RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513325.5

HERC3-211, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

TSL 5

Gene HERC3, Length 582 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-211ENST00000513325 CRTC2Q53ET0 693 aaPredicted RBP16.59■□□□□ 0.25
HERC3-211ENST00000513325 LDLRAP1Q5SW96 308 aa16.59■□□□□ 0.25
HERC3-211ENST00000513325 TMEM220Q6QAJ8 160 aa16.59■□□□□ 0.25
HERC3-211ENST00000513325 GLT6D1Q7Z4J2 308 aa16.59■□□□□ 0.25
HERC3-211ENST00000513325 KLHL6Q8WZ60 621 aa16.59■□□□□ 0.25
HERC3-211ENST00000513325 HAUS1Q96CS2 278 aa16.59■□□□□ 0.25
HERC3-211ENST00000513325 STAMBPL1Q96FJ0 436 aa16.59■□□□□ 0.25
HERC3-211ENST00000513325 ABHD17AQ96GS6 310 aa16.59■□□□□ 0.25
HERC3-211ENST00000513325 HACD3Q9P035 362 aa16.59■□□□□ 0.25
HERC3-211ENST00000513325 LNPEPQ9UIQ6 1025 aa16.59■□□□□ 0.25
HERC3-211ENST00000513325 PSMD13Q9UNM6 376 aa16.59■□□□□ 0.25
HERC3-211ENST00000513325 ZNF106Q9H2Y7 1883 aaKnown RBP16.59■□□□□ 0.25
HERC3-211ENST00000513325 GLYATL1P3A0A0U1RQE8 302 aa16.58■□□□□ 0.24
HERC3-211ENST00000513325 OR2AG2A6NM03 316 aa16.58■□□□□ 0.24
HERC3-211ENST00000513325 SPAG6O75602 509 aa16.58■□□□□ 0.24
HERC3-211ENST00000513325 FGF5P12034 268 aa16.58■□□□□ 0.24
HERC3-211ENST00000513325 NELFEP18615 380 aaKnown RBP16.58■□□□□ 0.24
HERC3-211ENST00000513325 HLA-DPA1P20036 260 aa16.58■□□□□ 0.24
HERC3-211ENST00000513325 PTMSP20962 102 aa16.58■□□□□ 0.24
HERC3-211ENST00000513325 DMPKQ09013 629 aa16.58■□□□□ 0.24
HERC3-211ENST00000513325 RPE65Q16518 533 aa16.58■□□□□ 0.24
HERC3-211ENST00000513325 TFDP3Q5H9I0 405 aa16.58■□□□□ 0.24
HERC3-211ENST00000513325 GPRC6AQ5T6X5 926 aa16.58■□□□□ 0.24
HERC3-211ENST00000513325 FAM83HQ6ZRV2 1179 aaPredicted RBP16.58■□□□□ 0.24
HERC3-211ENST00000513325 CNGA4Q8IV77 575 aa16.58■□□□□ 0.24
HERC3-211ENST00000513325 DDHD1Q8NEL9 900 aa16.58■□□□□ 0.24
HERC3-211ENST00000513325 GPR150Q8NGU9 434 aa16.58■□□□□ 0.24
HERC3-211ENST00000513325 VAT1Q99536 393 aa16.58■□□□□ 0.24
HERC3-211ENST00000513325 ZCCHC2Q9C0B9 1178 aaKnown RBP16.58■□□□□ 0.24
HERC3-211ENST00000513325 RAB33BQ9H082 229 aa16.58■□□□□ 0.24
HERC3-211ENST00000513325 IGF2BP1Q9NZI8 577 aaKnown RBP eCLIP16.58■□□□□ 0.24
HERC3-211ENST00000513325 PKP3Q9Y446 797 aa16.58■□□□□ 0.24
HERC3-211ENST00000513325 PCDHB3Q9Y5E6 796 aa16.58■□□□□ 0.24
HERC3-211ENST00000513325 BSNQ9UPA5 3926 aa16.58■□□□□ 0.24
HERC3-211ENST00000513325 hCG_1818297A0A087WSY0 165 aa16.57■□□□□ 0.24
HERC3-211ENST00000513325 AKR1B15C9JRZ8 316 aaPredicted RBP16.57■□□□□ 0.24
HERC3-211ENST00000513325 ZRANB2O95218 330 aaKnown RBP eCLIP16.57■□□□□ 0.24
HERC3-211ENST00000513325 FECHP22830 423 aa16.57■□□□□ 0.24
HERC3-211ENST00000513325 CASRP41180 1078 aa16.57■□□□□ 0.24
HERC3-211ENST00000513325 MAGEA1P43355 309 aa16.57■□□□□ 0.24
HERC3-211ENST00000513325 MARCKSL1P49006 195 aa16.57■□□□□ 0.24
HERC3-211ENST00000513325 HADHBP55084 474 aaKnown RBP16.57■□□□□ 0.24
HERC3-211ENST00000513325 MPP3Q13368 585 aa16.57■□□□□ 0.24
HERC3-211ENST00000513325 ITGA9Q13797 1035 aa16.57■□□□□ 0.24
HERC3-211ENST00000513325 SEPT6Q14141 434 aa16.57■□□□□ 0.24
HERC3-211ENST00000513325 ERV3-1Q14264 604 aa16.57■□□□□ 0.24
HERC3-211ENST00000513325 NFE2L1Q14494 772 aa16.57■□□□□ 0.24
HERC3-211ENST00000513325 PTPRCAPQ14761 206 aa16.57■□□□□ 0.24
HERC3-211ENST00000513325 LARP7Q4G0J3 582 aaKnown RBP eCLIP16.57■□□□□ 0.24
HERC3-211ENST00000513325 CCDC50Q8IVM0 306 aa16.57■□□□□ 0.24
HERC3-211ENST00000513325 KATNAL2Q8IYT4 538 aa16.57■□□□□ 0.24
HERC3-211ENST00000513325 RCOR2Q8IZ40 523 aa16.57■□□□□ 0.24
HERC3-211ENST00000513325 RNF214Q8ND24 703 aa16.57■□□□□ 0.24
HERC3-211ENST00000513325 QKIQ96PU8 341 aaKnown RBP eCLIP16.57■□□□□ 0.24
HERC3-211ENST00000513325 RSPH14Q9UHP6 348 aa16.57■□□□□ 0.24
HERC3-211ENST00000513325 ANAPC2Q9UJX6 822 aa16.57■□□□□ 0.24
HERC3-211ENST00000513325 KCTD3Q9Y597 815 aa16.57■□□□□ 0.24
HERC3-211ENST00000513325 DNMT3AQ9Y6K1 912 aaPredicted RBP16.57■□□□□ 0.24
HERC3-211ENST00000513325 IGHV5-51A0A0C4DH38 117 aa16.56■□□□□ 0.24
HERC3-211ENST00000513325 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa16.56■□□□□ 0.24
HERC3-211ENST00000513325 GAPDHSO14556 408 aaPredicted RBP16.56■□□□□ 0.24
HERC3-211ENST00000513325 KATNA1O75449 491 aa16.56■□□□□ 0.24
HERC3-211ENST00000513325 TIAF1O95411 115 aa16.56■□□□□ 0.24
HERC3-211ENST00000513325 FURINP09958 794 aa16.56■□□□□ 0.24
HERC3-211ENST00000513325 CCNYL3P0C7X3 344 aa16.56■□□□□ 0.24
HERC3-211ENST00000513325 PBLDP30039 288 aaPredicted RBP16.56■□□□□ 0.24
HERC3-211ENST00000513325 PLCL1Q15111 1095 aa16.56■□□□□ 0.24
HERC3-211ENST00000513325 FNBP1LQ5T0N5 605 aa16.56■□□□□ 0.24
HERC3-211ENST00000513325 KLHL35Q6PF15 583 aa16.56■□□□□ 0.24
HERC3-211ENST00000513325 PPP1R3BQ86XI6 285 aa16.56■□□□□ 0.24
HERC3-211ENST00000513325 BEND7Q8N7W2 519 aaPredicted RBP16.56■□□□□ 0.24
HERC3-211ENST00000513325 SIDT2Q8NBJ9 832 aaKnown RBP16.56■□□□□ 0.24
HERC3-211ENST00000513325 ZNF398Q8TD17 642 aa16.56■□□□□ 0.24
HERC3-211ENST00000513325 UBXN4Q92575 508 aa16.56■□□□□ 0.24
HERC3-211ENST00000513325 FSD1LQ9BXM9 530 aa16.56■□□□□ 0.24
HERC3-211ENST00000513325 TSPY26PQ9H489 355 aa16.56■□□□□ 0.24
HERC3-211ENST00000513325 C10orf88Q9H8K7 445 aa16.56■□□□□ 0.24
HERC3-211ENST00000513325 PDE7BQ9NP56 450 aa16.56■□□□□ 0.24
HERC3-211ENST00000513325 SEMA5BQ9P283 1151 aa16.56■□□□□ 0.24
HERC3-211ENST00000513325 TRHDEQ9UKU6 1024 aa16.56■□□□□ 0.24
HERC3-211ENST00000513325 PADI1Q9ULC6 663 aa16.56■□□□□ 0.24
HERC3-211ENST00000513325 TFR2Q9UP52 801 aa16.56■□□□□ 0.24
HERC3-211ENST00000513325 KCNMB2Q9Y691 235 aa16.56■□□□□ 0.24
HERC3-211ENST00000513325 HACD1B0YJ81 288 aa16.55■□□□□ 0.24
HERC3-211ENST00000513325 STX7O15400 261 aaKnown RBP16.55■□□□□ 0.24
HERC3-211ENST00000513325 AGTP01019 485 aa16.55■□□□□ 0.24
HERC3-211ENST00000513325 FOLR1P15328 257 aa16.55■□□□□ 0.24
HERC3-211ENST00000513325 MSH3P20585 1137 aa16.55■□□□□ 0.24
HERC3-211ENST00000513325 TBX2Q13207 712 aaPredicted RBP16.55■□□□□ 0.24
HERC3-211ENST00000513325 TUBB3Q13509 450 aa16.55■□□□□ 0.24
HERC3-211ENST00000513325 KCNAB1Q14722 419 aa16.55■□□□□ 0.24
HERC3-211ENST00000513325 IGFBP7Q16270 282 aa16.55■□□□□ 0.24
HERC3-211ENST00000513325 LONRF2Q1L5Z9 754 aa16.55■□□□□ 0.24
HERC3-211ENST00000513325 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP16.55■□□□□ 0.24
HERC3-211ENST00000513325 LACTB2Q53H82 288 aaPredicted RBP16.55■□□□□ 0.24
HERC3-211ENST00000513325 COLEC12Q5KU26 742 aa16.55■□□□□ 0.24
HERC3-211ENST00000513325 METRNLQ641Q3 311 aa16.55■□□□□ 0.24
HERC3-211ENST00000513325 CERS6Q6ZMG9 384 aa16.55■□□□□ 0.24
HERC3-211ENST00000513325 DET1Q7L5Y6 550 aa16.55■□□□□ 0.24
HERC3-211ENST00000513325 SLC41A2Q96JW4 573 aa16.55■□□□□ 0.24
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