RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000089378.4

Sh3bp1-203, Transcript of SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Sh3bp1, Length 2,001 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 LmnaP48678 665 aaKnown RBP20.78■□□□□ 0.92
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Ufm1P61961 85 aa20.78■□□□□ 0.92
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Ctps1P70698 591 aa20.78■□□□□ 0.92
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 A1bgQ19LI2 512 aa20.78■□□□□ 0.92
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Znrf3Q5SSZ7 913 aa20.78■□□□□ 0.92
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Pcbp2Q61990 362 aaKnown RBP20.78■□□□□ 0.92
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 IfneQ80ZF2 192 aa20.78■□□□□ 0.92
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Shc2Q8BMC3 573 aa20.78■□□□□ 0.92
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Gbp9Q8BTS3 619 aa20.78■□□□□ 0.92
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Mtfr2Q8VED8 361 aa20.78■□□□□ 0.92
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Hdac11Q91WA3 347 aa20.78■□□□□ 0.92
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Kif19Q99PT9 997 aa20.78■□□□□ 0.92
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 CatsperzQ9CQP8 194 aa20.78■□□□□ 0.92
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Cyb5r1Q9DB73 305 aa20.78■□□□□ 0.92
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Gpr63Q9EQQ3 425 aa20.78■□□□□ 0.92
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Sae1Q9R1T2 350 aa20.78■□□□□ 0.92
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Ccdc120A2AEV7 629 aa20.77■□□□□ 0.92
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 ZfrO88532 1074 aaKnown RBP20.77■□□□□ 0.92
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Il1aP01582 270 aa20.77■□□□□ 0.92
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 SirpaP97797 513 aa20.77■□□□□ 0.92
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 F8a1Q00558 380 aa20.77■□□□□ 0.92
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Znf800Q0VEE6 662 aa20.77■□□□□ 0.92
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 HdxQ14B70 692 aa20.77■□□□□ 0.92
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Axdnd1Q3UZ57 424 aa20.77■□□□□ 0.92
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 BegainQ68EF6 600 aa20.77■□□□□ 0.92
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Nod1Q8BHB0 953 aa20.77■□□□□ 0.92
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 SntnQ8C9X1 147 aa20.77■□□□□ 0.92
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 HnrnprQ8VHM5 632 aaKnown RBP20.77■□□□□ 0.92
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Dph2Q9CR25 489 aa20.77■□□□□ 0.92
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Mfsd10Q9D2V8 456 aaKnown RBP20.77■□□□□ 0.92
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Capn10Q9ESK3 666 aa20.77■□□□□ 0.92
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Rnf11Q9QYK7 154 aa20.77■□□□□ 0.92
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Gm42715A0A087WP63 3095 aaKnown RBP20.77■□□□□ 0.92
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Fam131cA2ADB2 273 aa20.77■□□□□ 0.91
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Ttc23lA6H6E9 458 aa20.77■□□□□ 0.91
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Polr2jO08740 117 aaKnown RBP20.77■□□□□ 0.91
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 AladP10518 330 aa20.77■□□□□ 0.91
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Eno2P17183 434 aa20.77■□□□□ 0.91
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Ckmt1P30275 418 aaKnown RBP20.77■□□□□ 0.91
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Q3KNL4 93 aa20.77■□□□□ 0.91
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Gm5800Q497L3 186 aa20.77■□□□□ 0.91
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 MslnQ61468 625 aa20.77■□□□□ 0.91
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Il1rapQ61730 570 aa20.77■□□□□ 0.91
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Tnpo3Q6P2B1 923 aaKnown RBP20.77■□□□□ 0.91
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Gxylt2Q810K9 444 aa20.77■□□□□ 0.91
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Thoc5Q8BKT7 683 aaKnown RBP20.77■□□□□ 0.91
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Ccdc32Q8BS39 179 aa20.77■□□□□ 0.91
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Thop1Q8C1A5 687 aaKnown RBP20.77■□□□□ 0.91
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Tmem252Q8C353 183 aa20.77■□□□□ 0.91
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Q8C5S3 137 aa20.77■□□□□ 0.91
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Slc45a3Q8K0H7 553 aa20.77■□□□□ 0.91
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Sirt5Q8K2C6 310 aa20.77■□□□□ 0.91
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Olfr606Q8VGZ8 319 aa20.77■□□□□ 0.91
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Scd3Q99PL7 359 aa20.77■□□□□ 0.91
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 FancgQ9EQR6 623 aa20.77■□□□□ 0.91
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Vmn1r49Q9WUF1 310 aa20.77■□□□□ 0.91
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Igkv12-98A0A0G2JGF9 115 aa20.76■□□□□ 0.91
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Vmn2r118E9Q1C1 853 aa20.76■□□□□ 0.91
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Ceacam3E9Q6J4 706 aa20.76■□□□□ 0.91
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Vmn2r65G3X931 845 aa20.76■□□□□ 0.91
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Sod3O09164 251 aa20.76■□□□□ 0.91
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 P04214 136 aa20.76■□□□□ 0.91
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Larp7Q05CL8 570 aaKnown RBP20.76■□□□□ 0.91
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Eps8Q08509 821 aa20.76■□□□□ 0.91
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Myadml2Q08AU7 307 aa20.76■□□□□ 0.91
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Mansc4Q3UU94 337 aa20.76■□□□□ 0.91
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Mthfd1lQ3V3R1 977 aaKnown RBP20.76■□□□□ 0.91
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Tapt1Q4VBD2 564 aa20.76■□□□□ 0.91
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Cd6Q61003 665 aa20.76■□□□□ 0.91
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 MogQ61885 246 aa20.76■□□□□ 0.91
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Ints6Q6PCM2 883 aa20.76■□□□□ 0.91
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 RragdQ7TT45 449 aa20.76■□□□□ 0.91
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Frs2Q8C180 508 aa20.76■□□□□ 0.91
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Batf2Q8R1H8 277 aa20.76■□□□□ 0.91
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Ccdc71Q8VEG0 433 aa20.76■□□□□ 0.91
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 SardhQ99LB7 919 aa20.76■□□□□ 0.91
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Nck1Q99M51 377 aa20.76■□□□□ 0.91
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Marc1Q9CW42 340 aa20.76■□□□□ 0.91
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Tomm70Q9CZW5 611 aa20.76■□□□□ 0.91
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 TesclQ9DAJ7 231 aa20.76■□□□□ 0.91
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Rhox9Q9EQM5 227 aa20.76■□□□□ 0.91
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Aqp5Q9WTY4 265 aa20.76■□□□□ 0.91
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Gsk3bQ9WV60 420 aa20.76■□□□□ 0.91
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Rp1P56716 2095 aa20.76■□□□□ 0.91
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Catsperg2C6KI89 1145 aa20.75■□□□□ 0.91
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Rnf169E9Q7F2 694 aa20.75■□□□□ 0.91
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 F830016B08RikG3UWE2 416 aa20.75■□□□□ 0.91
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Fkbp7O54998 218 aa20.75■□□□□ 0.91
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 CryaaP24622 196 aa20.75■□□□□ 0.91
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Mkl2P59759 1080 aa20.75■□□□□ 0.91
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Foxr1Q3UTB7 268 aa20.75■□□□□ 0.91
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Pde1aQ61481 565 aa20.75■□□□□ 0.91
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Lemd2Q6DVA0 511 aa20.75■□□□□ 0.91
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Syt14Q7TN84 555 aa20.75■□□□□ 0.91
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Slc9a7Q8BLV3 726 aa20.75■□□□□ 0.91
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Trmt2bQ8BQJ6 493 aa20.75■□□□□ 0.91
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Ca12Q8CI85 354 aa20.75■□□□□ 0.91
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Rab15Q8K386 212 aa20.75■□□□□ 0.91
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Golga7Q91W53 137 aa20.75■□□□□ 0.91
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 PacrglQ9D3X5 248 aa20.75■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 36.4 ms