RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533653.5

GMDS-AS1-211, humanhuman

TSL 2

Gene GMDS-AS1, Length 568 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GMDS-AS1-211ENST00000533653 PDIK1LQ8N165 341 aa16.14■□□□□ 0.17
GMDS-AS1-211ENST00000533653 ARL14Q8N4G2 192 aa16.14■□□□□ 0.17
GMDS-AS1-211ENST00000533653 BEND7Q8N7W2 519 aaPredicted RBP16.14■□□□□ 0.17
GMDS-AS1-211ENST00000533653 PNPLA1Q8N8W4 532 aa16.14■□□□□ 0.17
GMDS-AS1-211ENST00000533653 MNS1Q8NEH6 495 aa16.14■□□□□ 0.17
GMDS-AS1-211ENST00000533653 OR2L2Q8NH16 312 aa16.14■□□□□ 0.17
GMDS-AS1-211ENST00000533653 KIF18AQ8NI77 898 aa16.14■□□□□ 0.17
GMDS-AS1-211ENST00000533653 HM13Q8TCT9 377 aa16.14■□□□□ 0.17
GMDS-AS1-211ENST00000533653 SLC37A2Q8TED4 501 aa16.14■□□□□ 0.17
GMDS-AS1-211ENST00000533653 SH3KBP1Q96B97 665 aa16.14■□□□□ 0.17
GMDS-AS1-211ENST00000533653 GRAMD1AQ96CP6 724 aa16.14■□□□□ 0.17
GMDS-AS1-211ENST00000533653 LRRC39Q96DD0 335 aa16.14■□□□□ 0.17
GMDS-AS1-211ENST00000533653 MFSD3Q96ES6 412 aa16.14■□□□□ 0.17
GMDS-AS1-211ENST00000533653 SGF29Q96ES7 293 aa16.14■□□□□ 0.17
GMDS-AS1-211ENST00000533653 CCDC3Q9BQI4 270 aa16.14■□□□□ 0.17
GMDS-AS1-211ENST00000533653 TRIM51Q9BSJ1 452 aa16.14■□□□□ 0.17
GMDS-AS1-211ENST00000533653 RAB17Q9H0T7 212 aa16.14■□□□□ 0.17
GMDS-AS1-211ENST00000533653 FAM96AQ9H5X1 160 aa16.14■□□□□ 0.17
GMDS-AS1-211ENST00000533653 SLC23A2Q9UGH3 650 aa16.14■□□□□ 0.17
GMDS-AS1-211ENST00000533653 ACSL5Q9ULC5 683 aa16.14■□□□□ 0.17
GMDS-AS1-211ENST00000533653 KNTC1P50748 2209 aa16.14■□□□□ 0.17
GMDS-AS1-211ENST00000533653 OR51F1A6NGY5 319 aa16.13■□□□□ 0.17
GMDS-AS1-211ENST00000533653 EFCAB8A8MWE9 144 aa16.13■□□□□ 0.17
GMDS-AS1-211ENST00000533653 HYAL3O43820 417 aaPredicted RBP16.13■□□□□ 0.17
GMDS-AS1-211ENST00000533653 POP7O75817 140 aaKnown RBP16.13■□□□□ 0.17
GMDS-AS1-211ENST00000533653 TTC4O95801 387 aa16.13■□□□□ 0.17
GMDS-AS1-211ENST00000533653 PGAM1P18669 254 aa16.13■□□□□ 0.17
GMDS-AS1-211ENST00000533653 OGNP20774 298 aaKnown RBP16.13■□□□□ 0.17
GMDS-AS1-211ENST00000533653 ARNTP27540 789 aa16.13■□□□□ 0.17
GMDS-AS1-211ENST00000533653 HALP42357 657 aa16.13■□□□□ 0.17
GMDS-AS1-211ENST00000533653 CDKN1CP49918 316 aaPredicted RBP16.13■□□□□ 0.17
GMDS-AS1-211ENST00000533653 C2orf54Q08AI8 447 aa16.13■□□□□ 0.17
GMDS-AS1-211ENST00000533653 CBLBQ13191 982 aa16.13■□□□□ 0.17
GMDS-AS1-211ENST00000533653 BIRC2Q13490 618 aa16.13■□□□□ 0.17
GMDS-AS1-211ENST00000533653 CCDC157Q569K6 752 aa16.13■□□□□ 0.17
GMDS-AS1-211ENST00000533653 PERM1Q5SV97 790 aa16.13■□□□□ 0.17
GMDS-AS1-211ENST00000533653 HES3Q5TGS1 186 aa16.13■□□□□ 0.17
GMDS-AS1-211ENST00000533653 CDCP2Q5VXM1 449 aa16.13■□□□□ 0.17
GMDS-AS1-211ENST00000533653 IYDQ6PHW0 289 aa16.13■□□□□ 0.17
GMDS-AS1-211ENST00000533653 DET1Q7L5Y6 550 aa16.13■□□□□ 0.17
GMDS-AS1-211ENST00000533653 SPRED1Q7Z699 444 aa16.13■□□□□ 0.17
GMDS-AS1-211ENST00000533653 SLC9B2Q86UD5 537 aa16.13■□□□□ 0.17
GMDS-AS1-211ENST00000533653 LRRC6Q86X45 466 aa16.13■□□□□ 0.17
GMDS-AS1-211ENST00000533653 RBM12BQ8IXT5 1001 aaKnown RBP16.13■□□□□ 0.17
GMDS-AS1-211ENST00000533653 GPR150Q8NGU9 434 aa16.13■□□□□ 0.17
GMDS-AS1-211ENST00000533653 STAMBPL1Q96FJ0 436 aa16.13■□□□□ 0.17
GMDS-AS1-211ENST00000533653 SIGLEC10Q96LC7 697 aa16.13■□□□□ 0.17
GMDS-AS1-211ENST00000533653 ERP44Q9BS26 406 aa16.13■□□□□ 0.17
GMDS-AS1-211ENST00000533653 TSSK1BQ9BXA7 367 aa16.13■□□□□ 0.17
GMDS-AS1-211ENST00000533653 ABCG4Q9H172 646 aa16.13■□□□□ 0.17
GMDS-AS1-211ENST00000533653 UCK1Q9HA47 277 aa16.13■□□□□ 0.17
GMDS-AS1-211ENST00000533653 POT1Q9NUX5 634 aa16.13■□□□□ 0.17
GMDS-AS1-211ENST00000533653 WHRNQ9P202 907 aa16.13■□□□□ 0.17
GMDS-AS1-211ENST00000533653 LRIT1Q9P2V4 623 aa16.13■□□□□ 0.17
GMDS-AS1-211ENST00000533653 VPS9D1Q9Y2B5 631 aa16.13■□□□□ 0.17
GMDS-AS1-211ENST00000533653 MRFAP1Q9Y605 127 aa16.13■□□□□ 0.17
GMDS-AS1-211ENST00000533653 RPS6KL1Q9Y6S9 549 aa16.13■□□□□ 0.17
GMDS-AS1-211ENST00000533653 RNF215Q9Y6U7 377 aa16.13■□□□□ 0.17
GMDS-AS1-211ENST00000533653 RHPN2P1A8MT19 583 aa16.12■□□□□ 0.17
GMDS-AS1-211ENST00000533653 PDZK1P1A8MUH7 402 aa16.12■□□□□ 0.17
GMDS-AS1-211ENST00000533653 CD3EAPO15446 510 aaKnown RBP16.12■□□□□ 0.17
GMDS-AS1-211ENST00000533653 RAD51CO43502 376 aa16.12■□□□□ 0.17
GMDS-AS1-211ENST00000533653 FTH1P02794 183 aa16.12■□□□□ 0.17
GMDS-AS1-211ENST00000533653 POLBP06746 335 aa16.12■□□□□ 0.17
GMDS-AS1-211ENST00000533653 OR56A5P0C7T3 313 aa16.12■□□□□ 0.17
GMDS-AS1-211ENST00000533653 MYF5P13349 255 aa16.12■□□□□ 0.17
GMDS-AS1-211ENST00000533653 XRCC1P18887 633 aaPredicted RBP16.12■□□□□ 0.17
GMDS-AS1-211ENST00000533653 ARCN1P48444 511 aaKnown RBP16.12■□□□□ 0.17
GMDS-AS1-211ENST00000533653 EPHA4P54764 986 aa16.12■□□□□ 0.17
GMDS-AS1-211ENST00000533653 MAZP56270 477 aaKnown RBP16.12■□□□□ 0.17
GMDS-AS1-211ENST00000533653 UBE2IP63279 158 aaKnown RBP16.12■□□□□ 0.17
GMDS-AS1-211ENST00000533653 GPLD1P80108 840 aa16.12■□□□□ 0.17
GMDS-AS1-211ENST00000533653 CALCOCO2Q13137 446 aa16.12■□□□□ 0.17
GMDS-AS1-211ENST00000533653 RPA4Q13156 261 aa16.12■□□□□ 0.17
GMDS-AS1-211ENST00000533653 HIF1AQ16665 826 aa16.12■□□□□ 0.17
GMDS-AS1-211ENST00000533653 KCTD19Q17RG1 926 aaPredicted RBP16.12■□□□□ 0.17
GMDS-AS1-211ENST00000533653 TYSND1Q2T9J0 566 aa16.12■□□□□ 0.17
GMDS-AS1-211ENST00000533653 ANKRD20A4Q4UJ75 823 aa16.12■□□□□ 0.17
GMDS-AS1-211ENST00000533653 CHCHD2P9Q5T1J5 151 aaPredicted RBP16.12■□□□□ 0.17
GMDS-AS1-211ENST00000533653 METRNLQ641Q3 311 aa16.12■□□□□ 0.17
GMDS-AS1-211ENST00000533653 CHCHD4Q8N4Q1 142 aa16.12■□□□□ 0.17
GMDS-AS1-211ENST00000533653 DCBLD1Q8N8Z6 715 aa16.12■□□□□ 0.17
GMDS-AS1-211ENST00000533653 GABPB2Q8TAK5 448 aaPredicted RBP16.12■□□□□ 0.17
GMDS-AS1-211ENST00000533653 ZNF669Q96BR6 464 aaPredicted RBP16.12■□□□□ 0.17
GMDS-AS1-211ENST00000533653 DEPDC7Q96QD5 511 aa16.12■□□□□ 0.17
GMDS-AS1-211ENST00000533653 HS3ST6Q96QI5 342 aa16.12■□□□□ 0.17
GMDS-AS1-211ENST00000533653 TCF12Q99081 682 aa16.12■□□□□ 0.17
GMDS-AS1-211ENST00000533653 LDHAL6BQ9BYZ2 381 aaPredicted RBP16.12■□□□□ 0.17
GMDS-AS1-211ENST00000533653 PHACTR1Q9C0D0 580 aa16.12■□□□□ 0.17
GMDS-AS1-211ENST00000533653 EPB41L1Q9H4G0 881 aa16.12■□□□□ 0.17
GMDS-AS1-211ENST00000533653 CLCA2Q9UQC9 943 aa16.12■□□□□ 0.17
GMDS-AS1-211ENST00000533653 DNAJC16Q9Y2G8 782 aa16.12■□□□□ 0.17
GMDS-AS1-211ENST00000533653 UTP11Q9Y3A2 253 aaKnown RBP16.12■□□□□ 0.17
GMDS-AS1-211ENST00000533653 MSRB2Q9Y3D2 182 aa16.12■□□□□ 0.17
GMDS-AS1-211ENST00000533653 UNC13CQ8NB66 2214 aa16.12■□□□□ 0.17
GMDS-AS1-211ENST00000533653 NTN3O00634 580 aaPredicted RBP16.11■□□□□ 0.17
GMDS-AS1-211ENST00000533653 SNX2O60749 519 aa16.11■□□□□ 0.17
GMDS-AS1-211ENST00000533653 VAPBO95292 243 aa16.11■□□□□ 0.17
GMDS-AS1-211ENST00000533653 EML2O95834 649 aa16.11■□□□□ 0.17
GMDS-AS1-211ENST00000533653 PRSS56P0CW18 603 aa16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.8 ms