RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516176.1

RNU6-1161P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1161, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1161P, Length 102 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1161P-201ENST00000516176 NXPH2O95156 264 aa-2.59□□□□□ -2.82
RNU6-1161P-201ENST00000516176 ACSL3O95573 720 aa-2.59□□□□□ -2.82
RNU6-1161P-201ENST00000516176 EML2O95834 649 aa-2.59□□□□□ -2.82
RNU6-1161P-201ENST00000516176 IGHDP01880 384 aa-2.59□□□□□ -2.82
RNU6-1161P-201ENST00000516176 GSNP06396 782 aa-2.59□□□□□ -2.82
RNU6-1161P-201ENST00000516176 PLA2G4BP0C869 781 aa-2.59□□□□□ -2.82
RNU6-1161P-201ENST00000516176 HNRNPCL4P0DMR1 293 aa-2.59□□□□□ -2.82
RNU6-1161P-201ENST00000516176 EDNRBP24530 442 aa-2.59□□□□□ -2.82
RNU6-1161P-201ENST00000516176 GJA5P36382 358 aa-2.59□□□□□ -2.82
RNU6-1161P-201ENST00000516176 HK3P52790 923 aa-2.59□□□□□ -2.82
RNU6-1161P-201ENST00000516176 SELENOVP59797 346 aa-2.59□□□□□ -2.82
RNU6-1161P-201ENST00000516176 KCNJ10P78508 379 aa-2.59□□□□□ -2.82
RNU6-1161P-201ENST00000516176 SORDQ00796 357 aa-2.59□□□□□ -2.82
RNU6-1161P-201ENST00000516176 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP-2.59□□□□□ -2.82
RNU6-1161P-201ENST00000516176 PTPN11Q06124 597 aaPredicted RBP-2.59□□□□□ -2.82
RNU6-1161P-201ENST00000516176 ZNF543Q08ER8 600 aa-2.59□□□□□ -2.82
RNU6-1161P-201ENST00000516176 STRN3Q13033 797 aa-2.59□□□□□ -2.82
RNU6-1161P-201ENST00000516176 PRKAA1Q13131 559 aa-2.59□□□□□ -2.82
RNU6-1161P-201ENST00000516176 VEZF1Q14119 521 aa-2.59□□□□□ -2.82
RNU6-1161P-201ENST00000516176 NFIL3Q16649 462 aa-2.59□□□□□ -2.82
RNU6-1161P-201ENST00000516176 TMEM266Q2M3C6 531 aa-2.59□□□□□ -2.82
RNU6-1161P-201ENST00000516176 PDSS1Q5T2R2 415 aa-2.59□□□□□ -2.82
RNU6-1161P-201ENST00000516176 CWF19L1Q69YN2 538 aaKnown RBP-2.59□□□□□ -2.82
RNU6-1161P-201ENST00000516176 C1orf94Q6P1W5 598 aa-2.59□□□□□ -2.82
RNU6-1161P-201ENST00000516176 GLIPR1L1Q6UWM5 242 aa-2.59□□□□□ -2.82
RNU6-1161P-201ENST00000516176 DNAJB7Q7Z6W7 309 aaPredicted RBP-2.59□□□□□ -2.82
RNU6-1161P-201ENST00000516176 GPAT4Q86UL3 456 aa-2.59□□□□□ -2.82
RNU6-1161P-201ENST00000516176 TRIM48Q8IWZ4 208 aa-2.59□□□□□ -2.82
RNU6-1161P-201ENST00000516176 SELENOHQ8IZQ5 122 aaKnown RBP-2.59□□□□□ -2.82
RNU6-1161P-201ENST00000516176 DYNAPQ8N1N2 210 aa-2.59□□□□□ -2.82
RNU6-1161P-201ENST00000516176 CCDC82Q8N4S0 544 aa-2.59□□□□□ -2.82
RNU6-1161P-201ENST00000516176 Q8N9G6 341 aaPredicted RBP-2.59□□□□□ -2.82
RNU6-1161P-201ENST00000516176 FAM47BQ8NA70 645 aa-2.59□□□□□ -2.82
RNU6-1161P-201ENST00000516176 Q8NAQ8 132 aa-2.59□□□□□ -2.82
RNU6-1161P-201ENST00000516176 GABPB2Q8TAK5 448 aaPredicted RBP-2.59□□□□□ -2.82
RNU6-1161P-201ENST00000516176 CMTM2Q8TAZ6 248 aa-2.59□□□□□ -2.82
RNU6-1161P-201ENST00000516176 GPT2Q8TD30 523 aa-2.59□□□□□ -2.82
RNU6-1161P-201ENST00000516176 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP-2.59□□□□□ -2.82
RNU6-1161P-201ENST00000516176 ATRIPQ8WXE1 791 aa-2.59□□□□□ -2.82
RNU6-1161P-201ENST00000516176 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP-2.59□□□□□ -2.82
RNU6-1161P-201ENST00000516176 EXOC4Q96A65 974 aa-2.59□□□□□ -2.82
RNU6-1161P-201ENST00000516176 RSPRY1Q96DX4 576 aa-2.59□□□□□ -2.82
RNU6-1161P-201ENST00000516176 KLHL5Q96PQ7 755 aa-2.59□□□□□ -2.82
RNU6-1161P-201ENST00000516176 NEK1Q96PY6 1258 aa-2.59□□□□□ -2.82
RNU6-1161P-201ENST00000516176 USP28Q96RU2 1077 aa-2.59□□□□□ -2.82
RNU6-1161P-201ENST00000516176 FNBP1Q96RU3 617 aa-2.59□□□□□ -2.82
RNU6-1161P-201ENST00000516176 CBWD1Q9BRT8 395 aa-2.59□□□□□ -2.82
RNU6-1161P-201ENST00000516176 GCOM2Q9BZD3 368 aaPredicted RBP-2.59□□□□□ -2.82
RNU6-1161P-201ENST00000516176 ZNF436Q9C0F3 470 aaPredicted RBP-2.59□□□□□ -2.82
RNU6-1161P-201ENST00000516176 SAP30LQ9HAJ7 183 aa-2.59□□□□□ -2.82
RNU6-1161P-201ENST00000516176 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP-2.59□□□□□ -2.82
RNU6-1161P-201ENST00000516176 HPS4Q9NQG7 708 aa-2.59□□□□□ -2.82
RNU6-1161P-201ENST00000516176 ZDHHC7Q9NXF8 308 aa-2.59□□□□□ -2.82
RNU6-1161P-201ENST00000516176 MCM9Q9NXL9 1143 aa-2.59□□□□□ -2.82
RNU6-1161P-201ENST00000516176 ASIC5Q9NY37 505 aa-2.59□□□□□ -2.82
RNU6-1161P-201ENST00000516176 TMEM63CQ9P1W3 806 aa-2.59□□□□□ -2.82
RNU6-1161P-201ENST00000516176 FRMD4AQ9P2Q2 1039 aaPredicted RBP-2.59□□□□□ -2.82
RNU6-1161P-201ENST00000516176 SLC17A7Q9P2U7 560 aa-2.59□□□□□ -2.82
RNU6-1161P-201ENST00000516176 DENND2AQ9ULE3 1009 aa-2.59□□□□□ -2.82
RNU6-1161P-201ENST00000516176 VDAC3Q9Y277 283 aa-2.59□□□□□ -2.82
RNU6-1161P-201ENST00000516176 ARAP3Q8WWN8 1544 aa-2.59□□□□□ -2.82
RNU6-1161P-201ENST00000516176 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP-2.59□□□□□ -2.82
RNU6-1161P-201ENST00000516176 ERBINQ96RT1 1412 aa-2.59□□□□□ -2.82
RNU6-1161P-201ENST00000516176 SPTA1P02549 2419 aa-2.6□□□□□ -2.83
RNU6-1161P-201ENST00000516176 NEDD4P46934 1319 aa-2.6□□□□□ -2.83
RNU6-1161P-201ENST00000516176 C7orf72A4D263 438 aa-2.6□□□□□ -2.83
RNU6-1161P-201ENST00000516176 RBFOX3A6NFN3 312 aa-2.6□□□□□ -2.83
RNU6-1161P-201ENST00000516176 SAC3D1A6NKF1 404 aa-2.6□□□□□ -2.83
RNU6-1161P-201ENST00000516176 K7ESF4 209 aa-2.6□□□□□ -2.83
RNU6-1161P-201ENST00000516176 STK25O00506 426 aa-2.6□□□□□ -2.83
RNU6-1161P-201ENST00000516176 RIPK2O43353 540 aa-2.6□□□□□ -2.83
RNU6-1161P-201ENST00000516176 FCGR3BO75015 233 aa-2.6□□□□□ -2.83
RNU6-1161P-201ENST00000516176 IPO7O95373 1038 aaKnown RBP-2.6□□□□□ -2.83
RNU6-1161P-201ENST00000516176 RAF1P04049 648 aa-2.6□□□□□ -2.83
RNU6-1161P-201ENST00000516176 GZMBP10144 247 aa-2.6□□□□□ -2.83
RNU6-1161P-201ENST00000516176 ZNF23P17027 643 aa-2.6□□□□□ -2.83
RNU6-1161P-201ENST00000516176 FPR2P25090 351 aa-2.6□□□□□ -2.83
RNU6-1161P-201ENST00000516176 RPA1P27694 616 aa-2.6□□□□□ -2.83
RNU6-1161P-201ENST00000516176 TACR3P29371 465 aa-2.6□□□□□ -2.83
RNU6-1161P-201ENST00000516176 TRPC1P48995 793 aa-2.6□□□□□ -2.83
RNU6-1161P-201ENST00000516176 TMEM50BP56557 158 aa-2.6□□□□□ -2.83
RNU6-1161P-201ENST00000516176 PER3P56645 1201 aa-2.6□□□□□ -2.83
RNU6-1161P-201ENST00000516176 DEFB1P60022 68 aa-2.6□□□□□ -2.83
RNU6-1161P-201ENST00000516176 RPS7P62081 194 aaKnown RBP-2.6□□□□□ -2.83
RNU6-1161P-201ENST00000516176 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP-2.6□□□□□ -2.83
RNU6-1161P-201ENST00000516176 ARHGEF7Q14155 803 aa-2.6□□□□□ -2.83
RNU6-1161P-201ENST00000516176 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP-2.6□□□□□ -2.83
RNU6-1161P-201ENST00000516176 CALCRLQ16602 461 aa-2.6□□□□□ -2.83
RNU6-1161P-201ENST00000516176 LY6KQ17RY6 165 aa-2.6□□□□□ -2.83
RNU6-1161P-201ENST00000516176 PYDC2Q56P42 97 aa-2.6□□□□□ -2.83
RNU6-1161P-201ENST00000516176 FAM83BQ5T0W9 1011 aa-2.6□□□□□ -2.83
RNU6-1161P-201ENST00000516176 WLSQ5T9L3 541 aa-2.6□□□□□ -2.83
RNU6-1161P-201ENST00000516176 MYSM1Q5VVJ2 828 aa-2.6□□□□□ -2.83
RNU6-1161P-201ENST00000516176 IQCEQ6IPM2 695 aa-2.6□□□□□ -2.83
RNU6-1161P-201ENST00000516176 MTFR2Q6P444 385 aa-2.6□□□□□ -2.83
RNU6-1161P-201ENST00000516176 UNC5DQ6UXZ4 953 aa-2.6□□□□□ -2.83
RNU6-1161P-201ENST00000516176 CDHR3Q6ZTQ4 885 aa-2.6□□□□□ -2.83
RNU6-1161P-201ENST00000516176 KCTD8Q6ZWB6 473 aa-2.6□□□□□ -2.83
RNU6-1161P-201ENST00000516176 HAUS6Q7Z4H7 955 aa-2.6□□□□□ -2.83
RNU6-1161P-201ENST00000516176 BCDIN3DQ7Z5W3 292 aaKnown RBP-2.6□□□□□ -2.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.5 ms