RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000578009.5

IFT20-205, Transcript of intraflagellar transport 20, human

TSL 3

Gene IFT20, Length 611 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
IFT20-205	ENST00000578009	SSX2IP	Q9Y2D8	614 aa		4.87	□□□□□ -1.63
IFT20-205	ENST00000578009	ANKRD6	Q9Y2G4	727 aa		4.87	□□□□□ -1.63
IFT20-205	ENST00000578009	MTO1	Q9Y2Z2	717 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
IFT20-205	ENST00000578009	COQ6	Q9Y2Z9	468 aa		4.87	□□□□□ -1.63
IFT20-205	ENST00000578009	NR2E3	Q9Y5X4	410 aa		4.87	□□□□□ -1.63
IFT20-205	ENST00000578009	CDY1	Q9Y6F8	540 aa		4.87	□□□□□ -1.63
IFT20-205	ENST00000578009	NLRC5	Q86WI3	1866 aa		4.87	□□□□□ -1.63
IFT20-205	ENST00000578009	PLXNA3	P51805	1871 aa		4.86	□□□□□ -1.63
IFT20-205	ENST00000578009	PPAN-P2RY11	A0A0B4J1V8	794 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
IFT20-205	ENST00000578009	CXorf51A	A0A1B0GTR3	108 aa		4.86	□□□□□ -1.63
IFT20-205	ENST00000578009	LOC285095	A0A1B0GVY8	99 aa		4.86	□□□□□ -1.63
IFT20-205	ENST00000578009	ILVBL	A1L0T0	632 aa		4.86	□□□□□ -1.63
IFT20-205	ENST00000578009	HEATR9	A2RTY3	570 aa		4.86	□□□□□ -1.63
IFT20-205	ENST00000578009	NT5C1B-RDH14	C9J2C7	533 aa		4.86	□□□□□ -1.63
IFT20-205	ENST00000578009		F5H5T6	163 aa		4.86	□□□□□ -1.63
IFT20-205	ENST00000578009	GOLGA8R	I6L899	631 aa		4.86	□□□□□ -1.63
IFT20-205	ENST00000578009	SLC7A4	O43246	635 aa		4.86	□□□□□ -1.63
IFT20-205	ENST00000578009	UGT1A9	O60656	530 aa		4.86	□□□□□ -1.63
IFT20-205	ENST00000578009	PLIN3	O60664	434 aa		4.86	□□□□□ -1.63
IFT20-205	ENST00000578009	DNAJC6	O75061	913 aa		4.86	□□□□□ -1.63
IFT20-205	ENST00000578009	SNN	O75324	88 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
IFT20-205	ENST00000578009	IPO13	O94829	963 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
IFT20-205	ENST00000578009	SNUPN	O95149	360 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
IFT20-205	ENST00000578009	TBX18	O95935	607 aa		4.86	□□□□□ -1.63
IFT20-205	ENST00000578009	MOCS2	O96007	188 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
IFT20-205	ENST00000578009	TIMP1	P01033	207 aa		4.86	□□□□□ -1.63
IFT20-205	ENST00000578009	ALDOA	P04075	364 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
IFT20-205	ENST00000578009	BPGM	P07738	259 aa		4.86	□□□□□ -1.63
IFT20-205	ENST00000578009	ITGA2B	P08514	1039 aa		4.86	□□□□□ -1.63
IFT20-205	ENST00000578009	CLTB	P09497	229 aa		4.86	□□□□□ -1.63
IFT20-205	ENST00000578009	ERVK-10	P10266	1014 aa		4.86	□□□□□ -1.63
IFT20-205	ENST00000578009	HOXB8	P17481	243 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
IFT20-205	ENST00000578009	ATF6	P18850	670 aa		4.86	□□□□□ -1.63
IFT20-205	ENST00000578009	PSMA3	P25788	255 aa		4.86	□□□□□ -1.63
IFT20-205	ENST00000578009	TYK2	P29597	1187 aa		4.86	□□□□□ -1.63
IFT20-205	ENST00000578009	ALDH1A3	P47895	512 aa		4.86	□□□□□ -1.63
IFT20-205	ENST00000578009	SERPINB8	P50452	374 aa		4.86	□□□□□ -1.63
IFT20-205	ENST00000578009	CSRP3	P50461	194 aa		4.86	□□□□□ -1.63
IFT20-205	ENST00000578009	PRKAA2	P54646	552 aa		4.86	□□□□□ -1.63
IFT20-205	ENST00000578009	CCL23	P55773	120 aa		4.86	□□□□□ -1.63
IFT20-205	ENST00000578009	ARPP19	P56211	112 aa		4.86	□□□□□ -1.63
IFT20-205	ENST00000578009	WNT3A	P56704	352 aa		4.86	□□□□□ -1.63
IFT20-205	ENST00000578009	GABRE	P78334	506 aa		4.86	□□□□□ -1.63
IFT20-205	ENST00000578009	CRADD	P78560	199 aa		4.86	□□□□□ -1.63
IFT20-205	ENST00000578009	OCRL	Q01968	901 aa		4.86	□□□□□ -1.63
IFT20-205	ENST00000578009	ALDH6A1	Q02252	535 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
IFT20-205	ENST00000578009	PLD1	Q13393	1074 aa		4.86	□□□□□ -1.63
IFT20-205	ENST00000578009	MTM1	Q13496	603 aa		4.86	□□□□□ -1.63
IFT20-205	ENST00000578009	VEPH1	Q14D04	833 aa		4.86	□□□□□ -1.63
IFT20-205	ENST00000578009	POLD3	Q15054	466 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
IFT20-205	ENST00000578009	CCDC153	Q494R4	210 aa		4.86	□□□□□ -1.63
IFT20-205	ENST00000578009	TRIM60	Q495X7	471 aa		4.86	□□□□□ -1.63
IFT20-205	ENST00000578009	GAGE13	Q4V321	117 aa		4.86	□□□□□ -1.63
IFT20-205	ENST00000578009	TIGD2	Q4W5G0	525 aa		4.86	□□□□□ -1.63
IFT20-205	ENST00000578009	CATSPERE	Q5SY80	951 aa		4.86	□□□□□ -1.63
IFT20-205	ENST00000578009	CERCAM	Q5T4B2	595 aa		4.86	□□□□□ -1.63
IFT20-205	ENST00000578009	SDHAF4	Q5VUM1	108 aa		4.86	□□□□□ -1.63
IFT20-205	ENST00000578009	C1QL3	Q5VWW1	255 aa		4.86	□□□□□ -1.63
IFT20-205	ENST00000578009	FOXB2	Q5VYV0	432 aa		4.86	□□□□□ -1.63
IFT20-205	ENST00000578009	KIAA0930	Q6ICG6	404 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
IFT20-205	ENST00000578009	FBXO46	Q6PJ61	603 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
IFT20-205	ENST00000578009	PRSS55	Q6UWB4	352 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
IFT20-205	ENST00000578009	LIN28B	Q6ZN17	250 aa	Known RBP eCLIP	4.86	□□□□□ -1.63	5e-8	■■■□□ 17
IFT20-205	ENST00000578009	FAM47E	Q6ZV65	393 aa		4.86	□□□□□ -1.63
IFT20-205	ENST00000578009	CLEC14A	Q86T13	490 aa		4.86	□□□□□ -1.63
IFT20-205	ENST00000578009	SETD3	Q86TU7	594 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
IFT20-205	ENST00000578009	RASSF3	Q86WH2	238 aa		4.86	□□□□□ -1.63
IFT20-205	ENST00000578009	TMEM173	Q86WV6	379 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
IFT20-205	ENST00000578009	NUDCD3	Q8IVD9	361 aa		4.86	□□□□□ -1.63
IFT20-205	ENST00000578009	BBS5	Q8N3I7	341 aa		4.86	□□□□□ -1.63
IFT20-205	ENST00000578009	CCDC63	Q8NA47	563 aa		4.86	□□□□□ -1.63
IFT20-205	ENST00000578009	BEND2	Q8NDZ0	799 aa		4.86	□□□□□ -1.63
IFT20-205	ENST00000578009	PPHLN1	Q8NEY8	458 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
IFT20-205	ENST00000578009	OR6Y1	Q8NGX8	325 aa		4.86	□□□□□ -1.63
IFT20-205	ENST00000578009	ARRDC2	Q8TBH0	407 aa		4.86	□□□□□ -1.63
IFT20-205	ENST00000578009	RDH11	Q8TC12	318 aa		4.86	□□□□□ -1.63
IFT20-205	ENST00000578009	STON2	Q8WXE9	905 aa		4.86	□□□□□ -1.63
IFT20-205	ENST00000578009	DLG3	Q92796	817 aa		4.86	□□□□□ -1.63
IFT20-205	ENST00000578009	IGSF8	Q969P0	613 aa		4.86	□□□□□ -1.63
IFT20-205	ENST00000578009	E2F7	Q96AV8	911 aa		4.86	□□□□□ -1.63
IFT20-205	ENST00000578009	ZNF669	Q96BR6	464 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
IFT20-205	ENST00000578009	ARMC5	Q96C12	935 aa		4.86	□□□□□ -1.63
IFT20-205	ENST00000578009	HMCES	Q96FZ2	354 aa		4.86	□□□□□ -1.63
IFT20-205	ENST00000578009	ZNF333	Q96JL9	665 aa		4.86	□□□□□ -1.63
IFT20-205	ENST00000578009	FEM1C	Q96JP0	617 aa		4.86	□□□□□ -1.63
IFT20-205	ENST00000578009	ZNF512	Q96ME7	567 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
IFT20-205	ENST00000578009	PGLYRP2	Q96PD5	576 aa		4.86	□□□□□ -1.63
IFT20-205	ENST00000578009	FAM111A	Q96PZ2	611 aa		4.86	□□□□□ -1.63
IFT20-205	ENST00000578009	KLF6	Q99612	283 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
IFT20-205	ENST00000578009	GPR22	Q99680	433 aa		4.86	□□□□□ -1.63
IFT20-205	ENST00000578009	SEPT5	Q99719	369 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
IFT20-205	ENST00000578009	C19orf43	Q9BQ61	176 aa		4.86	□□□□□ -1.63
IFT20-205	ENST00000578009	FAM167B	Q9BTA0	163 aa		4.86	□□□□□ -1.63
IFT20-205	ENST00000578009	FICD	Q9BVA6	458 aa		4.86	□□□□□ -1.63
IFT20-205	ENST00000578009	TSSK1B	Q9BXA7	367 aa		4.86	□□□□□ -1.63
IFT20-205	ENST00000578009	VN1R3	Q9BXE9	311 aa		4.86	□□□□□ -1.63
IFT20-205	ENST00000578009	TOR3A	Q9H497	397 aa		4.86	□□□□□ -1.63
IFT20-205	ENST00000578009	RHOJ	Q9H4E5	214 aa		4.86	□□□□□ -1.63
IFT20-205	ENST00000578009	FAM96A	Q9H5X1	160 aa		4.86	□□□□□ -1.63
IFT20-205	ENST00000578009	STN1	Q9H668	368 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63

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