ 0.93
CCSAP-201ENST00000284617 DNAJB9Q9UBS3 223 aa20.88■□□□□ 0.93
CCSAP-201ENST00000284617 RUVBL1Q9Y265 456 aaKnown RBP20.88■□□□□ 0.93
CCSAP-201ENST00000284617 ARL5CA6NH57 179 aa20.88■□□□□ 0.93
CCSAP-201ENST00000284617 SLC7A1P30825 629 aa20.88■□□□□ 0.93
CCSAP-201ENST00000284617 SCN1BQ07699 218 aa20.88■□□□□ 0.93
CCSAP-201ENST00000284617 NOGQ13253 232 aa20.88■□□□□ 0.93
CCSAP-201ENST00000284617 IL18Q14116 193 aa20.88■□□□□ 0.93
CCSAP-201ENST00000284617 ZFP69Q49AA0 526 aa20.88■□□□□ 0.93
CCSAP-201ENST00000284617 PLEKHG4Q58EX7 1191 aa20.88■□□□□ 0.93
CCSAP-201ENST00000284617 ZDHHC21Q8IVQ6 265 aa20.88■□□□□ 0.93
CCSAP-201ENST00000284617 NSMCE3Q96MG7 304 aa20.88■□□□□ 0.93
CCSAP-201ENST00000284617 MAN2B2Q9Y2E5 1009 aa20.88■□□□□ 0.93
CCSAP-201ENST00000284617 H6PDO95479 791 aa20.88■□□□□ 0.93
CCSAP-201ENST00000284617 NSG1P42857 185 aa20.88■□□□□ 0.93
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF460Q14592 562 aa20.88■□□□□ 0.93
CCSAP-201ENST00000284617 KLHL24Q6TFL4 600 aa20.88■□□□□ 0.93
CCSAP-201ENST00000284617 RFKQ969G6 155 aa20.88■□□□□ 0.93
CCSAP-201ENST00000284617 CD320Q9NPF0 282 aa20.88■□□□□ 0.93
CCSAP-201ENST00000284617 AJAP1Q9UKB5 411 aaPredicted RBP20.88■□□□□ 0.93
CCSAP-201ENST00000284617 NFAT5O94916 1531 aa20.87■□□□□ 0.93
CCSAP-201ENST00000284617 SOWAHBA6NEL2 793 aa20.87■□□□□ 0.93
CCSAP-201ENST00000284617 CCNB2O95067 398 aa20.87■□□□□ 0.93
CCSAP-201ENST00000284617 LMO2P25791 158 aa20.87■□□□□ 0.93
CCSAP-201ENST00000284617 FBXO48Q5FWF7 155 aa20.87■□□□□ 0.93
CCSAP-201ENST00000284617 FUT10Q6P4F1 479 aa20.87■□□□□ 0.93
CCSAP-201ENST00000284617 C11orf24Q96F05 449 aaPredicted RBP20.87■□□□□ 0.93
CCSAP-201ENST00000284617 GPN1Q9HCN4 374 aaPredicted RBP20.87■□□□□ 0.93
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF221Q9UK13 617 aa20.87■□□□□ 0.93
CCSAP-201ENST00000284617 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa20.87■□□□□ 0.93
CCSAP-201ENST00000284617 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa20.87■□□□□ 0.93
CCSAP-201ENST00000284617 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa20.87■□□□□ 0.93
CCSAP-201ENST00000284617 TBC1D3DA0A087WVF3 549 aa20.87■□□□□ 0.93
CCSAP-201ENST00000284617 TBC1D3IA0A087WXS9 549 aa20.87■□□□□ 0.93
CCSAP-201ENST00000284617 TBC1D3EA0A087X179 549 aa20.87■□□□□ 0.93
CCSAP-201ENST00000284617 TBC1D3KA0A087X1G2 549 aa20.87■□□□□ 0.93
CCSAP-201ENST00000284617 TBC1D3FA6NER0 549 aaPredicted RBP20.87■□□□□ 0.93
CCSAP-201ENST00000284617 TBC1D3LB9A6J9 549 aa20.87■□□□□ 0.93
CCSAP-201ENST00000284617 TBC1D3HP0C7X1 549 aa20.87■□□□□ 0.93
CCSAP-201ENST00000284617 TBC1D3GQ6DHY5 549 aa20.87■□□□□ 0.93
CCSAP-201ENST00000284617 TBC1D3CQ6IPX1 549 aa20.87■□□□□ 0.93
CCSAP-201ENST00000284617 TBC1D3Q8IZP1 549 aaPredicted RBP20.87■□□□□ 0.93
CCSAP-201ENST00000284617 FAM156AQ8NDB6 213 aa20.87■□□□□ 0.93
CCSAP-201ENST00000284617 FCRL4Q96PJ5 515 aa20.87■□□□□ 0.93
CCSAP-201ENST00000284617 EBF4Q9BQW3 602 aa20.87■□□□□ 0.93
CCSAP-201ENST00000284617 HIPK3Q9H422 1215 aa20.87■□□□□ 0.93
CCSAP-201ENST00000284617 KAT8Q9H7Z6 458 aaKnown RBP20.87■□□□□ 0.93
CCSAP-201ENST00000284617 OXSMQ9NWU1 459 aa20.87■□□□□ 0.93
CCSAP-201ENST00000284617 RFTN1Q14699 578 aaPredicted RBP20.87■□□□□ 0.93
CCSAP-201ENST00000284617 IFI44LQ53G44 452 aa20.87■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.8 ms