RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000027502.15

Atg4b-201, Transcript of Cysteine protease ATG4B, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Atg4b, Length 4,173 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4b-201ENSMUST00000027502 P04213 122 aa10.13□□□□□ -0.79
Atg4b-201ENSMUST00000027502 JunbP09450 344 aaKnown RBP10.13□□□□□ -0.79
Atg4b-201ENSMUST00000027502 Mbl1P39039 239 aa10.13□□□□□ -0.79
Atg4b-201ENSMUST00000027502 Mrgprb1Q3UG61 350 aa10.13□□□□□ -0.79
Atg4b-201ENSMUST00000027502 Cpa6Q5U901 438 aa10.13□□□□□ -0.79
Atg4b-201ENSMUST00000027502 Lims2Q91XD2 341 aa10.13□□□□□ -0.79
Atg4b-201ENSMUST00000027502 DeraQ91YP3 318 aa10.13□□□□□ -0.79
Atg4b-201ENSMUST00000027502 Prmt3Q922H1 532 aa10.13□□□□□ -0.79
Atg4b-201ENSMUST00000027502 Cep350E9Q309 3095 aa10.13□□□□□ -0.79
Atg4b-201ENSMUST00000027502 Gm4869A0A1B0GSG7 984 aa10.12□□□□□ -0.79
Atg4b-201ENSMUST00000027502 PigfO09101 219 aa10.12□□□□□ -0.79
Atg4b-201ENSMUST00000027502 Angpt2O35608 496 aa10.12□□□□□ -0.79
Atg4b-201ENSMUST00000027502 CcnoP0C242 352 aa10.12□□□□□ -0.79
Atg4b-201ENSMUST00000027502 Sox2P48432 319 aa10.12□□□□□ -0.79
Atg4b-201ENSMUST00000027502 Kcnab2P62482 367 aa10.12□□□□□ -0.79
Atg4b-201ENSMUST00000027502 Zfp39Q02525 718 aa10.12□□□□□ -0.79
Atg4b-201ENSMUST00000027502 Abraxas2Q3TCJ1 415 aa10.12□□□□□ -0.79
Atg4b-201ENSMUST00000027502 Q6P2K3 674 aa10.12□□□□□ -0.79
Atg4b-201ENSMUST00000027502 Rpp38Q80UU2 280 aa10.12□□□□□ -0.79
Atg4b-201ENSMUST00000027502 Chil6Q80W26 440 aa10.12□□□□□ -0.79
Atg4b-201ENSMUST00000027502 Slco2b1Q8BXB6 683 aa10.12□□□□□ -0.79
Atg4b-201ENSMUST00000027502 Zbtb6Q8K088 423 aa10.12□□□□□ -0.79
Atg4b-201ENSMUST00000027502 Plac9Q8K262 108 aa10.12□□□□□ -0.79
Atg4b-201ENSMUST00000027502 Treml1Q8K558 317 aa10.12□□□□□ -0.79
Atg4b-201ENSMUST00000027502 Sirt3Q8R104 334 aa10.12□□□□□ -0.79
Atg4b-201ENSMUST00000027502 Olfr1250Q8VGM3 314 aa10.12□□□□□ -0.79
Atg4b-201ENSMUST00000027502 Ribc2Q9D4Q1 309 aa10.12□□□□□ -0.79
Atg4b-201ENSMUST00000027502 TrmuQ9DAT5 417 aa10.12□□□□□ -0.79
Atg4b-201ENSMUST00000027502 Hcar2Q9EP66 360 aa10.12□□□□□ -0.79
Atg4b-201ENSMUST00000027502 Pin1Q9QUR7 165 aa10.12□□□□□ -0.79
Atg4b-201ENSMUST00000027502 Katna1Q9WV86 491 aa10.12□□□□□ -0.79
Atg4b-201ENSMUST00000027502 Krt6bQ9Z331 562 aa10.12□□□□□ -0.79
Atg4b-201ENSMUST00000027502 Alpk2Q91ZB0 2144 aa10.12□□□□□ -0.79
Atg4b-201ENSMUST00000027502 Vmn2r31L7N1Z4 861 aa10.12□□□□□ -0.79
Atg4b-201ENSMUST00000027502 Gm6502L7N456 481 aa10.12□□□□□ -0.79
Atg4b-201ENSMUST00000027502 Nrp2O35375 931 aa10.12□□□□□ -0.79
Atg4b-201ENSMUST00000027502 Ppef1O35655 650 aa10.12□□□□□ -0.79
Atg4b-201ENSMUST00000027502 Aif1O70200 147 aa10.12□□□□□ -0.79
Atg4b-201ENSMUST00000027502 Sat1P48026 171 aa10.12□□□□□ -0.79
Atg4b-201ENSMUST00000027502 Gadd45aP48316 165 aa10.12□□□□□ -0.79
Atg4b-201ENSMUST00000027502 AhcyP50247 432 aa10.12□□□□□ -0.79
Atg4b-201ENSMUST00000027502 Plk5Q4FZD7 595 aa10.12□□□□□ -0.79
Atg4b-201ENSMUST00000027502 Prss53Q571E5 552 aa10.12□□□□□ -0.79
Atg4b-201ENSMUST00000027502 Klhl23Q6GQU2 558 aa10.12□□□□□ -0.79
Atg4b-201ENSMUST00000027502 4932411N23RikQ8C0S0 470 aa10.12□□□□□ -0.79
Atg4b-201ENSMUST00000027502 Psapl1Q8C1C1 522 aa10.12□□□□□ -0.79
Atg4b-201ENSMUST00000027502 Hmgcll1Q8JZS7 343 aa10.12□□□□□ -0.79
Atg4b-201ENSMUST00000027502 Hacd3Q8K2C9 362 aa10.12□□□□□ -0.79
Atg4b-201ENSMUST00000027502 Kiaa2013Q91X21 634 aa10.12□□□□□ -0.79
Atg4b-201ENSMUST00000027502 Trim33Q99PP7 1142 aa10.12□□□□□ -0.79
Atg4b-201ENSMUST00000027502 Nos1apQ9D3A8 503 aa10.12□□□□□ -0.79
Atg4b-201ENSMUST00000027502 Spin2gA0A0N4SW15 236 aa10.12□□□□□ -0.79
Atg4b-201ENSMUST00000027502 Olfr566A0A1B0GST0 319 aa10.12□□□□□ -0.79
Atg4b-201ENSMUST00000027502 Gm6569D3YTM9 175 aa10.12□□□□□ -0.79
Atg4b-201ENSMUST00000027502 Spin2eJ3QNQ0 234 aa10.12□□□□□ -0.79
Atg4b-201ENSMUST00000027502 Ackr2O08707 378 aa10.12□□□□□ -0.79
Atg4b-201ENSMUST00000027502 JunP05627 334 aa10.12□□□□□ -0.79
Atg4b-201ENSMUST00000027502 Cd86P42082 309 aa10.12□□□□□ -0.79
Atg4b-201ENSMUST00000027502 Clec12aQ504P2 267 aa10.12□□□□□ -0.79
Atg4b-201ENSMUST00000027502 SctrQ5FWI2 447 aa10.12□□□□□ -0.79
Atg4b-201ENSMUST00000027502 UrgcpQ5NCI0 926 aa10.12□□□□□ -0.79
Atg4b-201ENSMUST00000027502 Klhl26Q8BGY4 606 aa10.12□□□□□ -0.79
Atg4b-201ENSMUST00000027502 Cars2Q8BYM8 551 aa10.12□□□□□ -0.79
Atg4b-201ENSMUST00000027502 Casp9Q8C3Q9 454 aa10.12□□□□□ -0.79
Atg4b-201ENSMUST00000027502 Smoc2Q8CD91 447 aa10.12□□□□□ -0.79
Atg4b-201ENSMUST00000027502 DcxrQ91X52 244 aa10.12□□□□□ -0.79
Atg4b-201ENSMUST00000027502 Mta3Q924K8 591 aa10.12□□□□□ -0.79
Atg4b-201ENSMUST00000027502 Aco2Q99KI0 780 aaKnown RBP10.12□□□□□ -0.79
Atg4b-201ENSMUST00000027502 Rgs18Q99PG4 235 aa10.12□□□□□ -0.79
Atg4b-201ENSMUST00000027502 Trim16Q99PP9 556 aa10.12□□□□□ -0.79
Atg4b-201ENSMUST00000027502 Art4Q9CRA0 300 aa10.12□□□□□ -0.79
Atg4b-201ENSMUST00000027502 Haus5Q9D786 619 aa10.12□□□□□ -0.79
Atg4b-201ENSMUST00000027502 Hapln2Q9ESM3 341 aa10.12□□□□□ -0.79
Atg4b-201ENSMUST00000027502 Rpl38Q9JJI8 70 aaKnown RBP10.12□□□□□ -0.79
Atg4b-201ENSMUST00000027502 Faap100A2ACJ2 879 aa10.11□□□□□ -0.79
Atg4b-201ENSMUST00000027502 Mybpc1D3YU50 1127 aa10.11□□□□□ -0.79
Atg4b-201ENSMUST00000027502 Olfr414E9Q5P8 317 aa10.11□□□□□ -0.79
Atg4b-201ENSMUST00000027502 Gm14496K7N5U4 849 aa10.11□□□□□ -0.79
Atg4b-201ENSMUST00000027502 St3gal5O88829 414 aa10.11□□□□□ -0.79
Atg4b-201ENSMUST00000027502 SpnP15702 395 aa10.11□□□□□ -0.79
Atg4b-201ENSMUST00000027502 Pcbp1P60335 356 aaKnown RBP10.11□□□□□ -0.79
Atg4b-201ENSMUST00000027502 Vbp1P61759 196 aa10.11□□□□□ -0.79
Atg4b-201ENSMUST00000027502 SgcdP82347 289 aa10.11□□□□□ -0.79
Atg4b-201ENSMUST00000027502 Znf865Q3U3I9 1058 aa10.11□□□□□ -0.79
Atg4b-201ENSMUST00000027502 Klhl5Q6PFE1 708 aa10.11□□□□□ -0.79
Atg4b-201ENSMUST00000027502 Olfr366Q7TRY4 309 aa10.11□□□□□ -0.79
Atg4b-201ENSMUST00000027502 Gprc5aQ8BHL4 356 aa10.11□□□□□ -0.79
Atg4b-201ENSMUST00000027502 Ikzf5Q8BU00 419 aa10.11□□□□□ -0.79
Atg4b-201ENSMUST00000027502 UstQ8BUB6 407 aa10.11□□□□□ -0.79
Atg4b-201ENSMUST00000027502 Lpcat2Q8BYI6 544 aa10.11□□□□□ -0.79
Atg4b-201ENSMUST00000027502 Pnpla8Q8K1N1 776 aa10.11□□□□□ -0.79
Atg4b-201ENSMUST00000027502 Gpn2Q8VEJ1 310 aa10.11□□□□□ -0.79
Atg4b-201ENSMUST00000027502 Mob2Q8VI63 235 aa10.11□□□□□ -0.79
Atg4b-201ENSMUST00000027502 Pcdhb21Q91V48 774 aa10.11□□□□□ -0.79
Atg4b-201ENSMUST00000027502 Far1Q922J9 515 aa10.11□□□□□ -0.79
Atg4b-201ENSMUST00000027502 Ifitm3Q9CQW9 137 aa10.11□□□□□ -0.79
Atg4b-201ENSMUST00000027502 Ska2Q9CR46 120 aa10.11□□□□□ -0.79
Atg4b-201ENSMUST00000027502 VasnQ9CZT5 673 aa10.11□□□□□ -0.79
Atg4b-201ENSMUST00000027502 LctF8VPT3 1931 aa10.11□□□□□ -0.79
Atg4b-201ENSMUST00000027502 A0A1L1ST33 502 aa10.11□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 20.3 ms