RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495619.1

NCKAP1-208, Transcript of NCK associated protein 1, human

TSL 3

Gene NCKAP1, Length 665 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NCKAP1-208	ENST00000495619	GAGE2D	Q9UEU5	116 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NCKAP1-208	ENST00000495619	CMAHP	Q9Y471	501 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NCKAP1-208	ENST00000495619	ARHGEF40	Q8TER5	1519 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NCKAP1-208	ENST00000495619	PI4KAP2	A4QPH2	592 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NCKAP1-208	ENST00000495619		A8MZ25	164 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NCKAP1-208	ENST00000495619		J3QR06	171 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NCKAP1-208	ENST00000495619	PLPP2	O43688	288 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NCKAP1-208	ENST00000495619	ZNF217	O75362	1048 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NCKAP1-208	ENST00000495619	GH2	P01242	217 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NCKAP1-208	ENST00000495619	GNAZ	P19086	355 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NCKAP1-208	ENST00000495619	TNFAIP3	P21580	790 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NCKAP1-208	ENST00000495619	DCT	P40126	519 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NCKAP1-208	ENST00000495619	CDH8	P55286	799 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NCKAP1-208	ENST00000495619	MBTD1	Q05BQ5	628 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NCKAP1-208	ENST00000495619	TECRL	Q5HYJ1	363 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NCKAP1-208	ENST00000495619	SNX30	Q5VWJ9	437 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NCKAP1-208	ENST00000495619	HJURP	Q8NCD3	748 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
NCKAP1-208	ENST00000495619	RBM15B	Q8NDT2	890 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
NCKAP1-208	ENST00000495619	ZNF248	Q8NDW4	579 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NCKAP1-208	ENST00000495619	ZNF524	Q96C55	264 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NCKAP1-208	ENST00000495619	ZNF501	Q96CX3	271 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
NCKAP1-208	ENST00000495619	LGALS12	Q96DT0	336 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NCKAP1-208	ENST00000495619	C17orf77	Q96MU5	243 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NCKAP1-208	ENST00000495619	TIGD1	Q96MW7	591 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NCKAP1-208	ENST00000495619	SMARCAD1	Q9H4L7	1026 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NCKAP1-208	ENST00000495619	ZNF696	Q9H7X3	374 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NCKAP1-208	ENST00000495619	DDX43	Q9NXZ2	648 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
NCKAP1-208	ENST00000495619	ZKSCAN7	Q9P0L1	754 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
NCKAP1-208	ENST00000495619	ZNF624	Q9P2J8	865 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
NCKAP1-208	ENST00000495619	PNMA2	Q9UL42	364 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NCKAP1-208	ENST00000495619	FRMD3	A2A2Y4	597 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NCKAP1-208	ENST00000495619	PGPEP1L	A6NFU8	196 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NCKAP1-208	ENST00000495619	TMEM189-UBE2V1	I3L0A0	370 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NCKAP1-208	ENST00000495619	CIDEA	O60543	219 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NCKAP1-208	ENST00000495619	PAK4	O96013	591 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
NCKAP1-208	ENST00000495619	SERPINB2	P05120	415 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NCKAP1-208	ENST00000495619	RB1	P06400	928 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NCKAP1-208	ENST00000495619	CLTB	P09497	229 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NCKAP1-208	ENST00000495619	FGF5	P12034	268 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NCKAP1-208	ENST00000495619	CHRNB4	P30926	498 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NCKAP1-208	ENST00000495619	RXRG	P48443	463 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NCKAP1-208	ENST00000495619	UBE2V1	Q13404	147 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NCKAP1-208	ENST00000495619	PPIG	Q13427	754 aa	Known RBP eCLIP	4.91	□□□□□ -1.62
NCKAP1-208	ENST00000495619	ATG9A	Q7Z3C6	839 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NCKAP1-208	ENST00000495619	TRPT1	Q86TN4	253 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
NCKAP1-208	ENST00000495619	PTOV1	Q86YD1	416 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NCKAP1-208	ENST00000495619	ZNF473	Q8WTR7	871 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
NCKAP1-208	ENST00000495619	DACH2	Q96NX9	599 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NCKAP1-208	ENST00000495619	GAD1	Q99259	594 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NCKAP1-208	ENST00000495619	FTO	Q9C0B1	505 aa	Known RBP eCLIP	4.91	□□□□□ -1.62
NCKAP1-208	ENST00000495619	SEMA6A	Q9H2E6	1030 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NCKAP1-208	ENST00000495619	B3GALT5	Q9Y2C3	310 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NCKAP1-208	ENST00000495619	C2CD2	Q9Y426	696 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NCKAP1-208	ENST00000495619	ITIH6	Q6UXX5	1313 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NCKAP1-208	ENST00000495619	TMEM8B	A6NDV4	472 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NCKAP1-208	ENST00000495619	ZG16	O60844	167 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NCKAP1-208	ENST00000495619	APOH	P02749	345 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
NCKAP1-208	ENST00000495619	NR1D1	P20393	614 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NCKAP1-208	ENST00000495619	MSH3	P20585	1137 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NCKAP1-208	ENST00000495619	VEGFC	P49767	419 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NCKAP1-208	ENST00000495619	RPS18	P62269	152 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
NCKAP1-208	ENST00000495619	KCNJ10	P78508	379 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NCKAP1-208	ENST00000495619	SIM2	Q14190	667 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
NCKAP1-208	ENST00000495619	RAB6C	Q53S08	254 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NCKAP1-208	ENST00000495619	CCDC30	Q5VVM6	783 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NCKAP1-208	ENST00000495619	FAM109B	Q6ICB4	259 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
NCKAP1-208	ENST00000495619	ARHGAP11A	Q6P4F7	1023 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NCKAP1-208	ENST00000495619	RBMS3	Q6XE24	437 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
NCKAP1-208	ENST00000495619	ZNF534	Q76KX8	674 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NCKAP1-208	ENST00000495619	CHST9	Q7L1S5	443 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NCKAP1-208	ENST00000495619	MCEMP1	Q8IX19	187 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NCKAP1-208	ENST00000495619	GPALPP1	Q8IXQ4	340 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NCKAP1-208	ENST00000495619	SKA1	Q96BD8	255 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NCKAP1-208	ENST00000495619	ITPA	Q9BY32	194 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NCKAP1-208	ENST00000495619	RAB6C	Q9H0N0	254 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NCKAP1-208	ENST00000495619	DNAJC18	Q9H819	358 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NCKAP1-208	ENST00000495619	INTS10	Q9NVR2	710 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
NCKAP1-208	ENST00000495619	ADPRHL2	Q9NX46	363 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NCKAP1-208	ENST00000495619	SEC23IP	Q9Y6Y8	1000 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
NCKAP1-208	ENST00000495619	GREB1L	Q9C091	1923 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
NCKAP1-208	ENST00000495619	OR2M5	A3KFT3	312 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NCKAP1-208	ENST00000495619	DUXA	A6NLW8	204 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NCKAP1-208	ENST00000495619	NDUFS4	O43181	175 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NCKAP1-208	ENST00000495619	GPR137B	O60478	399 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NCKAP1-208	ENST00000495619	USO1	O60763	962 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
NCKAP1-208	ENST00000495619	LDLR	P01130	860 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NCKAP1-208	ENST00000495619	H1F0	P07305	194 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
NCKAP1-208	ENST00000495619	PON1	P27169	355 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NCKAP1-208	ENST00000495619	NR0B1	P51843	470 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
NCKAP1-208	ENST00000495619	NAP1L1	P55209	391 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
NCKAP1-208	ENST00000495619	AIMP2	Q13155	320 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
NCKAP1-208	ENST00000495619	MAPRE1	Q15691	268 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
NCKAP1-208	ENST00000495619	ASTE1	Q2TB18	679 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
NCKAP1-208	ENST00000495619	C4orf50	Q6ZRC1	276 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NCKAP1-208	ENST00000495619	C1orf122	Q6ZSJ8	110 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NCKAP1-208	ENST00000495619	ADGRF2	Q8IZF7	708 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NCKAP1-208	ENST00000495619	HCAR2	Q8TDS4	363 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NCKAP1-208	ENST00000495619	DDO	Q99489	341 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NCKAP1-208	ENST00000495619	SLX1A	Q9BQ83	275 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NCKAP1-208	ENST00000495619	FSD1	Q9BTV5	496 aa		4.89	□□□□□ -1.63

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