RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514813.6

RRN3P1-201, Transcript of RRN3 homolog, RNA polymerase I transcription factor pseudogene 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RRN3P1, Length 3,645 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRN3P1-201ENST00000514813 ALG11Q2TAA5 492 aa6.46□□□□□ -1.37
RRN3P1-201ENST00000514813 N4BP2L1Q5TBK1 243 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.37
RRN3P1-201ENST00000514813 THEMIS2Q5TEJ8 643 aa6.46□□□□□ -1.37
RRN3P1-201ENST00000514813 TMEM214Q6NUQ4 689 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.37
RRN3P1-201ENST00000514813 DPPA4Q7L190 304 aa6.46□□□□□ -1.37
RRN3P1-201ENST00000514813 LINC00523Q86TU6 105 aa6.46□□□□□ -1.37
RRN3P1-201ENST00000514813 SPATS2Q86XZ4 545 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.37
RRN3P1-201ENST00000514813 PALM2Q8IXS6 379 aa6.46□□□□□ -1.37
RRN3P1-201ENST00000514813 ZNF548Q8NEK5 533 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.37
RRN3P1-201ENST00000514813 ANKK1Q8NFD2 765 aa6.46□□□□□ -1.37
RRN3P1-201ENST00000514813 KIF18AQ8NI77 898 aa6.46□□□□□ -1.37
RRN3P1-201ENST00000514813 DTD2Q96FN9 168 aa6.46□□□□□ -1.37
RRN3P1-201ENST00000514813 MRGPRX2Q96LB1 330 aa6.46□□□□□ -1.37
RRN3P1-201ENST00000514813 NSMCE3Q96MG7 304 aa6.46□□□□□ -1.37
RRN3P1-201ENST00000514813 OR2M4Q96R27 311 aa6.46□□□□□ -1.37
RRN3P1-201ENST00000514813 FCRL5Q96RD9 977 aa6.46□□□□□ -1.37
RRN3P1-201ENST00000514813 RHOXF2Q9BQY4 288 aa6.46□□□□□ -1.37
RRN3P1-201ENST00000514813 RTKNQ9BST9 563 aa6.46□□□□□ -1.37
RRN3P1-201ENST00000514813 CHRAC1Q9NRG0 131 aa6.46□□□□□ -1.37
RRN3P1-201ENST00000514813 HACD3Q9P035 362 aa6.46□□□□□ -1.37
RRN3P1-201ENST00000514813 LRIT1Q9P2V4 623 aa6.46□□□□□ -1.37
RRN3P1-201ENST00000514813 SNX12Q9UMY4 172 aa6.46□□□□□ -1.37
RRN3P1-201ENST00000514813 ATRXP46100 2492 aa6.46□□□□□ -1.37
RRN3P1-201ENST00000514813 DMDP11532 3685 aa6.46□□□□□ -1.37
RRN3P1-201ENST00000514813 A0A1B0GTQ1 180 aa6.46□□□□□ -1.38
RRN3P1-201ENST00000514813 PRSS38A1L453 326 aa6.46□□□□□ -1.38
RRN3P1-201ENST00000514813 GSAPA4D1B5 854 aa6.46□□□□□ -1.38
RRN3P1-201ENST00000514813 C5orf60A6NFR6 353 aa6.46□□□□□ -1.38
RRN3P1-201ENST00000514813 PROB1E7EW31 1015 aa6.46□□□□□ -1.38
RRN3P1-201ENST00000514813 TTI1O43156 1089 aa6.46□□□□□ -1.38
RRN3P1-201ENST00000514813 POP7O75817 140 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
RRN3P1-201ENST00000514813 MPOP05164 745 aa6.46□□□□□ -1.38
RRN3P1-201ENST00000514813 UQCRHP07919 91 aa6.46□□□□□ -1.38
RRN3P1-201ENST00000514813 PF4V1P10720 104 aa6.46□□□□□ -1.38
RRN3P1-201ENST00000514813 ZNF30P17039 623 aa6.46□□□□□ -1.38
RRN3P1-201ENST00000514813 BPIP17213 487 aa6.46□□□□□ -1.38
RRN3P1-201ENST00000514813 IDSP22304 550 aa6.46□□□□□ -1.38
RRN3P1-201ENST00000514813 DUSP3P51452 185 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.38
RRN3P1-201ENST00000514813 ETF1P62495 437 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
RRN3P1-201ENST00000514813 CYP4F3Q08477 520 aa6.46□□□□□ -1.38
RRN3P1-201ENST00000514813 CCNG2Q16589 344 aa6.46□□□□□ -1.38
RRN3P1-201ENST00000514813 TEX35Q5T0J7 233 aa6.46□□□□□ -1.38
RRN3P1-201ENST00000514813 NKAIN2Q5VXU1 208 aa6.46□□□□□ -1.38
RRN3P1-201ENST00000514813 GUSBP11Q6P575 273 aa6.46□□□□□ -1.38
RRN3P1-201ENST00000514813 SDCCAG8Q86SQ7 713 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.38
RRN3P1-201ENST00000514813 OXR1Q8N573 874 aa6.46□□□□□ -1.38
RRN3P1-201ENST00000514813 BTN2A2Q8WVV5 523 aa6.46□□□□□ -1.38
RRN3P1-201ENST00000514813 GATAD2BQ8WXI9 593 aa6.46□□□□□ -1.38
RRN3P1-201ENST00000514813 ELMO1Q92556 727 aa6.46□□□□□ -1.38
RRN3P1-201ENST00000514813 CLPBQ9H078 707 aa6.46□□□□□ -1.38
RRN3P1-201ENST00000514813 PRDM8Q9NQV8 689 aa6.46□□□□□ -1.38
RRN3P1-201ENST00000514813 NENFQ9UMX5 172 aa6.46□□□□□ -1.38
RRN3P1-201ENST00000514813 SPTBP11277 2137 aa6.46□□□□□ -1.38
RRN3P1-201ENST00000514813 PFDN6O15212 129 aa6.46□□□□□ -1.38
RRN3P1-201ENST00000514813 LRP3O75074 770 aa6.46□□□□□ -1.38
RRN3P1-201ENST00000514813 C1SP09871 688 aa6.46□□□□□ -1.38
RRN3P1-201ENST00000514813 SLC35G4P0C7Q5 338 aa6.46□□□□□ -1.38
RRN3P1-201ENST00000514813 PPARGP37231 505 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.38
RRN3P1-201ENST00000514813 HADHAP40939 763 aa6.46□□□□□ -1.38
RRN3P1-201ENST00000514813 TMEM115Q12893 351 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.38
RRN3P1-201ENST00000514813 LONRF1Q17RB8 773 aa6.46□□□□□ -1.38
RRN3P1-201ENST00000514813 IZUMO3Q5VZ72 239 aa6.46□□□□□ -1.38
RRN3P1-201ENST00000514813 TTC23LQ6PF05 361 aa6.46□□□□□ -1.38
RRN3P1-201ENST00000514813 ADCK2Q7Z695 626 aa6.46□□□□□ -1.38
RRN3P1-201ENST00000514813 PDIK1LQ8N165 341 aa6.46□□□□□ -1.38
RRN3P1-201ENST00000514813 RCBTB1Q8NDN9 531 aa6.46□□□□□ -1.38
RRN3P1-201ENST00000514813 PWWP2AQ96N64 755 aa6.46□□□□□ -1.38
RRN3P1-201ENST00000514813 VPS37BQ9H9H4 285 aa6.46□□□□□ -1.38
RRN3P1-201ENST00000514813 C20orf96Q9NUD7 363 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.38
RRN3P1-201ENST00000514813 SOHLH2Q9NX45 425 aa6.46□□□□□ -1.38
RRN3P1-201ENST00000514813 HS3ST3A1Q9Y663 406 aa6.46□□□□□ -1.38
RRN3P1-201ENST00000514813 MYO18BQ8IUG5 2567 aa6.46□□□□□ -1.38
RRN3P1-201ENST00000514813 BANF1O75531 89 aa6.45□□□□□ -1.38
RRN3P1-201ENST00000514813 PEX11BO96011 259 aa6.45□□□□□ -1.38
RRN3P1-201ENST00000514813 PRLP01236 227 aa6.45□□□□□ -1.38
RRN3P1-201ENST00000514813 CPEP16870 476 aa6.45□□□□□ -1.38
RRN3P1-201ENST00000514813 FDFT1P37268 417 aa6.45□□□□□ -1.38
RRN3P1-201ENST00000514813 COILP38432 576 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
RRN3P1-201ENST00000514813 HADHBP55084 474 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
RRN3P1-201ENST00000514813 ABRQ12979 859 aa6.45□□□□□ -1.38
RRN3P1-201ENST00000514813 ITGA9Q13797 1035 aa6.45□□□□□ -1.38
RRN3P1-201ENST00000514813 DHX34Q14147 1143 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
RRN3P1-201ENST00000514813 PRKD1Q15139 912 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
RRN3P1-201ENST00000514813 GPRC6AQ5T6X5 926 aa6.45□□□□□ -1.38
RRN3P1-201ENST00000514813 KCTD16Q68DU8 428 aa6.45□□□□□ -1.38
RRN3P1-201ENST00000514813 C8orf74Q6P047 294 aa6.45□□□□□ -1.38
RRN3P1-201ENST00000514813 AMZ2Q86W34 360 aa6.45□□□□□ -1.38
RRN3P1-201ENST00000514813 CCDC116Q8IYX3 515 aa6.45□□□□□ -1.38
RRN3P1-201ENST00000514813 SLC22A18ASQ8N1D0 253 aa6.45□□□□□ -1.38
RRN3P1-201ENST00000514813 PRELID2Q8N945 189 aa6.45□□□□□ -1.38
RRN3P1-201ENST00000514813 IFI44Q8TCB0 444 aa6.45□□□□□ -1.38
RRN3P1-201ENST00000514813 GLYATL1Q969I3 302 aa6.45□□□□□ -1.38
RRN3P1-201ENST00000514813 HGH1Q9BTY7 390 aa6.45□□□□□ -1.38
RRN3P1-201ENST00000514813 LIN7BQ9HAP6 207 aa6.45□□□□□ -1.38
RRN3P1-201ENST00000514813 PISDQ9UG56 409 aa6.45□□□□□ -1.38
RRN3P1-201ENST00000514813 SLC2A6Q9UGQ3 507 aa6.45□□□□□ -1.38
RRN3P1-201ENST00000514813 APPL1Q9UKG1 709 aa6.45□□□□□ -1.38
RRN3P1-201ENST00000514813 CHMP2BQ9UQN3 213 aa6.45□□□□□ -1.38
RRN3P1-201ENST00000514813 UTP11Q9Y3A2 253 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
RRN3P1-201ENST00000514813 PCDHGB3Q9Y5G1 929 aa6.45□□□□□ -1.38
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.7 ms