RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000616641.4

PITX2-213, Transcript of paired like homeodomain 2, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PITX2, Length 3,102 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX2-213ENST00000616641 MAGP20916 626 aa11.46□□□□□ -0.57
PITX2-213ENST00000616641 PRDX3P30048 256 aaKnown RBP11.46□□□□□ -0.57
PITX2-213ENST00000616641 ATP5C1P36542 298 aaKnown RBP11.46□□□□□ -0.57
PITX2-213ENST00000616641 COPZ1P61923 177 aa11.46□□□□□ -0.57
PITX2-213ENST00000616641 IL10RBQ08334 325 aa11.46□□□□□ -0.57
PITX2-213ENST00000616641 PLD1Q13393 1074 aa11.46□□□□□ -0.57
PITX2-213ENST00000616641 FRG1Q14331 258 aaKnown RBP11.46□□□□□ -0.57
PITX2-213ENST00000616641 PLA2G4EQ3MJ16 856 aa11.46□□□□□ -0.57
PITX2-213ENST00000616641 MTX3Q5HYI7 312 aa11.46□□□□□ -0.57
PITX2-213ENST00000616641 ZNF678Q5SXM1 525 aa11.46□□□□□ -0.57
PITX2-213ENST00000616641 FAM45BPQ6NSW5 357 aa11.46□□□□□ -0.57
PITX2-213ENST00000616641 CARNMT1Q8N4J0 409 aa11.46□□□□□ -0.57
PITX2-213ENST00000616641 DNAJB14Q8TBM8 379 aa11.46□□□□□ -0.57
PITX2-213ENST00000616641 FAM45AQ8TCE6 357 aa11.46□□□□□ -0.57
PITX2-213ENST00000616641 BRSK1Q8TDC3 778 aa11.46□□□□□ -0.57
PITX2-213ENST00000616641 CCDC126Q96EE4 140 aa11.46□□□□□ -0.57
PITX2-213ENST00000616641 C8orf48Q96LL4 319 aa11.46□□□□□ -0.57
PITX2-213ENST00000616641 C17orf80Q9BSJ5 609 aa11.46□□□□□ -0.57
PITX2-213ENST00000616641 HIPK3Q9H422 1215 aa11.46□□□□□ -0.57
PITX2-213ENST00000616641 RPF2Q9H7B2 306 aaKnown RBP11.46□□□□□ -0.57
PITX2-213ENST00000616641 SCUBE2Q9NQ36 999 aa11.46□□□□□ -0.57
PITX2-213ENST00000616641 CACNA2D2Q9NY47 1150 aa11.46□□□□□ -0.57
PITX2-213ENST00000616641 UBA2Q9UBT2 640 aaPredicted RBP11.46□□□□□ -0.57
PITX2-213ENST00000616641 FKBPLQ9UIM3 349 aa11.46□□□□□ -0.57
PITX2-213ENST00000616641 ZNF229Q9UJW7 825 aa11.46□□□□□ -0.57
PITX2-213ENST00000616641 DGKBQ9Y6T7 804 aa11.46□□□□□ -0.57
PITX2-213ENST00000616641 MIA3Q5JRA6 1907 aa11.46□□□□□ -0.57
PITX2-213ENST00000616641 SAC3D1A6NKF1 404 aa11.46□□□□□ -0.57
PITX2-213ENST00000616641 CLOCKO15516 846 aa11.46□□□□□ -0.57
PITX2-213ENST00000616641 CLASP2O75122 1294 aaKnown RBP11.46□□□□□ -0.57
PITX2-213ENST00000616641 ABCB1P08183 1280 aaPredicted RBP11.46□□□□□ -0.57
PITX2-213ENST00000616641 BMP1P13497 986 aa11.46□□□□□ -0.57
PITX2-213ENST00000616641 CKMT2P17540 419 aa11.46□□□□□ -0.57
PITX2-213ENST00000616641 ALDH3B2P48448 385 aa11.46□□□□□ -0.57
PITX2-213ENST00000616641 DSC1Q08554 894 aa11.46□□□□□ -0.57
PITX2-213ENST00000616641 LRRC49Q8IUZ0 686 aa11.46□□□□□ -0.57
PITX2-213ENST00000616641 SLC22A9Q8IVM8 553 aa11.46□□□□□ -0.57
PITX2-213ENST00000616641 FBXO39Q8N4B4 442 aa11.46□□□□□ -0.57
PITX2-213ENST00000616641 SIDT2Q8NBJ9 832 aaKnown RBP11.46□□□□□ -0.57
PITX2-213ENST00000616641 TWIST2Q8WVJ9 160 aa11.46□□□□□ -0.57
PITX2-213ENST00000616641 VPS33AQ96AX1 596 aa11.46□□□□□ -0.57
PITX2-213ENST00000616641 CITED4Q96RK1 184 aa11.46□□□□□ -0.57
PITX2-213ENST00000616641 MFSD1Q9H3U5 465 aa11.46□□□□□ -0.57
PITX2-213ENST00000616641 CPQQ9Y646 472 aa11.46□□□□□ -0.57
PITX2-213ENST00000616641 SCN4AP35499 1836 aa11.46□□□□□ -0.58
PITX2-213ENST00000616641 A0A0J9YYE9 177 aa11.46□□□□□ -0.58
PITX2-213ENST00000616641 ANGPT2O15123 496 aa11.46□□□□□ -0.58
PITX2-213ENST00000616641 NRP2O60462 931 aa11.46□□□□□ -0.58
PITX2-213ENST00000616641 NOL3O60936 208 aaKnown RBP11.46□□□□□ -0.58
PITX2-213ENST00000616641 GUCA1CO95843 209 aa11.46□□□□□ -0.58
PITX2-213ENST00000616641 IMPDH1P20839 514 aa11.46□□□□□ -0.58
PITX2-213ENST00000616641 DIO3P55073 304 aa11.46□□□□□ -0.58
PITX2-213ENST00000616641 PHC1P78364 1004 aa11.46□□□□□ -0.58
PITX2-213ENST00000616641 SP3Q02447 781 aa11.46□□□□□ -0.58
PITX2-213ENST00000616641 CLCQ05315 142 aa11.46□□□□□ -0.58
PITX2-213ENST00000616641 LYSMD3Q7Z3D4 306 aa11.46□□□□□ -0.58
PITX2-213ENST00000616641 FUBP3Q96I24 572 aaKnown RBP eCLIP11.46□□□□□ -0.58
PITX2-213ENST00000616641 PPP1R2P1Q96PQ5 205 aa11.46□□□□□ -0.58
PITX2-213ENST00000616641 TRIT1Q9H3H1 467 aaKnown RBP11.46□□□□□ -0.58
PITX2-213ENST00000616641 NOL11Q9H8H0 719 aaKnown RBP11.46□□□□□ -0.58
PITX2-213ENST00000616641 COMMD8Q9NX08 183 aa11.46□□□□□ -0.58
PITX2-213ENST00000616641 COQ3Q9NZJ6 369 aa11.46□□□□□ -0.58
PITX2-213ENST00000616641 CD274Q9NZQ7 290 aa11.46□□□□□ -0.58
PITX2-213ENST00000616641 GNPTGQ9UJJ9 305 aa11.46□□□□□ -0.58
PITX2-213ENST00000616641 DNAJC15Q9Y5T4 150 aa11.46□□□□□ -0.58
PITX2-213ENST00000616641 ZNF559-ZNF177A0A0A6YYI6 481 aaPredicted RBP11.45□□□□□ -0.58
PITX2-213ENST00000616641 TRIM38O00635 465 aa11.45□□□□□ -0.58
PITX2-213ENST00000616641 RPP40O75818 363 aaKnown RBP11.45□□□□□ -0.58
PITX2-213ENST00000616641 CDK14O94921 469 aa11.45□□□□□ -0.58
PITX2-213ENST00000616641 CLIC3O95833 236 aa11.45□□□□□ -0.58
PITX2-213ENST00000616641 EOMESO95936 686 aa11.45□□□□□ -0.58
PITX2-213ENST00000616641 CORO1AP31146 461 aaKnown RBP11.45□□□□□ -0.58
PITX2-213ENST00000616641 GKP32189 559 aa11.45□□□□□ -0.58
PITX2-213ENST00000616641 PIK3CGP48736 1102 aa11.45□□□□□ -0.58
PITX2-213ENST00000616641 RAB15P59190 212 aa11.45□□□□□ -0.58
PITX2-213ENST00000616641 ZNF177Q13360 481 aaPredicted RBP11.45□□□□□ -0.58
PITX2-213ENST00000616641 ATXN7L2Q5T6C5 722 aaPredicted RBP11.45□□□□□ -0.58
PITX2-213ENST00000616641 RNF219Q5W0B1 726 aaPredicted RBP11.45□□□□□ -0.58
PITX2-213ENST00000616641 AFMIDQ63HM1 303 aa11.45□□□□□ -0.58
PITX2-213ENST00000616641 ANKRD26P1Q6NSI1 321 aa11.45□□□□□ -0.58
PITX2-213ENST00000616641 HMGCLL1Q8TB92 370 aa11.45□□□□□ -0.58
PITX2-213ENST00000616641 NUDT8Q8WV74 236 aa11.45□□□□□ -0.58
PITX2-213ENST00000616641 AUTS2Q8WXX7 1259 aa11.45□□□□□ -0.58
PITX2-213ENST00000616641 EFHD2Q96C19 240 aaPredicted RBP11.45□□□□□ -0.58
PITX2-213ENST00000616641 EGLN2Q96KS0 407 aa11.45□□□□□ -0.58
PITX2-213ENST00000616641 AP4S1Q9Y587 144 aa11.45□□□□□ -0.58
PITX2-213ENST00000616641 PCDHB9Q9Y5E1 797 aa11.45□□□□□ -0.58
PITX2-213ENST00000616641 SLC38A8A6NNN8 435 aa11.45□□□□□ -0.58
PITX2-213ENST00000616641 H3BUI4 141 aa11.45□□□□□ -0.58
PITX2-213ENST00000616641 AZIN1O14977 448 aa11.45□□□□□ -0.58
PITX2-213ENST00000616641 STX7O15400 261 aaKnown RBP11.45□□□□□ -0.58
PITX2-213ENST00000616641 ACSL4O60488 711 aa11.45□□□□□ -0.58
PITX2-213ENST00000616641 CAPN1P07384 714 aa11.45□□□□□ -0.58
PITX2-213ENST00000616641 ALDOCP09972 364 aaKnown RBP11.45□□□□□ -0.58
PITX2-213ENST00000616641 CD1DP15813 335 aa11.45□□□□□ -0.58
PITX2-213ENST00000616641 ZNF37AP17032 561 aaPredicted RBP11.45□□□□□ -0.58
PITX2-213ENST00000616641 SLC11A2P49281 568 aa11.45□□□□□ -0.58
PITX2-213ENST00000616641 APLP1P51693 650 aa11.45□□□□□ -0.58
PITX2-213ENST00000616641 ADGRE1Q14246 886 aa11.45□□□□□ -0.58
PITX2-213ENST00000616641 SQLEQ14534 574 aa11.45□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.2 ms